Definition Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome.
Accession NC_009615
Length 4,811,379

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The map label for this gene is yjbB [H]

Identifier: 150009739

GI number: 150009739

Start: 3813310

End: 3814995

Strand: Reverse

Name: yjbB [H]

Synonym: BDI_3154

Alternate gene names: 150009739

Gene position: 3814995-3813310 (Counterclockwise)

Preceding gene: 150009763

Following gene: 150009738

Centisome position: 79.29

GC content: 45.73

Gene sequence:

>1686_bases
ATGGACTATTCTTTTTTTGATTTTCTCCGGCTGATCGGCTCCTTGGCGCTGTTCTTGTACGGAATGAAGATCATGAGTGA
AGGGTTACAAAAATTTGCGGGTGACAGTTTACGTCGAATACTAACCGCGATGACCACAAACAGAGTGACCGGTGTGCTCA
CCGGCGTGTTAATAACGGCTCTCATCCAATCCTCATCGGCTACGACGGTTATGGTCGTGAGTTTCGTGAATGCCGGACTC
TTGACATTGACCCAATCCATCGGAGTCATTATGGGTGCCAACATCGGAACCACGGTAACGGCATGGCTTATCTCCGCCCT
CGGTTTCAAGGTCGATATCGCCGCATTCGCCCTTCCCCTTTTAGCTTTCGCTCTCCCACTCTTCTTCTCAGGAAAAAGCT
CTCGTAAATCAATTGGTGAATTTGTCTTTGGTTTCGCGTTCCTGTTCATGGGGCTTCAAAGCTTAAAGGCAAACGCCCCG
GACCTCGGAGCGAATCCGGAGATGCTGGCTTTCGTGCAGAATTATACGGATATGGGATTTTTCTCCATCATCTTGTTCTT
ATTTATCGGAGCGATCTTAACCATGATCGTACAAGCCTCCGCTGCCACGATGGCTATTACATTGATTATGTGCGCCAACG
GCTGGATCGATTATCATTTGGGAGTCGCTTTGGTATTAGGCGAGAATATCGGAACCACGATTACGGCCAACTTAGCCGCA
TTAACCGGAAACACACAAGCACGACGAGCCGCGTTAGCGCACCTTGTTTTCAACGTTTTCGGTGTCATGTGGGTTTTGGT
GCTCTTCTACCCTTTCACGAATGCCGTCTCATGGTTTGTTACCCATGTAATGAAGGTCAGTGATCCGGCTGTGGCGGTAT
CCTTTAAACTGGCAGCGTTCCACACAGCATTCAATATCAGTAATACTTTCATTATGATCTGGTTCGTAAGCTTGATCGAA
AAGACCGTATGTACGCTTATCAAGCCCAAGGTGGAAGACGAGGAATACCGCCTTCGCTATATCACGGGAGGTATGTTATC
CACCGCCGAGCTTTCTATCCTGCAAGCGCATAAAGAAATCTCATTATTCGCCGAGCGTACGGCTAGGATGTTTAATATGG
TGAAAGAATTATTCTACGAGAAGAATGAGGAGACCTTCCTCAAGACTTATAGCCGCATCGAGAAATACGAGAATATCAGC
GACCGCATGGAGATCGAGATCGCAAATTACTTGACTGAAGTATCGGAAGGCCGTTTGAGTTCTGAAAGTAAGGAAGAAAT
CCGTATCATGCTACGTGCCGTCTCGGAAATCGAGAGTATAGCGGATTCTTGTAATAACCTTGCCCGAAGTATCAAACGCA
GAAACGAGTTCAAATCCGAATTCACGGAGGAGCAAAACAAGCACTTGGATCATATGTTCGAGCTGGTATCCGGGGCGTTA
AATCGCATGAACCTAATTTTGCATAAACCGGAACTCGTACATGATGATATCAATCCTTCTTATAACATAGAGAACGAGAT
CAACAACTACCGTAACCAGTTGAAGAGCCGGAATATCGAAGATATCAACAATAAGCTGTACCAATATCAAGATGGCGTTT
ATTACATGGACATGGTTAGTGAAAGTGAAAAGCTGGGCGATTATGTATTAAATGTTGTTCAAGCGGTTATCGAGAAGAAA
ATATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTATTGTCTCAGACATACTATCTCAGTTATTATTTGTAAATTCGCCCCCTAAAGTTAGGAATATTAATCGGATATACAA
TCCACTTAAACGTAATTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGTATATTTGTCCTTAACAATATCAACAGCCCTTTTCCGTTATTGAGAGAAGGGCTGTTTTTAATATATATCCACTATGA
ATTATAAGTATTATACGATC

Product: putative Na+-dependent phosphate transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 561; Mature: 561

Protein sequence:

>561_residues
MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITALIQSSSATTVMVVSFVNAGL
LTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPLLAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAP
DLGANPEMLAFVQNYTDMGFFSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA
LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAFHTAFNISNTFIMIWFVSLIE
KTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEISLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENIS
DRMEIEIANYLTEVSEGRLSSESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL
NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVSESEKLGDYVLNVVQAVIEKK
I

Sequences:

>Translated_561_residues
MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITALIQSSSATTVMVVSFVNAGL
LTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPLLAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAP
DLGANPEMLAFVQNYTDMGFFSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA
LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAFHTAFNISNTFIMIWFVSLIE
KTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEISLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENIS
DRMEIEIANYLTEVSEGRLSSESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL
NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVSESEKLGDYVLNVVQAVIEKK
I
>Mature_561_residues
MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITALIQSSSATTVMVVSFVNAGL
LTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPLLAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAP
DLGANPEMLAFVQNYTDMGFFSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA
LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAFHTAFNISNTFIMIWFVSLIE
KTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEISLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENIS
DRMEIEIANYLTEVSEGRLSSESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL
NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVSESEKLGDYVLNVVQAVIEKK
I

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yqeW [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=572, Percent_Identity=22.9020979020979, Blast_Score=122, Evalue=7e-29,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62941; Mature: 62941

Theoretical pI: Translated: 5.89; Mature: 5.89

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIQSSSATTVMVVSFVNAGLLTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPL
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAPDLGANPEMLAFVQNYTDMGF
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHH
FSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEHHHH
LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEHHHHH
HTAFNISNTFIMIWFVSLIEKTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
SLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENISDRMEIEIANYLTEVSEGRLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVS
HHHHHHEECCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH
ESEKLGDYVLNVVQAVIEKKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MDYSFFDFLRLIGSLALFLYGMKIMSEGLQKFAGDSLRRILTAMTTNRVTGVLTGVLITA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIQSSSATTVMVVSFVNAGLLTLTQSIGVIMGANIGTTVTAWLISALGFKVDIAAFALPL
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
LAFALPLFFSGKSSRKSIGEFVFGFAFLFMGLQSLKANAPDLGANPEMLAFVQNYTDMGF
HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHH
FSIILFLFIGAILTMIVQASAATMAITLIMCANGWIDYHLGVALVLGENIGTTITANLAA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEHHHH
LTGNTQARRAALAHLVFNVFGVMWVLVLFYPFTNAVSWFVTHVMKVSDPAVAVSFKLAAF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEHHHHH
HTAFNISNTFIMIWFVSLIEKTVCTLIKPKVEDEEYRLRYITGGMLSTAELSILQAHKEI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHH
SLFAERTARMFNMVKELFYEKNEETFLKTYSRIEKYENISDRMEIEIANYLTEVSEGRLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SESKEEIRIMLRAVSEIESIADSCNNLARSIKRRNEFKSEFTEEQNKHLDHMFELVSGAL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRMNLILHKPELVHDDINPSYNIENEINNYRNQLKSRNIEDINNKLYQYQDGVYYMDMVS
HHHHHHEECCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHH
ESEKLGDYVLNVVQAVIEKKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]