| Definition | Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009615 |
| Length | 4,811,379 |
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The map label for this gene is 150009369
Identifier: 150009369
GI number: 150009369
Start: 3312194
End: 3314698
Strand: Reverse
Name: 150009369
Synonym: BDI_2777
Alternate gene names: NA
Gene position: 3314698-3312194 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150009370
Following gene: 150009361
Centisome position: 68.89
GC content: 44.07
Gene sequence:
>2505_bases ATGCGGAGTATAATGCAAAAATGGGGGAAGCATATCGCTGCTGTAGCCGTGTTCTTGGTGCTGACAGTGGTTTATTTTGC CCCGGCCGTATTTGAGGGTAAATCGATTCGTCAGGGAGACATGGAGAAAGCTGTTGGCATGGGAGGTAGCCAGATGGAGA AATATGAGAAATCCGCCCAGCCCGGTGAATTTAGCGTTTGGTCTGATGCCATGTTTGGAGGAATGCCCTATGCGGGAGGA TATGGGAATCCTGCCCCTAAGTTGCCTGGGTATACTTTATTAGAGGCACCATTAAAAGATATCGGTTATTTGAATGCGGG CATGGTATTTACCGGTTTGGTATGTTTTTATATATTGATGTGTGTAATGGGGGTGAATTGGTGGCTGGCCCTTGCGGGCT CGATCGCTTTTGCGTTAGCTTCTTATAATATAATCATTATAGAAGCCGGGCATATAACGAAAGCATATGTCATTGCCTAT ATGCCGCTAACCCTTGCGGGTATGGCGCTCCTGTTCAAACGTAAGTATTTGTGGGGAGGAATCGTATTCTTGTTGGGAGT TGCCTTATCCATATCGAATGGACATATCCAGATCACTTATTATTTATTGCTGCTTTGTTTGTTTGTTTATCTGGGGTACG TGTTCGCTAAACTACGAGAGAAAACATACAAAGAGTTAGGCAAAGTGACCGTGATTATGGTTGGTTGCGTTATATTAGCG ATTCTTCCCAACGCTCAAAATATGTATGCTCATTGGGATCTTGGCAAGAACTCTATCCGTGGTGCTACGGAATTGACTAC TACTACGGCTTCCGGAGAGAAAATCTCTTCGGGCCTGGATAAGGATTATGCTTTTGCCTGGAGCTATGGTAAAGGTGAGC TATTGACATTGCTGGTTCCTAATGCTTATGGAGGGGGATCCGGAGGTATGTTAGGACCGGACTCTGAATTGTATAAGGAA TTAAGGGCAAAGGGGGCTCAAGTAGGAAAAGAAGTACAAGCTCCTACCTATTGGGGGGAGAAGACGTTTACTTCGGGACC GGTGTATTTTGGAGCGTTGGTTTGTTTCTTGTTTATCATAGGAATGTTCGTGATCCGGAACCCGATAAAGTGGTGGCTGT TCGCTGGTTCGGTGTTCTTGATTTTTTTGGCTTTGGGACGTAATTTTGATGGTTTTAATGATTTTATGTTCCATTATTTA CCGATGTATAATAAATTCCGTACGGTGGAGATGGCTTTGGTTATTCCGGGTATGGTATTTCCCATCATAGCGATATGGGG GCTGAAAGAGATCGTGTCGGGAAAAGTGGATGATGCTTTATTTAAAAGGGGGTTAATCGTTTCTTTAGCGATTACGGGTG GATTGTGCTTGATCCTTTGGGTGATGCCAAGCATGTTACTTGATTTCCGTTCCTCTTTTGATGCTCAATACCAATTACCG GATTGGTACTATAATGCCTTATTGATGGATCGGGCTTCTTTGGCTTCCGCGGATGCTATGCGCTCTCTGATTTTTATATT GCTGGGTGCCGCTTTATTATTCTGGTATTATACGGTAAAAGATCGAAAGAAGGCTGGTACGATTGTGGGAATAGGTGTGG CAGTTTTGATGTTGGCTGATTTGTGGACTGTCGATAAACGTTATTTGAATGATGGTGATTTTGTTCGTCAGAAAGCTGTG GACGTGTATAAGGAGACTGTTGCGGACCAAGAGATCTTTAAGGATAAAGATCCTTCTTATCGTGTAGTGACGTTAAATAA TCCATTTCAAGAGACTAGTGTATCTTATTATCACCACTCCATCGGCGGTTACTATGCCGCTAAATTGAGACGGTACCAAG AATTGATCGACCACCGTCTGCAAGGAGAGCTTAACTCGGTTATCGGGGCTTTCCAGAAAGCGCAGACCGCAGAGGATTTG ATGGGGGCGTTCGCTGCTTGCCCGTCCTTGAATATGCTCAATACACGTTATATTATCTATAATCCGGAGCAACCGCCTTT GAGGAATCCGTTTGCTTTCGGCAACGCTTGGTTTGTGGATAAAGTGGAGGTCGTGGAGAATGCGGATGCGGAAATAGCGG CGTTGAATACGATCAATCCGTTAACGACGGCGGTTGTCGATAAACGTTTCGCTGATGAGGTGAAAGGTTTCACGCCTCAA TTGGACTCTACTGCTACGATAACATTGGATAGTTATCGCCCTAATAAATTAGTTTATACGACGAAGACGAATTCTGAGCA ATTAGCGGTATTCTCAGAGATCTATTATCAACCGGGATGGGAGGTAACTATTGATGGTAAGCCCGCTTCGCATTTCCGGG CGGATTGGATATTACGAGCTATGTTAGTTCCTGCGGGAGAGCATCAGATCGTATTTGAGTTTAGACCGCAAGGTTATATT ACGGCGGCTTATATTACCTCTTTCAGTTCGTTGATTATCTTGTTGTTATTGATTGGTGCGGTAGGATATTCGGTTTGGAA AGCTAGAAAGCAAAAAGAGATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGTCTCGACAATCGCATTGCATGGTTGGTTCGCCGTACGTTTCTATTTTGCCAAATGGTTTAAAGGTAGAGTATAAATA ATTAAATATAAATAAGTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTCCGGTTGGTTGTAGAGACGGGGCACACCCCGTCTCTACAACTAGATGAAACCGCTATTGATAAAATCGAGCAGTTTT CTCGTTAGGGTTTCCCACGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 834; Mature: 834
Protein sequence:
>834_residues MRSIMQKWGKHIAAVAVFLVLTVVYFAPAVFEGKSIRQGDMEKAVGMGGSQMEKYEKSAQPGEFSVWSDAMFGGMPYAGG YGNPAPKLPGYTLLEAPLKDIGYLNAGMVFTGLVCFYILMCVMGVNWWLALAGSIAFALASYNIIIIEAGHITKAYVIAY MPLTLAGMALLFKRKYLWGGIVFLLGVALSISNGHIQITYYLLLLCLFVYLGYVFAKLREKTYKELGKVTVIMVGCVILA ILPNAQNMYAHWDLGKNSIRGATELTTTTASGEKISSGLDKDYAFAWSYGKGELLTLLVPNAYGGGSGGMLGPDSELYKE LRAKGAQVGKEVQAPTYWGEKTFTSGPVYFGALVCFLFIIGMFVIRNPIKWWLFAGSVFLIFLALGRNFDGFNDFMFHYL PMYNKFRTVEMALVIPGMVFPIIAIWGLKEIVSGKVDDALFKRGLIVSLAITGGLCLILWVMPSMLLDFRSSFDAQYQLP DWYYNALLMDRASLASADAMRSLIFILLGAALLFWYYTVKDRKKAGTIVGIGVAVLMLADLWTVDKRYLNDGDFVRQKAV DVYKETVADQEIFKDKDPSYRVVTLNNPFQETSVSYYHHSIGGYYAAKLRRYQELIDHRLQGELNSVIGAFQKAQTAEDL MGAFAACPSLNMLNTRYIIYNPEQPPLRNPFAFGNAWFVDKVEVVENADAEIAALNTINPLTTAVVDKRFADEVKGFTPQ LDSTATITLDSYRPNKLVYTTKTNSEQLAVFSEIYYQPGWEVTIDGKPASHFRADWILRAMLVPAGEHQIVFEFRPQGYI TAAYITSFSSLIILLLLIGAVGYSVWKARKQKEI
Sequences:
>Translated_834_residues MRSIMQKWGKHIAAVAVFLVLTVVYFAPAVFEGKSIRQGDMEKAVGMGGSQMEKYEKSAQPGEFSVWSDAMFGGMPYAGG YGNPAPKLPGYTLLEAPLKDIGYLNAGMVFTGLVCFYILMCVMGVNWWLALAGSIAFALASYNIIIIEAGHITKAYVIAY MPLTLAGMALLFKRKYLWGGIVFLLGVALSISNGHIQITYYLLLLCLFVYLGYVFAKLREKTYKELGKVTVIMVGCVILA ILPNAQNMYAHWDLGKNSIRGATELTTTTASGEKISSGLDKDYAFAWSYGKGELLTLLVPNAYGGGSGGMLGPDSELYKE LRAKGAQVGKEVQAPTYWGEKTFTSGPVYFGALVCFLFIIGMFVIRNPIKWWLFAGSVFLIFLALGRNFDGFNDFMFHYL PMYNKFRTVEMALVIPGMVFPIIAIWGLKEIVSGKVDDALFKRGLIVSLAITGGLCLILWVMPSMLLDFRSSFDAQYQLP DWYYNALLMDRASLASADAMRSLIFILLGAALLFWYYTVKDRKKAGTIVGIGVAVLMLADLWTVDKRYLNDGDFVRQKAV DVYKETVADQEIFKDKDPSYRVVTLNNPFQETSVSYYHHSIGGYYAAKLRRYQELIDHRLQGELNSVIGAFQKAQTAEDL MGAFAACPSLNMLNTRYIIYNPEQPPLRNPFAFGNAWFVDKVEVVENADAEIAALNTINPLTTAVVDKRFADEVKGFTPQ LDSTATITLDSYRPNKLVYTTKTNSEQLAVFSEIYYQPGWEVTIDGKPASHFRADWILRAMLVPAGEHQIVFEFRPQGYI TAAYITSFSSLIILLLLIGAVGYSVWKARKQKEI >Mature_834_residues MRSIMQKWGKHIAAVAVFLVLTVVYFAPAVFEGKSIRQGDMEKAVGMGGSQMEKYEKSAQPGEFSVWSDAMFGGMPYAGG YGNPAPKLPGYTLLEAPLKDIGYLNAGMVFTGLVCFYILMCVMGVNWWLALAGSIAFALASYNIIIIEAGHITKAYVIAY MPLTLAGMALLFKRKYLWGGIVFLLGVALSISNGHIQITYYLLLLCLFVYLGYVFAKLREKTYKELGKVTVIMVGCVILA ILPNAQNMYAHWDLGKNSIRGATELTTTTASGEKISSGLDKDYAFAWSYGKGELLTLLVPNAYGGGSGGMLGPDSELYKE LRAKGAQVGKEVQAPTYWGEKTFTSGPVYFGALVCFLFIIGMFVIRNPIKWWLFAGSVFLIFLALGRNFDGFNDFMFHYL PMYNKFRTVEMALVIPGMVFPIIAIWGLKEIVSGKVDDALFKRGLIVSLAITGGLCLILWVMPSMLLDFRSSFDAQYQLP DWYYNALLMDRASLASADAMRSLIFILLGAALLFWYYTVKDRKKAGTIVGIGVAVLMLADLWTVDKRYLNDGDFVRQKAV DVYKETVADQEIFKDKDPSYRVVTLNNPFQETSVSYYHHSIGGYYAAKLRRYQELIDHRLQGELNSVIGAFQKAQTAEDL MGAFAACPSLNMLNTRYIIYNPEQPPLRNPFAFGNAWFVDKVEVVENADAEIAALNTINPLTTAVVDKRFADEVKGFTPQ LDSTATITLDSYRPNKLVYTTKTNSEQLAVFSEIYYQPGWEVTIDGKPASHFRADWILRAMLVPAGEHQIVFEFRPQGYI TAAYITSFSSLIILLLLIGAVGYSVWKARKQKEI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 92903; Mature: 92903
Theoretical pI: Translated: 8.47; Mature: 8.47
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRSIMQKWGKHIAAVAVFLVLTVVYFAPAVFEGKSIRQGDMEKAVGMGGSQMEKYEKSAQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHCCC PGEFSVWSDAMFGGMPYAGGYGNPAPKLPGYTLLEAPLKDIGYLNAGMVFTGLVCFYILM CCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH CVMGVNWWLALAGSIAFALASYNIIIIEAGHITKAYVIAYMPLTLAGMALLFKRKYLWGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVFLLGVALSISNGHIQITYYLLLLCLFVYLGYVFAKLREKTYKELGKVTVIMVGCVILA HHHHHHHHHEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILPNAQNMYAHWDLGKNSIRGATELTTTTASGEKISSGLDKDYAFAWSYGKGELLTLLVP HCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHEEEECCCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEC NAYGGGSGGMLGPDSELYKELRAKGAQVGKEVQAPTYWGEKTFTSGPVYFGALVCFLFII CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GMFVIRNPIKWWLFAGSVFLIFLALGRNFDGFNDFMFHYLPMYNKFRTVEMALVIPGMVF HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHH PIIAIWGLKEIVSGKVDDALFKRGLIVSLAITGGLCLILWVMPSMLLDFRSSFDAQYQLP HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC DWYYNALLMDRASLASADAMRSLIFILLGAALLFWYYTVKDRKKAGTIVGIGVAVLMLAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH LWTVDKRYLNDGDFVRQKAVDVYKETVADQEIFKDKDPSYRVVTLNNPFQETSVSYYHHS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHH IGGYYAAKLRRYQELIDHRLQGELNSVIGAFQKAQTAEDLMGAFAACPSLNMLNTRYIIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE NPEQPPLRNPFAFGNAWFVDKVEVVENADAEIAALNTINPLTTAVVDKRFADEVKGFTPQ CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LDSTATITLDSYRPNKLVYTTKTNSEQLAVFSEIYYQPGWEVTIDGKPASHFRADWILRA CCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHH MLVPAGEHQIVFEFRPQGYITAAYITSFSSLIILLLLIGAVGYSVWKARKQKEI HHCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MRSIMQKWGKHIAAVAVFLVLTVVYFAPAVFEGKSIRQGDMEKAVGMGGSQMEKYEKSAQ CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHCCC PGEFSVWSDAMFGGMPYAGGYGNPAPKLPGYTLLEAPLKDIGYLNAGMVFTGLVCFYILM CCCCEEEHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH CVMGVNWWLALAGSIAFALASYNIIIIEAGHITKAYVIAYMPLTLAGMALLFKRKYLWGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVFLLGVALSISNGHIQITYYLLLLCLFVYLGYVFAKLREKTYKELGKVTVIMVGCVILA HHHHHHHHHEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILPNAQNMYAHWDLGKNSIRGATELTTTTASGEKISSGLDKDYAFAWSYGKGELLTLLVP HCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHEEEECCCCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEEC NAYGGGSGGMLGPDSELYKELRAKGAQVGKEVQAPTYWGEKTFTSGPVYFGALVCFLFII CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GMFVIRNPIKWWLFAGSVFLIFLALGRNFDGFNDFMFHYLPMYNKFRTVEMALVIPGMVF HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHH PIIAIWGLKEIVSGKVDDALFKRGLIVSLAITGGLCLILWVMPSMLLDFRSSFDAQYQLP HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC DWYYNALLMDRASLASADAMRSLIFILLGAALLFWYYTVKDRKKAGTIVGIGVAVLMLAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEHHHHHHHHHHH LWTVDKRYLNDGDFVRQKAVDVYKETVADQEIFKDKDPSYRVVTLNNPFQETSVSYYHHS HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHH IGGYYAAKLRRYQELIDHRLQGELNSVIGAFQKAQTAEDLMGAFAACPSLNMLNTRYIIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEE NPEQPPLRNPFAFGNAWFVDKVEVVENADAEIAALNTINPLTTAVVDKRFADEVKGFTPQ CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LDSTATITLDSYRPNKLVYTTKTNSEQLAVFSEIYYQPGWEVTIDGKPASHFRADWILRA CCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHH MLVPAGEHQIVFEFRPQGYITAAYITSFSSLIILLLLIGAVGYSVWKARKQKEI HHCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA