Definition Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome.
Accession NC_009495
Length 3,886,916

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The map label for this gene is 148380924

Identifier: 148380924

GI number: 148380924

Start: 3165491

End: 3167005

Strand: Reverse

Name: 148380924

Synonym: CBO2972

Alternate gene names: NA

Gene position: 3167005-3165491 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148380925

Following gene: 148380923

Centisome position: 81.48

GC content: 31.35

Gene sequence:

>1515_bases
TTGAAGGAATTAGTTTCTAAATTAAAAGAAGTATCATATGCTGTTCTTCCAATTATAGTTATAGTATTGATACTAAATTT
TACTTTGACGCCTCTTAGCATGACATTAATTTCAAGGTTCCTTATTGGAGCAGGTCTGATTATTATAGGATTATCCATTT
TTTTATTTGGAGTAGATATTGGAATTACTCCTATTGGTAATTTTATGGGATCAATCATAGCAAAGACAAATAAAATATGG
AAGATAGTTATTTCAGGTTTAATACTTGGATTTATTATCTCAATTGCTGAACCGGATTTACACATTTTGGCGGGGCAAGT
TGATTTTGTTACGACTGGTTTAATATCGAAGTTGAGTATTGTTATTGTTGTATCTATTGGAATTGGAATAATGCTTTCTT
TAGGTCTTGCGAGAATTGTTCGTGGCACACCATTAAAAAAAATGTTAACAATTTTGTACTCTTTTATTTGTATACTTGCA
ATATTTACGTCAAAAGAGTTTTTAGCAATATCTTTTGATGCTTCTGGCGCCACTACTGGTGCGATGACAGTTCCATTTAT
TCTAGCTCTTGCAATGGGAGTTGCTATGTTAAAAAAAGGTGATAAAAATTCAGAGGAAGATAGTTTTGGACTAGTTGCCA
TAGCATCTACTGGTGCAATAATATCGGTTATGATTATGAATATTATTTCAAAAACTGATAAAATAACAGGGAGTCTTGAG
TACCATGAATCAATGTCATCATCAATTATTAGTCCTTTCATTGAAAAAATCCCAACAATAGCTGGAGAAGCTTTTTTAGC
ATTGATACCTATATTACTTATTTTTCTTGTGTTTCAAAAAGTTTCAATTAATCTATCTAAAAAGGATTTCAACAAAATTC
TAATTGGGCTTTTATTTACATTTATAGGATTAATTTTATTCTTAGTTGGTGTTAATGCTGGGTTTATGGACGTAGGAAGT
GCTATTGGATATGAAATAGCATCTCTAGATAGTAAAGCTTACGTTATTATTATAGGATTTATTTTGGGAGTTGTTACAAT
ATTTGCTGAGCCAGCTGTTTATGTATTAATGCATCAGATAGAAGAAGTTACAAGTGGACATGTAAATAGAAAAGCAGTAA
TGTTTACACTTTCTATAGGGGTTGGACTTGCAGTTGCTTTATCTATGTTAAGAATACTTATTCCTCAAATTCAATTGTGG
CATTATCTATTGCCTGGTTATCTAATTTCTGTAATAATGACTTATTTTGTACCAAATTTATTTGTGGGAATTGCATTTGA
TTCAGGAGGAGTTGCATCTGGACCAATGACAGCAACTTTTATATTAGCATTCGCACAAGGTGTTGCCGAATCAATAGAAG
GGGCAAATGTATTAGTAGATGGGTTTGGAGTAATTGCAATGGTAGCCTTAACTCCTTTAATTGCTTTACAGGTTTTAGGT
TTTATTTTTAAAATAAAGTCTGAAAAGGAAGATGCTAAAAATATTGAATCATCTCAAGAATGTATCTCATCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTAAAGAGCACAGATCATTATTCAAATCTTTATTTTAAAATTATATTCGCAATATTAATATTAGTGTAAAAATAGTTGA
TAGAAAGGATGTATTATATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATTGTTTTTTAGCTTAAGTTTAAGACACATATAAGTTTTAAGTAATGATATTTAAAAGTAATTTAGCATAGGTATAATA
ATAGTTACAGGTGCTTATAA

Product: membrane protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 504; Mature: 504

Protein sequence:

>504_residues
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW
KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA
IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFIGLILFLVGVNAGFMDVGS
AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW
HYLLPGYLISVIMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS

Sequences:

>Translated_504_residues
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW
KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA
IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFIGLILFLVGVNAGFMDVGS
AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW
HYLLPGYLISVIMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS
>Mature_504_residues
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDIGITPIGNFMGSIIAKTNKIW
KIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSIVIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILA
IFTSKEFLAISFDASGATTGAMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFTFIGLILFLVGVNAGFMDVGS
AIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQIEEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLW
HYLLPGYLISVIMTYFVPNLFVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53845; Mature: 53845

Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GITPIGNFMGSIIAKTNKIWKIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
VIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILAIFTSKEFLAISFDASGATTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
AMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FIGLILFLVGVNAGFMDVGSAIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
EEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLWHYLLPGYLISVIMTYFVPNL
HHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
HEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS
HHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKELVSKLKEVSYAVLPIIVIVLILNFTLTPLSMTLISRFLIGAGLIIIGLSIFLFGVDI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
GITPIGNFMGSIIAKTNKIWKIVISGLILGFIISIAEPDLHILAGQVDFVTTGLISKLSI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHH
VIVVSIGIGIMLSLGLARIVRGTPLKKMLTILYSFICILAIFTSKEFLAISFDASGATTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCC
AMTVPFILALAMGVAMLKKGDKNSEEDSFGLVAIASTGAIISVMIMNIISKTDKITGSLE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
YHESMSSSIISPFIEKIPTIAGEAFLALIPILLIFLVFQKVSINLSKKDFNKILIGLLFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FIGLILFLVGVNAGFMDVGSAIGYEIASLDSKAYVIIIGFILGVVTIFAEPAVYVLMHQI
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHH
EEVTSGHVNRKAVMFTLSIGVGLAVALSMLRILIPQIQLWHYLLPGYLISVIMTYFVPNL
HHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVGIAFDSGGVASGPMTATFILAFAQGVAESIEGANVLVDGFGVIAMVALTPLIALQVLG
HEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIFKIKSEKEDAKNIESSQECISS
HHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA