| Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 700970, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_002162 |
| Length | 751,719 |
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Identifier: 13357890
GI number: 13357890
Start: 376048
End: 377031
Strand: Direct
Name: Not Available
Synonym: UU330
Alternate gene names: NA
Gene position: 376048-377031 (Clockwise)
Preceding gene: 13357889
Following gene: 13357893
Centisome position: 50.03
GC content: 23.78
Gene sequence:
>984_bases ATGAATTCAAGATTTAAATTTAACTATGATATAAATAATAAATTAGCATTATCCTTTACAAAGGATTTAATTGCTAATAA AAAGCAAAAAAATAAAAAAAAATTTTTGCTTTTTTTATTTCCCTTTTATCCTTTAAAACTTTTTAAAACGATTAATTTAA TCGTGGTTTTTGCTGTTTTAGTTGCAATTCGTTTAGGAATGGGATTTTTACATATTAAAATTCCTGGTTTTAATATGGTT ATTTCTTTTACATGAATGGCATTAATGGTTTTAGGGTGGTATTTTGGACCATTAATTGGAATATTTGCTGGATTTTTAGT TGATACTTTAGCATGATTAATTAGTGGTGGAATTTGGTTTTGAATGTATGCTATTCAAGAACCTATTGTAGGCTTTATTG CTGGATTTCTAGGATCTGTAGCTACATTAAGAAAAAAAACTAAACGACCAATAATTGATCTAATAGTTAATCAAATCTTT ATTTTATTTTTTAGTATATTAACATTGTTTATGATTTTGACCTTAGTTAATGATGGTAAAAACTCCTTATTTAGCATTCT TAAAAAACGTGATAAAGAAATTAATGAAGATTGAATTAGTATTTTTAAATATTTAGCAATCGCTTTTTTAGCTACATTTG TTTTGCTTGTTGAAGCTTTTGTTATCATTTATTATTTACGTAATAGAAATCGTTCAAAAGTACAGTTAATTAATTTTATT TATTGCTCATTATTAGTAATTTTTTCAACAATGTTATTTTCGTTTGCACTAGGACCTTACGTAAGTGTAGCGTATTTAAA ATATATAAAAGTCCCAATTACGAATTATTTAAAATACGGAGTTAATTACTATTTATTACCACGCATTATTAAAGAAAGCA TTAAAACACCAATTTATATCATTTTATTATCTTCAATAATTAGTGCATTTGATTATGTCTTTCTAAATATTAAGCAAATT AATATGCACAAATGAAAACATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTATTACAAGAAATTCATGATGATATTTTAACAGGTAAAATTGATCCTAATACATATTTAAGAACAAAAAATCCCTTTA GAGACTTGTTTGGTTTTTAG
Downstream 100 bases:
>100_bases CAATACACTTTTGAAGGTATAAAATATAATCATAAGTTTTAAAAGAGAGATAAATGATAGTAGTTTATGGATTCTAAAAA ATTTAATGATTTAGATTTAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 327; Mature: 327
Protein sequence:
>327_residues MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVLVAIRLGMGFLHIKIPGFNMV ISFTWMALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLAWLISGGIWFWMYAIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIF ILFFSILTLFMILTLVNDGKNSLFSILKKRDKEINEDWISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFI YCSLLVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLSSIISAFDYVFLNIKQI NMHKWKH
Sequences:
>Translated_327_residues MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVLVAIRLGMGFLHIKIPGFNMV ISFT*MALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLA*LISGGIWF*MYAIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIF ILFFSILTLFMILTLVNDGKNSLFSILKKRDKEINED*ISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFI YCSLLVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLSSIISAFDYVFLNIKQI NMHK*KH >Mature_327_residues MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVLVAIRLGMGFLHIKIPGFNMV ISFT*MALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLA*LISGGIWF*MYAIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIF ILFFSILTLFMILTLVNDGKNSLFSILKKRDKEINED*ISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFI YCSLLVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLSSIISAFDYVFLNIKQI NMHK*KH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR009825 [H]
Pfam domain/function: PF07155 DUF1393 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 37094; Mature: 37094
Theoretical pI: Translated: 10.55; Mature: 10.55
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVL CCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCHHCCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAIRLGMGFLHIKIPGFNMVISFTMALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLALISGGIWFMY HHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH AIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIFILFFSILTLFMILTLVNDGKNSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH FSILKKRDKEINEDISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFIYCSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SIISAFDYVFLNIKQINMHKKH HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC >Mature Secondary Structure MNSRFKFNYDINNKLALSFTKDLIANKKQKNKKKFLLFLFPFYPLKLFKTINLIVVFAVL CCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHCCHHCCHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VAIRLGMGFLHIKIPGFNMVISFTMALMVLGWYFGPLIGIFAGFLVDTLALISGGIWFMY HHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH AIQEPIVGFIAGFLGSVATLRKKTKRPIIDLIVNQIFILFFSILTLFMILTLVNDGKNSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH FSILKKRDKEINEDISIFKYLAIAFLATFVLLVEAFVIIYYLRNRNRSKVQLINFIYCSL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH LVIFSTMLFSFALGPYVSVAYLKYIKVPITNYLKYGVNYYLLPRIIKESIKTPIYIILLS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH SIISAFDYVFLNIKQINMHKKH HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8675025; 8948633 [H]