Definition Clostridium acetobutylicum ATCC 824 plasmid pSOL1, complete sequence.
Accession NC_001988
Length 192,000

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Identifier: 15004731

GI number: 15004731

Start: 27517

End: 29364

Strand: Direct

Name: Not Available

Synonym: CA_P0027

Alternate gene names: 15004731

Gene position: 27517-29364 (Clockwise)

Preceding gene: 15004730

Following gene: 15004733

Centisome position: 14.33

GC content: 34.9

Gene sequence:

>1848_bases
ATGATGGATAAATTCCTGGATATCTTATTGGGTAAGCCTTTGGCAAATGAGCAAGGTTCTCATGAAAAGTTTAATATTCC
TTTTGGATTGGCCGTAATGGCTAGCGATGCTATTTCATCAGTGGCTTATGCTGCAGAAGAAATTTTAATAGTATTAATAG
TTGTGTTAGGGCTTCAAGCATATACTTGGCTTAGCATAGTGGCATTAATGATAATTGGACTGCTTGCCATTTTAACGGTA
TCTTATCTACAAATAATAAGGGCTTATCCTCAAGGTGGAGGTGCGTATATAGTTGCAAAAGAAAATATAGGTACAGTACC
GGGACTTGTGGCAGGAGCAGCTCTTTTAATTGATTATATTTTAACGGTTGCTGTTAGTGCTAGTGCAGGTGGAGCTGCTA
TTTTGTCTGCATTTCCAGGATTATTAAATTACAAAGTACTTATAGTTATAGTATTTATTGTGGTTCTAACAATTTTAAAT
TTAAGAGGAGTAAGTGAGTCTTCAAAGATTTTTAGCTTACCTACTTACATATTTGTATTCGGTATGATGTTTATGATAGT
TTTTGGAATATTTAAGTATGCATTTTGGGGAGGAGCTGCAAATCAGGTTAATAAAGTTGTCTTAAAGCAAACAGCTGATG
TTAGCATTTTTCTGATATTGAGGGCCTTTTCCCAAGGATGTTCTGCTTTAACTGGACTTGAAGCCGTAAGTAATTCTGTG
CCAAATTTCAAGGAACCAAGTCAAAGAAATGCTAAAATAGTAATGATACTACTGTCTTCTATAATACTATTTATATTTGG
AGGTTCATCTATTTTAGCTAATCTTTACCGTGCAGTTCCGGGAGAGAATGTCACAGTACTCGCTCAAATTGCAGAAGGAG
TTTTTGGAAGAAACTTTATGTTCTATTTGATTCAGGTTTCAACGGCTATAATACTTTTAATGGCTTGCAATACAGCTTTT
ACTGGATTTCCTATGCTTATGTATGTCGTAGCAAGGGATGGATTTGTACCAAGGCAATTTACTCATAGGGGAAAAAGACT
AAGCTTTTCCATAGGTATTGTGTCCTTATCTGTTATTGCAGGAATATTAGTTATAGTATTTAAAGCAGTTACTCATAATC
TTTTGCCACTTTACTCTGTGGGAGTATTTATGTCCTTTACACTTGCTCAAACAGGTATGGTAATTCATTGGAGACAGGGT
AAAGAAAGAAATTGGCGTATAAGAGCTTTAATAAATGGATTTGGAGCTGTTGTAACAACTATAACAACAGGGATAATAGC
TTATGAAAAATTTGAAGCAGGAGCATGGATAGTAATAATTTTAATACCTATTTTAGTTTTTATCATGCTTGCAATTAAAA
GACATTACAACATTGTGGCAGAGCAGCTTCGTGCACATCTAAAAGATTATAAGGCGGCGGATTTACAAAAAAAATTCACA
CATCTTGCAGTTGTTCCCATTGCTAGCTTAAATAAAGCTTCTTTGAGTGCACTTCAATATGCAAAAAGTGTAACTGATAA
CGTGATTGCGTTAAACATATCCATAAGCAAAGAGCAAATGGAAAAGTTAAAGGCATCCTGGAGTGAGCTTGATACGGATA
TAGTTTTGGTAAGCAAATATTCGCCGTATAGACATATAGTTACGCCACTTCTTCAGTCAATAGATGATATTGCATCTAGA
GCATCTGATGACGAGAAGATAACAGTAGTTCTTCCGCAATTTATAACTCATAAGTGGTGGGGAAATTTACTTCACAACAA
TACTGGAATCTTTCTTAGAGAGAGTATTCTTAGAAATAAAAACGTAATTGTATCAACGTATCCCTATCATTTGGATGATG
ATGAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTATTAAAAAAGGAACAAGGTAAGTCCCAAAATAAAGTATAAATAAAATTAATTTACTAATAATATTTTTATACTA
ACATTTTGGAGGAAGCATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAAAATAGGACCTTTTGGTCCTATTTTTTTATATAAACTTATATAATTCTAAGTGTTTTTGGAAAGGGATAAAATAA
AGTCATCGATCATTATGCGA

Product: amino acid permeases

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 615; Mature: 615

Protein sequence:

>615_residues
MMDKFLDILLGKPLANEQGSHEKFNIPFGLAVMASDAISSVAYAAEEILIVLIVVLGLQAYTWLSIVALMIIGLLAILTV
SYLQIIRAYPQGGGAYIVAKENIGTVPGLVAGAALLIDYILTVAVSASAGGAAILSAFPGLLNYKVLIVIVFIVVLTILN
LRGVSESSKIFSLPTYIFVFGMMFMIVFGIFKYAFWGGAANQVNKVVLKQTADVSIFLILRAFSQGCSALTGLEAVSNSV
PNFKEPSQRNAKIVMILLSSIILFIFGGSSILANLYRAVPGENVTVLAQIAEGVFGRNFMFYLIQVSTAIILLMACNTAF
TGFPMLMYVVARDGFVPRQFTHRGKRLSFSIGIVSLSVIAGILVIVFKAVTHNLLPLYSVGVFMSFTLAQTGMVIHWRQG
KERNWRIRALINGFGAVVTTITTGIIAYEKFEAGAWIVIILIPILVFIMLAIKRHYNIVAEQLRAHLKDYKAADLQKKFT
HLAVVPIASLNKASLSALQYAKSVTDNVIALNISISKEQMEKLKASWSELDTDIVLVSKYSPYRHIVTPLLQSIDDIASR
ASDDEKITVVLPQFITHKWWGNLLHNNTGIFLRESILRNKNVIVSTYPYHLDDDE

Sequences:

>Translated_615_residues
MMDKFLDILLGKPLANEQGSHEKFNIPFGLAVMASDAISSVAYAAEEILIVLIVVLGLQAYTWLSIVALMIIGLLAILTV
SYLQIIRAYPQGGGAYIVAKENIGTVPGLVAGAALLIDYILTVAVSASAGGAAILSAFPGLLNYKVLIVIVFIVVLTILN
LRGVSESSKIFSLPTYIFVFGMMFMIVFGIFKYAFWGGAANQVNKVVLKQTADVSIFLILRAFSQGCSALTGLEAVSNSV
PNFKEPSQRNAKIVMILLSSIILFIFGGSSILANLYRAVPGENVTVLAQIAEGVFGRNFMFYLIQVSTAIILLMACNTAF
TGFPMLMYVVARDGFVPRQFTHRGKRLSFSIGIVSLSVIAGILVIVFKAVTHNLLPLYSVGVFMSFTLAQTGMVIHWRQG
KERNWRIRALINGFGAVVTTITTGIIAYEKFEAGAWIVIILIPILVFIMLAIKRHYNIVAEQLRAHLKDYKAADLQKKFT
HLAVVPIASLNKASLSALQYAKSVTDNVIALNISISKEQMEKLKASWSELDTDIVLVSKYSPYRHIVTPLLQSIDDIASR
ASDDEKITVVLPQFITHKWWGNLLHNNTGIFLRESILRNKNVIVSTYPYHLDDDE
>Mature_615_residues
MMDKFLDILLGKPLANEQGSHEKFNIPFGLAVMASDAISSVAYAAEEILIVLIVVLGLQAYTWLSIVALMIIGLLAILTV
SYLQIIRAYPQGGGAYIVAKENIGTVPGLVAGAALLIDYILTVAVSASAGGAAILSAFPGLLNYKVLIVIVFIVVLTILN
LRGVSESSKIFSLPTYIFVFGMMFMIVFGIFKYAFWGGAANQVNKVVLKQTADVSIFLILRAFSQGCSALTGLEAVSNSV
PNFKEPSQRNAKIVMILLSSIILFIFGGSSILANLYRAVPGENVTVLAQIAEGVFGRNFMFYLIQVSTAIILLMACNTAF
TGFPMLMYVVARDGFVPRQFTHRGKRLSFSIGIVSLSVIAGILVIVFKAVTHNLLPLYSVGVFMSFTLAQTGMVIHWRQG
KERNWRIRALINGFGAVVTTITTGIIAYEKFEAGAWIVIILIPILVFIMLAIKRHYNIVAEQLRAHLKDYKAADLQKKFT
HLAVVPIASLNKASLSALQYAKSVTDNVIALNISISKEQMEKLKASWSELDTDIVLVSKYSPYRHIVTPLLQSIDDIASR
ASDDEKITVVLPQFITHKWWGNLLHNNTGIFLRESILRNKNVIVSTYPYHLDDDE

Specific function: Probable Amino-Acid Or Metabolite Transport Protein. [C]

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67498; Mature: 67498

Theoretical pI: Translated: 9.70; Mature: 9.70

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MMDKFLDILLGKPLANEQGSHEKFNIPFGLAVMASDAISSVAYAAEEILIVLIVVLGLQA
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTWLSIVALMIIGLLAILTVSYLQIIRAYPQGGGAYIVAKENIGTVPGLVAGAALLIDYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LTVAVSASAGGAAILSAFPGLLNYKVLIVIVFIVVLTILNLRGVSESSKIFSLPTYIFVF
HHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHH
GMMFMIVFGIFKYAFWGGAANQVNKVVLKQTADVSIFLILRAFSQGCSALTGLEAVSNSV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PNFKEPSQRNAKIVMILLSSIILFIFGGSSILANLYRAVPGENVTVLAQIAEGVFGRNFM
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHH
FYLIQVSTAIILLMACNTAFTGFPMLMYVVARDGFVPRQFTHRGKRLSFSIGIVSLSVIA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHH
GILVIVFKAVTHNLLPLYSVGVFMSFTLAQTGMVIHWRQGKERNWRIRALINGFGAVVTT
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH
ITTGIIAYEKFEAGAWIVIILIPILVFIMLAIKRHYNIVAEQLRAHLKDYKAADLQKKFT
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HLAVVPIASLNKASLSALQYAKSVTDNVIALNISISKEQMEKLKASWSELDTDIVLVSKY
HEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECC
SPYRHIVTPLLQSIDDIASRASDDEKITVVLPQFITHKWWGNLLHNNTGIFLRESILRNK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHCCC
NVIVSTYPYHLDDDE
CEEEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MMDKFLDILLGKPLANEQGSHEKFNIPFGLAVMASDAISSVAYAAEEILIVLIVVLGLQA
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTWLSIVALMIIGLLAILTVSYLQIIRAYPQGGGAYIVAKENIGTVPGLVAGAALLIDYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
LTVAVSASAGGAAILSAFPGLLNYKVLIVIVFIVVLTILNLRGVSESSKIFSLPTYIFVF
HHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHH
GMMFMIVFGIFKYAFWGGAANQVNKVVLKQTADVSIFLILRAFSQGCSALTGLEAVSNSV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PNFKEPSQRNAKIVMILLSSIILFIFGGSSILANLYRAVPGENVTVLAQIAEGVFGRNFM
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHH
FYLIQVSTAIILLMACNTAFTGFPMLMYVVARDGFVPRQFTHRGKRLSFSIGIVSLSVIA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHH
GILVIVFKAVTHNLLPLYSVGVFMSFTLAQTGMVIHWRQGKERNWRIRALINGFGAVVTT
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHH
ITTGIIAYEKFEAGAWIVIILIPILVFIMLAIKRHYNIVAEQLRAHLKDYKAADLQKKFT
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HLAVVPIASLNKASLSALQYAKSVTDNVIALNISISKEQMEKLKASWSELDTDIVLVSKY
HEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECC
SPYRHIVTPLLQSIDDIASRASDDEKITVVLPQFITHKWWGNLLHNNTGIFLRESILRNK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHCCC
NVIVSTYPYHLDDDE
CEEEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]