| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is yueF [H]
Identifier: 146302325
GI number: 146302325
Start: 5561286
End: 5562377
Strand: Direct
Name: yueF [H]
Synonym: Fjoh_4598
Alternate gene names: 146302325
Gene position: 5561286-5562377 (Clockwise)
Preceding gene: 146302324
Following gene: 146302326
Centisome position: 91.22
GC content: 29.21
Gene sequence:
>1092_bases ATGATAACGTCAAAAACTATTTCTAACGGAATCTTACGAGCATTGGCAACAATCTTAGTAATAGGTATCGTTTTATACTT CTTATATGAAATTCAAACCGTAATTGTTTATTTATGTGTTTCCCTGATATTGTGTTTAATTGCAAATCCGCTGGTTTTAT TTTTAAAAAATAAACTAAAATTCAGCAATTCAATGGCCGCTGCAACTACAATTATCTTTTTTATATTTCTTATTGTAGGC TTTATTCTGCTGTTTGTGCCATTAATTATTTCTCAGGCAAATAATCTGGCTTTATTAGATACGGCACATCTTCAGACTAA ATTTATGGAGACAGAAAAACATCTAGAAGAATATTTTAATATTCAGCATATTGATTTAAATAAAGTTATTAAAGATTCTA AACTAACTTCGGTATTAGATTTTAGTTATTTCACCAGATTTATCAATTCGATTATCAATTTTATGGCCGATATGGGAATG GGATTGGTATCGGTATTTTTTATTACTTTCTTTTTTATAAAAGACCAGACTATTTTTAAAGATCAGGCCAGAAGAATACT TCCAGATTCTAATGAAGATAAAATTTTAAATTCTATAACAAAAATCAACCACTTACTAACCCGCTATTTTATTGGTTTAT TATTGCAGTTAATCGTTGTATTTATTCTGTATCTGATTGTGTTATTAATCTTTGGAAACAAAAACGCATTTGTAATTGCT TTTTTATGTGCCATACTAAATATTATACCTTATTTAGGTCCTATTATTGGAACTACTTTGGCAGCTATTTTAACCATGAT TAGTATGATTGGACAGGATTTTCAATCAGAAATTCTGCCTAAGACCATTTATGTTGTTATAGGCTTTTTAGTCGTTCAGG CAATTGACAATAATATAAGCCAGCCGATAATTTCATCAAAAAGCGTAAATTCGCACCCGTTAGAAATATTCCTAATTATC TTAATCAGCGGTATTACATTTGGAATTGTCGGGATGATCATTGCAGTTCCGGCTTTTACAATGATTAAGGTAATTTTAAA AGAATTTTTTCCTAACAACAAGATTGTATCTGTATTAACCGAAAGAATTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGAAATCATCCCGCTTTTTTTTTATTAATTATTTTTAGAACGCCCGAAACACTAGAATTATAAAAGCTTTTTCCTATAT TTATATTCTAAATTTTAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTTGAATAATCCTATTTTGCATCCAGAGATTCAGGAATTTATAATTCAGAATACTGGTGCAGATTTAACAAAATTGGCG CTGCAGAAAAACCCGTTTCC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 363; Mature: 363
Protein sequence:
>363_residues MITSKTISNGILRALATILVIGIVLYFLYEIQTVIVYLCVSLILCLIANPLVLFLKNKLKFSNSMAAATTIIFFIFLIVG FILLFVPLIISQANNLALLDTAHLQTKFMETEKHLEEYFNIQHIDLNKVIKDSKLTSVLDFSYFTRFINSIINFMADMGM GLVSVFFITFFFIKDQTIFKDQARRILPDSNEDKILNSITKINHLLTRYFIGLLLQLIVVFILYLIVLLIFGNKNAFVIA FLCAILNIIPYLGPIIGTTLAAILTMISMIGQDFQSEILPKTIYVVIGFLVVQAIDNNISQPIISSKSVNSHPLEIFLII LISGITFGIVGMIIAVPAFTMIKVILKEFFPNNKIVSVLTERI
Sequences:
>Translated_363_residues MITSKTISNGILRALATILVIGIVLYFLYEIQTVIVYLCVSLILCLIANPLVLFLKNKLKFSNSMAAATTIIFFIFLIVG FILLFVPLIISQANNLALLDTAHLQTKFMETEKHLEEYFNIQHIDLNKVIKDSKLTSVLDFSYFTRFINSIINFMADMGM GLVSVFFITFFFIKDQTIFKDQARRILPDSNEDKILNSITKINHLLTRYFIGLLLQLIVVFILYLIVLLIFGNKNAFVIA FLCAILNIIPYLGPIIGTTLAAILTMISMIGQDFQSEILPKTIYVVIGFLVVQAIDNNISQPIISSKSVNSHPLEIFLII LISGITFGIVGMIIAVPAFTMIKVILKEFFPNNKIVSVLTERI >Mature_363_residues MITSKTISNGILRALATILVIGIVLYFLYEIQTVIVYLCVSLILCLIANPLVLFLKNKLKFSNSMAAATTIIFFIFLIVG FILLFVPLIISQANNLALLDTAHLQTKFMETEKHLEEYFNIQHIDLNKVIKDSKLTSVLDFSYFTRFINSIINFMADMGM GLVSVFFITFFFIKDQTIFKDQARRILPDSNEDKILNSITKINHLLTRYFIGLLLQLIVVFILYLIVLLIFGNKNAFVIA FLCAILNIIPYLGPIIGTTLAAILTMISMIGQDFQSEILPKTIYVVIGFLVVQAIDNNISQPIISSKSVNSHPLEIFLII LISGITFGIVGMIIAVPAFTMIKVILKEFFPNNKIVSVLTERI
Specific function: Unknown
COG id: COG0628
COG function: function code R; Predicted permease
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=202, Percent_Identity=30.6930693069307, Blast_Score=84, Evalue=1e-17,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002549 [H]
Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 40864; Mature: 40864
Theoretical pI: Translated: 9.02; Mature: 9.02
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MITSKTISNGILRALATILVIGIVLYFLYEIQTVIVYLCVSLILCLIANPLVLFLKNKLK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSNSMAAATTIIFFIFLIVGFILLFVPLIISQANNLALLDTAHLQTKFMETEKHLEEYFN HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC IQHIDLNKVIKDSKLTSVLDFSYFTRFINSIINFMADMGMGLVSVFFITFFFIKDQTIFK CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH DQARRILPDSNEDKILNSITKINHLLTRYFIGLLLQLIVVFILYLIVLLIFGNKNAFVIA HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH FLCAILNIIPYLGPIIGTTLAAILTMISMIGQDFQSEILPKTIYVVIGFLVVQAIDNNIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC QPIISSKSVNSHPLEIFLIILISGITFGIVGMIIAVPAFTMIKVILKEFFPNNKIVSVLT CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH ERI HCC >Mature Secondary Structure MITSKTISNGILRALATILVIGIVLYFLYEIQTVIVYLCVSLILCLIANPLVLFLKNKLK CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSNSMAAATTIIFFIFLIVGFILLFVPLIISQANNLALLDTAHLQTKFMETEKHLEEYFN HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC IQHIDLNKVIKDSKLTSVLDFSYFTRFINSIINFMADMGMGLVSVFFITFFFIKDQTIFK CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHH DQARRILPDSNEDKILNSITKINHLLTRYFIGLLLQLIVVFILYLIVLLIFGNKNAFVIA HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH FLCAILNIIPYLGPIIGTTLAAILTMISMIGQDFQSEILPKTIYVVIGFLVVQAIDNNIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC QPIISSKSVNSHPLEIFLIILISGITFGIVGMIIAVPAFTMIKVILKEFFPNNKIVSVLT CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH ERI HCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9384377 [H]