| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146299882
Identifier: 146299882
GI number: 146299882
Start: 2569868
End: 2572705
Strand: Direct
Name: 146299882
Synonym: Fjoh_2126
Alternate gene names: NA
Gene position: 2569868-2572705 (Clockwise)
Preceding gene: 146299881
Following gene: 146299885
Centisome position: 42.15
GC content: 23.11
Gene sequence:
>2838_bases ATGGAGAGAATATTAAAACTAAAAATTTTCTTAAAAAGTAAATTATCATTTTTTTTTGAAGCAATAATAAATCTATTTGG TAAAATATTAGTCTTTCTAAAAAGCAATTTTAATGTTTTTTTTTCTTGGTTAGTTTTGGTTACAATAGTTTTGATTTTTC AAAATAAAATTGCAACTTTTTTAGCAGAAAATTCTATCATAAAACATGTTGATGTTAAAAAACAAAGTTTCAATTTAGCA TTTGTAACATTAGTACTGATATTCTTGATTCGTTTTTTTTGGTTTATAGTAAAAAACTATAGAATTTCTCAAAAACAGAA CTATTTTATCTTTTTATTTAGTTCAATTTACTTCTTTCTTAGGAATGATGAAAATGACTCTTTATATTTTTCATATTTAA GTAGAAGACACGAATTATATTATTCTGATATAATATTACTAATTGCAATTTTATCAATTTTATTAATCTTTAGAAATATA TTTTTAAGAAATTGGAGTTTATATGATAATATAGTTAGTTGGTTTGATGAATTGATCAAAAAAGGCGAACATGTTAAATC CTCTTTTTTAATAGAAGACATTCCTCTAAATAATACAAATATTAACGATAATGAAAAAGTAATTGATGAGGTTGTAAAGG CTGTAATAAATTTAAAACCATCTTATTCATTTATAATAGGAATAAACTCAATATGGGGAATTGGTAAAACAAGTTTTTTG AAACGTCTAGAATATAAACTTACCATTCAAAAAATACACAATGAAAGTAAGCCAATAACTTTTTGGTTTAATGCTTGGCA ACATCAGGATGAAAAATCAATAATTAATAATTTTTTCAATCAATTAAAAAAAGAACTATCAGTATTTTCAGGAGATTCTG AAAATTCAATCGACAATTATTTAAAAGAAATGCTGGCTTTAGCCGACAATAAATATTTAAATTTCTTTAAATCAATAACT GATAGCATATTCTCTAATGGAGATAGTATAAAAGAGTCTTATGATGAAATAAATGTTATCATTGAGGAAATTAATAGAAA AATAATTGTATTTGTTGATGATATTGATAGATTAAATAAAGTTGAAATTTTAGAGACATTACGGATTTTACGTAATATAG CAAATTTTAAAAATGTTGTTTTTGTCTGTGGTTTTGATAGAGAATATGTGGTCAAACAATCGCAAATTGATAATCATTAT CTCGATAAAATTTTCAATTTAGAAATTAATTTAACTACACAAAATCAAAAAGGATTTGTTTCTTTTTTTAGTGAATTAAT TAATAGTTCGTCTGGCTACGATAATGATGAAAAAAATATATTAATAGAATCTGTTAATAAAATATTTTATGCAGATGAAG AAAGCAGTATTGATATTAGTTCACTCATTAAAATGACACGCGAAAATAACACAAATCAAGAAGGTTTTAAAAATGAAGAA GTTTTAGCCAAAATACCTTTAATTCCTTCATTTTTCTTTGAATCAAGAAGGGATGTTAAAAAATTTTATAACGAATTATA TATTAATTTTAAAACTCTGGGTAGCAACATTTCGGATATTAATCTTGAGAAATACTTATTATTGAAACTATTATTATTCA AATATAAATGGATGCATAAAAATTTTGCTTCGAAAAGAATAAATTCTTGGCTTGGAAGTGAACCTGTTTTGAGGTTTAAA GAATTAAATTTAAAAAAATTATTGCTGAATAAGGAAATAGAAAATCAAGATAGTTATATAATTTTTTCAGTTTTACTTCT CTTATTTCCAGAAAATGGTTTGCATAATCATTCTCCAGAAATAAATCAAAAAAGATATTTTCCTATCTATTTCAGTAACA ATGTATTTAATGAATGTCTGACTTATTATCAGCTAACTGATGCTATTAAAAATAATAGAGTTAAAAAACTTTTAACAGAT ATTGTAAATGGGAAAGAAAATGAAAGGTCAATTATAAATGATATAAAATTATTTTTGCTAAAACCTGAGAATATAGATAA TATTAATGAATACAAACAAGTCGTAGATTTAATCAAAAATGGTGATTTGGGTAAAGTTGATGAAATGAAAATTCTTAATT TTTTGCATTTAGGCGAGAAAAATTTTGGAATTGAGTACAAGAAATTGTTAGCTTTTATTTTTACAAATTTTGAAGATCCT TTCGGATCTTTTGCATTAGATTTAAGTATCTATTATAGAAAATATCCTCTTGATTCTTCAAGAAACAAATATAAACTTGA GGACGGCATTGATCATAAAACAATTGATGCTTTAAAGATTTTGAATAAAGAAGTTCTAAAGAAACTAAATTTAGTAATTC TCAGAAAAGAAATAAATGCTAAAAATTTGGATACTAAAATGATTTTATCAAATTTTAATAGATTCTATGAAATATATTTT ACAGACCTTAAATTCGGATTTTTTTATGAAGAATATAAGGTAATCATAAAGGGTTATATGACTGAAAATTTTGAAAATAT TTTTTTAGCTAATAATGTAGAGAAAACAATTTCAGATATGGATACAACTTTATTGACCAATCTTTTTGAAAATGATATTG ATAAAAAAGAATTTGTAGAGGTATTAAAAATGCAAGTTGACGGCAAAGTTAATGGAACATCTAAGCCAATGAATGGAATA ATTTATAGAGAAGGAGGATTGAATAATTTTATTAAATATGTTGAAGATATAGAGAATTTAATTAGCCCAGAAAAAATAGA AATTTATAAAGAGTTTTTAGTATGGTTACATACATTTAGAGATAATTTTTACTTAGGTAAACCAACTACAAAAGAAGTAA GTGATTTTAAAAATGGAATTCGTAATAATGTTAATTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AATAAATCTGTAAAACAAAGCTAAAACATGAGTGCGGGCACGGATTTCAAATCCGCGCTATCGGGTTCTATGATTGGATA CTTAACTTTAAAAACATCAC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTGAAGATATACTTCTAAATAAAGATTTTATAGTCCCTGTCTCGTCCTGAAACCCGATAACGCAGATTGCAAATCCA CGTTATCGGGTTTTTAAACT
Product: KAP P-loop domain-containing protein
Products: NA
Alternate protein names: KAP Family P-Loop Domain Protein; KAP Family P-Loop Domain-Containing Protein; Protein Containing KAP Family P-Loop Domain; P-Loop ATPase
Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 945
Protein sequence:
>945_residues MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATFLAENSIIKHVDVKKQSFNLA FVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFLRNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNI FLRNWSLYDNIVSWFDELIKKGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNYLKEMLALADNKYLNFFKSIT DSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNKVEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHY LDKIFNLEINLTTQNQKGFVSFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHKNFASKRINSWLGSEPVLRFK ELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPEINQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTD IVNGKENERSIINDIKLFLLKPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINAKNLDTKMILSNFNRFYEIYF TDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDMDTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGI IYREGGLNNFIKYVEDIENLISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN
Sequences:
>Translated_945_residues MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATFLAENSIIKHVDVKKQSFNLA FVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFLRNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNI FLRNWSLYDNIVSWFDELIKKGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNYLKEMLALADNKYLNFFKSIT DSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNKVEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHY LDKIFNLEINLTTQNQKGFVSFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHKNFASKRINSWLGSEPVLRFK ELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPEINQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTD IVNGKENERSIINDIKLFLLKPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINAKNLDTKMILSNFNRFYEIYF TDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDMDTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGI IYREGGLNNFIKYVEDIENLISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN >Mature_945_residues MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATFLAENSIIKHVDVKKQSFNLA FVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFLRNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNI FLRNWSLYDNIVSWFDELIKKGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNYLKEMLALADNKYLNFFKSIT DSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNKVEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHY LDKIFNLEINLTTQNQKGFVSFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHKNFASKRINSWLGSEPVLRFK ELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPEINQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTD IVNGKENERSIINDIKLFLLKPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINAKNLDTKMILSNFNRFYEIYF TDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDMDTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGI IYREGGLNNFIKYVEDIENLISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN
Specific function: Unknown
COG id: COG4928
COG function: function code R; Predicted P-loop ATPase
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 111764; Mature: 111764
Theoretical pI: Translated: 8.07; Mature: 8.07
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.1 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAENSIIKHVDVKKQSFNLAFVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFL HHHCCHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHH RNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNIFLRNWSLYDNIVSWFDELIK CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH KGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL CCCHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHCCCCHHHHH KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNY HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH LKEMLALADNKYLNFFKSITDSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNK HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHH VEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHYLDKIFNLEINLTTQNQKGFV HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHEEEEEEEEECCCCHHH SFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHK HHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NFASKRINSWLGSEPVLRFKELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPE HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC INQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTDIVNGKENERSIINDIKLFLL CCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEEEE KPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINA CCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCC KNLDTKMILSNFNRFYEIYFTDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDM CCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHH DTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGIIYREGGLNNFIKYVEDIENL HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH ISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MERILKLKIFLKSKLSFFFEAIINLFGKILVFLKSNFNVFFSWLVLVTIVLIFQNKIATF CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAENSIIKHVDVKKQSFNLAFVTLVLIFLIRFFWFIVKNYRISQKQNYFIFLFSSIYFFL HHHCCHHHHCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHH RNDENDSLYFSYLSRRHELYYSDIILLIAILSILLIFRNIFLRNWSLYDNIVSWFDELIK CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH KGEHVKSSFLIEDIPLNNTNINDNEKVIDEVVKAVINLKPSYSFIIGINSIWGIGKTSFL CCCHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCHHCCCCHHHHH KRLEYKLTIQKIHNESKPITFWFNAWQHQDEKSIINNFFNQLKKELSVFSGDSENSIDNY HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH LKEMLALADNKYLNFFKSITDSIFSNGDSIKESYDEINVIIEEINRKIIVFVDDIDRLNK HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHH VEILETLRILRNIANFKNVVFVCGFDREYVVKQSQIDNHYLDKIFNLEINLTTQNQKGFV HHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHEEEEEEEEECCCCHHH SFFSELINSSSGYDNDEKNILIESVNKIFYADEESSIDISSLIKMTRENNTNQEGFKNEE HHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCH VLAKIPLIPSFFFESRRDVKKFYNELYINFKTLGSNISDINLEKYLLLKLLLFKYKWMHK HHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NFASKRINSWLGSEPVLRFKELNLKKLLLNKEIENQDSYIIFSVLLLLFPENGLHNHSPE HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC INQKRYFPIYFSNNVFNECLTYYQLTDAIKNNRVKKLLTDIVNGKENERSIINDIKLFLL CCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHEEEE KPENIDNINEYKQVVDLIKNGDLGKVDEMKILNFLHLGEKNFGIEYKKLLAFIFTNFEDP CCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC FGSFALDLSIYYRKYPLDSSRNKYKLEDGIDHKTIDALKILNKEVLKKLNLVILRKEINA CCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCC KNLDTKMILSNFNRFYEIYFTDLKFGFFYEEYKVIIKGYMTENFENIFLANNVEKTISDM CCCHHHHHHHHHHHHEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHH DTTLLTNLFENDIDKKEFVEVLKMQVDGKVNGTSKPMNGIIYREGGLNNFIKYVEDIENL HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH ISPEKIEIYKEFLVWLHTFRDNFYLGKPTTKEVSDFKNGIRNNVN CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA