Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is 146300181

Identifier: 146300181

GI number: 146300181

Start: 2902567

End: 2904036

Strand: Direct

Name: 146300181

Synonym: Fjoh_2426

Alternate gene names: NA

Gene position: 2902567-2904036 (Clockwise)

Preceding gene: 146300180

Following gene: 146300182

Centisome position: 47.61

GC content: 30.27

Gene sequence:

>1470_bases
ATGGGTATTGTCTTAAACCAGTCTTTTAAAAACACCATAATTACATATATAGGCTTTGGAATTGGAGCCATTAATACGCT
TTATTTATACCCTGTTTTTTTAGGCGCAACTTTTTATGGTTTAACGAATTATATCACATCTGCAGCAAATGTTATTATGC
CTTTGTTTGCAATTGGAATGCAGAATACTTTGGTTAAATTTTATTCGCAGTACCAAACAGATGAAGAAAAATCCCGTTTT
TTATCCTTTACGGTTTTATTTCCGCTGTTATTAATAATTCCACTTTTGCTTATTGGTCTTGTTTTTTATGATGAGATTAT
ATTCTTTGTATCAAAAAAGAATGCGATTGTAAAAAGTTATATCTGGTTAATACCATTTATAGGGCTGTGCATGGCTTATT
TTGAAATTTTTTATGCCTGGCTCCGTGTAAATATGCATTCCGTTTTTGGAAACTTTATTAAAGAAGTAGGTTTACGATTG
TTTTCATTATTTCTATTGATAGGCGTTTATTACGATTGGCTCAGTGTAGAAGGTTTTGTGTATGCAACAGCTGTTTTATA
CTTTTTGGCATTTCTGGTTACGATGTTATACGCGTTCAGTATTCAAAAGCCAACTTTTCAGTTTACAATACCAGTTAATA
CAAAAGATATATTGATATATACATTTTATATTATTTTATCTGGAAGCGTTGCCAATTTGCTTTTAGATGGAGATAAAATG
ATATTGAATCAGTACATGCAGATTGAAAATATTGCGTTCTATTCTGTAGCAACTTATATTGCTTTGGTAATTTCGGTTCC
GAGTCGTGCCATGCACCAAATTGTATATCCCATTACGGCAAAATTAATGCATGAAAATAAACATGACGAACTGAATCAGC
TTTATAAAAAGACTTCTATAAACCTGCAGATTGTGGGTGGTTTTGTAATGCTTTGCATATTCGTAAACATTAATCAGTTG
TATGAGTTGGTTCCAAAAGAATACAGCGGCGGAATTGCAGTTGTATTTATGATTGGTTTATCTAAGTACTTTGATTTAAT
TTTAGGAAACAATAACGCTATCATTTTTAATACTAAATATTACCGCATGGTGCTTTATTTAGGATTAATGCTGGTTGTAC
TAACAGTTGTTTTAAATATGATCTTTATTCCAATTTTCGGAATATTCGGGTCTGCTTTTGCTACTTTATTATCTATTACA
TTATACAGTTTAGCTAAGCTGCTTTTTGTGGTTAAAAAGCTTAATTTATATCCTTTTACAAAAGAAACAATCTCGTCAAT
GCTATTAACATTTGCTTTGTTTTTAGTATTTTATTTCTGGGAGTTTCCATTTTTTCAGCTTATCAGTATTGCCTTAAAAT
CTATTTTGGTAACCATTTTATATGTTTACCTGAATTACAGATTTAATATTTCTCCGGATATTAATAAAGTTATAGACAAC
ATTCTGAGAAAAATAGGAATTAAAATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTAGTACAATTGATAAATTAAAACAACAATTTCAAAAATAAAAAGAGAGCAGAAAATCAAAAATCTTAACTCTACAAT
CTAAACTCTGCAATCAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACGATTTTATTTCGAAATAAGGAGGGTAATTTAAAATCGAATCTATTTTGTTTTTATATTTGTTAGTAGTAACTAACTA
ATTATAAATGAAATATGAAA

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: Membrane Export Protein; Polysaccharide Transporter

Number of amino acids: Translated: 489; Mature: 488

Protein sequence:

>489_residues
MGIVLNQSFKNTIITYIGFGIGAINTLYLYPVFLGATFYGLTNYITSAANVIMPLFAIGMQNTLVKFYSQYQTDEEKSRF
LSFTVLFPLLLIIPLLLIGLVFYDEIIFFVSKKNAIVKSYIWLIPFIGLCMAYFEIFYAWLRVNMHSVFGNFIKEVGLRL
FSLFLLIGVYYDWLSVEGFVYATAVLYFLAFLVTMLYAFSIQKPTFQFTIPVNTKDILIYTFYIILSGSVANLLLDGDKM
ILNQYMQIENIAFYSVATYIALVISVPSRAMHQIVYPITAKLMHENKHDELNQLYKKTSINLQIVGGFVMLCIFVNINQL
YELVPKEYSGGIAVVFMIGLSKYFDLILGNNNAIIFNTKYYRMVLYLGLMLVVLTVVLNMIFIPIFGIFGSAFATLLSIT
LYSLAKLLFVVKKLNLYPFTKETISSMLLTFALFLVFYFWEFPFFQLISIALKSILVTILYVYLNYRFNISPDINKVIDN
ILRKIGIKI

Sequences:

>Translated_489_residues
MGIVLNQSFKNTIITYIGFGIGAINTLYLYPVFLGATFYGLTNYITSAANVIMPLFAIGMQNTLVKFYSQYQTDEEKSRF
LSFTVLFPLLLIIPLLLIGLVFYDEIIFFVSKKNAIVKSYIWLIPFIGLCMAYFEIFYAWLRVNMHSVFGNFIKEVGLRL
FSLFLLIGVYYDWLSVEGFVYATAVLYFLAFLVTMLYAFSIQKPTFQFTIPVNTKDILIYTFYIILSGSVANLLLDGDKM
ILNQYMQIENIAFYSVATYIALVISVPSRAMHQIVYPITAKLMHENKHDELNQLYKKTSINLQIVGGFVMLCIFVNINQL
YELVPKEYSGGIAVVFMIGLSKYFDLILGNNNAIIFNTKYYRMVLYLGLMLVVLTVVLNMIFIPIFGIFGSAFATLLSIT
LYSLAKLLFVVKKLNLYPFTKETISSMLLTFALFLVFYFWEFPFFQLISIALKSILVTILYVYLNYRFNISPDINKVIDN
ILRKIGIKI
>Mature_488_residues
GIVLNQSFKNTIITYIGFGIGAINTLYLYPVFLGATFYGLTNYITSAANVIMPLFAIGMQNTLVKFYSQYQTDEEKSRFL
SFTVLFPLLLIIPLLLIGLVFYDEIIFFVSKKNAIVKSYIWLIPFIGLCMAYFEIFYAWLRVNMHSVFGNFIKEVGLRLF
SLFLLIGVYYDWLSVEGFVYATAVLYFLAFLVTMLYAFSIQKPTFQFTIPVNTKDILIYTFYIILSGSVANLLLDGDKMI
LNQYMQIENIAFYSVATYIALVISVPSRAMHQIVYPITAKLMHENKHDELNQLYKKTSINLQIVGGFVMLCIFVNINQLY
ELVPKEYSGGIAVVFMIGLSKYFDLILGNNNAIIFNTKYYRMVLYLGLMLVVLTVVLNMIFIPIFGIFGSAFATLLSITL
YSLAKLLFVVKKLNLYPFTKETISSMLLTFALFLVFYFWEFPFFQLISIALKSILVTILYVYLNYRFNISPDINKVIDNI
LRKIGIKI

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56206; Mature: 56075

Theoretical pI: Translated: 9.37; Mature: 9.37

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
GIVLNQSFKNTIITYIGFGIGAINTLYLYPVFLGATFYGLTNYITSAANVIMPLFAIGM
CEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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HHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA