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The map label for this gene is 146298823

Identifier: 146298823

GI number: 146298823

Start: 1205295

End: 1206689

Strand: Direct

Name: 146298823

Synonym: Fjoh_1062

Alternate gene names: NA

Gene position: 1205295-1206689 (Clockwise)

Preceding gene: 146298822

Following gene: 146298824

Centisome position: 19.77

GC content: 32.26

Gene sequence:

>1395_bases
ATGCTTAGTTTTTTATTGGTCAGATTATATACAGGTATTTTGCCTACCGCCGAATATGGCGAAGTTTCGATTGTATTGTC
CTGGATGGTTTTCTTTAACGTAGTTCTTTCTTACGGAATGGAAACGGCATTTTTTAGATTTTACAGTGCCGAAGAAGACA
AGAAAAATGTTATTGCAACATCTACAATATCCATATTTTGGTCATCAATCGGGTTCTTGTTTGCAGCCTTAATTTTTAGA
AATACCCTCGCAAATTGGGCCGAAGTCGATGCACAGTATATTACCTATTCAGTTTGGATTTTGGTTTTAGATGCATTGGT
TTTAGTACCGTTTTCTAAACTAAGAGCCAACCAGCGCCCAATGGTTTATGCAGCAATTAAAATTGGAAACGTAGTCATTA
ATTTATTACTGAATATTTTCTTTTTAATGTATCTGCCAAAATTAGCAGCTGCAAATCCTAATTCAGTTTGGGATAATTTA
TATGTAGAAAATTTCCAGATCGCTTATATTTTCATTGCAAACCTTTTAGCGAGTTTAGCCACTTTCATTGTTCTTTCTCC
AAATTATCTTTCGCTTGGACGAAAATTTGATCCTGTACTTTGGAAAAAAATGATGAAATACGGACTGCCAATTTTAGTAG
CCGGACTTGCATTTGCAGTTAACGAACATTTCGATAAAATCTTATTAGGATATTTATTGCCCGAAAATTTGGCAAAATCT
GAAGTTGGAGCCTATTCTGCCTGTTATAAACTAGGTTTATTTATGGTTTTATTTGCAACCGCATTTAGATTAGGAATTGA
ACCTTTCTTTTTCAGCCATGCCAAAAACGAAAAAGCACCACAGACTTATGCCGTAATTACAAAATACTTTGTAATTTTTG
GATCATTGATTTTATTGGGAGTTATCGTTTTTGCCGATGTTTTAAAATTCCTTCTTCTGGATAATAAATCATATTGGGAA
GCAATGAAAGTAGTGCCATTAATTATTTTGGCAAACTTCTTTTTAGGAATTTACAATAACCTTTCTGTTTGGTATAAACT
AACAGATAAAACAAAAATTGGAGCCTACATTTCAATTGTTGGTGCTATTATAACATTAGTTTTAAATTACTTTTTAATTC
CAAAATACAGCTATTACGGTTCTGCGATTGCAACAATTTCTGCTTACGGAAGTATGATGTTGATATCCTATATTTTAGGA
AATAAGTATTATCCAATACCTTATGATATGAATAAAATTGGAGCTTATTTAGGAATTTCAATTTTATTTTCGGCTATTTC
CTTTTACGGATTTAGAGAAAATTATTTCGTTGGAATTCCGTTATTATTAGCCTTTATGTACTTTGTGTACCACAACGAAA
AAGACACGATCAAAGGAATTATGAACAGAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTTTTGTTTTCCGAACTTTATTACTAATTATTTTGGGATTATATAAAAATCTATTCAAACAAACTGCGATTTATGGGC
TGGCAACCGTTTTACCACGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATGCTTTTTTAATCTTTTATAATAAAATGAAAATACAAATTATCAATAAATCACGACACGATTTACCAAATTACGAAA
CAATAGCTTCTGCAGGAATG

Product: multi anti extrusion protein MatE

Products: NA

Alternate protein names: Exopolysaccharide Biosynthesis Protein; O-Antigen And Teichoic Acid Export Protein; Multi Anti Extrusion Protein MatE; Polysaccharide Transporter; Polysaccharide Biosynthesis Protein CpsL; Polysaccharide Biosynthesis Domain-Containing Protein; O-Antigen Translocase; Polysaccharide Biosynthesis Transmembrane Protein

Number of amino acids: Translated: 464; Mature: 464

Protein sequence:

>464_residues
MLSFLLVRLYTGILPTAEYGEVSIVLSWMVFFNVVLSYGMETAFFRFYSAEEDKKNVIATSTISIFWSSIGFLFAALIFR
NTLANWAEVDAQYITYSVWILVLDALVLVPFSKLRANQRPMVYAAIKIGNVVINLLLNIFFLMYLPKLAAANPNSVWDNL
YVENFQIAYIFIANLLASLATFIVLSPNYLSLGRKFDPVLWKKMMKYGLPILVAGLAFAVNEHFDKILLGYLLPENLAKS
EVGAYSACYKLGLFMVLFATAFRLGIEPFFFSHAKNEKAPQTYAVITKYFVIFGSLILLGVIVFADVLKFLLLDNKSYWE
AMKVVPLIILANFFLGIYNNLSVWYKLTDKTKIGAYISIVGAIITLVLNYFLIPKYSYYGSAIATISAYGSMMLISYILG
NKYYPIPYDMNKIGAYLGISILFSAISFYGFRENYFVGIPLLLAFMYFVYHNEKDTIKGIMNRK

Sequences:

>Translated_464_residues
MLSFLLVRLYTGILPTAEYGEVSIVLSWMVFFNVVLSYGMETAFFRFYSAEEDKKNVIATSTISIFWSSIGFLFAALIFR
NTLANWAEVDAQYITYSVWILVLDALVLVPFSKLRANQRPMVYAAIKIGNVVINLLLNIFFLMYLPKLAAANPNSVWDNL
YVENFQIAYIFIANLLASLATFIVLSPNYLSLGRKFDPVLWKKMMKYGLPILVAGLAFAVNEHFDKILLGYLLPENLAKS
EVGAYSACYKLGLFMVLFATAFRLGIEPFFFSHAKNEKAPQTYAVITKYFVIFGSLILLGVIVFADVLKFLLLDNKSYWE
AMKVVPLIILANFFLGIYNNLSVWYKLTDKTKIGAYISIVGAIITLVLNYFLIPKYSYYGSAIATISAYGSMMLISYILG
NKYYPIPYDMNKIGAYLGISILFSAISFYGFRENYFVGIPLLLAFMYFVYHNEKDTIKGIMNRK
>Mature_464_residues
MLSFLLVRLYTGILPTAEYGEVSIVLSWMVFFNVVLSYGMETAFFRFYSAEEDKKNVIATSTISIFWSSIGFLFAALIFR
NTLANWAEVDAQYITYSVWILVLDALVLVPFSKLRANQRPMVYAAIKIGNVVINLLLNIFFLMYLPKLAAANPNSVWDNL
YVENFQIAYIFIANLLASLATFIVLSPNYLSLGRKFDPVLWKKMMKYGLPILVAGLAFAVNEHFDKILLGYLLPENLAKS
EVGAYSACYKLGLFMVLFATAFRLGIEPFFFSHAKNEKAPQTYAVITKYFVIFGSLILLGVIVFADVLKFLLLDNKSYWE
AMKVVPLIILANFFLGIYNNLSVWYKLTDKTKIGAYISIVGAIITLVLNYFLIPKYSYYGSAIATISAYGSMMLISYILG
NKYYPIPYDMNKIGAYLGISILFSAISFYGFRENYFVGIPLLLAFMYFVYHNEKDTIKGIMNRK

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52712; Mature: 52712

Theoretical pI: Translated: 9.49; Mature: 9.49

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHCCCCCCEECHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA