| Definition | Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009257 |
| Length | 1,898,476 |
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The map label for this gene is wzy
Identifier: 134301498
GI number: 134301498
Start: 414757
End: 415986
Strand: Direct
Name: wzy
Synonym: FTW_0417
Alternate gene names: NA
Gene position: 414757-415986 (Clockwise)
Preceding gene: 134301497
Following gene: 134301499
Centisome position: 21.85
GC content: 22.52
Gene sequence:
>1230_bases GTGTACATAAAAAAAGTGTCTTTTAAAATTTTATATTTATATTTACTAGCTTTTTGTATTATTTTTAGTTTAGAATTTAA ATTTGCTATATTGAATATTATAGTTTATCTTCCGGCTTGTATTTTGGGTTTTTTAGCTCTTAAAAAACTATTTGTCGGAA ATATTGTTAAGAAACAATTAGCTTTCCTTTTTTTCTTTTTCTTTTTATCAATGATTTATTTAATAATAGTCCAAATAATC TTACTTGATGCAGCATCATTGTTTCCTCAGTTTTTATTTAACATTTTGATCGCGATAGGTTTTTGTAACTTTATTTTTGT TTCATATGATAATAATGAAAATTATTTTTTTAATATGTCTAAAATAATATTTTTTGTTACTTTCTTACAATCTATTTTTG TATTTCTTTCAAGGTATTATATATTTTTAAATGATTGGATATTCTTTTTTTTAGTGAAAAAAGGGAATATTGAGATTTCG AATGTTATTGAATATAAGTTAAGAGTATTCGGACTTAGTAACGCTGGAGGGGATGGTTTAGGATTTTCAATTACTATAGG ATTATGTTTTTCTATATTTTATTTTATCAAATATATTAAAGGTAAATCTATATTTACCAAACTTATGCTGTTTGTACCTT TAATTCTTATTGTGTTTTCTAATATTTTCATATCTAGAACATCACTCTTAACTTCTTCACTTATATTGTTAATAACAATA TTTTATATATATATTAAAAAAGAAAAATTACTGTTTATTATAATATTGGCGCTATTCTTTTTATCAATATGGATATTGTT CAAATTAAATTTGAATTTGAGTTGGGCTTTTGAAAATATTTACTCGTACATTCAATCTGGCGATTTTTCACATGGAAGTC TAAGTGTTTTAATCAATAAAATGCTTTTTGTGCCAGATAACCTTTTGACTTGGATATTTGGTTGTGAGGATGTTAGTAAT ACTGATATTGGTTATATTAAATATTTATACTATTATGGGATTATATTTAGTATGTTTTTTTATATTCTTATTATTTTCTT GTACTTTGAAATGAGAAAATGTTTTATATCTTCAGAGTATCGATCATTATTTCTATTGTTGTTAATAGTATGTTTAGTTT TTCAAGCAAAAATAATTTTTTTGACAGTAGGATTATTTACTAAATTAACCATTATATTATTTATTTTTTCTCTTAAAGAA AACAGCTTTACAACTAGGAGTGTGATTTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCTAGGAATATGCTCGGATATAATCCGGAATATGATTTTGAATTAGGCATAAAGCATGCTGTTGAGTGGTATTTAATTAA TTAAATGGTATTTTAATCAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAGGTTTGTACATTTAATAATAAACCTTAACCAAGGTGGTGCTGAAACAATGCTTTATAAACTTTGCAAATCTATGGAT AAGTCAATATATCATATTAC
Product: O-antigen polymerase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 409; Mature: 409
Protein sequence:
>409_residues MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQLAFLFFFFFLSMIYLIIVQII LLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMSKIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEIS NVIEYKLRVFGLSNAGGDGLGFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINKMLFVPDNLLTWIFGCEDVSN TDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEYRSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKE NSFTTRSVI
Sequences:
>Translated_409_residues MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQLAFLFFFFFLSMIYLIIVQII LLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMSKIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEIS NVIEYKLRVFGLSNAGGDGLGFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINKMLFVPDNLLTWIFGCEDVSN TDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEYRSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKE NSFTTRSVI >Mature_409_residues MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQLAFLFFFFFLSMIYLIIVQII LLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMSKIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEIS NVIEYKLRVFGLSNAGGDGLGFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINKMLFVPDNLLTWIFGCEDVSN TDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEYRSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKE NSFTTRSVI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 48060; Mature: 48060
Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFLFFFFFLSMIYLIIVQIILLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEHH KIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEISNVIEYKLRVFGLSNAGGDGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCC GFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH MLFVPDNLLTWIFGCEDVSNTDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEY HHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKENSFTTRSVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCC >Mature Secondary Structure MYIKKVSFKILYLYLLAFCIIFSLEFKFAILNIIVYLPACILGFLALKKLFVGNIVKKQL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AFLFFFFFLSMIYLIIVQIILLDAASLFPQFLFNILIAIGFCNFIFVSYDNNENYFFNMS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCEEEEHH KIIFFVTFLQSIFVFLSRYYIFLNDWIFFFLVKKGNIEISNVIEYKLRVFGLSNAGGDGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCEEHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCC GFSITIGLCFSIFYFIKYIKGKSIFTKLMLFVPLILIVFSNIFISRTSLLTSSLILLITI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYIYIKKEKLLFIIILALFFLSIWILFKLNLNLSWAFENIYSYIQSGDFSHGSLSVLINK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH MLFVPDNLLTWIFGCEDVSNTDIGYIKYLYYYGIIFSMFFYILIIFLYFEMRKCFISSEY HHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSLFLLLLIVCLVFQAKIIFLTVGLFTKLTIILFIFSLKENSFTTRSVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA