| Definition | Bacteroides vulgatus ATCC 8482 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009614 |
| Length | 5,163,189 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 150006512
Identifier: 150006512
GI number: 150006512
Start: 4963792
End: 4965321
Strand: Reverse
Name: 150006512
Synonym: BVU_4032
Alternate gene names: NA
Gene position: 4965321-4963792 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150006513
Following gene: 150006511
Centisome position: 96.17
GC content: 32.55
Gene sequence:
>1530_bases ATGAGCATATCATATCGCGGAAAATATTTTAGGATTTACATTTGGCAAGGATTATCCATAATTTTAGGTTTTCTTTCGCT TTTTATTGTGATGCCTTCACTTTCTGGAAATAAAACACTCTTTGGTATTTACAGTGTTTGTACGTCTCTGACTATATTCT TTTCGTATGCTGATTTAGGTTTTATTTCATCGGGATTGAAATATGCAGCGGAATATTATATTCGTGGTGACCGAAAGAAT GAAATTCGTACGATAGGTTTTACTGCATTTATTATGCTTAGCATGTTTATGCTGATAGCTTTGCTATTTGGAATAATCAG CATATTCCCTCAAATTCTCATGCCTGAATTGGAACCAGATAGTGAAAATTTTTATACGGCACGTTATTTGCTGATTCTGT TGTCTGTTTCCTGTCCGGTAATCATTGGCCAACGAATTCTTAATATGATTTATTCCATACGTGTAGAAGATTATAAATTA CAGCGTATCTCTGCGGTAGGCAGTATTCTGAAGATTTTATCAGTTTTCTTTTTTTTTGGAAGTGAAAATTATTTGTTGGT ACCTTATTTTGCATTCGTGCAGTTTATCAACCTATCCGTAGTATTGATGGCAGCTTTTCAGGTCCGAAAGTATCAATATT CATTTGTGGAATTTCTTAAAGCTATCCGTTTTGACCGTATTATCTTTGATAAAGAAAAGGGCTTGACGGGAGCTTCATTT ATATCTATACTTTCTTGGGTGTTGTTCTATGAATTTGATCAAATCGCGATTTCAAATTTTGTTGGTCTGGAGGCAGTAGC AGTTTATGGCATAGCTTTTTCTGCATTGACCTTTGTACGAACCTTTGTGTCATTACTTTATTCACCTTATTCATCGCGAT ATAATCATTTGATTGGTGAAAATGACAGGGTAGGACTGATGAAATTTGTGAATCGGATGTTATTAATGCTCTCGCCAATG GTAGTTCTGCCCATTGTTGGATTGTCTATGCTGAGTGAACCATTTATTATAAGTTGGGTTGGATTCAATTATGAGGAATC CAGTTCTATTTTATCACTTTTGGTGTTTTGTTTCTTTCCTTGCTTTCTCTCAAACCCTAGTTCTTCTTATTTTATTGCAA TTGAAAAAACTACTTTACTTAATAGGTTTAATATATTTCAACCTATACTATACTGGTTATTAATTTTTTTTACTGTTGGT AAATGGGGCGTATTTTCGTTCGCTATATCTAAAGGATTGATTCCTATATTTTTGGGTATTCTTTATTGGTATTCATTATA CAGAGATTTTGCAAAGAATGCTGGTCAGATAGTTTCACTATTCCTAATTTTGAAAACTTTGTTTTTACCTTTAATTGTAC TATTAGTATTAAGTACTCTTGTAAAGCCTTATATGGCTTATGAATATAATAAGATTTCCCTTTGTTATAATTTATTGGTT ATGGGATTGATTGTTTTAATATCAATTCTAGTATCAGTGTGTTGTAATAGAGAAATGTATTCATTGGTGAAGTCAATTAT TAGACGTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAAATATTGAGGATGCAATGACCGAGGGCTATCGGTTGAGAAACTATTTCTTTACCAAACTAGAGCCTCAGTTAATTTTC CAACTTTTCACTTGATACCT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAGAAAGGAATTATGGAAAACGAAACCATTTAGAGATTATGATAATATCAAAAATGAAAAAAATGTTTAGACTATTGTT TACGTCTGAAATCAGTAGCT
Product: putative lipopolysaccharide biosynthesis related polysaccharide transporter/flippase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 509; Mature: 508
Protein sequence:
>509_residues MSISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLGFISSGLKYAAEYYIRGDRKN EIRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPDSENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKL QRISAVGSILKILSVFFFFGSENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASF ISILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGENDRVGLMKFVNRMLLMLSPM VVLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFPCFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVG KWGVFSFAISKGLIPIFLGILYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLV MGLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR
Sequences:
>Translated_509_residues MSISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLGFISSGLKYAAEYYIRGDRKN EIRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPDSENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKL QRISAVGSILKILSVFFFFGSENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASF ISILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGENDRVGLMKFVNRMLLMLSPM VVLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFPCFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVG KWGVFSFAISKGLIPIFLGILYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLV MGLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR >Mature_508_residues SISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLGFISSGLKYAAEYYIRGDRKNE IRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPDSENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKLQ RISAVGSILKILSVFFFFGSENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASFI SILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGENDRVGLMKFVNRMLLMLSPMV VLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFPCFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVGK WGVFSFAISKGLIPIFLGILYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLVM GLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 58466; Mature: 58335
Theoretical pI: Translated: 9.39; Mature: 9.39
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 3.1 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 3.0 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLG CCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISSGLKYAAEYYIRGDRKNEIRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKLQRISAVGSILKILSVFFFFG CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASF CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHH ISILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NDRVGLMKFVNRMLLMLSPMVVLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFP CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH CFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVGKWGVFSFAISKGLIPIFLGI HHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLV HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH MGLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure SISYRGKYFRIYIWQGLSIILGFLSLFIVMPSLSGNKTLFGIYSVCTSLTIFFSYADLG CCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FISSGLKYAAEYYIRGDRKNEIRTIGFTAFIMLSMFMLIALLFGIISIFPQILMPELEPD HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC SENFYTARYLLILLSVSCPVIIGQRILNMIYSIRVEDYKLQRISAVGSILKILSVFFFFG CCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC SENYLLVPYFAFVQFINLSVVLMAAFQVRKYQYSFVEFLKAIRFDRIIFDKEKGLTGASF CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHH ISILSWVLFYEFDQIAISNFVGLEAVAVYGIAFSALTFVRTFVSLLYSPYSSRYNHLIGE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC NDRVGLMKFVNRMLLMLSPMVVLPIVGLSMLSEPFIISWVGFNYEESSSILSLLVFCFFP CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH CFLSNPSSSYFIAIEKTTLLNRFNIFQPILYWLLIFFTVGKWGVFSFAISKGLIPIFLGI HHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHH LYWYSLYRDFAKNAGQIVSLFLILKTLFLPLIVLLVLSTLVKPYMAYEYNKISLCYNLLV HHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH MGLIVLISILVSVCCNREMYSLVKSIIRR HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA