| Definition | Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009089 |
| Length | 4,290,252 |
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The map label for this gene is 126699537
Identifier: 126699537
GI number: 126699537
Start: 2225996
End: 2227354
Strand: Direct
Name: 126699537
Synonym: CD1928
Alternate gene names: NA
Gene position: 2225996-2227354 (Clockwise)
Preceding gene: 126699535
Following gene: 126699538
Centisome position: 51.88
GC content: 24.28
Gene sequence:
>1359_bases TTGAGTAACATAATAACGAATTTAATAGAGTCAATATTTACTAATCCAATAACTATATTGTTTTTACTTGCAATAACTGT GTATTCTGTTTTTAAAATAATAGAAAATAACAGAGTATATTCATTTGTAAGTTCAAAATTAGACGAAATCAATAGAGATT ATAAGACAAGTGAGTTTTATAAAAAGGTAAGGGATGACTACTATACATATAGTAAAGAAAATCCTTATGCAGACGTAAAT ATAACTTCATTTATAGAGGAAGTTGTATCTGATTTAAAGCATAATAATTTGCCATTGTTAGAAAAAATTAGAAGTATAAA AAATTCATCTTCAATAAGTATATTACTTGGGGTTTTAGGTACGTTTGTTGGTCTTTCTACAATGCTTTTATGTGTTGATA CTAAAGACATTATAAATTCACTTCCTTCAACTATTAGTAGTATGCAAACTGCATTTACAACTAGTATATTTGGAGTTGTA TTTTCTCTAATTATAGGTTACTTTACTAAGATAAAAGATTGTGAACATGTTTTGATACAAATAATGTTAAAATCTGAAAA TTTACTAACATCTGAAATAACTCATTTTAAGTCAGAAAGAATGGATTTAAAAGTAGAAGAGGTAAAAAATACAATAAAAC AAATAAGTAAGTCTATAGAAGCTATTGAAAAATTTGATAAAATATCTAAAGATTTAAATGACTTTAATGATGAATTTATC AGTGGTATAGAAGCTTTAAAAAGCCTTTTAGAAGGTTCTCAAAGTTCTATTAAGACATTTGACCAGAGCGTAAGAAAATT AGATAAACAGTTTAATATTTTAAATATAAAATTTGTAAAGCTTTTTGATAAATATGATAATCAAGATAATATAAATAAAG AGATTTTATTTGATATAAAAGAATCTTCAAAAAATATATACAATGCCACTGAAAGCCAATTCAAAATTAGAGATTATATA AAAAATATAAATGCAGGATTTGCTCTATATGAAAGAAGTGCTCAAGACTTATTAACTAAATTAATGACCCATGAAAATAA AATCTCTCAAAATCAAAAAATCCTTTTAGATGAAAAGTTTACCTTAGATGACTCAATAAAAAATCTCTCAAGTATTATTG AAAACTTTTCTAATGACCTACAAGTTAAACTGGATATGATGTTTGAAAATTCTTTAGATATTCAAGATAAGTTAGATGTT ATGTTTAATAACTCTTTTATGAATGATGAAGTTCCTCTTGATAGTGAAGAATTATTTAAGGATGATGTTAATAATGTATT TAATCCTTTTAGTGAAGAAATTTATGAGATAGAGGATAAAGAAATAAAGGTCATAGGTGAGGATGAGTTAAATGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTCATAAATATAATATAAATATTTTGTTTATTTACGTATTTTCTTAGTAACTTGTACGTATAAATTATAGATAAATAAA TTATAAGGTAGGGGATAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TAAATATAGAAGAACTGTTAACAGAGAATTTGAAAAGAGTAGCTTTTGGCCAACATTTACAGATTTATTATCTACTGTAT TGATGGTTGTAATTCTTATC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 452; Mature: 451
Protein sequence:
>452_residues MSNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFYKKVRDDYYTYSKENPYADVN ITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLGTFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVV FSLIIGYFTKIKDCEHVLIQIMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIKESSKNIYNATESQFKIRDYI KNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKFTLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDV MFNNSFMNDEVPLDSEELFKDDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE
Sequences:
>Translated_452_residues MSNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFYKKVRDDYYTYSKENPYADVN ITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLGTFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVV FSLIIGYFTKIKDCEHVLIQIMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIKESSKNIYNATESQFKIRDYI KNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKFTLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDV MFNNSFMNDEVPLDSEELFKDDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE >Mature_451_residues SNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFYKKVRDDYYTYSKENPYADVNI TSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLGTFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVVF SLIIGYFTKIKDCEHVLIQIMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFIS GIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIKESSKNIYNATESQFKIRDYIK NINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKFTLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDVM FNNSFMNDEVPLDSEELFKDDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 52220; Mature: 52089
Theoretical pI: Translated: 4.47; Mature: 4.47
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFY CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH KKVRDDYYTYSKENPYADVNITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLG HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH TFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVVFSLIIGYFTKIKDCEHVLIQ HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIK HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEH ESSKNIYNATESQFKIRDYIKNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKF HHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCC TLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDVMFNNSFMNDEVPLDSEELFK CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH DDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE HHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure SNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFY HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH KKVRDDYYTYSKENPYADVNITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLG HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH TFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVVFSLIIGYFTKIKDCEHVLIQ HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIK HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEH ESSKNIYNATESQFKIRDYIKNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKF HHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCC TLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDVMFNNSFMNDEVPLDSEELFK CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH DDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE HHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA