| Definition | Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009257 |
| Length | 1,898,476 |
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The map label for this gene is yidK [C]
Identifier: 134301624
GI number: 134301624
Start: 558934
End: 560205
Strand: Direct
Name: yidK [C]
Synonym: FTW_0563
Alternate gene names: 134301624
Gene position: 558934-560205 (Clockwise)
Preceding gene: 134301623
Following gene: 134301631
Centisome position: 29.44
GC content: 29.09
Gene sequence:
>1272_bases ATGAATAACTCTGAAAACTACTACACAGCAGGAAAGAGTTTAGGGCTTTTTGCTCTTACAGCTACTCTTGTAATGACAGA GTTAAATATATCGACTTTAGTAGGTTTCTCAAGTTTAGGTTATTTGTATGGTTTTTCAGAATTATTTTTAGGGATTGTAT TTCTAGTTGGGTTATTATTTTATTCTTTTAGTGTTGCTAAAAAGTGGAAAAATTTTGATGCAATCTGTGTTTCAGAATTT TTTTCTCAACGTTATAATAGGGCATTTGGTTTGATGGTAGCATTGTGCTTACTAATAGCAATGACAGGTTTTGGAGCTAA CTTTATATATTCTACTACAATTTACCTACAAGAAATTTTCCCTAATTATAATCATTGGTTAATAAGTGGGGTAGCTTGTA GTTTAATGTTATTATTTACTATAAGAGATGGTCTAATAAGGATAGTAAAAATAGATAAACTAAGTTTTATATTATCTCTA ATATTATTTGTATATTTAGGCTATTTAGTATATAAGGCAGGCATTTCTTCATTTAAACATATTAGTAGTCAAGAAGTAAC TTTGCCATTTTCTTTCCCAATCTCTTTAGCATTTCTTACAGCATTTACATATATTCTTTCACCTTGGTATGGTCAAAAGA TATTTGCGGCAAAATCTAAGAAAACAGCATTTTATGCAGTGATGATTGCTGCATTTATTGTAAGCTTAATTTATTTAATA GCAGTTTATACTACAGCTAAATATGCTGGGATGATTAATTTGTCAAATCCTGATAAGGCATTTACATCTATAGTTACAAC TCTTTTTAGTAGACCTATACTAGTAACATTTTATATTGTGATGTTTCTAATAGCCTTAACAACTATCGCGGCCCTTTGGA ATACTATGGCATCGATGTGTTTTGTACACTTTCAAAGAAATAAGAGTGAAAAGAAAAATATTATTACAGTAATAATTATT GCAATTTTAAGTTATACACTTGCCAATACTTTTATAGATCAAGTTCTGGATAAGATGCTACTTTTTAATATCCCAATAGC AGCATTAGCATTTAGTTTATTATATGGTTTTTATGGCAGTAGAACTAATTTTTTAGGAGCTATCTTAAGCACAATAGTTG GGATTGTGAGTGCTTTATACTGTTATTTGCTTTTTAAGCAAGAAGAGTTTGTTTTTTATTGGGCTTTTATATGCATACCA TTGAGTTTTATAGTAGGATATTTGCCTGTAATTACAGATAAATACAGAAGGTTGTTAAGAGTAAAGAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CATAAGGGTTATCCAACAAAAGAGCATTTAGAGAATATAAAAAAATATGGTGTATTAGATATCCATAGGAAAAGTTATAA ACCAGTACAAGTGTTATTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTAACGAAAGAACGTTATCTGAATTAGTTTCTCCTAATTTCTTAGGATTAGCAGTTTCATCATCTTCGCCTTCATTGAT ATTAATTCCATAACCAAATT
Product: sodium-solute symporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: Sodium/Glucose Cotransporter
Number of amino acids: Translated: 423; Mature: 423
Protein sequence:
>423_residues MNNSENYYTAGKSLGLFALTATLVMTELNISTLVGFSSLGYLYGFSELFLGIVFLVGLLFYSFSVAKKWKNFDAICVSEF FSQRYNRAFGLMVALCLLIAMTGFGANFIYSTTIYLQEIFPNYNHWLISGVACSLMLLFTIRDGLIRIVKIDKLSFILSL ILFVYLGYLVYKAGISSFKHISSQEVTLPFSFPISLAFLTAFTYILSPWYGQKIFAAKSKKTAFYAVMIAAFIVSLIYLI AVYTTAKYAGMINLSNPDKAFTSIVTTLFSRPILVTFYIVMFLIALTTIAALWNTMASMCFVHFQRNKSEKKNIITVIII AILSYTLANTFIDQVLDKMLLFNIPIAALAFSLLYGFYGSRTNFLGAILSTIVGIVSALYCYLLFKQEEFVFYWAFICIP LSFIVGYLPVITDKYRRLLRVKN
Sequences:
>Translated_423_residues MNNSENYYTAGKSLGLFALTATLVMTELNISTLVGFSSLGYLYGFSELFLGIVFLVGLLFYSFSVAKKWKNFDAICVSEF FSQRYNRAFGLMVALCLLIAMTGFGANFIYSTTIYLQEIFPNYNHWLISGVACSLMLLFTIRDGLIRIVKIDKLSFILSL ILFVYLGYLVYKAGISSFKHISSQEVTLPFSFPISLAFLTAFTYILSPWYGQKIFAAKSKKTAFYAVMIAAFIVSLIYLI AVYTTAKYAGMINLSNPDKAFTSIVTTLFSRPILVTFYIVMFLIALTTIAALWNTMASMCFVHFQRNKSEKKNIITVIII AILSYTLANTFIDQVLDKMLLFNIPIAALAFSLLYGFYGSRTNFLGAILSTIVGIVSALYCYLLFKQEEFVFYWAFICIP LSFIVGYLPVITDKYRRLLRVKN >Mature_423_residues MNNSENYYTAGKSLGLFALTATLVMTELNISTLVGFSSLGYLYGFSELFLGIVFLVGLLFYSFSVAKKWKNFDAICVSEF FSQRYNRAFGLMVALCLLIAMTGFGANFIYSTTIYLQEIFPNYNHWLISGVACSLMLLFTIRDGLIRIVKIDKLSFILSL ILFVYLGYLVYKAGISSFKHISSQEVTLPFSFPISLAFLTAFTYILSPWYGQKIFAAKSKKTAFYAVMIAAFIVSLIYLI AVYTTAKYAGMINLSNPDKAFTSIVTTLFSRPILVTFYIVMFLIALTTIAALWNTMASMCFVHFQRNKSEKKNIITVIII AILSYTLANTFIDQVLDKMLLFNIPIAALAFSLLYGFYGSRTNFLGAILSTIVGIVSALYCYLLFKQEEFVFYWAFICIP LSFIVGYLPVITDKYRRLLRVKN
Specific function: Unknown
COG id: COG4146
COG function: function code R; Predicted symporter
Gene ontology:
Cell location: Integral Membrane Protein [C]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 47806; Mature: 47806
Theoretical pI: Translated: 9.65; Mature: 9.65
Prosite motif: PS00591 GLYCOSYL_HYDROL_F10 ; PS50283 NA_SOLUT_SYMP_3
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 4.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNNSENYYTAGKSLGLFALTATLVMTELNISTLVGFSSLGYLYGFSELFLGIVFLVGLLF CCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSFSVAKKWKNFDAICVSEFFSQRYNRAFGLMVALCLLIAMTGFGANFIYSTTIYLQEIF HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHC PNYNHWLISGVACSLMLLFTIRDGLIRIVKIDKLSFILSLILFVYLGYLVYKAGISSFKH CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISSQEVTLPFSFPISLAFLTAFTYILSPWYGQKIFAAKSKKTAFYAVMIAAFIVSLIYLI CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVYTTAKYAGMINLSNPDKAFTSIVTTLFSRPILVTFYIVMFLIALTTIAALWNTMASMC HHHHHHHHHCEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVHFQRNKSEKKNIITVIIIAILSYTLANTFIDQVLDKMLLFNIPIAALAFSLLYGFYGS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC RTNFLGAILSTIVGIVSALYCYLLFKQEEFVFYWAFICIPLSFIVGYLPVITDKYRRLLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKN CCC >Mature Secondary Structure MNNSENYYTAGKSLGLFALTATLVMTELNISTLVGFSSLGYLYGFSELFLGIVFLVGLLF CCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YSFSVAKKWKNFDAICVSEFFSQRYNRAFGLMVALCLLIAMTGFGANFIYSTTIYLQEIF HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHC PNYNHWLISGVACSLMLLFTIRDGLIRIVKIDKLSFILSLILFVYLGYLVYKAGISSFKH CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISSQEVTLPFSFPISLAFLTAFTYILSPWYGQKIFAAKSKKTAFYAVMIAAFIVSLIYLI CCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVYTTAKYAGMINLSNPDKAFTSIVTTLFSRPILVTFYIVMFLIALTTIAALWNTMASMC HHHHHHHHHCEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FVHFQRNKSEKKNIITVIIIAILSYTLANTFIDQVLDKMLLFNIPIAALAFSLLYGFYGS HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCC RTNFLGAILSTIVGIVSALYCYLLFKQEEFVFYWAFICIPLSFIVGYLPVITDKYRRLLR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VKN CCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA