| Definition | Shewanella baltica OS155 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009052 |
| Length | 5,127,376 |
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The map label for this gene is 126174044
Identifier: 126174044
GI number: 126174044
Start: 2108842
End: 2110041
Strand: Direct
Name: 126174044
Synonym: Sbal_1817
Alternate gene names: NA
Gene position: 2108842-2110041 (Clockwise)
Preceding gene: 126174043
Following gene: 126174045
Centisome position: 41.13
GC content: 46.0
Gene sequence:
>1200_bases ATGAGCAACAATAATGGCTTACCGGATGGAGACATGATGACCAATCCTTTAACGGGTTCAGTAGCGACTCCTTTAAAGTC TCCTTCAAAAGAGAATGCCGCTTTAATTGATGCATCGGGTGAATCCAGTCTGATAACACTGTGGCAATCCTTGTATGCCG AGGGCAAAGTCAGTACGCCCCAAATGCCAGAAAACCATGATATTCCTTGGTATATTGCCGCTATGCAGGCCTTTGCCGCT TGGATAGCCGCTTTGTTTCTATTGGGTTTTATGATGGCAGCATTTGGCGCTATTTTTGAGCGGGTAGGTGAGGGCGTCGC CTTATTTATCGGCTTAACCTATTTAGCCGTGGGCATTGGGCTGTACTTTTTACCGCGGCAACAGATCTTCATTGAGCAAT TTGCTTTTGCCGCCTGTTTGAGTGGTTTAATCAGTGTGGCTTGGGGATTCTATGATTTAATCGACAATGATTTTAGCCTC AACTGGTATCTGTGTATGGCGGGTATTCTCTTGCTGTTGTGGGGCTTAATTGCCCATGGATTAGCCCAGTTTGTGTTCGC GTTTGGCTTAAGTTGGTGCGTGATTGGCCTCATGGCTAAGTTCGAATGGCTCAATGTCAGCCCAAGTCTGTTTGCCTTAA TCATTAGCTTAGTGTTGTTCAATATCAATCGGTTCGGGCGTCATTACCGCCGCGCGCGCATGCTTATCTACGGCTTTGCA CTGGCATTACTGACATTGCAACTGATGCATGCCTTTAGCATGGACAGTATTTTTGAAGCCTTATTCAGTCCTTGGCAACA AAGCTTGTGGCTCACGCTGATCCATCTGTCGATTATTTTTGTCATTTGCGGATTATTGTTGGTCAGCGTTTTTCGCGAAC GCCAACAATCACTCAGCTCACTGGCGGCGATAGGCTGTTTTCTCGGTTTAATGGTTATTAGCGGTTTATCTTTACCCATG CAGGGATTATCGACGGCTATCCTATTGATTCTGCTTGGCCATTATTGGAATGAGCCTTGGTTAAAAGGTATGGGAATTGT GTCGGCGCTGCTGTTTGTCAGCGGATATTATTATTCCTTAGAAACAACACTACTGCTGAAATCTGCTTATTTGATGGGTT TAGGCGCGCTGTTGCTGGTGGCAAGGATGCTGGTGTGGCGGTTATTTCCTGCCAATGAAAATGCCAAGGAGACTGTGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCACTGTCACAGTCTATGTCAGAATTAGAACCTGAACCTATGTCTGAATTAGAGCCTGATCCAGCAGCGAGAGCGACCCA AGGGAAAGTGGGAGACATTC
Downstream 100 bases:
>100_bases TGGGCAATATGATGGGAAAACTGGCGGCTTCACATAAATGGGCGCTGGGCATAGTACTGTTCACGACTGTTGCGATTCTC GCTGGCGTGAATTGGCGGAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 399; Mature: 398
Protein sequence:
>399_residues MSNNNGLPDGDMMTNPLTGSVATPLKSPSKENAALIDASGESSLITLWQSLYAEGKVSTPQMPENHDIPWYIAAMQAFAA WIAALFLLGFMMAAFGAIFERVGEGVALFIGLTYLAVGIGLYFLPRQQIFIEQFAFAACLSGLISVAWGFYDLIDNDFSL NWYLCMAGILLLLWGLIAHGLAQFVFAFGLSWCVIGLMAKFEWLNVSPSLFALIISLVLFNINRFGRHYRRARMLIYGFA LALLTLQLMHAFSMDSIFEALFSPWQQSLWLTLIHLSIIFVICGLLLVSVFRERQQSLSSLAAIGCFLGLMVISGLSLPM QGLSTAILLILLGHYWNEPWLKGMGIVSALLFVSGYYYSLETTLLLKSAYLMGLGALLLVARMLVWRLFPANENAKETV
Sequences:
>Translated_399_residues MSNNNGLPDGDMMTNPLTGSVATPLKSPSKENAALIDASGESSLITLWQSLYAEGKVSTPQMPENHDIPWYIAAMQAFAA WIAALFLLGFMMAAFGAIFERVGEGVALFIGLTYLAVGIGLYFLPRQQIFIEQFAFAACLSGLISVAWGFYDLIDNDFSL NWYLCMAGILLLLWGLIAHGLAQFVFAFGLSWCVIGLMAKFEWLNVSPSLFALIISLVLFNINRFGRHYRRARMLIYGFA LALLTLQLMHAFSMDSIFEALFSPWQQSLWLTLIHLSIIFVICGLLLVSVFRERQQSLSSLAAIGCFLGLMVISGLSLPM QGLSTAILLILLGHYWNEPWLKGMGIVSALLFVSGYYYSLETTLLLKSAYLMGLGALLLVARMLVWRLFPANENAKETV >Mature_398_residues SNNNGLPDGDMMTNPLTGSVATPLKSPSKENAALIDASGESSLITLWQSLYAEGKVSTPQMPENHDIPWYIAAMQAFAAW IAALFLLGFMMAAFGAIFERVGEGVALFIGLTYLAVGIGLYFLPRQQIFIEQFAFAACLSGLISVAWGFYDLIDNDFSLN WYLCMAGILLLLWGLIAHGLAQFVFAFGLSWCVIGLMAKFEWLNVSPSLFALIISLVLFNINRFGRHYRRARMLIYGFAL ALLTLQLMHAFSMDSIFEALFSPWQQSLWLTLIHLSIIFVICGLLLVSVFRERQQSLSSLAAIGCFLGLMVISGLSLPMQ GLSTAILLILLGHYWNEPWLKGMGIVSALLFVSGYYYSLETTLLLKSAYLMGLGALLLVARMLVWRLFPANENAKETV
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44172; Mature: 44041
Theoretical pI: Translated: 6.23; Mature: 6.23
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 4.3 %Met (Translated Protein) 5.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 4.0 %Met (Mature Protein) 5.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSNNNGLPDGDMMTNPLTGSVATPLKSPSKENAALIDASGESSLITLWQSLYAEGKVSTP CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QMPENHDIPWYIAAMQAFAAWIAALFLLGFMMAAFGAIFERVGEGVALFIGLTYLAVGIG CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYFLPRQQIFIEQFAFAACLSGLISVAWGFYDLIDNDFSLNWYLCMAGILLLLWGLIAHG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAQFVFAFGLSWCVIGLMAKFEWLNVSPSLFALIISLVLFNINRFGRHYRRARMLIYGFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LALLTLQLMHAFSMDSIFEALFSPWQQSLWLTLIHLSIIFVICGLLLVSVFRERQQSLSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAAIGCFLGLMVISGLSLPMQGLSTAILLILLGHYWNEPWLKGMGIVSALLFVSGYYYSL HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETTLLLKSAYLMGLGALLLVARMLVWRLFPANENAKETV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure SNNNGLPDGDMMTNPLTGSVATPLKSPSKENAALIDASGESSLITLWQSLYAEGKVSTP CCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCC QMPENHDIPWYIAAMQAFAAWIAALFLLGFMMAAFGAIFERVGEGVALFIGLTYLAVGIG CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYFLPRQQIFIEQFAFAACLSGLISVAWGFYDLIDNDFSLNWYLCMAGILLLLWGLIAHG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAQFVFAFGLSWCVIGLMAKFEWLNVSPSLFALIISLVLFNINRFGRHYRRARMLIYGFA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LALLTLQLMHAFSMDSIFEALFSPWQQSLWLTLIHLSIIFVICGLLLVSVFRERQQSLSS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAAIGCFLGLMVISGLSLPMQGLSTAILLILLGHYWNEPWLKGMGIVSALLFVSGYYYSL HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETTLLLKSAYLMGLGALLLVARMLVWRLFPANENAKETV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA