Definition Shewanella baltica OS155 chromosome, complete genome.
Accession NC_009052
Length 5,127,376

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The map label for this gene is 126173794

Identifier: 126173794

GI number: 126173794

Start: 1815291

End: 1818848

Strand: Direct

Name: 126173794

Synonym: Sbal_1560

Alternate gene names: NA

Gene position: 1815291-1818848 (Clockwise)

Preceding gene: 126173793

Following gene: 126173795

Centisome position: 35.4

GC content: 45.31

Gene sequence:

>3558_bases
ATGTTGTTATCAATGCTTAGGTTTGAGTGGCGTTATTATTTACGTCAGCCATCCTTTTATGTTGTTTCTTTTCTATTGTT
TTTAATGAGTTTTCTATCTGTCGCATCTAACAATATCCAAATTGGTAGTGGCGGCGAGGTGATGAAAAACAGCCCATTTG
GTATTACCCAAACTATGTTGATCATGGGATTAATTTCCATGTTTGCCGTGGTGAATTTTGTGGGCAGCACGGCTATCCGC
AATCATCAGCATTTGATGGAAGAGCTGATTTATAGCAAACCCCTATCGCCATTTGCATATCAATTTGGCCGCTTTTTAGG
CAGCTTTGTTGTAGTGATGATGGTATTCGCGTTTATTCCCATAGGGTTAATGCTCGGTTCCTTTATGCCATGGGTCGATG
CGAGCCGCTTTGGGCCTTTTGTGTTATCGAATTATCTTGTTCCGTATTTTTTGCTCGCCATGCCGAGTTTGCTGCTGATC
TCCACTCTGTTCTATGCGATGGCAAGTCGCTTTCGTTCCTTAATGGCGCTTTATCTGACTGCAGTGGCTATGTTGGTGCT
CTATACCCTAACGGGCGAAATGGCGAGTCAGCCGCAATATCGCACCATAGCTGCCTTGCTTGATCCGTTTGCGCTGCGCA
CCTTTGCCGAAGTGACTCGTTATTGGACCATTAGTGAGAAGAATAACCAGTTAATTGAATTCTCTGGGCTAGTGCTGCAA
AACCGCGCGCTATGGTTTGGAATTGCCTGCGTGTTACTGGCCGTTTCCGGGATTTTTCGTCAGCCGAGCTTGACCAAGAA
GCGTGAGAAAAAATCTGATAAAGCGGGAATAGTGCCCAGCTTAGTGCCTTTGGCACAATTGGCTATGGCAACTGAACCTA
ATGGTCGTCAGCAATTTTGGACGCGCATTAAATTTGAAGTACGCCAAGTGCTGTTTACCGCACCATTTGTGGTGTTAGGC
GTGCTGACTATTTTCAACTTAGTCGGCCCCATGTTCGATGATTTTGGTTGGTATGGCACATCTAACTGGCCATTAACCCA
AGATATGGTAGATAACATTGCCGGCGCGACGGGGTTATTGATGGTGATAGTGCTGATTTATTACAGCGCAGAAATCGTCT
GGCGTGAACGCAGTTCAGGAATGGGGGATATCGTCGACAGCGTTCCCGTATCAAACTTAAGTTTTTGGGGCTCTAAGCTC
GTGTCTGTGGTCATAGTGATGACCTTGCTGTACGTGCTCGCCATGTGTACCACCATCGCCTTCCAACTGATAAAAGGTCA
AGCCAATCTTGAGATTGCTCAGTACCTTATTCGATTGGGATTTTATTATCTCTTGCCGCTGTTGATGACCGCTGTGCTGG
CGTTTTTCCTGCAAGTGCTTAGCCCAAATAAGTACGCTGGAATGGGGCTATTTGTTGCTTATTATCTAACGACGTTTGTC
ATGGCAAGCTGGGGATTTGGCCATAGCCTGTATAACTTTGGTCAATCGCCAACCTTAAGTTACTCCGATATGAACGGCTA
CGGCTGGGGCTTATTAAGCCATGCACTCTATATGATTTACTGGGGGGCTTTTAGCCTTATCCTGTTTGTTTTAGGTTATG
GTTTGTATCATCGCGGACCGCAGCAGAGTATTAAAACGCGTCTGAGCTTACTGGGCTATCAGCTTGGTTTTAGTGGTAAA
GCCATTGTTAGTGTTGCCTTAGTGGTGTTTTTGGGTATGGGTAGTTATTTGTTCTACCAGACCAAAGTGGTGAATCAGTT
CCTCACCCAAGATGAGACCACAGATCTGCAAGCCGATTATGAGAAGGCCTTTAAGCAATACCAAGACATGCCGATTTTAG
TGACCACTAAGGTCAATGCGAATGTCGATATTTTCCCTGAAGATCGCAAAATTGTCGCTAAGGTGATGTTTGAATGGCAA
AACAAGTCGGATAAACCGATCGAGAAGATGCTAGTGCAGTTGCCCGAACACACTCAGGCAGATACGGTAAAAATCAATAT
TCCTAATGCTAACTTAGGTGAGTTTGATAGCCGCTATCGTAATACTTGGCTGACCTTTTCGACGCCAGTGCAGCCTGGGC
AAGTGGTGCAAGGGGATATCCAACTAGTACGCGAGTCGGTGGGTGTTGCTGAATCTGGCTTTGATATGTCAGTGGTTGAA
AATGGCACCTTCATCAATAACTTCGAACTATTGCCGCTCTTTGGTTATCAAGATGGCTATGAGTTGATGGATCGCCACGA
GCGCCAAAAGCGCGATTTAGCCGAAAAAGCACGTGCGAACAAACTTGAAGACAGCCGCTATTACACGCAAAACTTCTTTG
GTGTCGATGGCGATTTCATTCAATTTGAAGCCACTATTTCGACAAGTGCTGATCAAATTGCATTAGCACCAGGATATTTG
CAAAAACAGTGGCAGCAGGATGGGCGTCAGTATTTCCATTATTCGATGGACAGCCCCATGGTGAATTTCTATGCCATTAT
TTCGGGCCGTTATCAGGTAGAAAAAACCGAGCATAATGGTGTCGCCGTTGAGGTCTATTACCACGCAGATCATCCTTGGA
ACGTTGCCCGCATGATAGAGTCAGTTAAAGATTCTATCGATTACTACACACAAGCATTTGGGCCTTATCAGCACAAACAA
ATGCGGATCATGGAGTTTCCGGGTTACCGTAGTTTTGCACAAAGTTTTGCTAATACAGTGCCTTACTCTGAGCGTATTGG
TTTTATCACTGATTTACGCAACGAGGATAATATCGACCCTGTGTATTACGTCACCGCCCATGAAGTGGCGCATCAATGGT
GGGGACATCAAGTGGGTGCTGCTGACGTACAGGGTAGCGCTGTGATATCCGAAAGCTTGTCACAGTATTCGGCGCTTATG
GTGTTGGAGAAAAAGTACGGCGATAAAATGATCCGTAAATTCTTGAAATATGAATTAGATAGATATTTACGTGGCCGTTC
ATCCGAGTCCATAAAAGAGATGCCTGTGCTGCGCAGTGAAAATCAGCAGTACATTCATTATCAGAAAGGCTCAGTGGTGA
TGATGGCGATTAAAGATGTGTTAGGTGAAGCGAAACTCAACGCTAATCTCAAGGCATTTTTAGCGCGTTATCAGTATCGT
AACGATCCTTTCCCAACCACATTGGATTTGGTGAGTTACCTTGAGCAAGGGGCAGATGAAGCGCAGGCTCGCTTTATCGA
TGAGTCTTTTAATGAGATTACGCTCTACGATCTCAGGTTAACCAATGCGGTAATGACGACTCTGGCTGATGGCAAGACGC
AAGTTGAGCTGACCGTCTATGCCAGCCGCAAGGTGGCCAGTGGTAAAGGTGAAGAAACTGAACAACCTTTAGATGCCATG
ATTGATATCGGTGCCTTTAGTGCCGATCCCGATAAGCTGAAGGACGATAAACAGGTGTTATTAATTGAGAAGCACAGACT
GGTCAGTGGTGAAAACAAGCTGACGATCATTTTGGCTCAGAAGCCCAGTTATGTGGGAGTCGATCCCTTTGTGAAACTCA
TCGACAGAGATGCGAAGGACAATATCTTTAAACTGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGCCCCGAAGGATTTACCCCGGCGACAGCTGGGCTTGAAGATCTGTATTTTTCTACCTTACACAGTCATCGCCGTCAGG
CTGCCTAAGGAGATATCAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATCAGCTATCAAACAAGCTCGTTAACACCAACGCACTATCCGGCATGAATGGCCAGATAGTGCGTTTTTTATGCTAAGCC
TTAGTTTATGCCGAAATTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 1185; Mature: 1185

Protein sequence:

>1185_residues
MLLSMLRFEWRYYLRQPSFYVVSFLLFLMSFLSVASNNIQIGSGGEVMKNSPFGITQTMLIMGLISMFAVVNFVGSTAIR
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IDIGAFSADPDKLKDDKQVLLIEKHRLVSGENKLTIILAQKPSYVGVDPFVKLIDRDAKDNIFKL

Sequences:

>Translated_1185_residues
MLLSMLRFEWRYYLRQPSFYVVSFLLFLMSFLSVASNNIQIGSGGEVMKNSPFGITQTMLIMGLISMFAVVNFVGSTAIR
NHQHLMEELIYSKPLSPFAYQFGRFLGSFVVVMMVFAFIPIGLMLGSFMPWVDASRFGPFVLSNYLVPYFLLAMPSLLLI
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AIVSVALVVFLGMGSYLFYQTKVVNQFLTQDETTDLQADYEKAFKQYQDMPILVTTKVNANVDIFPEDRKIVAKVMFEWQ
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IDIGAFSADPDKLKDDKQVLLIEKHRLVSGENKLTIILAQKPSYVGVDPFVKLIDRDAKDNIFKL
>Mature_1185_residues
MLLSMLRFEWRYYLRQPSFYVVSFLLFLMSFLSVASNNIQIGSGGEVMKNSPFGITQTMLIMGLISMFAVVNFVGSTAIR
NHQHLMEELIYSKPLSPFAYQFGRFLGSFVVVMMVFAFIPIGLMLGSFMPWVDASRFGPFVLSNYLVPYFLLAMPSLLLI
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NDPFPTTLDLVSYLEQGADEAQARFIDESFNEITLYDLRLTNAVMTTLADGKTQVELTVYASRKVASGKGEETEQPLDAM
IDIGAFSADPDKLKDDKQVLLIEKHRLVSGENKLTIILAQKPSYVGVDPFVKLIDRDAKDNIFKL

Specific function: Unknown

COG id: COG0308

COG function: function code E; Aminopeptidase N

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 134653; Mature: 134653

Theoretical pI: Translated: 6.58; Mature: 6.58

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLLSMLRFEWRYYLRQPSFYVVSFLLFLMSFLSVASNNIQIGSGGEVMKNSPFGITQTML
CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHH
IMGLISMFAVVNFVGSTAIRNHQHLMEELIYSKPLSPFAYQFGRFLGSFVVVMMVFAFIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLMLGSFMPWVDASRFGPFVLSNYLVPYFLLAMPSLLLISTLFYAMASRFRSLMALYLT
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AVAMLVLYTLTGEMASQPQYRTIAALLDPFALRTFAEVTRYWTISEKNNQLIEFSGLVLQ
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEECCCHHC
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TRIKFEVRQVLFTAPFVVLGVLTIFNLVGPMFDDFGWYGTSNWPLTQDMVDNIAGATGLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHH
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HHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
MASWGFGHSLYNFGQSPTLSYSDMNGYGWGLLSHALYMIYWGAFSLILFVLGYGLYHRGP
HHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
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DTVKINIPNANLGEFDSRYRNTWLTFSTPVQPGQVVQGDIQLVRESVGVAESGFDMSVVE
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NGTFINNFELLPLFGYQDGYELMDRHERQKRDLAEKARANKLEDSRYYTQNFFGVDGDFI
CCCEEECEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEE
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PYSERIGFITDLRNEDNIDPVYYVTAHEVAHQWWGHQVGAADVQGSAVISESLSQYSALM
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HHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCEEE
LIEKHRLVSGENKLTIILAQKPSYVGVDPFVKLIDRDAKDNIFKL
EEEHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHH
IMGLISMFAVVNFVGSTAIRNHQHLMEELIYSKPLSPFAYQFGRFLGSFVVVMMVFAFIP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IGLMLGSFMPWVDASRFGPFVLSNYLVPYFLLAMPSLLLISTLFYAMASRFRSLMALYLT
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEECCCHHC
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TRIKFEVRQVLFTAPFVVLGVLTIFNLVGPMFDDFGWYGTSNWPLTQDMVDNIAGATGLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHH
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HHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
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HHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
EKAFKQYQDMPILVTTKVNANVDIFPEDRKIVAKVMFEWQNKSDKPIEKMLVQLPEHTQA
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CEEEEECCCCCCCHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEC
NGTFINNFELLPLFGYQDGYELMDRHERQKRDLAEKARANKLEDSRYYTQNFFGVDGDFI
CCCEEECEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEE
QFEATISTSADQIALAPGYLQKQWQQDGRQYFHYSMDSPMVNFYAIISGRYQVEKTEHNG
EEEEEECCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCC
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EEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHCC
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CCHHHCCHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
VLEKKYGDKMIRKFLKYELDRYLRGRSSESIKEMPVLRSENQQYIHYQKGSVVMMAIKDV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHH
LGEAKLNANLKAFLARYQYRNDPFPTTLDLVSYLEQGADEAQARFIDESFNEITLYDLRL
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHH
TNAVMTTLADGKTQVELTVYASRKVASGKGEETEQPLDAMIDIGAFSADPDKLKDDKQVL
HHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCEEE
LIEKHRLVSGENKLTIILAQKPSYVGVDPFVKLIDRDAKDNIFKL
EEEHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA