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The map label for this gene is ypnP [H]

Identifier: 126699725

GI number: 126699725

Start: 2436461

End: 2437807

Strand: Direct

Name: ypnP [H]

Synonym: CD2108

Alternate gene names: 126699725

Gene position: 2436461-2437807 (Clockwise)

Preceding gene: 126699723

Following gene: 126699726

Centisome position: 56.79

GC content: 31.55

Gene sequence:

>1347_bases
GTGAAAGATTTAACTACAGGTCATGAGGGAAAGTCCATATTCTTTTTTGCCATGCCTATGCTTATTGGTAGTTTATTTCA
ACAACTATACAATACAGCTGACAGTATAATAGTTGGTAGATTTATTGGAAAAGAAGCAATGGCGGCAGTCTCTGGAGCTA
ACCCTATAATGTTTTTATTGGTGGCAGCGCTTATGGGTGTTAGCCTTGGATTTTCTATTTTAGTGTCACAATTTTATGGC
TCAGGAGATTTAAAAAAGGTAAAAGCTACTATTGATACTACATATATACTTTTATTTATTGGTTCTATATTAATAAGTAT
TCTTGGAATAGTATTTGGTGGCCCCATGCTTAAGCTTATGAATACACCAGAATCCATTTTTGCTCAATCAAAATTGTATC
TTACTATAATATTTAGTGGAATATTATTTTCTGCTGGATATAATTCAGTAAGTGCAATACTTAGAGGACTTGGAGATTCA
GTAACTCCACTTTATTTTCTGATAATAGCCACAATTCTAAATATAGTTTTAGACTTAACTTTTATTGTAGTGCTAAGAAT
GGGTGTTGAGGGCGTTGCACTTGCCACTATAATGGCTCAGGCAGTATCATTTATAATAAGTATAATTTATTTAAATAAAA
GACATGAAGTGCTTAAATTTAAAATCAAAGGAATTGTATATGATAACAAAATATTTAAAGATGGACTTAGATTAGGACTT
CCAAGTGGAGTTCAACAAATGTTGTTTTCAATTGGAAATATGGCTCTTCAATTTTTAGTTAATAGTTATGGTACATCTGC
TATGGCAGCTTTTGGTGCTGGTCTTAGGATAGAAAATTTTATAAGCTTACCTATTATGAATCTTGGTTCTGCTGTTTCTA
CTTTTGTTGCTCAAAACATAGGTGCTGGAGAAAATGAAAGAGTTAAAAAAGGCATTCGAGAATCTATAAAAATGACCTTA
GTTTTAGCAGTTACAGTTATTGCTTTAATTTTGCTATTTAGGGAAAATCTAATTGCTCTATTCAATACTGATAAAGATGT
CATTAAAATTGGCTCTTCTTACTTATTTATAATAGGACCATTCTTTTTATTTATTGGAACTTCTTTTGTACTTTCAAGTG
CAATGAAAGGTGCTGGTGATTCCATGTTTGCACTTATAAGCTCAATAGTATCTTTATGGCTTGGAAGACTTCCAGCTTCT
TATATGCTTTCTAAATTTTTTGGAACAGACGGAATTTGGATGGGTATTCCTTTTGGTTGGACTTTAGGTCTTATTGTTAC
AGTTATCTACTATAAGAAAGGACATTGGAAAACTAAAGCTATTGTAAATCATAGAATCAATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATATGATATTTTGATACAATTTATTTATAGTTTGGATATAAAGTTTATGTTAAGATTATACTATAATAAATTAATAATT
TTTTTATTTGGAGGAATAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCTTTTTATAAAATGTATTCACATTCATTGTATTCACCTCCATTATGATATAATAAATTATGGAGGTGAATATAAAAATG
GGTATTATTCTTAAGCCAAA

Product: drug/sodium antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 448; Mature: 448

Protein sequence:

>448_residues
MKDLTTGHEGKSIFFFAMPMLIGSLFQQLYNTADSIIVGRFIGKEAMAAVSGANPIMFLLVAALMGVSLGFSILVSQFYG
SGDLKKVKATIDTTYILLFIGSILISILGIVFGGPMLKLMNTPESIFAQSKLYLTIIFSGILFSAGYNSVSAILRGLGDS
VTPLYFLIIATILNIVLDLTFIVVLRMGVEGVALATIMAQAVSFIISIIYLNKRHEVLKFKIKGIVYDNKIFKDGLRLGL
PSGVQQMLFSIGNMALQFLVNSYGTSAMAAFGAGLRIENFISLPIMNLGSAVSTFVAQNIGAGENERVKKGIRESIKMTL
VLAVTVIALILLFRENLIALFNTDKDVIKIGSSYLFIIGPFFLFIGTSFVLSSAMKGAGDSMFALISSIVSLWLGRLPAS
YMLSKFFGTDGIWMGIPFGWTLGLIVTVIYYKKGHWKTKAIVNHRINE

Sequences:

>Translated_448_residues
MKDLTTGHEGKSIFFFAMPMLIGSLFQQLYNTADSIIVGRFIGKEAMAAVSGANPIMFLLVAALMGVSLGFSILVSQFYG
SGDLKKVKATIDTTYILLFIGSILISILGIVFGGPMLKLMNTPESIFAQSKLYLTIIFSGILFSAGYNSVSAILRGLGDS
VTPLYFLIIATILNIVLDLTFIVVLRMGVEGVALATIMAQAVSFIISIIYLNKRHEVLKFKIKGIVYDNKIFKDGLRLGL
PSGVQQMLFSIGNMALQFLVNSYGTSAMAAFGAGLRIENFISLPIMNLGSAVSTFVAQNIGAGENERVKKGIRESIKMTL
VLAVTVIALILLFRENLIALFNTDKDVIKIGSSYLFIIGPFFLFIGTSFVLSSAMKGAGDSMFALISSIVSLWLGRLPAS
YMLSKFFGTDGIWMGIPFGWTLGLIVTVIYYKKGHWKTKAIVNHRINE
>Mature_448_residues
MKDLTTGHEGKSIFFFAMPMLIGSLFQQLYNTADSIIVGRFIGKEAMAAVSGANPIMFLLVAALMGVSLGFSILVSQFYG
SGDLKKVKATIDTTYILLFIGSILISILGIVFGGPMLKLMNTPESIFAQSKLYLTIIFSGILFSAGYNSVSAILRGLGDS
VTPLYFLIIATILNIVLDLTFIVVLRMGVEGVALATIMAQAVSFIISIIYLNKRHEVLKFKIKGIVYDNKIFKDGLRLGL
PSGVQQMLFSIGNMALQFLVNSYGTSAMAAFGAGLRIENFISLPIMNLGSAVSTFVAQNIGAGENERVKKGIRESIKMTL
VLAVTVIALILLFRENLIALFNTDKDVIKIGSSYLFIIGPFFLFIGTSFVLSSAMKGAGDSMFALISSIVSLWLGRLPAS
YMLSKFFGTDGIWMGIPFGWTLGLIVTVIYYKKGHWKTKAIVNHRINE

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI226510954, Length=420, Percent_Identity=24.7619047619048, Blast_Score=91, Evalue=2e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48741; Mature: 48741

Theoretical pI: Translated: 10.18; Mature: 10.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKDLTTGHEGKSIFFFAMPMLIGSLFQQLYNTADSIIVGRFIGKEAMAAVSGANPIMFLL
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
VAALMGVSLGFSILVSQFYGSGDLKKVKATIDTTYILLFIGSILISILGIVFGGPMLKLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
NTPESIFAQSKLYLTIIFSGILFSAGYNSVSAILRGLGDSVTPLYFLIIATILNIVLDLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIVVLRMGVEGVALATIMAQAVSFIISIIYLNKRHEVLKFKIKGIVYDNKIFKDGLRLGL
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCC
PSGVQQMLFSIGNMALQFLVNSYGTSAMAAFGAGLRIENFISLPIMNLGSAVSTFVAQNI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHC
GAGENERVKKGIRESIKMTLVLAVTVIALILLFRENLIALFNTDKDVIKIGSSYLFIIGP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHCCCHHHHHHH
FFLFIGTSFVLSSAMKGAGDSMFALISSIVSLWLGRLPASYMLSKFFGTDGIWMGIPFGW
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHH
TLGLIVTVIYYKKGHWKTKAIVNHRINE
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKDLTTGHEGKSIFFFAMPMLIGSLFQQLYNTADSIIVGRFIGKEAMAAVSGANPIMFLL
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
VAALMGVSLGFSILVSQFYGSGDLKKVKATIDTTYILLFIGSILISILGIVFGGPMLKLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
NTPESIFAQSKLYLTIIFSGILFSAGYNSVSAILRGLGDSVTPLYFLIIATILNIVLDLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FIVVLRMGVEGVALATIMAQAVSFIISIIYLNKRHEVLKFKIKGIVYDNKIFKDGLRLGL
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEEEEEEEECCHHHHHHHHCCC
PSGVQQMLFSIGNMALQFLVNSYGTSAMAAFGAGLRIENFISLPIMNLGSAVSTFVAQNI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHC
GAGENERVKKGIRESIKMTLVLAVTVIALILLFRENLIALFNTDKDVIKIGSSYLFIIGP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCHHHHHHCCCHHHHHHH
FFLFIGTSFVLSSAMKGAGDSMFALISSIVSLWLGRLPASYMLSKFFGTDGIWMGIPFGW
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHH
TLGLIVTVIYYKKGHWKTKAIVNHRINE
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]