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The map label for this gene is 126209177

Identifier: 126209177

GI number: 126209177

Start: 1944171

End: 1946177

Strand: Reverse

Name: 126209177

Synonym: APL_1713

Alternate gene names: NA

Gene position: 1946177-1944171 (Counterclockwise)

Preceding gene: 126209178

Following gene: 126209175

Centisome position: 85.57

GC content: 47.09

Gene sequence:

>2007_bases
ATGAATAATCCTACCGCTCTACGGGAGCTTACCCTAAGGGGAATGATTCTAGGGGCATTGATCACAGTGGTATTTACCGC
CTCAAATGTTTATTTAGGTCTAAAAGTCGGGATGACCTTTGCTTCATCCATTCCGGCAGCCGTTATTTCCATGGCGGTAT
TAAAAATGTTTCAAGGCTCAAACATTCTTGAAAACAACATGGTACAAACCCAAGCCTCATCGGCAGGGACGCTTTCTTCG
GTTATTTTTGTCATCCCCGCATTATTAATGATGGGCTACTGGCAATCATTTCCTTTCTGGCAAACCTTATTAATCTGTAT
TTCCGGCGGGATTTTAGGGGTTATCTTTACCGTGCCGTTACGAAACGTAATGGTGGTAAAAAGCGACTTACCTTATCCGG
AAGGCGTTGCGGCGGCGGAAATTTTAAAAGCCAGCGATGAAAGCGATAACAAAGACAGCGGTATTAAAGAAATCGTTTCC
GGCGGTCTGTTAGCCGCATCGGTCAGCTTCTTGACCAACGGGTTACGCGTGGTTGCGGACGGCGCAAGTTACTGGTTTAA
AGGCGGCAATGCGATCTTCCAAGTACCGATGGGCTTCTCTTTCGCATTACTCGGCGCCGGCTATTTAGTCGGCATGATGG
GCGGTATCGCGATGTTAGTCGGTACTCTCTTCACTTGGGGTGTCGCCGTACCTTATTTCACCGCGACCACGCCGATGCCT
GCCGATGCGGATATGGTAAGTTTCGCTACCGGTCTATGGAAAAGCAACGTTCGCTTTATCGGGGTAGGGACGATTGCGAT
TGCGGCGATTTGGACGCTATTAGTGTTATTTAAACCGATGGTGCAAGGTATGTCGCAAGCGTTCCGTGCGTTAAAAGATC
CGTCAATGCAAAGTCTTGAGCGTACCGCGCAAGACCTTTCGCCGAAAACGATGATTTATACGGTGTTAGCGAGTATCGCA
TTGATTATCGTGGCGTTAGTCAGCTTCTTACAACCGGTCGGTTTATCCATGGAATTAGCCTTCTTATTGGTGGTGGTTTG
TACCATTCTTGCCGTTATCGTCGGTTTCTTGGTTGCTGCGGCATCCGGTTATATGGCGGGTCTGGTCGGTTCGTCATCAA
GCCCGATTTCAGGTATCGGTATTATCTCCATAGTGATTATTTCAGTGATTCTGATGATGGTCGGTAACGCCGCCGGCTTA
ATGGAAACAGCGGACGGACAACGTTTCCTTACGGCATTAACCATTTTCACCGCATCAATCGTATTCTGTGTTTCCACGAT
TTCAAACGATAACCTACAAGATTTAAAAACCGGTTATCTAGTGAAAGCAACACCATGGCGTCAGCAATTTGCGTTAATTA
TCGGCTGTATCGTCGGTGCGTTAGTTATCACACCGGTATTAGAAATTCTGTACCACGCATACGGTTTTGCCGGTGCAATG
CCACGTGAGGGAATGGATGCGGCACAAGCACTTTCGGCACCGCAAGCTACCATTATGATGACTATTTCGAACGGTATTTT
CTCAAATAGCCTTGAATGGACTTATATTTTAGTCGGTGTTGCTTTCGGTATTTGCTTAATTATCGTGGATACATTATTGA
AAAAAGCCAGCGCAGGTCGCTTAGGTTTACCGACTTTAGCGGTCGGTATCGGTATTTACTTACCGCCGGTGGTAAACGTA
CCGTTAATTATCGGTGCAACGCTTTCTTGGTTAGTCAATCGTCATATCAAACGCTATGCTAAACGTAGCGGTAAAGATGT
CGAAACGACAAGCAAAAAAGCGGAACGCTACGGCACACTTTTCGCCGCCGGTTTAATCGTTGGAGAAAGCTTAGTCGGCG
TACTGTTAGCCTTTGTGATTGCAGGTTCCGTTACTTCGGGCGGTTCTGACGCGCCGCTAGCGCTAAATCTCGAGAACTGG
GGCGGTATGGCGGAATTACTCGGCTTAACACTGTTTGCAATCGGCTGTATTATTTTCGCACGTCGCGTACTGCAAGCGAA
AAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTAAAGATTCGATTAAATACACACAAAACAAGCCGAATAATTATGTAAACCCGCCGATTTCTTATAAGATGTTGCTTTA
TTTTATTTTTTGGAGGAACG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTCCCCTATTGTGAATCAAACGGCATTTTCGGATGCCGTTTTTTATTGTCTGACATAACCGCCGCTTACCTGCTTAATC
ACACTTAATAATTCCAAACC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 668; Mature: 668

Protein sequence:

>668_residues
MNNPTALRELTLRGMILGALITVVFTASNVYLGLKVGMTFASSIPAAVISMAVLKMFQGSNILENNMVQTQASSAGTLSS
VIFVIPALLMMGYWQSFPFWQTLLICISGGILGVIFTVPLRNVMVVKSDLPYPEGVAAAEILKASDESDNKDSGIKEIVS
GGLLAASVSFLTNGLRVVADGASYWFKGGNAIFQVPMGFSFALLGAGYLVGMMGGIAMLVGTLFTWGVAVPYFTATTPMP
ADADMVSFATGLWKSNVRFIGVGTIAIAAIWTLLVLFKPMVQGMSQAFRALKDPSMQSLERTAQDLSPKTMIYTVLASIA
LIIVALVSFLQPVGLSMELAFLLVVVCTILAVIVGFLVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISIVIISVILMMVGNAAGL
METADGQRFLTALTIFTASIVFCVSTISNDNLQDLKTGYLVKATPWRQQFALIIGCIVGALVITPVLEILYHAYGFAGAM
PREGMDAAQALSAPQATIMMTISNGIFSNSLEWTYILVGVAFGICLIIVDTLLKKASAGRLGLPTLAVGIGIYLPPVVNV
PLIIGATLSWLVNRHIKRYAKRSGKDVETTSKKAERYGTLFAAGLIVGESLVGVLLAFVIAGSVTSGGSDAPLALNLENW
GGMAELLGLTLFAIGCIIFARRVLQAKK

Sequences:

>Translated_668_residues
MNNPTALRELTLRGMILGALITVVFTASNVYLGLKVGMTFASSIPAAVISMAVLKMFQGSNILENNMVQTQASSAGTLSS
VIFVIPALLMMGYWQSFPFWQTLLICISGGILGVIFTVPLRNVMVVKSDLPYPEGVAAAEILKASDESDNKDSGIKEIVS
GGLLAASVSFLTNGLRVVADGASYWFKGGNAIFQVPMGFSFALLGAGYLVGMMGGIAMLVGTLFTWGVAVPYFTATTPMP
ADADMVSFATGLWKSNVRFIGVGTIAIAAIWTLLVLFKPMVQGMSQAFRALKDPSMQSLERTAQDLSPKTMIYTVLASIA
LIIVALVSFLQPVGLSMELAFLLVVVCTILAVIVGFLVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISIVIISVILMMVGNAAGL
METADGQRFLTALTIFTASIVFCVSTISNDNLQDLKTGYLVKATPWRQQFALIIGCIVGALVITPVLEILYHAYGFAGAM
PREGMDAAQALSAPQATIMMTISNGIFSNSLEWTYILVGVAFGICLIIVDTLLKKASAGRLGLPTLAVGIGIYLPPVVNV
PLIIGATLSWLVNRHIKRYAKRSGKDVETTSKKAERYGTLFAAGLIVGESLVGVLLAFVIAGSVTSGGSDAPLALNLENW
GGMAELLGLTLFAIGCIIFARRVLQAKK
>Mature_668_residues
MNNPTALRELTLRGMILGALITVVFTASNVYLGLKVGMTFASSIPAAVISMAVLKMFQGSNILENNMVQTQASSAGTLSS
VIFVIPALLMMGYWQSFPFWQTLLICISGGILGVIFTVPLRNVMVVKSDLPYPEGVAAAEILKASDESDNKDSGIKEIVS
GGLLAASVSFLTNGLRVVADGASYWFKGGNAIFQVPMGFSFALLGAGYLVGMMGGIAMLVGTLFTWGVAVPYFTATTPMP
ADADMVSFATGLWKSNVRFIGVGTIAIAAIWTLLVLFKPMVQGMSQAFRALKDPSMQSLERTAQDLSPKTMIYTVLASIA
LIIVALVSFLQPVGLSMELAFLLVVVCTILAVIVGFLVAAASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISIVIISVILMMVGNAAGL
METADGQRFLTALTIFTASIVFCVSTISNDNLQDLKTGYLVKATPWRQQFALIIGCIVGALVITPVLEILYHAYGFAGAM
PREGMDAAQALSAPQATIMMTISNGIFSNSLEWTYILVGVAFGICLIIVDTLLKKASAGRLGLPTLAVGIGIYLPPVVNV
PLIIGATLSWLVNRHIKRYAKRSGKDVETTSKKAERYGTLFAAGLIVGESLVGVLLAFVIAGSVTSGGSDAPLALNLENW
GGMAELLGLTLFAIGCIIFARRVLQAKK

Specific function: Unknown

COG id: COG1297

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the oligopeptide OPT transporter family [H]

Homologues:

Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6321324, Length=736, Percent_Identity=23.2336956521739, Blast_Score=92, Evalue=2e-19,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004814
- InterPro:   IPR004813 [H]

Pfam domain/function: PF03169 OPT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70334; Mature: 70334

Theoretical pI: Translated: 8.88; Mature: 8.88

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNNPTALRELTLRGMILGALITVVFTASNVYLGLKVGMTFASSIPAAVISMAVLKMFQGS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVIPALLMMGYWQSFPFWQTLLICISGGILGVIFTVPL
CCHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
RNVMVVKSDLPYPEGVAAAEILKASDESDNKDSGIKEIVSGGLLAASVSFLTNGLRVVAD
CCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEC
GASYWFKGGNAIFQVPMGFSFALLGAGYLVGMMGGIAMLVGTLFTWGVAVPYFTATTPMP
CHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCC
ADADMVSFATGLWKSNVRFIGVGTIAIAAIWTLLVLFKPMVQGMSQAFRALKDPSMQSLE
CCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RTAQDLSPKTMIYTVLASIALIIVALVSFLQPVGLSMELAFLLVVVCTILAVIVGFLVAA
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISIVIISVILMMVGNAAGLMETADGQRFLTALTIFTASI
HCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VFCVSTISNDNLQDLKTGYLVKATPWRQQFALIIGCIVGALVITPVLEILYHAYGFAGAM
HHHHHHHCCCCHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PREGMDAAQALSAPQATIMMTISNGIFSNSLEWTYILVGVAFGICLIIVDTLLKKASAGR
CCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LGLPTLAVGIGIYLPPVVNVPLIIGATLSWLVNRHIKRYAKRSGKDVETTSKKAERYGTL
CCCHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FAAGLIVGESLVGVLLAFVIAGSVTSGGSDAPLALNLENWGGMAELLGLTLFAIGCIIFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRVLQAKK
HHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNNPTALRELTLRGMILGALITVVFTASNVYLGLKVGMTFASSIPAAVISMAVLKMFQGS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NILENNMVQTQASSAGTLSSVIFVIPALLMMGYWQSFPFWQTLLICISGGILGVIFTVPL
CCHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
RNVMVVKSDLPYPEGVAAAEILKASDESDNKDSGIKEIVSGGLLAASVSFLTNGLRVVAD
CCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCEEEEC
GASYWFKGGNAIFQVPMGFSFALLGAGYLVGMMGGIAMLVGTLFTWGVAVPYFTATTPMP
CHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCC
ADADMVSFATGLWKSNVRFIGVGTIAIAAIWTLLVLFKPMVQGMSQAFRALKDPSMQSLE
CCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHH
RTAQDLSPKTMIYTVLASIALIIVALVSFLQPVGLSMELAFLLVVVCTILAVIVGFLVAA
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASGYMAGLVGSSSSPISGIGIISIVIISVILMMVGNAAGLMETADGQRFLTALTIFTASI
HCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VFCVSTISNDNLQDLKTGYLVKATPWRQQFALIIGCIVGALVITPVLEILYHAYGFAGAM
HHHHHHHCCCCHHHHCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PREGMDAAQALSAPQATIMMTISNGIFSNSLEWTYILVGVAFGICLIIVDTLLKKASAGR
CCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
LGLPTLAVGIGIYLPPVVNVPLIIGATLSWLVNRHIKRYAKRSGKDVETTSKKAERYGTL
CCCHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH
FAAGLIVGESLVGVLLAFVIAGSVTSGGSDAPLALNLENWGGMAELLGLTLFAIGCIIFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRVLQAKK
HHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]