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The map label for this gene is 146301787

Identifier: 146301787

GI number: 146301787

Start: 4830888

End: 4837676

Strand: Direct

Name: 146301787

Synonym: Fjoh_4051

Alternate gene names: NA

Gene position: 4830888-4837676 (Clockwise)

Preceding gene: 146301786

Following gene: 146301788

Centisome position: 79.24

GC content: 40.67

Gene sequence:

>6789_bases
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TTACCGGATATGATGGTACTTATGCCAATACATTAGGCGATGAATTTAGTTTTGTCTGCCTTAAAACTCTCGATGCTAAT
ACGGTAATTCGTTTTACGGACAGAGGATACTTTTCAGACACAACCTGGTGGCCAGCCAGTAGTTTAGAAGGTACTGTTAC
ATGGACAGTGGGCAGTACAATTCCAGCAGGAACAGAGGTGCATATAAAAGGATTAAGTGCCTCTACCTACAATCAGTCTA
ATGGTACTTTAACCGCAAACGGTTTTTTAGCACTAAATAACGGAACCATGCCAAATGGACTTGTTTTGACTGCTGCCGGA
GATCAGATTTATGCTTTTCAGGGAGGTTCTGGAAATCCTTCTGACGCTGGTGTTGTACTTGTTGCCGGAATACATTTTTA
CTATTGTCCATCAGGAACTACAACAGCAGCATGGGATACCGGATGTGCAAACGGTTCAAATAGCTCTACTTTAAAAACAG
GCACTGGTGGTCTTATTGGAGGTACAAGTGCTTTCTATACCGGAACTCTCCCTGGTAATGTAGTAGCTGGTGTTGGAAGA
TTTGACAATACACTAAGTTCTCCGCTAAGTACAATAGCAGAAATTAGAACTGCTGTAATGAATCAGGCAAACTGGAATCT
TTCAGCAACTACTCTAACACTGCCTTCTGGTAAACCATTTTTAAGCACACCTACGACTATTACACTTAATCCTCTTGACA
AACTTATATGTCCGGGAGCTAATACAAGTTTTACTGTTGCTGCTACGAATGCCACTGGTTATCAATGGCAGGTAAATACA
GGTGCTGGTTTTGCAAATATTACAAATGGGGGTGTTTATTCTGGAGCAACTACTGCAACTCTTACTATTACAGGAGCAGC
TGCAGGAATGAACAACTACAAATATCGATGTGTTGCTACAGGAACTGGAACAGCAACTTCGAATGAAGCAACTTTAACTG
TGCCAACTGCCATAGCACCTTCTATACAATCACAAAGTAATGTAAGTGTTTATGGAGGTAATAATGGTTCAGCTACTCTT
AGTGTTTCAGGAGGTACTGCTCCTTATTTCTATTCATGGTCTCCTTCTGGGGGAACTGCTGCAACTGCATCAGGGCTTAG
TGCAGGAACTTATACAGTAACTATTACAGACAGCACTCCAAATGGATTAGGCGGTTGTAGTACAACTCAAACCGTAAATA
TAGTACAGCCAGGAGGCTCTGTTGTATCTGTTACCTCTTTAAGTGCTTTTTCAAGCTGCGGCGGTGCATCTACAGAACAG
AGTTTTACTGTACAAGCCGGAGGCTTAACAGCTAATCTTGATCTTGCAGCCCCAACCGGTTTTGAAATATCAACATCGGC
AGGAGGAATTTATACTAATAATATATCGTATGTTCCTTCATCAGGAGTTGTCACTACTAAAACAATTTACGTTCGTTTAG
CGGCTTCAGCCACAGGAACACCTTCTGGTAATATTACTATTTCTTCTACTGGAATAGTAACTAAAAATGTTGCCGTAACA
GGAAGCATGAATACTATAAGTTTTGGAACACAGCCTGTAGCAGCAGGAACCTGTGCAGGAGGTAATGCGACTTTTACTGC
TGCAGTCTCAAACGCAACAGGATATCAATGGCAGGAAAATACCGGTTCTGGTTTTGTTAACATTACAGATGGAGGTGTTT
ATTCTGGTGCAGCTACCTCAACACTTACTATTACAGGAGCTACAGCGGGAATGAACGGATTCCTTTATAGATTAGCGGCA
TCAGGAACTTGTCCTACCGTTAATTCAAACAGCGTTGCACTAAATATTAATGTAGCTGCGTCTATTACAGCACAGCCTTC
TTCAAGTACAATTTGTGCAGGAGCTAATACCTCTTTCGCTGTTGCAGCTTCAAATGCTGTAGGATATCAGTGGCAGGTAA
ATACAGGTTCTGGTTTTACAAATATTACAAATGGAGGTGTTTACACTGGAGCAGCCACTGCAACTCTTACTATTACAGGA
GCAACTGCAGGAATGAGCGGTTATCTTTACAGAGTAATTGCAACAGGTTCATGTACACCAGATGCTACTTCAAACGATGC
AGCTTTAACAATTAATGTAGCACCAGCTATAACAGCACAGCCGGCAGATAGTTCTATTTGTGTTGGCTCAAACACGACTT
TCAGCGTGACTGCTTCGAATGCCACTGGTTATCAATGGCAGGTAAATACAGGTTCTGGTTTTAATAACATTACGAATGGT
GCCCCATATTCTGGAGCAACTACAGCAACGCTTACAATAACAGGAGCAACTGCAGCACTTAATAATTACCAATACCGTTT
AGTTGCTTCAGGAGGTTGTACTCCAGCTGCCACTTCAAACTCTGGTACATTAAAAGTATCTAATATTCAGGCTACTTCAG
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TATCTATGGTCAAATGGAGCAACTAGTTCTTCAATCAGCAATTTAACAGCTGGTAACTACAGTGTGAGTATTAAAGATGC
TGTTTTATGCGAAAAAGAATTAAACTTTACAGTAACTCAACCACCAGTTTTAGTTGCTGCTCAAGGCACAGTTAACAATG
TTAGCTGTCATGGAGGTTCAAACGGTAGTGGTACAGTAACTGTATCAGGAGGAACTCCGGGTTATACCTATTCATGGGCT
CCTTCTGGAGGTACTGCAGCTACAGCTTCAGGACTTGCAGCCGGAACTTATACAGTAACAGTTACGGATGCTAACAATTG
TCAGACTACGGCAACAGTTACCATAACTGAGCCTGCGGTCGCTTTAAGTGCAACTGCAGGGTTACAAAATAATATCTTAT
GTCGTGGAACTGCAACTGGATCTGCAACTGTAACAGCTGCAGGCGGGACCCCAGGTTACACTTACTCTTGGTCTCCTTCT
GGAGGAACTGCGGCTACAGCTACAGGACTTACTGCCGGAACTTATACAGTAACAGTTACAGATGCTAATGCATGTCAGAC
TACACAATCTTTTACAATTACAGAACCAGCTGCATCTTTAACAGCGACTCCATTAGCACAAACTAACATAGCTTGTCGTG
GTGGAGCTACAGGATCTGCAACTGTAACGGCTGCAGGAGGTACTGGTGGATATACTTATTCATGGGCTCCTTCTGGAGGA
ACTGCGGCTACAGCTACAGGTCTTTCTGCAGGAACTTATACCGTAACGGTTACGGATGCTAACAATTGTCAGGTAACGCA
AAGCTTTACAATTACACAGCCAGCTGCAGTACTTTCAGCCGCTTTTGGTTCACAAAATAATGTTTCTTGTAATGGAGGCG
CTAACGGAACTGCAACTGTAACAGTAACTGGAGGAACTCCTGGATACACCTATTCTTGGGCTCCATCTGGAGGTACAAAC
GCTACAGCAACTGGTCTTTCTGCTGGAACATATACAGTAACAGTTACTGATGCTAATGCATGTCAGACTACACAAAGCTT
TACAATTACACAACCTGCAGCTCTAGTTGCAAGTGTTGGTTCTCAAAACAATGTTTCTTGTAATGGCGGTACAAACGGTT
CAGCAACTGTAGCCGTTACAGGAGGAACAGGTGCACGCACTTATTCTTGGTCTCCTACGGGAGGAACTGCAGCTACAGCA
TCAGGTTTAGCAGTAGGAACTTACACAGTAACAGTTACAGACGCAAACAATTGTCAAGCTACACAAAGTTTTACTATTAC
ACAGCCTGCGGCTCTTACGGCAACTCAATCACAAACTGACGTACTTTGCAACGGCGGTGCTACAGGTACAGCAACAGTTA
TTCCAATAGGCGGAACACCAAACTATACTTACTCATGGGCTCCTTCTGGAGGAACTGTTGCAACTGCCACAGGATTAACT
GTAGGGGTTTACACCTGCACAATAACAGATGCAAATGGATGTTCAGTTACAAAAAGCTTCACAATTATGCAGCCTTCTGC
ATTAATTGCAACACAAAGCCAGATCAATGCAACTTGTTCAACTGGTGGTCAGGCAGCAGTAAATGCATCTGGAGGTACTC
CTTCTTATAGTTATTTATGGTCACCATCAGGAGCGACTACATCAGTTGTAACAGGGTTATCAGCAGGAAACCATAGCGTA
GTAATTACAGACGCTAACGGATGTACTTTAACAAAAAACTTTACTATTACTACAACTAATACACTTGTTGCTTCATCATT
TCAAACTAATGTTTTATGTAATGGAACAAATACTGGATCTGCCGGCGTAATTCCTAGCGGTGCACCTGGACCATTTACTT
ATGTTTGGGCTCCTTCTGGAGGTTCTGCTGATACAGCAACTAATCTAACTGCCGGTAATTATTCAGTAACGATTACTGCT
TCAAATGGTTGTTCTATTGTTAAAAACTTTACCATAACACAGCCGACTGCTCTTGCTGTAGCTTCAAATTCACAGACCAA
TGTTTCTTGTAATGGAGGTTCAAACGGATCTGCAAGTGTTACGGTTACAGGAGGAACAGGAGTATATACTTATGCTTGGT
CACCTTCTGGCGGTACTGGAGCAACAGCTAATGGTCTTGCTGCCGGAACCTATACTGTAACAATTACAGATAGTAATTTA
TGTACAACAACACAAAACTTTACTATAACACAACCTACAGCACTTAGTCCAACAACATCTAAAACTGATGTTTCTTGTAA
TGGTGGTTCAAACGGATCAGCAACAGTAAATGTAACTGGAGGAACAGGAACATACACTTATTCATGGGCTCCTTCTGGAG
GAACTGCTGCAACTGCAACTGGTCTTGCTGCAGGAACTTATACTGTAACAATTACTGATGCTAATGCATGTCAAACAACA
GCATCTGTAACTATTGCACAACCTGCTCTATTAACAGCATCAATATCTAAAACTGATGTTTCTTGTAACGGTGCAAGCGA
CGGAACCGCTGCTGTAACAGCTTCTGGAGGAACTTCGCCTTATACTTATTCATGGTCTCCATCAGGAGGAACTGCAGCAG
CAGCATCAGGATTAAGTCCAAATACGTATACAGTTACCGTGACAGATGCAAACGGATGTTTTACAACTCAATCAGTTACT
ATTGGTACAACTCCAGACGTAACAGCACCGGTACCTAATGTGGCTGTTTTACCGGAGATTACAAATTACTGCTCAGTTTT
AGCATCAGAAATTGCTATTCCAACTGCAACAGATAATTGTGCAGGAACAATAAACGCAACTACAACTGATCCTTTAACTT
ATAATGCAACAGGAACTTATACTATTACATGGGCATACAATGATGGAAACGGAAACGTTACTACTCAGACTCAAACTGTA
AAAGTATTAGCTTCACCTCTAGATTTAGTTACTTTCAGTAATGCATCAGTGACTTACGATGGAAATGCTCATCCTCTACA
GGTTGCAAATCTTCCAACTGGAGCGGCTGTAGCTTACTCTGCAAATAACACATCTGTAAATGCGGGAACTTACACAGTAA
CAGCTGTAATAACTCCTGCTGCCAGTTCGCCTAACTGTTCTCAAATAACATTAACTGCGAACCTGACTATTAATAAAGCA
CCACAAACAATTACGTTTAGTGCTATTCCGGTTAAAACACTAGGAGCAAATAATACTTTTAATTTGACTGCAGCAGCAAG
TTCAAATTTACCAGTAGATTATACTTTTAATTATACTTCTGCTCTGCCTCCTGCAAATGTTTCTACGACTGGTGTTGTAA
ATATGCTGCAATCTGGAGAAGTAACCATCACAGCACATCAGGCTGGAGATGCTAATTATCTTCCTGCTGCAGATGTTTCA
CAATTATTGGTAATCCTTAACAACAATATTGATGTTAAGAGAATTACAATAGGAACAAAAGTATTCGAAAACCCTGGAAA
AGCCATTACACACATAATGTCATGTGCTGAAAACAATCCGGCTGTTTCAATTGTAAACGAATCAAATGCTGTAATTTCTC
CTTCTGCTAATTTCACGATTCAAACTCCAAAACCTGGAATTTATACTCAAAACGTGACCATTACATCAGAAGATGGAAGT
TTGTCTGCAACGTATGCAATTACTGTTGAAAAACCATTCGGATTCTTCGATATCGTTCGTCAGAAATTTAACAATGTACT
TCTTGTAAACAATAATCCGGCAACAAACGGAGGTTACGAATTTGTAGCTTACCAATGGTTTAAAAACGGACAATTGATAG
GAACTGGTCAATATTACTCTGTAAGCGAAAGTTTGAGTACAACTTTAGACCCAACAGCTGATTACAGCGTAAAAATGACA
ACAAAAGATGGTAAAGTATTACAGACTTGTTCTGGCAGAATTACACTTACCAACTCACTTCAGGCTAAGCTGTATCCAAA
CCCAATTCAAACTGGAAAAGCAATCACTGTTGAAGCTGATTTCCCTCAGGAAGAATTAAATAACATGCAGATCAGCCTTT
ACTCAGTTTCTGGCCAATTGATTAAAACTGTTCAATCTTCATCAGCATTAACTGAGATACAATTACCTCAAACAATCGAG
AGTAATATACTTATGGTAGTTCTTGAAACTCCTAATGTAAAAAAATCTTTCAAAGTAATTGTAAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAATACAATGTTATAATAATACACAACTTCGTATAAATACTGTTTATACAGAAGAAGGCTTTATGAGTGGGCACAAATT
GCTCGCTTTTGGTATAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAAACCTGCCGGCACTCTAAAAGCAGTGCCGGCATAATAAAATTTAAGATGAAAAAATATATCAAATCACTCGCCATTA
TAACCGCATTTTTTGCAGCA

Product: PKD domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 2262; Mature: 2261

Protein sequence:

>2262_residues
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SNILMVVLETPNVKKSFKVIVK

Sequences:

>Translated_2262_residues
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TVIRFTDRGYFSDTTWWPASSLEGTVTWTVGSTIPAGTEVHIKGLSASTYNQSNGTLTANGFLALNNGTMPNGLVLTAAG
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GSMNTISFGTQPVAAGTCAGGNATFTAAVSNATGYQWQENTGSGFVNITDGGVYSGAATSTLTITGATAGMNGFLYRLAA
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TAATATGLSAGTYTVTVTDANNCQVTQSFTITQPAAVLSAAFGSQNNVSCNGGANGTATVTVTGGTPGYTYSWAPSGGTN
ATATGLSAGTYTVTVTDANACQTTQSFTITQPAALVASVGSQNNVSCNGGTNGSATVAVTGGTGARTYSWSPTGGTAATA
SGLAVGTYTVTVTDANNCQATQSFTITQPAALTATQSQTDVLCNGGATGTATVIPIGGTPNYTYSWAPSGGTVATATGLT
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KVLASPLDLVTFSNASVTYDGNAHPLQVANLPTGAAVAYSANNTSVNAGTYTVTAVITPAASSPNCSQITLTANLTINKA
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QLLVILNNNIDVKRITIGTKVFENPGKAITHIMSCAENNPAVSIVNESNAVISPSANFTIQTPKPGIYTQNVTITSEDGS
LSATYAITVEKPFGFFDIVRQKFNNVLLVNNNPATNGGYEFVAYQWFKNGQLIGTGQYYSVSESLSTTLDPTADYSVKMT
TKDGKVLQTCSGRITLTNSLQAKLYPNPIQTGKAITVEADFPQEELNNMQISLYSVSGQLIKTVQSSSALTEIQLPQTIE
SNILMVVLETPNVKKSFKVIVK
>Mature_2261_residues
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SMNTISFGTQPVAAGTCAGGNATFTAAVSNATGYQWQENTGSGFVNITDGGVYSGAATSTLTITGATAGMNGFLYRLAAS
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PYSGATTATLTITGATAALNNYQYRLVASGGCTPAATSNSGTLKVSNIQATSVLTSVACNGGNTGSISVTPTGGIGTYTY
LWSNGATSSSISNLTAGNYSVSIKDAVLCEKELNFTVTQPPVLVAAQGTVNNVSCHGGSNGSGTVTVSGGTPGYTYSWAP
SGGTAATASGLAAGTYTVTVTDANNCQTTATVTITEPAVALSATAGLQNNILCRGTATGSATVTAAGGTPGYTYSWSPSG
GTAATATGLTAGTYTVTVTDANACQTTQSFTITEPAASLTATPLAQTNIACRGGATGSATVTAAGGTGGYTYSWAPSGGT
AATATGLSAGTYTVTVTDANNCQVTQSFTITQPAAVLSAAFGSQNNVSCNGGANGTATVTVTGGTPGYTYSWAPSGGTNA
TATGLSAGTYTVTVTDANACQTTQSFTITQPAALVASVGSQNNVSCNGGTNGSATVAVTGGTGARTYSWSPTGGTAATAS
GLAVGTYTVTVTDANNCQATQSFTITQPAALTATQSQTDVLCNGGATGTATVIPIGGTPNYTYSWAPSGGTVATATGLTV
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ITDANGCTLTKNFTITTTNTLVASSFQTNVLCNGTNTGSAGVIPSGAPGPFTYVWAPSGGSADTATNLTAGNYSVTITAS
NGCSIVKNFTITQPTALAVASNSQTNVSCNGGSNGSASVTVTGGTGVYTYAWSPSGGTGATANGLAAGTYTVTITDSNLC
TTTQNFTITQPTALSPTTSKTDVSCNGGSNGSATVNVTGGTGTYTYSWAPSGGTAATATGLAAGTYTVTITDANACQTTA
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GTTPDVTAPVPNVAVLPEITNYCSVLASEIAIPTATDNCAGTINATTTDPLTYNATGTYTITWAYNDGNGNVTTQTQTVK
VLASPLDLVTFSNASVTYDGNAHPLQVANLPTGAAVAYSANNTSVNAGTYTVTAVITPAASSPNCSQITLTANLTINKAP
QTITFSAIPVKTLGANNTFNLTAAASSNLPVDYTFNYTSALPPANVSTTGVVNMLQSGEVTITAHQAGDANYLPAADVSQ
LLVILNNNIDVKRITIGTKVFENPGKAITHIMSCAENNPAVSIVNESNAVISPSANFTIQTPKPGIYTQNVTITSEDGSL
SATYAITVEKPFGFFDIVRQKFNNVLLVNNNPATNGGYEFVAYQWFKNGQLIGTGQYYSVSESLSTTLDPTADYSVKMTT
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NILMVVLETPNVKKSFKVIVK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 226695; Mature: 226564

Theoretical pI: Translated: 4.60; Mature: 4.60

Prosite motif: PS50835 IG_LIKE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.9 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.9 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MANNLPLYNLTNFIMKHFYSQIKKCLNIALFLGIFLQSYLSNSQTTLAAGDILFTGYDGT
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCEEEECCCCC
YANTLGDEFSFVCLKTLDANTVIRFTDRGYFSDTTWWPASSLEGTVTWTVGSTIPAGTEV
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EEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCEECCCCEEEEECCCCCEEEECCC
FDNTLSSPLSTIAEIRTAVMNQANWNLSATTLTLPSGKPFLSTPTTITLNPLDKLICPGA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHCCCCC
NTSFTVAATNATGYQWQVNTGAGFANITNGGVYSGATTATLTITGAAAGMNNYKYRCVAT
CCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCEEECCCCCEECCCEEEEEEEEEEECCCCCCEEEEEEE
GTGTATSNEATLTVPTAIAPSIQSQSNVSVYGGNNGSATLSVSGGTAPYFYSWSPSGGTA
CCCCCCCCCEEEEECCEECCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCE
ATASGLSAGTYTVTITDSTPNGLGGCSTTQTVNIVQPGGSVVSVTSLSAFSSCGGASTEQ
EECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHCCCCCCCC
SFTVQAGGLTANLDLAAPTGFEISTSAGGIYTNNISYVPSSGVVTTKTIYVRLAASATGT
EEEEEECCEEEEEEECCCCCCEEECCCCCEEECCEEECCCCCCEEEEEEEEEEEECCCCC
PSGNITISSTGIVTKNVAVTGSMNTISFGTQPVAAGTCAGGNATFTAAVSNATGYQWQEN
CCCCEEEEECCEEEEEEEEEECCCEEEECCCCCCCEEECCCCEEEEEEECCCCCCEEECC
TGSGFVNITDGGVYSGAATSTLTITGATAGMNGFLYRLAASGTCPTVNSNSVALNINVAA
CCCEEEEEECCCEECCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEEEEE
SITAQPSSSTICAGANTSFAVAASNAVGYQWQVNTGSGFTNITNGGVYTGAATATLTITG
EEEECCCCCEEEECCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCEEEEEEEEE
ATAGMSGYLYRVIATGSCTPDATSNDAALTINVAPAITAQPADSSICVGSNTTFSVTASN
CCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEECCCEEECCCCCEEEECCCCEEEEEECC
ATGYQWQVNTGSGFNNITNGAPYSGATTATLTITGATAALNNYQYRLVASGGCTPAATSN
CCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCCC
SGTLKVSNIQATSVLTSVACNGGNTGSISVTPTGGIGTYTYLWSNGATSSSISNLTAGNY
CCEEEEECEEHHHEEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCE
SVSIKDAVLCEKELNFTVTQPPVLVAAQGTVNNVSCHGGSNGSGTVTVSGGTPGYTYSWA
EEEEEHEEEEECCCCEEEECCCEEEEECCCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEC
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>Mature Secondary Structure 
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