Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is pkn5

Identifier: 148358417

GI number: 148358417

Start: 295371

End: 298256

Strand: Direct

Name: pkn5

Synonym: LPC_0283

Alternate gene names: NA

Gene position: 295371-298256 (Clockwise)

Preceding gene: 148358415

Following gene: 148358418

Centisome position: 8.26

GC content: 38.63

Gene sequence:

>2886_bases
ATGAAATTGCTTCGGTCTCATGAATTAAAATCATTGCCAAGCATGGACGAGAAAGCATTGGAATTGTTGATAAAGGTTTT
AAGCAACAAAGGCATTAGAAAACTAATAAAATCTGCCGACGGCAAGCCTATATCACGTGAAATAATGATTCGTGAGTTTG
GAATAGATTGTCAAATTCTATTTATTACCACCGAGGAATCTCTTAAGCCAATCATTGTTCCCACTGAAAACAAGATTTCA
GGAGGTGGTAAATCTTATTGCGAGCAATTTAAAGTTTATGCTTTGGATGATGGAAAAACTTATTTCCTAAAATCCGTTAA
GATCGATCCTGAAAGCTTGATAGAGTTTACCAATGAGAAAGACACCTTAAGCAAATTGGGTCGCTTGGTAGGAACTTTTT
TTAATGAGCAAACCCAGGTGCATTATATTCTCACAACTTTTATAAAAGGGATTGATTTATCCCGGTATAAAAACTCACTT
CCTCTTAGTGTTAATCTAAAACATTTTTGGGAAGTTCTCGGCATTATGATTTCTGTATGCCATCAGGTGAAACAATTCCA
TGAATTAGGCTTAATTCACCGCGATCTTAAACCTGGAAATATTATGCTGGATGCGGATATGCAGTGTCATTTAGTTGATT
TCGGCAGCAGTTCTTCTGATAAAGAGCCTAAACCGGCATCATGGGGAACCTCAAGCTATTTAGCACCAGAACTTAATGCA
CAAGAGGATTTTATTGCTTTCTCTCAGGCTAGTGATCTTTTTGCTTTGGCCTATTCTCTGGATGAACTTTTTAATCCATT
CAGGCAGGTTAAATTTGCGAAAGTGGATATAGGAATTAAAAATAAGCATCTTGTGCTTTTACACGCTGAAATCGAGGCAT
GCATTACTGGGCTCATGTCAAATGAAACATCAGCACGAACACTTTATTTTTCTCGCATCCTGCAATTACAAAGAGTCCCA
GATAGTTTCAAATCGAGACCAGAAGCATTTACCTATATGATTATGCTGCTTACTCAATGGAAAAGCTGCTATAAAATACC
GGAAATGAACAAAGAGTTAGATGAAATCATTGCAGAAATAAAAGTAGCTTATGAAAACCATGAACAGGATGTCGTAAAAA
TTATAGCACTGCTTGAGCAGTTATCTAAAGCGGACGGGCTGCTTAATTCTCATAAAGCCTTACTCTCTGTTTTGATTAAA
TCGCTTGCTAATGTCAAGCAACAAGAACCCGGGCACGACGACATCTTGCCGCGTCGTTTTGAATCAGACGTTGTGAGCCG
CCTGATAAAAACTCCAACAGCTAAAATGATGGCAGCAATTAAACAAGTTTCAGATGCTATCGTAAAAATCCTGGAACAAT
ATGAACATTCCCCTACCGAATCTTTTGAGCATGAGGTTTTACAAGATTTTCTCGAACAAATGGTTCAATCGGACATTCTT
TTTGGTGCCCCCAAAGAGAAAATTGAGATTTCCGATATTATAAAAATACTCAAGGCAAACAGGACGGAAGATTTCGTACA
AATTCAGCATATTTCTTTTAAATTTGCCCAAGTTGCTTTACGCGATCTTGCCTTGCATGACCTGCCAAAACATGAGCCAA
AAGGTGCGTTTTTAGAAATATTGCAAAAATATCAAGCAAAATATGCGCCTGAAGAGACATCACTTTTTGAGCTCTATCAT
CACATGGCAGGTGTTAGAGATCACAACCCATCGAAAGTAAAAAAAGGGGAGGGATACCGCTTTAGAGCATTCATTTGTGA
TGAGCTTTTTTATGGAGATGAAATTTTTAGTACCGGGGATAATCGTGGCCGCGAAGGCAAGCCTAACCAAAGATTACAAA
CTAATCAAGTTGGTTTAATGAAGTTCGAACATTCAGCCCACACCAAAGGACTACTGACGTTAAATGGTCAATCCTGGTAT
GCTGATTGTAAGACCCAGCTACCAAACTACGATTCAATTCATTATCTCTCAGCCCTGAAAACGGACTGCCCTTATATTAC
GGGGCCTTCCGGGATGACTTCATTATTTATGAATATGATGTTTCTTCTGCTCAACCCTAAGGATCAAGATGTCATTCTCT
CTTACAGCCTTGGGGTAATGACTTATGTAGTTGGTGCTGGTTACCATAGCATTAAAGAAATTCTTATTCCGATGGTCAAG
TGCGTAGGCATTATGCCTGATTATCCGCAACATAAAGGAATAGAGTATCTTACTGCCTCGCCTTTATATAATCACTACTT
TAAGGCGATAGAGGAGTTTGATAAAGAGTTTGCAGAGGTTCATGAAAAAATTTGGCAGGAGCACCTTGCGTATTTCCATA
TGACTTATATGCCTGTTTGTATGCGTGATCATTGCCTACCACATCAAGTTCCCTCAATGGAAGATATAAGCTCGGAAGTA
AAAGAAATGCTTGAAATTGTGTCTAAGTCTGTGAAAAATTGCTTAGAAGAGCATCAAGTTAAGCGTACTGGCGATATGGG
GTTGTTTCTTTCAACATCATGTGGGCAAACAAAGGCGCTTGAGGTTTTAAGTCATGTCTGTCAACAACAGGTAGGGCTAA
CCGCAATTTTTAGGCAGATTCAGGCGTATTTTAAAGGAACTTTTGAGACAGAGGAGGGGATAACAATAAATAGAGAAATG
CAACTTAAATTTATTGCTCATTTCTTTGATGTATTAAAGGAAAGCCCAACACTGCTTTCACAATTCAATTTGACCTTAAG
GATAGAAAATACGATTGGTGTGCATCAGTGCGAATTGGGAAGCTCTAAGCGAAAAGAGCTCTTCCTGGAGATTAAGAAGA
CGTCCATTGCAGCAAATGAAGAGCGGATGGTTGCAAATCATGAACCCAGGAAAGAAAACTGCAACGTCATCATTTTGCCA
TATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGCGCGCTGCTCTCAATTTTTACTTAATTTTCTCTTAATGATGATTTTTTATAATATCAAGTCATTTTTATTCAAGTTT
GTAAATATGTGAGGTTCCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTCAAGGAAGGCGTTCTATGTTAAGTAAAGAAAAAATTAACCCTTCTCTAAAAAATACAAAACGCCAAGGCAGCGATAA
CCTTGCTGCCATGGCTGACC

Product: serine/threonine-protein kinase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 961; Mature: 961

Protein sequence:

>961_residues
MKLLRSHELKSLPSMDEKALELLIKVLSNKGIRKLIKSADGKPISREIMIREFGIDCQILFITTEESLKPIIVPTENKIS
GGGKSYCEQFKVYALDDGKTYFLKSVKIDPESLIEFTNEKDTLSKLGRLVGTFFNEQTQVHYILTTFIKGIDLSRYKNSL
PLSVNLKHFWEVLGIMISVCHQVKQFHELGLIHRDLKPGNIMLDADMQCHLVDFGSSSSDKEPKPASWGTSSYLAPELNA
QEDFIAFSQASDLFALAYSLDELFNPFRQVKFAKVDIGIKNKHLVLLHAEIEACITGLMSNETSARTLYFSRILQLQRVP
DSFKSRPEAFTYMIMLLTQWKSCYKIPEMNKELDEIIAEIKVAYENHEQDVVKIIALLEQLSKADGLLNSHKALLSVLIK
SLANVKQQEPGHDDILPRRFESDVVSRLIKTPTAKMMAAIKQVSDAIVKILEQYEHSPTESFEHEVLQDFLEQMVQSDIL
FGAPKEKIEISDIIKILKANRTEDFVQIQHISFKFAQVALRDLALHDLPKHEPKGAFLEILQKYQAKYAPEETSLFELYH
HMAGVRDHNPSKVKKGEGYRFRAFICDELFYGDEIFSTGDNRGREGKPNQRLQTNQVGLMKFEHSAHTKGLLTLNGQSWY
ADCKTQLPNYDSIHYLSALKTDCPYITGPSGMTSLFMNMMFLLLNPKDQDVILSYSLGVMTYVVGAGYHSIKEILIPMVK
CVGIMPDYPQHKGIEYLTASPLYNHYFKAIEEFDKEFAEVHEKIWQEHLAYFHMTYMPVCMRDHCLPHQVPSMEDISSEV
KEMLEIVSKSVKNCLEEHQVKRTGDMGLFLSTSCGQTKALEVLSHVCQQQVGLTAIFRQIQAYFKGTFETEEGITINREM
QLKFIAHFFDVLKESPTLLSQFNLTLRIENTIGVHQCELGSSKRKELFLEIKKTSIAANEERMVANHEPRKENCNVIILP
Y

Sequences:

>Translated_961_residues
MKLLRSHELKSLPSMDEKALELLIKVLSNKGIRKLIKSADGKPISREIMIREFGIDCQILFITTEESLKPIIVPTENKIS
GGGKSYCEQFKVYALDDGKTYFLKSVKIDPESLIEFTNEKDTLSKLGRLVGTFFNEQTQVHYILTTFIKGIDLSRYKNSL
PLSVNLKHFWEVLGIMISVCHQVKQFHELGLIHRDLKPGNIMLDADMQCHLVDFGSSSSDKEPKPASWGTSSYLAPELNA
QEDFIAFSQASDLFALAYSLDELFNPFRQVKFAKVDIGIKNKHLVLLHAEIEACITGLMSNETSARTLYFSRILQLQRVP
DSFKSRPEAFTYMIMLLTQWKSCYKIPEMNKELDEIIAEIKVAYENHEQDVVKIIALLEQLSKADGLLNSHKALLSVLIK
SLANVKQQEPGHDDILPRRFESDVVSRLIKTPTAKMMAAIKQVSDAIVKILEQYEHSPTESFEHEVLQDFLEQMVQSDIL
FGAPKEKIEISDIIKILKANRTEDFVQIQHISFKFAQVALRDLALHDLPKHEPKGAFLEILQKYQAKYAPEETSLFELYH
HMAGVRDHNPSKVKKGEGYRFRAFICDELFYGDEIFSTGDNRGREGKPNQRLQTNQVGLMKFEHSAHTKGLLTLNGQSWY
ADCKTQLPNYDSIHYLSALKTDCPYITGPSGMTSLFMNMMFLLLNPKDQDVILSYSLGVMTYVVGAGYHSIKEILIPMVK
CVGIMPDYPQHKGIEYLTASPLYNHYFKAIEEFDKEFAEVHEKIWQEHLAYFHMTYMPVCMRDHCLPHQVPSMEDISSEV
KEMLEIVSKSVKNCLEEHQVKRTGDMGLFLSTSCGQTKALEVLSHVCQQQVGLTAIFRQIQAYFKGTFETEEGITINREM
QLKFIAHFFDVLKESPTLLSQFNLTLRIENTIGVHQCELGSSKRKELFLEIKKTSIAANEERMVANHEPRKENCNVIILP
Y
>Mature_961_residues
MKLLRSHELKSLPSMDEKALELLIKVLSNKGIRKLIKSADGKPISREIMIREFGIDCQILFITTEESLKPIIVPTENKIS
GGGKSYCEQFKVYALDDGKTYFLKSVKIDPESLIEFTNEKDTLSKLGRLVGTFFNEQTQVHYILTTFIKGIDLSRYKNSL
PLSVNLKHFWEVLGIMISVCHQVKQFHELGLIHRDLKPGNIMLDADMQCHLVDFGSSSSDKEPKPASWGTSSYLAPELNA
QEDFIAFSQASDLFALAYSLDELFNPFRQVKFAKVDIGIKNKHLVLLHAEIEACITGLMSNETSARTLYFSRILQLQRVP
DSFKSRPEAFTYMIMLLTQWKSCYKIPEMNKELDEIIAEIKVAYENHEQDVVKIIALLEQLSKADGLLNSHKALLSVLIK
SLANVKQQEPGHDDILPRRFESDVVSRLIKTPTAKMMAAIKQVSDAIVKILEQYEHSPTESFEHEVLQDFLEQMVQSDIL
FGAPKEKIEISDIIKILKANRTEDFVQIQHISFKFAQVALRDLALHDLPKHEPKGAFLEILQKYQAKYAPEETSLFELYH
HMAGVRDHNPSKVKKGEGYRFRAFICDELFYGDEIFSTGDNRGREGKPNQRLQTNQVGLMKFEHSAHTKGLLTLNGQSWY
ADCKTQLPNYDSIHYLSALKTDCPYITGPSGMTSLFMNMMFLLLNPKDQDVILSYSLGVMTYVVGAGYHSIKEILIPMVK
CVGIMPDYPQHKGIEYLTASPLYNHYFKAIEEFDKEFAEVHEKIWQEHLAYFHMTYMPVCMRDHCLPHQVPSMEDISSEV
KEMLEIVSKSVKNCLEEHQVKRTGDMGLFLSTSCGQTKALEVLSHVCQQQVGLTAIFRQIQAYFKGTFETEEGITINREM
QLKFIAHFFDVLKESPTLLSQFNLTLRIENTIGVHQCELGSSKRKELFLEIKKTSIAANEERMVANHEPRKENCNVIILP
Y

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 109825; Mature: 109825

Theoretical pI: Translated: 6.65; Mature: 6.65

Prosite motif: PS00108 PROTEIN_KINASE_ST ; PS50011 PROTEIN_KINASE_DOM

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLLRSHELKSLPSMDEKALELLIKVLSNKGIRKLIKSADGKPISREIMIREFGIDCQIL
CCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHEECCCEEEE
FITTEESLKPIIVPTENKISGGGKSYCEQFKVYALDDGKTYFLKSVKIDPESLIEFTNEK
EEEECCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCH
DTLSKLGRLVGTFFNEQTQVHYILTTFIKGIDLSRYKNSLPLSVNLKHFWEVLGIMISVC
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHH
HQVKQFHELGLIHRDLKPGNIMLDADMQCHLVDFGSSSSDKEPKPASWGTSSYLAPELNA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
QEDFIAFSQASDLFALAYSLDELFNPFRQVKFAKVDIGIKNKHLVLLHAEIEACITGLMS
CHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHC
NETSARTLYFSRILQLQRVPDSFKSRPEAFTYMIMLLTQWKSCYKIPEMNKELDEIIAEI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
KVAYENHEQDVVKIIALLEQLSKADGLLNSHKALLSVLIKSLANVKQQEPGHDDILPRRF
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
ESDVVSRLIKTPTAKMMAAIKQVSDAIVKILEQYEHSPTESFEHEVLQDFLEQMVQSDIL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FGAPKEKIEISDIIKILKANRTEDFVQIQHISFKFAQVALRDLALHDLPKHEPKGAFLEI
CCCCHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LQKYQAKYAPEETSLFELYHHMAGVRDHNPSKVKKGEGYRFRAFICDELFYGDEIFSTGD
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHCCCHHHCCCC
NRGREGKPNQRLQTNQVGLMKFEHSAHTKGLLTLNGQSWYADCKTQLPNYDSIHYLSALK
CCCCCCCCCCCEECCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
TDCPYITGPSGMTSLFMNMMFLLLNPKDQDVILSYSLGVMTYVVGAGYHSIKEILIPMVK
CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
CVGIMPDYPQHKGIEYLTASPLYNHYFKAIEEFDKEFAEVHEKIWQEHLAYFHMTYMPVC
HHCCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MRDHCLPHQVPSMEDISSEVKEMLEIVSKSVKNCLEEHQVKRTGDMGLFLSTSCGQTKAL
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHH
EVLSHVCQQQVGLTAIFRQIQAYFKGTFETEEGITINREMQLKFIAHFFDVLKESPTLLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
QFNLTLRIENTIGVHQCELGSSKRKELFLEIKKTSIAANEERMVANHEPRKENCNVIILP
HCCEEEEEECCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEEC
Y
C
>Mature Secondary Structure
MKLLRSHELKSLPSMDEKALELLIKVLSNKGIRKLIKSADGKPISREIMIREFGIDCQIL
CCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHEECCCEEEE
FITTEESLKPIIVPTENKISGGGKSYCEQFKVYALDDGKTYFLKSVKIDPESLIEFTNEK
EEEECCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHCCEEEEECCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCH
DTLSKLGRLVGTFFNEQTQVHYILTTFIKGIDLSRYKNSLPLSVNLKHFWEVLGIMISVC
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHH
HQVKQFHELGLIHRDLKPGNIMLDADMQCHLVDFGSSSSDKEPKPASWGTSSYLAPELNA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
QEDFIAFSQASDLFALAYSLDELFNPFRQVKFAKVDIGIKNKHLVLLHAEIEACITGLMS
CHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHC
NETSARTLYFSRILQLQRVPDSFKSRPEAFTYMIMLLTQWKSCYKIPEMNKELDEIIAEI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
KVAYENHEQDVVKIIALLEQLSKADGLLNSHKALLSVLIKSLANVKQQEPGHDDILPRRF
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
ESDVVSRLIKTPTAKMMAAIKQVSDAIVKILEQYEHSPTESFEHEVLQDFLEQMVQSDIL
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
FGAPKEKIEISDIIKILKANRTEDFVQIQHISFKFAQVALRDLALHDLPKHEPKGAFLEI
CCCCHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
LQKYQAKYAPEETSLFELYHHMAGVRDHNPSKVKKGEGYRFRAFICDELFYGDEIFSTGD
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHCCCHHHCCCC
NRGREGKPNQRLQTNQVGLMKFEHSAHTKGLLTLNGQSWYADCKTQLPNYDSIHYLSALK
CCCCCCCCCCCEECCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
TDCPYITGPSGMTSLFMNMMFLLLNPKDQDVILSYSLGVMTYVVGAGYHSIKEILIPMVK
CCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
CVGIMPDYPQHKGIEYLTASPLYNHYFKAIEEFDKEFAEVHEKIWQEHLAYFHMTYMPVC
HHCCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MRDHCLPHQVPSMEDISSEVKEMLEIVSKSVKNCLEEHQVKRTGDMGLFLSTSCGQTKAL
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCHHHH
EVLSHVCQQQVGLTAIFRQIQAYFKGTFETEEGITINREMQLKFIAHFFDVLKESPTLLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
QFNLTLRIENTIGVHQCELGSSKRKELFLEIKKTSIAANEERMVANHEPRKENCNVIILP
HCCEEEEEECCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEEEC
Y
C

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA