| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146299021
Identifier: 146299021
GI number: 146299021
Start: 1436842
End: 1438062
Strand: Direct
Name: 146299021
Synonym: Fjoh_1261
Alternate gene names: NA
Gene position: 1436842-1438062 (Clockwise)
Preceding gene: 146299020
Following gene: 146299022
Centisome position: 23.57
GC content: 33.66
Gene sequence:
>1221_bases ATGAAAAATATAGGAATTAAAATCTCACTTTACCTCAATTATTTTGTCTTTGCTATTTTATTAAACAGCGTAGGAATTGT GATTTTAAAATCGCAGAAAAATTATGGAGTCGACGAGGTTCAGGCGAGTATTTTAGAAGCCTTTAAAGATATGCCAATTG CCATTGTATCCTTTTTTATAGCTTCTTTTCTGCCCCGAATAGGTTATAGAAAAGCGATGTTAACAGGATTGGCTTTGGTT ACTTTGGCGTGTATTTCTATGTATTTTGGAAACTCATTTAACAATGCTAAAATCCTTTTTGCAACCGTTGGAGTTTCATT TGCTCTGATTAAAGTTTCTGTTTATTCGTTAATAGGAACCGTAACCGAAACCAAAAAAGAGCACAATGCTTTAATGAGCA GTATCGAAGGTTTTTTTATGGTAGGAATTGCGCTGGCTTATTTTTTATTTCCGGCTTTTAATAACGAAAATGATCCCAAT TCATGGCTTAATGTATATTGGTTATTGGCAGGATTATCGTTTTTATCGTTTTTGTTTTTACTCTTTATAAAATTTGAAGA AACAGAAGTCGCAGCAGGAGCAAACCTTAAAGATGATTTTTTGCAGATGTTCAAATTAATGGCAAAACTGCTGACCGTTA TTTTTGTCATCAGCGTGTTTTTATTTGTAATGATCGAGCAGGGAATACTTTCTTGGCTGCCTACATTTAATACAAAAGTG CTGCATCTGCCTGAAAACATCAGCATTATGATGGCCAGTATTTTGGCAGTTTCATTAGCAATTGGAAGACTTATAGCAGG AATTGTAACTAAAAAAATAAACTGGATTTGGGTTTTAAGTTTCTGCATTGTTTCAGCCATGCTTTTGGTAACATTTGTGC TTCCAAAAACGGTTGGATTAGAAGTGAAAAATATTGATACACTTTCAGATATACCATTAATTGGTTTTGCATTTCCTTTA ATCGGATTGTTTATTGCGCCCATTTATCCATTGTTAAATTCAATTGTATTAAGTGCTTTACCAAAGAATCTGCAAAGTTC CATGACCGGATTAATTGTCATTTTTTCGGCTCTTGGCGGCACATTGGGGTCCAGAATTACAGGCTGGCTTTTTAAAAATG AAGGTCCGGAAAAGGCTTTTTATTTTACCCTCATTCCAATGACTTTGTTACTGATCTCCTTTTTTATTCTTAAAAAAATA ACTGCAAAAGATGAAATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTCTATGTGTTAAAATTTATATGGTATTGTAGAGACGCACTGCTGTGTGTCTCGGCACCATAACTAAACGTATTACGT TCCATAACCACAAAATACAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ACTACATATAACCCAAACCATCGAAAAATTATTGGCTCAGGAAGATACTGACGGCGATAAAAAAATTACGATAGATGACA ACGGTCCAAAAAGTTTTTTA
Product: major facilitator transporter
Products: NA
Alternate protein names: Facilitator Superfamily Transporter; Facilitator Family Transporter; Transporter Facilitator Family; Transporter MFS Superfamily; Facilitator Superfamily Permease
Number of amino acids: Translated: 406; Mature: 406
Protein sequence:
>406_residues MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFIASFLPRIGYRKAMLTGLALV TLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGTVTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPN SWLNVYWLLAGLSFLSFLFLLFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGLEVKNIDTLSDIPLIGFAFPL IGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGGTLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKI TAKDEI
Sequences:
>Translated_406_residues MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFIASFLPRIGYRKAMLTGLALV TLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGTVTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPN SWLNVYWLLAGLSFLSFLFLLFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGLEVKNIDTLSDIPLIGFAFPL IGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGGTLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKI TAKDEI >Mature_406_residues MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFIASFLPRIGYRKAMLTGLALV TLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGTVTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPN SWLNVYWLLAGLSFLSFLFLLFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGLEVKNIDTLSDIPLIGFAFPL IGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGGTLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKI TAKDEI
Specific function: Unknown
COG id: COG0738
COG function: function code G; Fucose permease
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44990; Mature: 44990
Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51
Prosite motif: PS50850 MFS
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 3.4 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFI CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH ASFLPRIGYRKAMLTGLALVTLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPNSWLNVYWLLAGLSFLSFLFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV HHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGL EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC EVKNIDTLSDIPLIGFAFPLIGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGG EECCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKITAKDEI HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFI CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH ASFLPRIGYRKAMLTGLALVTLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPNSWLNVYWLLAGLSFLSFLFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV HHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGL EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC EVKNIDTLSDIPLIGFAFPLIGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGG EECCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKITAKDEI HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA