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The map label for this gene is 148358957

Identifier: 148358957

GI number: 148358957

Start: 1640575

End: 1643226

Strand: Direct

Name: 148358957

Synonym: LPC_0842

Alternate gene names: NA

Gene position: 1640575-1643226 (Clockwise)

Preceding gene: 148358956

Following gene: 148358958

Centisome position: 45.87

GC content: 34.84

Gene sequence:

>2652_bases
ATGACCCCACAGCACGTCATAAGTCAACTGCTGGAATCTGACACCAAATACCCTCAGAATTTAGATTTATTAAAAAAAAT
AATCATATCAGCTTATCTGGGACGCCTCAGAATTAATGGATTACCTCCAGATAACAAGATTGCACTTGGAAATTATTTAT
TTGATGATGAACGTATGATTTTTGATTTCACTCGATTGAGTGATTCAAAAAGAGCTTTATTTATTGAATGGTTGCTTGAG
TCTCATCAAAAAGATAAAGAGCATGGTTTTTTAAGTGGCGTTTACGTGAATGAATATCGAGGTTTCACTGCGGAGGTTGC
TTTAAGCTGGTGGGGTATCTTAAAAAACTGGTTATTTAATAATAAATCTGAGCATTGGAAAATAACGGATTTGGGACTTT
CTGTCAATTATCAGTTGACTGGTATTGAAATGTGTCATGGAAAGCAGGGTATCTTAATTGGATTTAACCAGTTTTTAGTA
CCACCTTCAGGTACAAAATACAGAGATCCTAATGATAACCAAAGTGAGCCATTAGGTAATGTTAAAAGAGTATTCATTAC
TGATAAACTGGTTGATGAACTTGTTGGACTCAATTATAAAAATCTTAATTATGAGTCTGTCTGTAAAAGCCCTCATCCGC
AATCTATTGATGTAACTGATCCAGAAGCTCGTCATAAAGACATGTATGATTATAGAAAAATGCAACGTTTCAATGGTGTG
AGGCCTTGGTATATCAGACTTTGGAGATGGATATCTAAACTATTTTTTGGCGATACATACGACGCTAAAAAAACAAGCAC
TGCAGACGACAATTTGGAATTACTTTATAAAACTAAAACTGTCAAAATTTATCAGCGCTCCAAATCAAAAGAGATCTTGG
TCACAGAGAAGCGACCTGATATTACTAATTTGGTTTTTTGTGGAGGTGGGGCAAAAATTTTTGCTCACGTGGGGGTTTGG
AAGGCTCTCAATGAAGCAGGAATGAAGCCAACCAAATTTGCAGGAAGCTCTGCCGGTGCAATCATGTCTTTGATGTGCTA
CCTAGGTTATACTGCTGATGAAATTAGTGAACTTTTCCAGCATTTTAAACAAGAGCATTTAGTTCAATTTGATATAGACA
GAAATGGATTATCGGATACCCATTCCTTAAAAACGGCGCTGGATTATGCTATCGCAAATAAAGTAAGGCAAATAGTAAAT
AAATATAAAATTCCATATCCTAAGGGAAAAATAACTTTTAGTACTTTAGCTTCTCTAAGAGAGCAATTTCCAGATTGTGG
AATAGGCAAAGAATTAATTGTTACAGCAACAAATAAACGCTCAGGAAAAACTATTTATTTATCAGCAAATCGTTACCCAT
TATTGGAGGTCAGTGAAGCAGTTAAAATTTCTGCGAGCTTTCCAGTTTTGTATAGAGATACTCTGCTGGATGGTGAAGAG
CATAATGATGGTGGAATATTAAGTAATTTTCCAACCGAAGTTTTTTTTGATGACCACTCAACGCTGTTGGAGTCTGAATT
TGGTAATAATTTAAAAGTATTGGCAGTTCAATTTGATAATGGGATTGAAAGAAATGTTATTGATAGAATAATGGACAAAG
TTTATCGAGAGAATTTCGTTCTTAACTGGATTTATAGCTTACTGACTGGAGTGAGTGATCCTGCAAGTGGATGGGAAAGA
GACCGCCTTAAATTAAGACAATATGCTCTTCAAACTATAATTCCTGAAACAGGGAAAGTATCAACAACAGGATTTAATGT
AGAGAGGCAGAGCCAGGAGGAGTTGATCCAAAATGGTTATCAATCAACTCTGGATTATCTTAATGTAAGATATACTAGAA
AAAACAACAGCTATGTTAACAAGGAAATAATGTATTCTACTTTCAATTCTTTGGGAGATTTGCTTGCTTACTGTTGTTAC
AGGGGAGATGAACAATGGTTTAATGTTGTTAATAATCTAATTGTGCAATCTACCTTACCTAATCGTACTGCTTTAATGAA
ACAATCCCTTGAACTTAGAAAACTTTATTTTAATACGTCTCTACCATCTAACCCTGAAAAGAATAAAACAGCTTGTAATG
AAAGCAATACTTTAACTTTTTTTGGTAATGCGGTTTGTCAGCATCATAATCACAGCCAGGAACTTGAAAATGGAAACCAT
GATGTCTTATTGGCGCTCTATCCAATTTTTTTAAAACTATCTACTGATTTATTAATAAATAAAATTGATAAGAACCTATT
AGACCGTGCACGTCATTCACTAAATATACACTCTCCCTTTGATTGTCTTGAGCATTTTAATAAAATTTCAGGAAATGCTC
ATGTTATGATTCATATCATCGTTAAATTAATTAAAGAGCTCAAAGAAAGATCATGCCAACAAATTTATGATGTATTAAAA
GAGGTTAGGCATTTATTGTATAGCGATATTAATCTTATGAAAGCAAATTATTTTGGCAAATGGGATTTAAGTCTCCCTCA
ATGTATACGGATCTTGAATTTGTTAAAACAGGAAAAGCATGACGATGTATCTCGGCAATTGGATTGCCTACGTAACCAAA
TGGAGCCTGTGCAAACAGTAAAAGGAGGAGTGCATCATGATGACCTTAATAACGGGGGCCACGAGAGGTATAGGCTTGGC
CTTGGCGTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATGATAATTGTTATAAAGATGATTAATAAATATTTAAAAATAATCAATATTATTTCAGATATTTATTCTATGGACTAC
CCAGACGTAAGGATTTACTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTTGCATCACATGGCCATGATTTAATACTTATTGGTAGAGATTCTGAACAGCTGGAGCACATTTCAAAGCAATTAAATA
CACAATATCAAGTTAATGTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Patatin; Phospholipase Patatin Family; Esterase; Alpha-Beta Hydrolase Superfamily Esterase; Phospholipase; Esterase Of Alpha/Beta Hydrolase Superfamily Protein

Number of amino acids: Translated: 883; Mature: 882

Protein sequence:

>883_residues
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLE
SHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLV
PPSGTKYRDPNDNQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVW
KALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVN
KYKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWER
DRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCY
RGDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTSLPSNPEKNKTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERSCQQIYDVLK
EVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLG
LGV

Sequences:

>Translated_883_residues
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLE
SHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLV
PPSGTKYRDPNDNQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVW
KALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVN
KYKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWER
DRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCY
RGDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTSLPSNPEKNKTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERSCQQIYDVLK
EVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLG
LGV
>Mature_882_residues
TPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMIFDFTRLSDSKRALFIEWLLES
HQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFNNKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLVP
PSGTKYRDPNDNQSEPLGNVKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGVR
PWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPDITNLVFCGGGAKIFAHVGVWK
ALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQHFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNK
YKIPYPKGKITFSTLASLREQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEEH
NDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFVLNWIYSLLTGVSDPASGWERD
RLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGYQSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYR
GDEQWFNVVNNLIVQSTLPNRTALMKQSLELRKLYFNTSLPSNPEKNKTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNHD
VLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHIIVKLIKELKERSCQQIYDVLKE
VRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKHDDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGL
GV

Specific function: Unknown

COG id: COG1752

COG function: function code R; Predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101614; Mature: 101483

Theoretical pI: Translated: 8.12; Mature: 8.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMI
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECCEEECCCCEE
FDFTRLSDSKRALFIEWLLESHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFN
EEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLVPPSGTKYRDPNDNQSEPLGN
CCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
HHEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPD
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCC
ITNLVFCGGGAKIFAHVGVWKALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQ
CCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
HFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNKYKIPYPKGKITFSTLASLR
HHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHH
EQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEECCCHHEEECCCCEEEHHHHCCCCC
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFV
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNWIYSLLTGVSDPASGWERDRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGY
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCHH
QSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYRGDEQWFNVVNNLIVQSTLP
HHHHHHHEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
NRTALMKQSLELRKLYFNTSLPSNPEKNKTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHCCCCHHHHCCCCC
DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHII
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VKLIKELKERSCQQIYDVLKEVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHC
DDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGLGV
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCC
>Mature Secondary Structure 
TPQHVISQLLESDTKYPQNLDLLKKIIISAYLGRLRINGLPPDNKIALGNYLFDDERMI
CHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCEEECCEEECCCCEE
FDFTRLSDSKRALFIEWLLESHQKDKEHGFLSGVYVNEYRGFTAEVALSWWGILKNWLFN
EEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NKSEHWKITDLGLSVNYQLTGIEMCHGKQGILIGFNQFLVPPSGTKYRDPNDNQSEPLGN
CCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
VKRVFITDKLVDELVGLNYKNLNYESVCKSPHPQSIDVTDPEARHKDMYDYRKMQRFNGV
HHEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RPWYIRLWRWISKLFFGDTYDAKKTSTADDNLELLYKTKTVKIYQRSKSKEILVTEKRPD
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCC
ITNLVFCGGGAKIFAHVGVWKALNEAGMKPTKFAGSSAGAIMSLMCYLGYTADEISELFQ
CCEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
HFKQEHLVQFDIDRNGLSDTHSLKTALDYAIANKVRQIVNKYKIPYPKGKITFSTLASLR
HHHHCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHH
EQFPDCGIGKELIVTATNKRSGKTIYLSANRYPLLEVSEAVKISASFPVLYRDTLLDGEE
HHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEECCCHHEEECCCCEEEHHHHCCCCC
HNDGGILSNFPTEVFFDDHSTLLESEFGNNLKVLAVQFDNGIERNVIDRIMDKVYRENFV
CCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNWIYSLLTGVSDPASGWERDRLKLRQYALQTIIPETGKVSTTGFNVERQSQEELIQNGY
HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCHH
QSTLDYLNVRYTRKNNSYVNKEIMYSTFNSLGDLLAYCCYRGDEQWFNVVNNLIVQSTLP
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NRTALMKQSLELRKLYFNTSLPSNPEKNKTACNESNTLTFFGNAVCQHHNHSQELENGNH
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHCCCCHHHHCCCCC
DVLLALYPIFLKLSTDLLINKIDKNLLDRARHSLNIHSPFDCLEHFNKISGNAHVMIHII
CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
VKLIKELKERSCQQIYDVLKEVRHLLYSDINLMKANYFGKWDLSLPQCIRILNLLKQEKH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHC
DDVSRQLDCLRNQMEPVQTVKGGVHHDDLNNGGHERYRLGLGV
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA