Definition Desulfotomaculum reducens MI-1 chromosome, complete genome.
Accession NC_009253
Length 3,608,104

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The map label for this gene is 134299248

Identifier: 134299248

GI number: 134299248

Start: 1494827

End: 1497523

Strand: Reverse

Name: 134299248

Synonym: Dred_1389

Alternate gene names: NA

Gene position: 1497523-1494827 (Counterclockwise)

Preceding gene: 134299249

Following gene: 134299247

Centisome position: 41.5

GC content: 41.68

Gene sequence:

>2697_bases
ATGAATCAAAACGAGTTCAAACAATACATTAAAAATATGGTTAACTCGATGTTGGAAAAAGTTCCAAACTACAGTGAACA
AGACCTGGAAGAACTCCTAAAAGATGATTTGCCGGAGGAATTCGCTAAAGAGTCATCAAAAAAACCCATAGGTAATTTTT
TAGATGACTTTGATGAAGATCTACCACAGAGTTTTTCACAGGACTTAACGGAAGATGCAGCAGATTTCTCTGAGGACTTG
ACAGAAGACATAGCCGATGAGATCGTTGATGAACTATCAGATGACATAGAGTATTTAGAAAAAAACTTTGGTTTTAAAGA
CGATTGGGGAGATATTTCAGACTGGAATGACCTTATTGACTGGGCAGGCCTTAAGGAATTTGGCAGTTACGGCGACACTT
GTGATCCTTATGATCAAAAGAATCCATTCAAAGATTCTTGCGATATTAATGATCCCTTTAATTGTAATGATCCCGGCCAT
CATGATCACCACCATTGCCATCACCATGACCATCATAAAGATCCCTGCTTTGATGACAAACTACTCAAGTGCTTTATTTT
CACCTGCCTCAAACTAAAAATTATTCTCTGCCTGCTAAAAAATAAAAAGTTTGGGCTTAGGGAGATTAAGAAAGAAATTA
AATGCATTGAAGAGGCTATCTTTAACCGGAGATTTGGCCTGAAAGAAATTAAAAGAGAAGTTAACCGCATTGAAAATGGT
GTTTTCAGTTGCACCTTTGGATTACCAGAGATTAAGTCTGAAGTTTCTATTATTCTAACAATTGTAGCCGGTATTGATGA
CGAAATTAATAATCCTACCTTTGGTTTGTCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGA
CCTTCGGGTTATCCGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGTAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGC
GATATTAAGTCCGAGATCTCTGCTATCGAATCTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATTAAGGCTGAAGT
ATCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTC
TGGTCAGCAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCCGAAATCTCTGCTATCGAATCTGCGGTGTTCAGTGAG
ACCTTTGGTTTGTCCGAGATTAAGTCCGAGATCTCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTCGGGTTATCCGA
AATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATACTTGCTCTGGTCAGCAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCTGAAA
TCTCTGCTATCGAGTCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTTGGGTTATCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTCT
GCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGCAGCCTGAG
TATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCCGAAATCTCTGCTATCGAATCCGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTG
AAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGCAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCCGAG
ATCTCTGCTATCGAGTCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTTGGGTTATCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTC
TGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCCGAAATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATCGAGTCTGCTGTGTTCAGTGAGA
CCTTCGGGTTATCCGAAATCAAGGCTGAGGTTTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGTAGCCTGAGTATTGTTGACTTCGGC
GATATTAAGTCCGAGATCTCTGCTATCGAATCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCTGAAATCAAGGCTGAGGT
TTCTGATATCCTTGCTCTGGTCAGCAGCCTAAGTATTGTTGACTTCGGCGATATTAAGTCTGAAATCTCTGCTATCGAGT
CTGCTGTGTTCAGTGAGACCTTTGGTTTGTCCGAGATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATTGAATCCGCTGTATTCAGTGAG
ACCTTCGGGTTATCCGAAATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATTGAATCCGCTGTATTCAGTGAGACCTTCGGGTTATCCGA
AATTAAGTCTGAAGTATCTGCCATTGAATCCGCTGTGTTCAGTGAGACCTTCGGGTTATCTGAAATCAAGGCTGAGGTTT
CATCATTGCTTGCCCTCCGGGGTCCAGCACAGAATCTAACCACCGGCCCCTTCCTTCTAATAAAAACTATAATGGATCTT
GAATATAAAATGTTCAATGCCAGCGGGACAACCGCAAGTGTAACATTTAAAACCTTCGATATTGGAACTTGTCCAATATC
GCAAATAAACACAATTGGTTTCTCTAATATTACTAACTGTTGTGGTACTCATTTTATTTTTAGTAATCCTTTTAACGAAG
ATAAAAATTTAATAATAAATGCCCAAACCAGTTCCACTTTTGGCATCTTCCTTTACGTTGCTGGAAATACAGGACAAAAC
ATACCAGTATCATTTAAATCAGGAGATTTTCTCCCCTTTGGCACCCTTTGCAGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGATATTTAGGTTTCGAGTGTTTTTTTAGTCTTAAAACGTCACCTATTTACTTAGCGTGGAATAAATTAACAACATATAG
AAAGGGGGTAGCTAGCTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACAGAAGTCGGCAACATTTGTTGCCGACTTCCCTATTTACAAATATTTTCCTTTTGACACTTCATTTACTACTTTAACAT
ATACTAACCTAATAACTTTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 898; Mature: 898

Protein sequence:

>898_residues
MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDEDLPQSFSQDLTEDAADFSEDL
TEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLIDWAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGH
HDHHHCHHHDHHKDPCFDDKLLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG
VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG
DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSE
TFGLSEIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES
AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSE
ISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG
DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE
TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALRGPAQNLTTGPFLLIKTIMDL
EYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNCCGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQN
IPVSFKSGDFLPFGTLCS

Sequences:

>Translated_898_residues
MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDEDLPQSFSQDLTEDAADFSEDL
TEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLIDWAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGH
HDHHHCHHHDHHKDPCFDDKLLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG
VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG
DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSE
TFGLSEIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES
AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSE
ISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG
DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE
TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALRGPAQNLTTGPFLLIKTIMDL
EYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNCCGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQN
IPVSFKSGDFLPFGTLCS
>Mature_898_residues
MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDEDLPQSFSQDLTEDAADFSEDL
TEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLIDWAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGH
HDHHHCHHHDHHKDPCFDDKLLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG
VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG
DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSE
TFGLSEIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES
AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSE
ISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFG
DIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE
TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALRGPAQNLTTGPFLLIKTIMDL
EYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNCCGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQN
IPVSFKSGDFLPFGTLCS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 97659; Mature: 97659

Theoretical pI: Translated: 3.93; Mature: 3.93

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDED
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LPQSFSQDLTEDAADFSEDLTEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHH
WAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGHHDHHHCHHHDHHKDPCFDDK
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH
LLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC
VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEI
CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
KAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFG
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEISAIESAVFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVS
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
DILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIK
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
SEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
SEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALR
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC
GPAQNLTTGPFLLIKTIMDLEYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNC
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH
CGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQNIPVSFKSGDFLPFGTLCS
HHCCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNQNEFKQYIKNMVNSMLEKVPNYSEQDLEELLKDDLPEEFAKESSKKPIGNFLDDFDED
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
LPQSFSQDLTEDAADFSEDLTEDIADEIVDELSDDIEYLEKNFGFKDDWGDISDWNDLID
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WAGLKEFGSYGDTCDPYDQKNPFKDSCDINDPFNCNDPGHHDHHHCHHHDHHKDPCFDDK
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LLKCFIFTCLKLKIILCLLKNKKFGLREIKKEIKCIEEAIFNRRFGLKEIKREVNRIENG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCC
VFSCTFGLPEIKSEVSIILTIVAGIDDEINNPTFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEI
CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
KAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVSAIESAVFSETFG
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
LSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEISAIESAVFS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIES
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
AVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKAEVS
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
DILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIK
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH
SEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGL
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
SEIKAEVSDILALVSSLSIVDFGDIKSEISAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKSEVSAIESAVFSETFGLSEIKAEVSSLLALR
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC
GPAQNLTTGPFLLIKTIMDLEYKMFNASGTTASVTFKTFDIGTCPISQINTIGFSNITNC
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCHHHHHH
CGTHFIFSNPFNEDKNLIINAQTSSTFGIFLYVAGNTGQNIPVSFKSGDFLPFGTLCS
HHCCCEECCCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA