| Definition | Haemophilus influenzae PittEE chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009566 |
| Length | 1,813,033 |
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The map label for this gene is glnD [H]
Identifier: 148825740
GI number: 148825740
Start: 698798
End: 701389
Strand: Direct
Name: glnD [H]
Synonym: CGSHiEE_03445
Alternate gene names: 148825740
Gene position: 698798-701389 (Clockwise)
Preceding gene: 148825739
Following gene: 148825741
Centisome position: 38.54
GC content: 38.77
Gene sequence:
>2592_bases ATGCTGTTTCCTTTGTCATTATCTTCTCCTTTAACGCCAAGTGCGGTCAAAATTGAGCGAGAAAATCTCAAGCAATTTGA GCTAGAGAATTTTTCTCGTTATTCCATTTTTGAGCTGGTTGAAAATCGCAGTGATTTTTATGACGCTTTATTGATTCAAC TTTGGCAGGAAATGGGATTAAGTGAACAACTGGGAATTTCTTTAATTGCGGTGGGCGGTTATGGACGGCGTGAGATGTTT CCTTTGTCGGATTTAGATTTTTTAATTTTGGTCGAGCAAACCCCAATCCCAGAAATTGAAGAAAAGATTACCCAATTTAT CCAATTTTTATGGGATTGTGGTTTTGAGGTGGGACATAGTGTTCGAACCTTACAACAATGCGAATCGGAAGGAAAACAAG ATATTACGATTGCCACTAATTTATTAGAAGCCAGATTTCTCATTGGAAATCGACCGCACTTTGATGCACTAAATGAATTG GTAAAACGTGCTGATTTTTGGTCGAAAGAAGGTTTTTTTAATGCCAAAGTGCAAGAGCAAATAGAACGTTATCAGCGTTA TCACAATACGGCTTATAACCTTGAGCCAGATATTAAGTACAGCCCCGGTGGCTTGCGTGATTTGCATTTGTTGTATTGGG TGGCGTTGCACCATTCGGGGGCGCAGACTCTTGAGGACATTTTACAAAGTGGTTTTATTTATCCTCAAGAATATCAGCAA CTACAAGAAAGTCGTGCATTTTTATTTAAAGTGCGGTTTGCTTTGCATTTGATTTTGACACGTTACGATAATCGTCTGTT GTTTGATCGCCAAATTAAAGTCAGTGAATTGTTGGGTTTTCGAGGGGAAGGCAATCAAGCTGTAGAAAAAATGATGAAAT GTTTTTTCCAAGCATTGCACCGCATTTCGCTGATTAGTAATTTGTTGATTCAGCATTATCGAGAAAATGTGCTTTCATCA AATCAGGCTACTGTGATTGAGCAGTTAGACGATGATTTCCAACTGATTAACCAATGCTTATGTTTGCGTAATAGCCTTGT TTTTCAAGAAAAACCAGCGCGAATTTTAGATCTATTCTTTTATTTAACGCAGTACGAACAGGCTAATATTCATTCTGATA CCTTGCGTCAATTACAAATTTCCTTAGAGCAATTACCACAAAAATTATGTGAAATTCCTGAGGCTCGAGAAAAATTTCTA CGTTTGTTTAATCAACCTAATTCGATTAAGCGTGCGTTTATGCCGATGCACCAATATGGCGTATTAACGGCGTATCTTCC GCAATGGCAAGCCATTGAGGGCTTAATGCAATTTGATTTGTTCCATATTTATACGGTGGATGAGCATACATTGCGCGTGA TGTTGAAATTGGAAAGTTTTCTGTCACAGGAAAGTGCGCAAGAACATCCCATTGCCCATCGAATTTTTAGCCAACTTTCT GACCGCACTTTGCTTTATATTGCGGCGTTGTTCCACGATATTGCAAAAGGGCGGGGCGGCGATCACGCAGAACTTGGCGC AAAAGATGTAGCAAATTTTGCGCGATTACATGGTTTAGATCGTCGAGAAATTGATACCCTTGCTTGGCTAGTCCAATCTC ATTTGCTGATGTCAATTACTGCGCAACGCCGTGATATTCATGATCCTGAAGTCGTCATGAATTTTGCGGAAGCCGTGCAA AATCAAGTTCGATTAGATTATCTCACTTGTTTAACGGTGGCGGATATTTGTGCAACCAATGGTAATTTATGGAATAGCTG GAAACGTTCGCTTTTTGCCTCTTTATATGAATTTACCGAACAACAATTTGCACAAGGCATGAAAGAATTGCTTGATTATT CAGAAAAATCGGCAGAAAACCGAAAACTTGCACAACAAATTTTAACGCAGGATTATTCTGATATTATGCCAATTTCGATT GACCAATTATGGGAGCGTTGCCCTGAAGATTATTTTGTGCGTAATACGCCAAAACAAATCGCATGGCATACAAGTTTGCT GGTGGATTTAGTTGAGGCATTATTAGTGAAAATTAGTAATCGCTTTTCACTTGGTGGCACGGAAGTGTTTATTTATTGCC AAGATCAACCGCACTTATTTAATAAAGTCGTGAGTACCATTGGAGCAAAAAAATTCAGTATCCACGATGCACAGATTATT ACAACACAAGATGGTTATGTTTTTGATAGCTTTATCATCACAGAACTTAATGGAGAATTAGTGGAATTTGATCGTCGCCG AGAATTAGAGCAAGCCCTCACATTAGCCCTTCAAAGTGAAAAATTATCCGCACTTTCTATTACGCCGAATCGTCAGCTTC AACATTTTACTGTACAAACCGACGTGCGTTTTTTACACGAAAACAAAAAAGAGCATACTGAAATGGAACTGGTTGCCTTG GATAAAGCAGGGTTATTAGCCCAAGTGAGCCAGATTTTCAGTGAGTTAAATCTCAATTTATTGAATGCAAAAATTACCAC AGTGGGCGAGAAAGCCGAGGATTTTTTTATTTTGACGAACCAATTTGGGCAAGCTCTGGATTCTCAACAAAGAGAAATAT TACGTAACGTGCTGTATCGAAATATTGGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTGTAATTGACATTAAATTATAAGCAAGGGCGTAGATATACGCCCTTTTTGTTTTTCTTTATAATAAAGCCACTTCTA ACCACTAAAGGGCAATCAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases TCCTTTTTATAAAAATATATTTCTAGGTAAATTTGCCTTATGTTATCCTTTACAAAAAATTTTAGGGTCACACTATGCTG AGTATTTTTGTTACTTTTCT
Product: PII uridylyl-transferase
Products: NA
Alternate protein names: PII uridylyl-transferase; UTase; Uridylyl-removing enzyme [H]
Number of amino acids: Translated: 863; Mature: 863
Protein sequence:
>863_residues MLFPLSLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSRYSIFELVENRSDFYDALLIQLWQEMGLSEQLGISLIAVGGYGRREMF PLSDLDFLILVEQTPIPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGHSVRTLQQCESEGKQDITIATNLLEARFLIGNRPHFDALNEL VKRADFWSKEGFFNAKVQEQIERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALHHSGAQTLEDILQSGFIYPQEYQQ LQESRAFLFKVRFALHLILTRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNQAVEKMMKCFFQALHRISLISNLLIQHYRENVLSS NQATVIEQLDDDFQLINQCLCLRNSLVFQEKPARILDLFFYLTQYEQANIHSDTLRQLQISLEQLPQKLCEIPEAREKFL RLFNQPNSIKRAFMPMHQYGVLTAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLS DRTLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAKDVANFARLHGLDRREIDTLAWLVQSHLLMSITAQRRDIHDPEVVMNFAEAVQ NQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTEQQFAQGMKELLDYSEKSAENRKLAQQILTQDYSDIMPISI DQLWERCPEDYFVRNTPKQIAWHTSLLVDLVEALLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQII TTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTLALQSEKLSALSITPNRQLQHFTVQTDVRFLHENKKEHTEMELVAL DKAGLLAQVSQIFSELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTNQFGQALDSQQREILRNVLYRNIG
Sequences:
>Translated_863_residues MLFPLSLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSRYSIFELVENRSDFYDALLIQLWQEMGLSEQLGISLIAVGGYGRREMF PLSDLDFLILVEQTPIPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGHSVRTLQQCESEGKQDITIATNLLEARFLIGNRPHFDALNEL VKRADFWSKEGFFNAKVQEQIERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALHHSGAQTLEDILQSGFIYPQEYQQ LQESRAFLFKVRFALHLILTRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNQAVEKMMKCFFQALHRISLISNLLIQHYRENVLSS NQATVIEQLDDDFQLINQCLCLRNSLVFQEKPARILDLFFYLTQYEQANIHSDTLRQLQISLEQLPQKLCEIPEAREKFL RLFNQPNSIKRAFMPMHQYGVLTAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLS DRTLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAKDVANFARLHGLDRREIDTLAWLVQSHLLMSITAQRRDIHDPEVVMNFAEAVQ NQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTEQQFAQGMKELLDYSEKSAENRKLAQQILTQDYSDIMPISI DQLWERCPEDYFVRNTPKQIAWHTSLLVDLVEALLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQII TTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTLALQSEKLSALSITPNRQLQHFTVQTDVRFLHENKKEHTEMELVAL DKAGLLAQVSQIFSELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTNQFGQALDSQQREILRNVLYRNIG >Mature_863_residues MLFPLSLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSRYSIFELVENRSDFYDALLIQLWQEMGLSEQLGISLIAVGGYGRREMF PLSDLDFLILVEQTPIPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGHSVRTLQQCESEGKQDITIATNLLEARFLIGNRPHFDALNEL VKRADFWSKEGFFNAKVQEQIERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALHHSGAQTLEDILQSGFIYPQEYQQ LQESRAFLFKVRFALHLILTRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNQAVEKMMKCFFQALHRISLISNLLIQHYRENVLSS NQATVIEQLDDDFQLINQCLCLRNSLVFQEKPARILDLFFYLTQYEQANIHSDTLRQLQISLEQLPQKLCEIPEAREKFL RLFNQPNSIKRAFMPMHQYGVLTAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLS DRTLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAKDVANFARLHGLDRREIDTLAWLVQSHLLMSITAQRRDIHDPEVVMNFAEAVQ NQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTEQQFAQGMKELLDYSEKSAENRKLAQQILTQDYSDIMPISI DQLWERCPEDYFVRNTPKQIAWHTSLLVDLVEALLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQII TTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTLALQSEKLSALSITPNRQLQHFTVQTDVRFLHENKKEHTEMELVAL DKAGLLAQVSQIFSELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTNQFGQALDSQQREILRNVLYRNIG
Specific function: Modifies, by uridylylation or deuridylylation the PII (glnB) regulatory protein [H]
COG id: COG2844
COG function: function code O; UTP:GlnB (protein PII) uridylyltransferase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the glnD family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786363, Length=855, Percent_Identity=46.6666666666667, Blast_Score=774, Evalue=0.0,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002912 - InterPro: IPR010043 - InterPro: IPR003607 - InterPro: IPR002934 - InterPro: IPR013546 [H]
Pfam domain/function: PF01842 ACT; PF08335 GlnD_UR_UTase; PF01909 NTP_transf_2 [H]
EC number: =2.7.7.59 [H]
Molecular weight: Translated: 100199; Mature: 100199
Theoretical pI: Translated: 5.31; Mature: 5.31
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLFPLSLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSRYSIFELVENRSDFYDALLIQLWQEMGL CEECCCCCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCC SEQLGISLIAVGGYGRREMFPLSDLDFLILVEQTPIPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGHS CHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH VRTLQQCESEGKQDITIATNLLEARFLIGNRPHFDALNELVKRADFWSKEGFFNAKVQEQ HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH IERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALHHSGAQTLEDILQSGFIYPQEYQQ HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH LQESRAFLFKVRFALHLILTRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNQAVEKMMKCFFQALH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RISLISNLLIQHYRENVLSSNQATVIEQLDDDFQLINQCLCLRNSLVFQEKPARILDLFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH YLTQYEQANIHSDTLRQLQISLEQLPQKLCEIPEAREKFLRLFNQPNSIKRAFMPMHQYG HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH VLTAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLS HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCHHHHHHHHHHC DRTLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAKDVANFARLHGLDRREIDTLAWLVQSHLLMSIT CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQRRDIHDPEVVMNFAEAVQNQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTE HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQFAQGMKELLDYSEKSAENRKLAQQILTQDYSDIMPISIDQLWERCPEDYFVRNTPKQI HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCEECCCCHHH AWHTSLLVDLVEALLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEE TTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTLALQSEKLSALSITPNRQLQHFTVQT EECCCEEEHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEHHH DVRFLHENKKEHTEMELVALDKAGLLAQVSQIFSELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTN HHHHHHCCCHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEECCCCCCCEEEEHH QFGQALDSQQREILRNVLYRNIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MLFPLSLSSPLTPSAVKIERENLKQFELENFSRYSIFELVENRSDFYDALLIQLWQEMGL CEECCCCCCCCCCCHHEEEHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCC SEQLGISLIAVGGYGRREMFPLSDLDFLILVEQTPIPEIEEKITQFIQFLWDCGFEVGHS CHHCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH VRTLQQCESEGKQDITIATNLLEARFLIGNRPHFDALNELVKRADFWSKEGFFNAKVQEQ HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHH IERYQRYHNTAYNLEPDIKYSPGGLRDLHLLYWVALHHSGAQTLEDILQSGFIYPQEYQQ HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH LQESRAFLFKVRFALHLILTRYDNRLLFDRQIKVSELLGFRGEGNQAVEKMMKCFFQALH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH RISLISNLLIQHYRENVLSSNQATVIEQLDDDFQLINQCLCLRNSLVFQEKPARILDLFF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH YLTQYEQANIHSDTLRQLQISLEQLPQKLCEIPEAREKFLRLFNQPNSIKRAFMPMHQYG HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH VLTAYLPQWQAIEGLMQFDLFHIYTVDEHTLRVMLKLESFLSQESAQEHPIAHRIFSQLS HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHCCHHHHHHHHHHC DRTLLYIAALFHDIAKGRGGDHAELGAKDVANFARLHGLDRREIDTLAWLVQSHLLMSIT CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AQRRDIHDPEVVMNFAEAVQNQVRLDYLTCLTVADICATNGNLWNSWKRSLFASLYEFTE HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH QQFAQGMKELLDYSEKSAENRKLAQQILTQDYSDIMPISIDQLWERCPEDYFVRNTPKQI HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCCHHHHHHHCCCCCEECCCCHHH AWHTSLLVDLVEALLVKISNRFSLGGTEVFIYCQDQPHLFNKVVSTIGAKKFSIHDAQII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEE TTQDGYVFDSFIITELNGELVEFDRRRELEQALTLALQSEKLSALSITPNRQLQHFTVQT EECCCEEEHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEHHH DVRFLHENKKEHTEMELVALDKAGLLAQVSQIFSELNLNLLNAKITTVGEKAEDFFILTN HHHHHHCCCHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEECCCCCCCEEEEHH QFGQALDSQQREILRNVLYRNIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA