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The map label for this gene is 148358370

Identifier: 148358370

GI number: 148358370

Start: 247070

End: 249436

Strand: Direct

Name: 148358370

Synonym: LPC_0234

Alternate gene names: NA

Gene position: 247070-249436 (Clockwise)

Preceding gene: 148358369

Following gene: 148358371

Centisome position: 6.91

GC content: 38.15

Gene sequence:

>2367_bases
ATGGTAACAGCATTAAACAAAAAATTGTGGCGTGATGTGATCAAATTAAGAAGTCAAATCATCACGATCGCATTAGTTGT
CTGTAGTGGAGTCAGTGTTTTAATTGCGTCAGTCAATACCTATGTTTCTTTAAGGAATGCACAACAAGAATTTTATTCAA
AATATCATTTTGCAGATGTGTTTGCTTCATTGAAAAGAGCGCCTGACTATTTAGAAAAGCGAATAACAGAAATTTCAGGA
GTATCTCGAGTAGAGACCCGAATTGTAAAAGATGTTGTGCTTGATTTGCCTTGGATGCCAGAGCCCGCTGTAGGCCGCTT
TATATCGATATCGGATAAGAATAAATCGGGTCTTAATCAATTGTATTTACGTCAGGGAAGATGGCCTGACAGCAATCGAT
ATGATGAGATACTGGTGAATGAAAGTTTTGCAAACAGCCATGATTTAAAACCAGGCGATAACATTATTGCATTATTAAAC
GGGCACAGAGAACAGTTAAAAATTGTTGGGATTGCATTATCACCTGAGTATGTGTACGCCATTCGGGGAGAAGATTTACT
TCCTGACAACAGGCATTTCGGTGTTTTTTGGATGGATAGAAAGGCATTAAGCACCACCTTTGGGATGCAGGGCGCTTTTA
ATGACATCATCATTAAGCTCGCGCCTAATGCGTCAGAGCAATTTGTGATGACTCAATTGGAAAGAATGTTTCGTTCTTAT
GGTTTGACCATCACGTATTCACGAAAAGATCAGGTATCCGATCGATTTGTAACCAATGAAATAAAACAGCAAAAAATTAT
TGCCACTTATATCCCGCCTGTTTTTCTGTTGGTGGCAGCGTTTTTATTGAATTTGGTGACAGGACGTTTGGTAAGTAAAG
AACGCGAACAAATAGCAACCTTGAAGGCATTAGGTTATGGTGATTTGGCGATTGCCTACCACTATATAAAAATAATTTTA
ATTATTATTGTTATTGGGTCACTTGCAGGTGTGTCATTAGGTGCCTGGTTTGGTAATTTGATGACCGAGCTCTATGCCGA
GTATTTCAGGTTCCCCAGGTTCTCTTATCTTTTTTCCAATTTAGCAGCGTTTATCGGGATCCTGGTTTGTTTTTTGGCTG
CTCTTTTGGGGACATTGCGTGCGATTTACCAGGTCATAAATCTCATGCCCGCAGTAGCGATGAAACCGCCTGCCCCTATC
GTGTATCGAGCCACTTTGATTGAAAAAATTAAATTTTTTTCAAGACTTCCCAGTAGTGTCAAAATGGTTTATCGATATAT
TTTCCGCCATTTTTTACGCACCATGTTGACTTGTGTGGGTATTGCGTTGGCAATGGCTATCATAATTCTGGGTTTGTTTT
GGCAAGATGCGATACGCTATCTCATCAATACCCAATTCATAATGGCACAACGTGAACATGCCATGGTCAGCTTTAATAAT
CCCGTTAATAAAATAGCGGTAACGGAGTTGAATAAAATTACTGGGGTTACGAGCAGTGAAGGTTATCGTATTGTTCCTGC
TCGATTAACTTACCAACATCGTAGTGAATTATCCTCGCTGTTTGGTATCGCTGAAAATGCGGAATTAAAAATTTTATTAG
ACAAGCATCTTAATCGAATGATCATTCCTGAGCAGGGTTTATTAATCAGTGAGGGATTGGCAGAACGATTGCGTTTGGCT
GTTGGTGACAGGCTTGATATCGAACTGCTGGAAGGAAATAAAGCAAAAACTCAACTGAAAGTACAAGGAGTAATAAATGA
CTATGTAGGTATGTTTGCCTATATAGAAATTAAAGCGCTTAACCGTTTATTAAATGAGGATCGGTTAGTCAATGCAGCGG
CTATTACAGTAGACACCAAACACGTCAAACATTTATATAAAAAGGTAAAGGAAATACCCAAGATAGGCACTATTACTTTT
AAAACCTCCATCATTAGGACATTTGAGGAAACTTTTGCAAAACACATTCTTGTATTTACTACCATTCTTGCAAGTTTTGC
CATCATTATTGCGGTGAGTGTTGTTTATAATAATGCGAGCATCACCTTGGCAGAAAGGGCGAGAGAGTTAACGACACTCC
AAGTGTTAGGATTTACTCAGGGAGAAGTATCCACCTTGCTGTTTTTAAATCACATCTTTGAAATAATAATCTCTACCCCT
TTAGGATTAGTTATCGGGTATTTGATGTCCTGGTCTATACTGCAATTAATGCAAACCGATTGGTTCAAGATTCCTTTTGT
TATAGAACTGAAAACCTATGTTATTTCGATTATGGTGATATTTTTTTCTAGTTTAATTAGTTTTTATATTATTCAGCGTA
AAGCAAGCCATCTGAATTTAACAGCGGTATTAAAGGTAGCAGACTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTCATAAGCGAGATGGCTGATCGTGTGATCCATATTGCTGATGGTGTCATAAGCAACATATCCAAGAATAAATTCAAG
CGCAAACCAGAAGAATTAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAAGATAATGAACCTGAATTTGAAAAAACTAATAGGGTATTTTCTGGCAATAGTGATATTTTTCAGTGTTGTTCTCTGG
TTCCTTTCTCATCAAGGTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Permease; Peptide ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease; Efflux ABC Transporter Permease Protein; ABC Transporter; Antimicrobial Peptide ABC Transporter Permease; ABC Transporter Inner Membrane Subunit; Permease Domain-Containing Protein; ABC-Type Antimicrobial Peptide Transport System Protein; ABC-Type Transporter; ABC-Type Transport System Permease; ABC-Type Transport System

Number of amino acids: Translated: 788; Mature: 788

Protein sequence:

>788_residues
MVTALNKKLWRDVIKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADVFASLKRAPDYLEKRITEISG
VSRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQLYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFANSHDLKPGDNIIALLN
GHREQLKIVGIALSPEYVYAIRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTTFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
GLTITYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIATLKALGYGDLAIAYHYIKIIL
IIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYAEYFRFPRFSYLFSNLAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPI
VYRATLIEKIKFFSRLPSSVKMVYRYIFRHFLRTMLTCVGIALAMAIIILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAMVSFNN
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRMIIPEQGLLISEGLAERLRLA
VGDRLDIELLEGNKAKTQLKVQGVINDYVGMFAYIEIKALNRLLNEDRLVNAAAITVDTKHVKHLYKKVKEIPKIGTITF
KTSIIRTFEETFAKHILVFTTILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
LGLVIGYLMSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNLTAVLKVAD

Sequences:

>Translated_788_residues
MVTALNKKLWRDVIKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADVFASLKRAPDYLEKRITEISG
VSRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQLYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFANSHDLKPGDNIIALLN
GHREQLKIVGIALSPEYVYAIRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTTFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
GLTITYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIATLKALGYGDLAIAYHYIKIIL
IIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYAEYFRFPRFSYLFSNLAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPI
VYRATLIEKIKFFSRLPSSVKMVYRYIFRHFLRTMLTCVGIALAMAIIILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAMVSFNN
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRMIIPEQGLLISEGLAERLRLA
VGDRLDIELLEGNKAKTQLKVQGVINDYVGMFAYIEIKALNRLLNEDRLVNAAAITVDTKHVKHLYKKVKEIPKIGTITF
KTSIIRTFEETFAKHILVFTTILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
LGLVIGYLMSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNLTAVLKVAD
>Mature_788_residues
MVTALNKKLWRDVIKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADVFASLKRAPDYLEKRITEISG
VSRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQLYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFANSHDLKPGDNIIALLN
GHREQLKIVGIALSPEYVYAIRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTTFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
GLTITYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIATLKALGYGDLAIAYHYIKIIL
IIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYAEYFRFPRFSYLFSNLAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPI
VYRATLIEKIKFFSRLPSSVKMVYRYIFRHFLRTMLTCVGIALAMAIIILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAMVSFNN
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRMIIPEQGLLISEGLAERLRLA
VGDRLDIELLEGNKAKTQLKVQGVINDYVGMFAYIEIKALNRLLNEDRLVNAAAITVDTKHVKHLYKKVKEIPKIGTITF
KTSIIRTFEETFAKHILVFTTILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
LGLVIGYLMSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNLTAVLKVAD

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89278; Mature: 89278

Theoretical pI: Translated: 9.94; Mature: 9.94

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MVTALNKKLWRDVIKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FASLKRAPDYLEKRITEISGVSRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQ
HHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHH
LYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFANSHDLKPGDNIIALLNGHREQLKIVGIALSPEYVYA
HHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCEEEE
IRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTTFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
ECCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
GLTITYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIAT
CCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKALGYGDLAIAYHYIKIILIIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYAEYFRFPRFSYLFSN
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPIVYRATLIEKIKFFSRLPSSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
KMVYRYIFRHFLRTMLTCVGIALAMAIIILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAMVSFNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHCCCEEEECC
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRM
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHCCCCE
IIPEQGLLISEGLAERLRLAVGDRLDIELLEGNKAKTQLKVQGVINDYVGMFAYIEIKAL
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRLLNEDRLVNAAAITVDTKHVKHLYKKVKEIPKIGTITFKTSIIRTFEETFAKHILVFT
HHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGLVIGYLMSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
TAVLKVAD
EEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MVTALNKKLWRDVIKLRSQIITIALVVCSGVSVLIASVNTYVSLRNAQQEFYSKYHFADV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FASLKRAPDYLEKRITEISGVSRVETRIVKDVVLDLPWMPEPAVGRFISISDKNKSGLNQ
HHHHHHCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHH
LYLRQGRWPDSNRYDEILVNESFANSHDLKPGDNIIALLNGHREQLKIVGIALSPEYVYA
HHHHCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCEEEE
IRGEDLLPDNRHFGVFWMDRKALSTTFGMQGAFNDIIIKLAPNASEQFVMTQLERMFRSY
ECCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHC
GLTITYSRKDQVSDRFVTNEIKQQKIIATYIPPVFLLVAAFLLNLVTGRLVSKEREQIAT
CCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKALGYGDLAIAYHYIKIILIIIVIGSLAGVSLGAWFGNLMTELYAEYFRFPRFSYLFSN
HHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
LAAFIGILVCFLAALLGTLRAIYQVINLMPAVAMKPPAPIVYRATLIEKIKFFSRLPSSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
KMVYRYIFRHFLRTMLTCVGIALAMAIIILGLFWQDAIRYLINTQFIMAQREHAMVSFNN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHCCCEEEECC
PVNKIAVTELNKITGVTSSEGYRIVPARLTYQHRSELSSLFGIAENAELKILLDKHLNRM
CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHCCCCE
IIPEQGLLISEGLAERLRLAVGDRLDIELLEGNKAKTQLKVQGVINDYVGMFAYIEIKAL
ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NRLLNEDRLVNAAAITVDTKHVKHLYKKVKEIPKIGTITFKTSIIRTFEETFAKHILVFT
HHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TILASFAIIIAVSVVYNNASITLAERARELTTLQVLGFTQGEVSTLLFLNHIFEIIISTP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LGLVIGYLMSWSILQLMQTDWFKIPFVIELKTYVISIMVIFFSSLISFYIIQRKASHLNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCE
TAVLKVAD
EEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA