Definition Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome.
Accession NC_009089
Length 4,290,252

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The map label for this gene is 126699537

Identifier: 126699537

GI number: 126699537

Start: 2225996

End: 2227354

Strand: Direct

Name: 126699537

Synonym: CD1928

Alternate gene names: NA

Gene position: 2225996-2227354 (Clockwise)

Preceding gene: 126699535

Following gene: 126699538

Centisome position: 51.88

GC content: 24.28

Gene sequence:

>1359_bases
TTGAGTAACATAATAACGAATTTAATAGAGTCAATATTTACTAATCCAATAACTATATTGTTTTTACTTGCAATAACTGT
GTATTCTGTTTTTAAAATAATAGAAAATAACAGAGTATATTCATTTGTAAGTTCAAAATTAGACGAAATCAATAGAGATT
ATAAGACAAGTGAGTTTTATAAAAAGGTAAGGGATGACTACTATACATATAGTAAAGAAAATCCTTATGCAGACGTAAAT
ATAACTTCATTTATAGAGGAAGTTGTATCTGATTTAAAGCATAATAATTTGCCATTGTTAGAAAAAATTAGAAGTATAAA
AAATTCATCTTCAATAAGTATATTACTTGGGGTTTTAGGTACGTTTGTTGGTCTTTCTACAATGCTTTTATGTGTTGATA
CTAAAGACATTATAAATTCACTTCCTTCAACTATTAGTAGTATGCAAACTGCATTTACAACTAGTATATTTGGAGTTGTA
TTTTCTCTAATTATAGGTTACTTTACTAAGATAAAAGATTGTGAACATGTTTTGATACAAATAATGTTAAAATCTGAAAA
TTTACTAACATCTGAAATAACTCATTTTAAGTCAGAAAGAATGGATTTAAAAGTAGAAGAGGTAAAAAATACAATAAAAC
AAATAAGTAAGTCTATAGAAGCTATTGAAAAATTTGATAAAATATCTAAAGATTTAAATGACTTTAATGATGAATTTATC
AGTGGTATAGAAGCTTTAAAAAGCCTTTTAGAAGGTTCTCAAAGTTCTATTAAGACATTTGACCAGAGCGTAAGAAAATT
AGATAAACAGTTTAATATTTTAAATATAAAATTTGTAAAGCTTTTTGATAAATATGATAATCAAGATAATATAAATAAAG
AGATTTTATTTGATATAAAAGAATCTTCAAAAAATATATACAATGCCACTGAAAGCCAATTCAAAATTAGAGATTATATA
AAAAATATAAATGCAGGATTTGCTCTATATGAAAGAAGTGCTCAAGACTTATTAACTAAATTAATGACCCATGAAAATAA
AATCTCTCAAAATCAAAAAATCCTTTTAGATGAAAAGTTTACCTTAGATGACTCAATAAAAAATCTCTCAAGTATTATTG
AAAACTTTTCTAATGACCTACAAGTTAAACTGGATATGATGTTTGAAAATTCTTTAGATATTCAAGATAAGTTAGATGTT
ATGTTTAATAACTCTTTTATGAATGATGAAGTTCCTCTTGATAGTGAAGAATTATTTAAGGATGATGTTAATAATGTATT
TAATCCTTTTAGTGAAGAAATTTATGAGATAGAGGATAAAGAAATAAAGGTCATAGGTGAGGATGAGTTAAATGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTCATAAATATAATATAAATATTTTGTTTATTTACGTATTTTCTTAGTAACTTGTACGTATAAATTATAGATAAATAAA
TTATAAGGTAGGGGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAATATAGAAGAACTGTTAACAGAGAATTTGAAAAGAGTAGCTTTTGGCCAACATTTACAGATTTATTATCTACTGTAT
TGATGGTTGTAATTCTTATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 452; Mature: 451

Protein sequence:

>452_residues
MSNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFYKKVRDDYYTYSKENPYADVN
ITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLGTFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVV
FSLIIGYFTKIKDCEHVLIQIMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI
SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIKESSKNIYNATESQFKIRDYI
KNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKFTLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDV
MFNNSFMNDEVPLDSEELFKDDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE

Sequences:

>Translated_452_residues
MSNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFYKKVRDDYYTYSKENPYADVN
ITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLGTFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVV
FSLIIGYFTKIKDCEHVLIQIMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI
SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIKESSKNIYNATESQFKIRDYI
KNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKFTLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDV
MFNNSFMNDEVPLDSEELFKDDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE
>Mature_451_residues
SNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFYKKVRDDYYTYSKENPYADVNI
TSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLGTFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVVF
SLIIGYFTKIKDCEHVLIQIMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFIS
GIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIKESSKNIYNATESQFKIRDYIK
NINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKFTLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDVM
FNNSFMNDEVPLDSEELFKDDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52220; Mature: 52089

Theoretical pI: Translated: 4.47; Mature: 4.47

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFY
CHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
KKVRDDYYTYSKENPYADVNITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLG
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
TFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVVFSLIIGYFTKIKDCEHVLIQ
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEH
ESSKNIYNATESQFKIRDYIKNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKF
HHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCC
TLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDVMFNNSFMNDEVPLDSEELFK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
DDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE
HHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SNIITNLIESIFTNPITILFLLAITVYSVFKIIENNRVYSFVSSKLDEINRDYKTSEFY
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
KKVRDDYYTYSKENPYADVNITSFIEEVVSDLKHNNLPLLEKIRSIKNSSSISILLGVLG
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
TFVGLSTMLLCVDTKDIINSLPSTISSMQTAFTTSIFGVVFSLIIGYFTKIKDCEHVLIQ
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IMLKSENLLTSEITHFKSERMDLKVEEVKNTIKQISKSIEAIEKFDKISKDLNDFNDEFI
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SGIEALKSLLEGSQSSIKTFDQSVRKLDKQFNILNIKFVKLFDKYDNQDNINKEILFDIK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEH
ESSKNIYNATESQFKIRDYIKNINAGFALYERSAQDLLTKLMTHENKISQNQKILLDEKF
HHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCC
TLDDSIKNLSSIIENFSNDLQVKLDMMFENSLDIQDKLDVMFNNSFMNDEVPLDSEELFK
CHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
DDVNNVFNPFSEEIYEIEDKEIKVIGEDELNE
HHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA