Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is 146299021

Identifier: 146299021

GI number: 146299021

Start: 1436842

End: 1438062

Strand: Direct

Name: 146299021

Synonym: Fjoh_1261

Alternate gene names: NA

Gene position: 1436842-1438062 (Clockwise)

Preceding gene: 146299020

Following gene: 146299022

Centisome position: 23.57

GC content: 33.66

Gene sequence:

>1221_bases
ATGAAAAATATAGGAATTAAAATCTCACTTTACCTCAATTATTTTGTCTTTGCTATTTTATTAAACAGCGTAGGAATTGT
GATTTTAAAATCGCAGAAAAATTATGGAGTCGACGAGGTTCAGGCGAGTATTTTAGAAGCCTTTAAAGATATGCCAATTG
CCATTGTATCCTTTTTTATAGCTTCTTTTCTGCCCCGAATAGGTTATAGAAAAGCGATGTTAACAGGATTGGCTTTGGTT
ACTTTGGCGTGTATTTCTATGTATTTTGGAAACTCATTTAACAATGCTAAAATCCTTTTTGCAACCGTTGGAGTTTCATT
TGCTCTGATTAAAGTTTCTGTTTATTCGTTAATAGGAACCGTAACCGAAACCAAAAAAGAGCACAATGCTTTAATGAGCA
GTATCGAAGGTTTTTTTATGGTAGGAATTGCGCTGGCTTATTTTTTATTTCCGGCTTTTAATAACGAAAATGATCCCAAT
TCATGGCTTAATGTATATTGGTTATTGGCAGGATTATCGTTTTTATCGTTTTTGTTTTTACTCTTTATAAAATTTGAAGA
AACAGAAGTCGCAGCAGGAGCAAACCTTAAAGATGATTTTTTGCAGATGTTCAAATTAATGGCAAAACTGCTGACCGTTA
TTTTTGTCATCAGCGTGTTTTTATTTGTAATGATCGAGCAGGGAATACTTTCTTGGCTGCCTACATTTAATACAAAAGTG
CTGCATCTGCCTGAAAACATCAGCATTATGATGGCCAGTATTTTGGCAGTTTCATTAGCAATTGGAAGACTTATAGCAGG
AATTGTAACTAAAAAAATAAACTGGATTTGGGTTTTAAGTTTCTGCATTGTTTCAGCCATGCTTTTGGTAACATTTGTGC
TTCCAAAAACGGTTGGATTAGAAGTGAAAAATATTGATACACTTTCAGATATACCATTAATTGGTTTTGCATTTCCTTTA
ATCGGATTGTTTATTGCGCCCATTTATCCATTGTTAAATTCAATTGTATTAAGTGCTTTACCAAAGAATCTGCAAAGTTC
CATGACCGGATTAATTGTCATTTTTTCGGCTCTTGGCGGCACATTGGGGTCCAGAATTACAGGCTGGCTTTTTAAAAATG
AAGGTCCGGAAAAGGCTTTTTATTTTACCCTCATTCCAATGACTTTGTTACTGATCTCCTTTTTTATTCTTAAAAAAATA
ACTGCAAAAGATGAAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTCTATGTGTTAAAATTTATATGGTATTGTAGAGACGCACTGCTGTGTGTCTCGGCACCATAACTAAACGTATTACGT
TCCATAACCACAAAATACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTACATATAACCCAAACCATCGAAAAATTATTGGCTCAGGAAGATACTGACGGCGATAAAAAAATTACGATAGATGACA
ACGGTCCAAAAAGTTTTTTA

Product: major facilitator transporter

Products: NA

Alternate protein names: Facilitator Superfamily Transporter; Facilitator Family Transporter; Transporter Facilitator Family; Transporter MFS Superfamily; Facilitator Superfamily Permease

Number of amino acids: Translated: 406; Mature: 406

Protein sequence:

>406_residues
MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFIASFLPRIGYRKAMLTGLALV
TLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGTVTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPN
SWLNVYWLLAGLSFLSFLFLLFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV
LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGLEVKNIDTLSDIPLIGFAFPL
IGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGGTLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKI
TAKDEI

Sequences:

>Translated_406_residues
MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFIASFLPRIGYRKAMLTGLALV
TLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGTVTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPN
SWLNVYWLLAGLSFLSFLFLLFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV
LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGLEVKNIDTLSDIPLIGFAFPL
IGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGGTLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKI
TAKDEI
>Mature_406_residues
MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFIASFLPRIGYRKAMLTGLALV
TLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGTVTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPN
SWLNVYWLLAGLSFLSFLFLLFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV
LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGLEVKNIDTLSDIPLIGFAFPL
IGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGGTLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKI
TAKDEI

Specific function: Unknown

COG id: COG0738

COG function: function code G; Fucose permease

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 44990; Mature: 44990

Theoretical pI: Translated: 9.51; Mature: 9.51

Prosite motif: PS50850 MFS

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFI
CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
ASFLPRIGYRKAMLTGLALVTLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPNSWLNVYWLLAGLSFLSFLFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV
HHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGL
EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EVKNIDTLSDIPLIGFAFPLIGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGG
EECCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKITAKDEI
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKNIGIKISLYLNYFVFAILLNSVGIVILKSQKNYGVDEVQASILEAFKDMPIAIVSFFI
CCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
ASFLPRIGYRKAMLTGLALVTLACISMYFGNSFNNAKILFATVGVSFALIKVSVYSLIGT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTETKKEHNALMSSIEGFFMVGIALAYFLFPAFNNENDPNSWLNVYWLLAGLSFLSFLFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFIKFEETEVAAGANLKDDFLQMFKLMAKLLTVIFVISVFLFVMIEQGILSWLPTFNTKV
HHHHCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
LHLPENISIMMASILAVSLAIGRLIAGIVTKKINWIWVLSFCIVSAMLLVTFVLPKTVGL
EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EVKNIDTLSDIPLIGFAFPLIGLFIAPIYPLLNSIVLSALPKNLQSSMTGLIVIFSALGG
EECCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TLGSRITGWLFKNEGPEKAFYFTLIPMTLLLISFFILKKITAKDEI
HHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA