Definition Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome.
Accession NC_009089
Length 4,290,252

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The map label for this gene is 126699259

Identifier: 126699259

GI number: 126699259

Start: 1919166

End: 1920896

Strand: Direct

Name: 126699259

Synonym: CD1655

Alternate gene names: NA

Gene position: 1919166-1920896 (Clockwise)

Preceding gene: 126699255

Following gene: 126699260

Centisome position: 44.73

GC content: 32.06

Gene sequence:

>1731_bases
ATGAGGAACAAAAAAATTAATATTATTTTTCTGACGACAATCATGTTCATAATGTCAACAGTAATGGTTTTTGCAGAAGA
AGATATAGACACTATTGCACTAGCCAATGCAGAAAAATTTGGGATTTTAACTTTAATACCACCATTAGTTGCTATAATAC
TTGCATTTATAACTAAAAACGTAATAATTTCTTTACTTATAGGTATTCTTTCTGGTAGTTTTATAATTAAAGCTAGTGGT
ATTAATGTTTTTGCGACATTTATACAGGCATTTTTAGATTTAGTAGATAGAGCTTTAGTATCTTTAGCAGACCCTTGGAA
TGCAGGGATAATACTACAGGTTTTGGCAATTGGAGGAGTAATAAATCTTGTTGCTAAAATGGGAGGAGCTAAAGCCATAG
CTGAAGCACTTGCTAAAAGAGCAAAGTCAGCAAAAGGGACACAGCTTATAACATGGTTTTTGGGGCTTTTAGTATTCTTT
GATGATTATGCCAATTCACTAATAGTAGGTCCTATGATGAGACCTGTTGCAGATAAAATGAAAATATCGAGAGAAAAGCT
GGCATTTATAATAGATGCCACAGCAGCACCAGTTGCTGGTTTAGCTATAATATCTACATGGATAGGTCTTGAGGTTGGTT
TAATACATGATGCTTTTGAAAGTATAAGTATAGATGTAGATGCATTTGGTATATTTTTAAATACAATACCATTTAGATTT
TACAATATATTAATATTAGCTTTCATTGTAATATCAGCATTATTATTAAAAGAATTTGGTCCAATGAGAAAAGCTGAGAT
AAAATCTAGAAGTAGAAAAATTAGTATAGACCTTGATGAAGGCGTAGAAGAGTTGGATGATTTAGCTCCAAAAAATGGAG
TAAAATTGAGTGTATGGAATGCTATAATCCCAATAGGAACATTGATAATAGTTGCATTAGCATCATTTTATTATAGTGGA
TATACATCTATAATGGGAGGAGACGATAAGGCTCTGATACAACTATTTACAAATTCTCCATATTCTTTTGAAGCAATAAA
AGAAGCATTTAGCGCATCTGATGCATCTAGAGCATTATTCCAGTCTGCACTTGTTGCAAGTTTAGTTGCTATTATAATGG
CTGTAGTAAAAAAGATTTTTACAATATCAGAAGCAATTGATGTTTGGATAGATGGAATGAAAAGTTTAGTAATCACTGGT
GTAATATTAATACTTGCATGGTCATTAAGTTCAGTAATAAAAGAGTTAGGTACAGCTAAATTTTTAATACACCTATTATC
AGGTTCACTACCACCATTCTTATTACCAAGTTTAATATTTGGTTTAGGAGCAATAATATCTTTTGCTACTGGAACAGCTT
ATGGAACAATGGGTATACTTATGCCACTTGCAATTCCATTAGCATACTCATTAAATCCTGATATGTCTTATGTAATAGTA
AGTACTAGTGCAGTTTTAACAGGTGCAATATTTGGAGACCATTGTTCTCCAATTTCAGATACAACAATACTTTCTTCAAT
GGGAGCTGGCTGTAATCATATAGACCATGTTAACACTCAAATGCCATATGCTATATTTACAGCAGTAATCACTATTGTAT
TTGGGTATATACCAGCTGGACTTGGATTGCCAATATATATAGTATTACCAGTGGCAATAGCTGCTATATTTGTAGGTATT
CAAATAATTGGTAAGAAAGTTGATGAAGCGGAAATAGAACTTGTAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGTTTAAGCCTTGAGTGTTTACCACTCAAGGCTTTTTTAGTTTTATTGTAACATAATACCCTGTACAGTTCACAAAATT
AAAAGGAGAGGGAGATTTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATATAAATAAGTTTCACCTTTTATTATCACTATTTTGTTAGTTTTTAGATAATTTTAAAAAGTTATTGAAAATAATGG
CGAAATATAGTAAAATAAAA

Product: Na+/H+ antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 576; Mature: 576

Protein sequence:

>576_residues
MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASG
INVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFF
DDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRF
YNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSG
YTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITG
VILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIV
STSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGI
QIIGKKVDEAEIELVE

Sequences:

>Translated_576_residues
MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASG
INVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFF
DDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRF
YNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSG
YTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITG
VILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIV
STSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGI
QIIGKKVDEAEIELVE
>Mature_576_residues
MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKNVIISLLIGILSGSFIIKASG
INVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGVINLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFF
DDYANSLIVGPMMRPVADKMKISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRF
YNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWNAIIPIGTLIIVALASFYYSG
YTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALFQSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITG
VILILAWSLSSVIKELGTAKFLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIV
STSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAGLGLPIYIVLPVAIAAIFVGI
QIIGKKVDEAEIELVE

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61663; Mature: 61663

Theoretical pI: Translated: 5.13; Mature: 5.13

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKN
CCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGV
HHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
INLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKM
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHHHHHHHH
KISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRF
HHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHH
AIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH
QSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIV
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEE
STSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAG
EHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEECC
>Mature Secondary Structure
MRNKKINIIFLTTIMFIMSTVMVFAEEDIDTIALANAEKFGILTLIPPLVAIILAFITKN
CCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VIISLLIGILSGSFIIKASGINVFATFIQAFLDLVDRALVSLADPWNAGIILQVLAIGGV
HHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
INLVAKMGGAKAIAEALAKRAKSAKGTQLITWFLGLLVFFDDYANSLIVGPMMRPVADKM
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHHHHHHHH
KISREKLAFIIDATAAPVAGLAIISTWIGLEVGLIHDAFESISIDVDAFGIFLNTIPFRF
HHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
YNILILAFIVISALLLKEFGPMRKAEIKSRSRKISIDLDEGVEELDDLAPKNGVKLSVWN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHH
AIIPIGTLIIVALASFYYSGYTSIMGGDDKALIQLFTNSPYSFEAIKEAFSASDASRALF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHH
QSALVASLVAIIMAVVKKIFTISEAIDVWIDGMKSLVITGVILILAWSLSSVIKELGTAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FLIHLLSGSLPPFLLPSLIFGLGAIISFATGTAYGTMGILMPLAIPLAYSLNPDMSYVIV
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEE
STSAVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSMGAGCNHIDHVNTQMPYAIFTAVITIVFGYIPAG
EHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
LGLPIYIVLPVAIAAIFVGIQIIGKKVDEAEIELVE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]