| Definition | Parabacteroides distasonis ATCC 8503 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009615 |
| Length | 4,811,379 |
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The map label for this gene is 150007917
Identifier: 150007917
GI number: 150007917
Start: 1486208
End: 1488367
Strand: Direct
Name: 150007917
Synonym: BDI_1278
Alternate gene names: NA
Gene position: 1486208-1488367 (Clockwise)
Preceding gene: 150007916
Following gene: 150007918
Centisome position: 30.89
GC content: 36.06
Gene sequence:
>2160_bases ATGGATATTACACTATACATATCCCGTTTTTTATATAGAATTCGTCACCAACTGATATTTGGAACGCTTATTGTAACAGC ATTGGTTGCCTATTTCAGTCAATTCATGGAGAAAAAATACACCGTGACAACTTCGATCTACACAGGTATTACCTCCAACA CGGGTTTAGATGAAGAGACAAAACCTGATTGGCAGGCAGTAAACAACACATATGATAACTTGGTTAATTTAACAAAATCA AGAGGAACCCTAGAAAACGTATCACTAAAATTATTAGCATTAAACCTAACACAAGGAAATCCTGAAATAGATAATCTCTA TATAACAGCTGACAATTACAAGAAATTAACAGCATCTATACCTGAAGAAATAATAAATTTAATAGACACGGCTTCTCTCG ATAACACTATAAACAGATTTAAAGAATATAAAAACATTGATAGCCGCAATTATTTGCATGAATTGCTCAACGGAGGAGCT GCATTCTATAGCTACGCAGCTTTATCCAGCATAATTATTAGACGCCAAGGTAATAGCGATTTGATAGAGATAGCCTACAC TAGCTCAGATCCCGGAATCACATGGAATACGGTTAAGTTAGTCAGCGAAGAAATGAAATATTCTTACGATAATTTAAAAT ATAAAACAGCAAATGATATCGTAAAATATTATGAGCAGGAATTGAATAAATTAAGGACAAAACTCAATCAACAAGAAAAT GATCTTACAAATTATAACGTACAAAACAGCGTCATAAATTATACAGAACAAACAAAATCTATCGCAAACTCTTTTGCTGA TTTTGAGAACCGTTACGAAGAAACACAACGAAGTTACGAGAGCTCAACCAAAATCATCAACGAGTTAGAGAAATATATGG AAGTTCGTACTAAACTTGTCAAAACGAATGAAGAGTTTATCAACGCATTGGAAGATGTTTCCCGCATCAGTGGTAAAATC ACCGAGATAGAGACTTTCACCTCTGAAAACGCATTAAACAAGGATACAGAATTAACACGATATCAAGATCAACTGAAAGA TGTCGAGAAGAGAATAGCATTACTGACAGATAAAATTAATAGCTATAAAGAAAGTAAAGAAGGAATCGCTATTGACGGAT TAGTACAAGAATGGTTGTCACAGACCTTGATACAAGTGAAATCCAAGGCAGACTTAGAGATTTTAAACAAAAGAAAGCAC GATTTCGAGGAGCAGTATAAGAATTATTCTCCCATTGGGACTAAGATCAACCAGCAAGAACGAGAGATCAATGTCACTGA ACAGTCTTATCTACAAGTTCTCCATGCCTTAAATATGGCTAAGATGAAACAGGTGAACTTACAATTAACCTCATCAAACT TAACAACTATCTCAGAGGCCGCTTATCCATTGTTTAGTGACAAAGGTAAGCGCATGTTTTTAGTCATAGCCGCTTTTATC GGTAGTTTAATTTTCATTATAGCCCTAAATTTGGTCATTGAATTACTAGACCGTACCCTCCGGGATGCAGAACGGGCTAA ACGCCTCACAGGAATGAATATATTAGGAGCCTTCAACGGACGCAACTCCCAATTGAAATACAGGGGATTTGTAAAGACCT GTAACCGAATATCAGCCGCATACGCTTGCAATCGGTTGGCTCCTTATTTGCAAAAAAATAAGACTCTATACATAAATATA TTAAGTATAGAAGAAAGAGAAGGGAAGACATTCGTTGCCAAATATTTTCAAGAACGTTGGGAAGAGCTAGGTTTCCAAGT ACGATATATAAGGATCGGAGAAGAGATAAACATTGAATCGTCACTATTCACCACAGAAAATATAGAAGAGTATATTAAAG CCGAAAGTCAACCAGACATTGTATTAATCGAATATCCTTCCATTCAAGGAAACAGTGTGCCTCCACATTTGCTAAGCTCA AGTCAAGTTAATATTCTAATAGCTAATGTACGCAGAGTATGGAAAAATAGCGATAAGGAATTTGTTAGTTATTTGCGTGA GATAACTAAAAATACATCTTTGTATTTATACTTGAATAACGCCTCACGAGAAGCCGTAGAAGATTTCACCGGGCAATTGC CCCCTCAGACCTCCATGCGCTCTTTCACGAACCGTATGATGTATATGGGGTTAACCGCAACCAATTCGGCCATAAAATAG
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CGAAGCTCATGGATACTTCAAGAGAGATAAAAGAGGATTCTTCTTTCAATATGACCCTATTAATCCTTGTCATAGGACTA GTAGGAATAGGAGGAGCTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 719; Mature: 719
Protein sequence:
>719_residues MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEETKPDWQAVNNTYDNLVNLTKS RGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASIPEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGA AFYSYAALSSIIIRRQGNSDLIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLVKTNEEFINALEDVSRISGKI TEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKINSYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKH DFEEQYKNYSPIGTKINQQEREINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAAYACNRLAPYLQKNKTLYINI LSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIESSLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSS SQVNILIANVRRVWKNSDKEFVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK
Sequences:
>Translated_719_residues MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEETKPDWQAVNNTYDNLVNLTKS RGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASIPEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGA AFYSYAALSSIIIRRQGNSDLIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLVKTNEEFINALEDVSRISGKI TEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKINSYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKH DFEEQYKNYSPIGTKINQQEREINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAAYACNRLAPYLQKNKTLYINI LSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIESSLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSS SQVNILIANVRRVWKNSDKEFVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK >Mature_719_residues MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEETKPDWQAVNNTYDNLVNLTKS RGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASIPEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGA AFYSYAALSSIIIRRQGNSDLIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLVKTNEEFINALEDVSRISGKI TEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKINSYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKH DFEEQYKNYSPIGTKINQQEREINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAAYACNRLAPYLQKNKTLYINI LSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIESSLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSS SQVNILIANVRRVWKNSDKEFVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82900; Mature: 82900
Theoretical pI: Translated: 6.18; Mature: 6.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEET CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHEECCCCCCCCCCCC KPDWQAVNNTYDNLVNLTKSRGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH PEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGAAFYSYAALSSIIIRRQGNSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN EEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTNEEFINALEDVSRISGKITEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKIN HCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKHDFEEQYKNYSPIGTKINQQE HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHH REINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHH GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH YACNRLAPYLQKNKTLYINILSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIES HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCH SLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSSSQVNILIANVRRVWKNSDKE HHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCHH FVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure MDITLYISRFLYRIRHQLIFGTLIVTALVAYFSQFMEKKYTVTTSIYTGITSNTGLDEET CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEHHEECCCCCCCCCCCC KPDWQAVNNTYDNLVNLTKSRGTLENVSLKLLALNLTQGNPEIDNLYITADNYKKLTASI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH PEEIINLIDTASLDNTINRFKEYKNIDSRNYLHELLNGGAAFYSYAALSSIIIRRQGNSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC LIEIAYTSSDPGITWNTVKLVSEEMKYSYDNLKYKTANDIVKYYEQELNKLRTKLNQQEN EEEEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC DLTNYNVQNSVINYTEQTKSIANSFADFENRYEETQRSYESSTKIINELEKYMEVRTKLV CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTNEEFINALEDVSRISGKITEIETFTSENALNKDTELTRYQDQLKDVEKRIALLTDKIN HCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SYKESKEGIAIDGLVQEWLSQTLIQVKSKADLEILNKRKHDFEEQYKNYSPIGTKINQQE HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHH REINVTEQSYLQVLHALNMAKMKQVNLQLTSSNLTTISEAAYPLFSDKGKRMFLVIAAFI HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHH GSLIFIIALNLVIELLDRTLRDAERAKRLTGMNILGAFNGRNSQLKYRGFVKTCNRISAA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH YACNRLAPYLQKNKTLYINILSIEEREGKTFVAKYFQERWEELGFQVRYIRIGEEINIES HHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCCH SLFTTENIEEYIKAESQPDIVLIEYPSIQGNSVPPHLLSSSQVNILIANVRRVWKNSDKE HHCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCCCEEEHHHHHHHHCCCCHH FVSYLREITKNTSLYLYLNNASREAVEDFTGQLPPQTSMRSFTNRMMYMGLTATNSAIK HHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA