Definition Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome.
Accession NC_009089
Length 4,290,252

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The map label for this gene is 126698967

Identifier: 126698967

GI number: 126698967

Start: 1579381

End: 1581834

Strand: Direct

Name: 126698967

Synonym: CD1366

Alternate gene names: NA

Gene position: 1579381-1581834 (Clockwise)

Preceding gene: 126698966

Following gene: 126698968

Centisome position: 36.81

GC content: 31.13

Gene sequence:

>2454_bases
ATGGGAAATGTGAGAGAAGAAGGTATAAATATGTACCTTACAGATAATTACACACCAAAAATGAATCAAATTATATCAGT
AACTGATAATTTTAGGAGAGCAACTGTGGCTGTTTCACTTTCCACTAATGTAATGGCTAGTAGCATAAAAAATTCTATTG
GAAGTGCAAGTAATAGAGTAAACAGTTTAAATTCCTCGTTAAGAAAAGTTCAAACTACTGCTAGTAGTGTAAGTTCAACT
ATGACAAAATTAAGTTCTAGCATAAATGCTGTTTCAGGAGTTATTGGAAGTTTAAATGGAAGTATTATGAGACTAGCAAT
AACTATAGCTATGATTATTGATTATTTTAATAAGTTGATTCAAAAGAAAAATGAGTTTAATTCAAATATTATGATTATAT
TAATATTTAAAGCTAAAAGTGATGAAGTAGAAAAAACTAAAAATAAATTACTTGGAAATTTAAAAAAGATTGGTGGCAAG
ATTTGGAATATCGTAATAAAAGCAAAAGATATGACTAAGAGAGTGATAAGTAGTATCTTGGGAAAATTAAAACAAGTAGA
GAAACGTCCTTATCAAGGAAGTATTAATCTTAAAGATATGGTGAGTAGTGCTATGGGTAGAATTTTGCCTAAGTTAATGT
TGTTTAAAAATACTTTTTGGAGTGGTGTAATAGCTATAAAAGATATGGCAAGTGGCATTATAAGTAAAGTATTTCCCAAA
TTGAGATTATTTGCAGGTAAGGTATGGAGTGGTGCAATAGCTGTAAAGGATATGGCAAGTGGAATACTTGGTTCGATAAA
AGGGAAGATATCTGATTTGACAAATGGTGCTACTATAGGTGTCGCTGTGAAAAAGGGTGTTGATTTACTTGGTCAGGAAC
AAAATCAGAAAGTTGTTCTAGAAAGTGTAATGAAAAGAAATACTGGAAAAGTTAATCAAATAGATGTTGATGATTATTAT
GGCAGTTTAGTAAGAATGGCAAATGATACGCCTTTTGACCCTGAAGATGTTGTTGCAATGGGAACTAAAGCTAAAATGAT
TAGTAATATTACTGGTGGCAAAAAAGAAAAAGATATAACTCAAGCTATGGTAGATGTTAGAGCTTTAAATATGAATACAA
GTAGTGAACAAGATGTATCAGCAGCTTTCTTAAGTGCAGCAAAAGGAAACATGGAATCTCTTAATACTCTGGTAGGAGAA
AATTATAAAACTTTTGATGAAGCATTGGAAGGCATAAGTGTAAAGCAGATGGGGTTAGCTAAAGAAATGAGTAATACAAT
ACCAGGTATAATATCAGGAGCTCAAACAAGCATTAACAATGGCTTGAAGAGTATTGTTAAACCTTTTGATGATATTTTAG
GTCAAGGACTAAAGAAAATAAAAACTTTTATAGAAAGTGGATTAGGCAATTTAGCTGGCTTATCTGAAAAAATGGCTGGT
AAAATAGGCAATGTAATGAATGGTAAGATAATTATTGGCAACAAATATGACCAGATGCAATCTAGAAGTGTAAAAAATGG
AAAAGAGTTTTCTGATTCTACTCAATATCGAATTTCTAATGAGGCTGAAAAGCGTAAAATGATGGTTGAAAATAAGCAAG
AACGTTTTGAAAATCATGCAGCAACAATGATAGGGAATGCACCAAAAGCAATTGTTAACGCAGGAAGTACACTATTACAA
AATATCGATTTTACAGCATTAATAGATTCATTACTTCCAGTAGTAAACTTAGTAAATAATTTACTAGATAGTATAAACAA
TAAATCACCAATTGCACAAGGATTAATAAGTATATTTGGTACAATAGTAACTACAGCATTCCAACTAATCGGACCTGTAG
TTGAAGCTGTTAGTCCTATTATCACAAGAATTTTTACTTTTTTAGGTGAATATGCACCTCAAATAAACAATTTTATAGAG
ACACTGGGTGTTATTTGGAAAACTGTATGGGAGACCTTAGGACCTCTGTTGGAAACTGGATGGAAAATTATAGAGCCAAT
ATTGGGAGCTTTTTTTAACATATTAGATAAAGTATGTAAAATAGTTAAAGATATATGCAAGTGGTGGCAAACTATGATTA
ATAAGATAAAAAATGGAAGCATCACAGGAACAGTTTTAAATCTAGTGGAAAAGAGTAAAAAAAATTACAAAGATAATCCA
TATGCTGGAACAAAGGCTGGTGATTCTGGTAAAGCTTATTCAGGTAAGAAAGGTAATAATGCATTTGGATTGAACTATGT
TCCTTATAATGACTATCAAACCAGACTCCATGAAGGTGAAATGGTTTTAACTAAACAAGAAGCAAATCAATATAGAAGCA
GAAAAAATGGTGGAAATATAAACATAGCTAAGTTAGCTGATACAATAGTAATTAGAGAAGAAGCTGATATAGAAAAGATA
ACATCAAAATTAGTTGCAAGTATCCAATTGGCACAGTTAGGGGGTGTCTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAAGCTTATTGAAGCTTTTTTCGCCTTAGAAATTGAGGAAGAAGTTGAAAAAATGAAACATGGATATGGAGTGTGTCCT
TTGACAGGAGGTGGTATGTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGAAATGTGGCTTAGACAAGCTGAAGATAGATTTAGATTTCCAGTATTTCCATCTTCCTTTAGTATTAATGGAAAAGCT
GCTGTAAACTCTTCTAGTAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 817; Mature: 816

Protein sequence:

>817_residues
MGNVREEGINMYLTDNYTPKMNQIISVTDNFRRATVAVSLSTNVMASSIKNSIGSASNRVNSLNSSLRKVQTTASSVSST
MTKLSSSINAVSGVIGSLNGSIMRLAITIAMIIDYFNKLIQKKNEFNSNIMIILIFKAKSDEVEKTKNKLLGNLKKIGGK
IWNIVIKAKDMTKRVISSILGKLKQVEKRPYQGSINLKDMVSSAMGRILPKLMLFKNTFWSGVIAIKDMASGIISKVFPK
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GSLVRMANDTPFDPEDVVAMGTKAKMISNITGGKKEKDITQAMVDVRALNMNTSSEQDVSAAFLSAAKGNMESLNTLVGE
NYKTFDEALEGISVKQMGLAKEMSNTIPGIISGAQTSINNGLKSIVKPFDDILGQGLKKIKTFIESGLGNLAGLSEKMAG
KIGNVMNGKIIIGNKYDQMQSRSVKNGKEFSDSTQYRISNEAEKRKMMVENKQERFENHAATMIGNAPKAIVNAGSTLLQ
NIDFTALIDSLLPVVNLVNNLLDSINNKSPIAQGLISIFGTIVTTAFQLIGPVVEAVSPIITRIFTFLGEYAPQINNFIE
TLGVIWKTVWETLGPLLETGWKIIEPILGAFFNILDKVCKIVKDICKWWQTMINKIKNGSITGTVLNLVEKSKKNYKDNP
YAGTKAGDSGKAYSGKKGNNAFGLNYVPYNDYQTRLHEGEMVLTKQEANQYRSRKNGGNINIAKLADTIVIREEADIEKI
TSKLVASIQLAQLGGVL

Sequences:

>Translated_817_residues
MGNVREEGINMYLTDNYTPKMNQIISVTDNFRRATVAVSLSTNVMASSIKNSIGSASNRVNSLNSSLRKVQTTASSVSST
MTKLSSSINAVSGVIGSLNGSIMRLAITIAMIIDYFNKLIQKKNEFNSNIMIILIFKAKSDEVEKTKNKLLGNLKKIGGK
IWNIVIKAKDMTKRVISSILGKLKQVEKRPYQGSINLKDMVSSAMGRILPKLMLFKNTFWSGVIAIKDMASGIISKVFPK
LRLFAGKVWSGAIAVKDMASGILGSIKGKISDLTNGATIGVAVKKGVDLLGQEQNQKVVLESVMKRNTGKVNQIDVDDYY
GSLVRMANDTPFDPEDVVAMGTKAKMISNITGGKKEKDITQAMVDVRALNMNTSSEQDVSAAFLSAAKGNMESLNTLVGE
NYKTFDEALEGISVKQMGLAKEMSNTIPGIISGAQTSINNGLKSIVKPFDDILGQGLKKIKTFIESGLGNLAGLSEKMAG
KIGNVMNGKIIIGNKYDQMQSRSVKNGKEFSDSTQYRISNEAEKRKMMVENKQERFENHAATMIGNAPKAIVNAGSTLLQ
NIDFTALIDSLLPVVNLVNNLLDSINNKSPIAQGLISIFGTIVTTAFQLIGPVVEAVSPIITRIFTFLGEYAPQINNFIE
TLGVIWKTVWETLGPLLETGWKIIEPILGAFFNILDKVCKIVKDICKWWQTMINKIKNGSITGTVLNLVEKSKKNYKDNP
YAGTKAGDSGKAYSGKKGNNAFGLNYVPYNDYQTRLHEGEMVLTKQEANQYRSRKNGGNINIAKLADTIVIREEADIEKI
TSKLVASIQLAQLGGVL
>Mature_816_residues
GNVREEGINMYLTDNYTPKMNQIISVTDNFRRATVAVSLSTNVMASSIKNSIGSASNRVNSLNSSLRKVQTTASSVSSTM
TKLSSSINAVSGVIGSLNGSIMRLAITIAMIIDYFNKLIQKKNEFNSNIMIILIFKAKSDEVEKTKNKLLGNLKKIGGKI
WNIVIKAKDMTKRVISSILGKLKQVEKRPYQGSINLKDMVSSAMGRILPKLMLFKNTFWSGVIAIKDMASGIISKVFPKL
RLFAGKVWSGAIAVKDMASGILGSIKGKISDLTNGATIGVAVKKGVDLLGQEQNQKVVLESVMKRNTGKVNQIDVDDYYG
SLVRMANDTPFDPEDVVAMGTKAKMISNITGGKKEKDITQAMVDVRALNMNTSSEQDVSAAFLSAAKGNMESLNTLVGEN
YKTFDEALEGISVKQMGLAKEMSNTIPGIISGAQTSINNGLKSIVKPFDDILGQGLKKIKTFIESGLGNLAGLSEKMAGK
IGNVMNGKIIIGNKYDQMQSRSVKNGKEFSDSTQYRISNEAEKRKMMVENKQERFENHAATMIGNAPKAIVNAGSTLLQN
IDFTALIDSLLPVVNLVNNLLDSINNKSPIAQGLISIFGTIVTTAFQLIGPVVEAVSPIITRIFTFLGEYAPQINNFIET
LGVIWKTVWETLGPLLETGWKIIEPILGAFFNILDKVCKIVKDICKWWQTMINKIKNGSITGTVLNLVEKSKKNYKDNPY
AGTKAGDSGKAYSGKKGNNAFGLNYVPYNDYQTRLHEGEMVLTKQEANQYRSRKNGGNINIAKLADTIVIREEADIEKIT
SKLVASIQLAQLGGVL

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89053; Mature: 88922

Theoretical pI: Translated: 10.30; Mature: 10.30

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGNVREEGINMYLTDNYTPKMNQIISVTDNFRRATVAVSLSTNVMASSIKNSIGSASNRV
CCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSLNSSLRKVQTTASSVSSTMTKLSSSINAVSGVIGSLNGSIMRLAITIAMIIDYFNKLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QKKNEFNSNIMIILIFKAKSDEVEKTKNKLLGNLKKIGGKIWNIVIKAKDMTKRVISSIL
HHHHCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHH
GKLKQVEKRPYQGSINLKDMVSSAMGRILPKLMLFKNTFWSGVIAIKDMASGIISKVFPK
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRLFAGKVWSGAIAVKDMASGILGSIKGKISDLTNGATIGVAVKKGVDLLGQEQNQKVVL
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHCHHHHCCCCCHHHHH
ESVMKRNTGKVNQIDVDDYYGSLVRMANDTPFDPEDVVAMGTKAKMISNITGGKKEKDIT
HHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
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HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
KEMSNTIPGIISGAQTSINNGLKSIVKPFDDILGQGLKKIKTFIESGLGNLAGLSEKMAG
HHHHCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
KIGNVMNGKIIIGNKYDQMQSRSVKNGKEFSDSTQYRISNEAEKRKMMVENKQERFENHA
HHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ATMIGNAPKAIVNAGSTLLQNIDFTALIDSLLPVVNLVNNLLDSINNKSPIAQGLISIFG
HHHHCCCCHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
TIVTTAFQLIGPVVEAVSPIITRIFTFLGEYAPQINNFIETLGVIWKTVWETLGPLLETG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WKIIEPILGAFFNILDKVCKIVKDICKWWQTMINKIKNGSITGTVLNLVEKSKKNYKDNP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
YAGTKAGDSGKAYSGKKGNNAFGLNYVPYNDYQTRLHEGEMVLTKQEANQYRSRKNGGNI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCE
NIAKLADTIVIREEADIEKITSKLVASIQLAQLGGVL
EHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
GNVREEGINMYLTDNYTPKMNQIISVTDNFRRATVAVSLSTNVMASSIKNSIGSASNRV
CCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSLNSSLRKVQTTASSVSSTMTKLSSSINAVSGVIGSLNGSIMRLAITIAMIIDYFNKLI
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QKKNEFNSNIMIILIFKAKSDEVEKTKNKLLGNLKKIGGKIWNIVIKAKDMTKRVISSIL
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KIGNVMNGKIIIGNKYDQMQSRSVKNGKEFSDSTQYRISNEAEKRKMMVENKQERFENHA
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NIAKLADTIVIREEADIEKITSKLVASIQLAQLGGVL
EHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA