Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yhgE [H]

Identifier: 125624458

GI number: 125624458

Start: 1635111

End: 1637510

Strand: Reverse

Name: yhgE [H]

Synonym: llmg_1659

Alternate gene names: 125624458

Gene position: 1637510-1635111 (Counterclockwise)

Preceding gene: 125624460

Following gene: 125624457

Centisome position: 64.74

GC content: 37.58

Gene sequence:

>2400_bases
ATGTTAAAAAAGGAATGGCAGGCCATTTTAAAACACAAATTTTTTATTATTGTTATTATTGCATTGGCGCTTGTACCAGC
AATTTACAACTATATTTTCTTGGGGTCGATGTGGGACCCCTATGGTAAGCTAAATGACTTACCGGTAGCAGTTGTAAATT
TGGACAAGACGTCTGAATTGAACGGTAAAAAATTCAAACTTGGTGATGATGTCATTACTGAGATGAAAAAATCAAAGGAT
TTAGACTATCATTTCGTTTCCAAGGACAAAGCTTCTGAGGGAATAAAAAAAGGTGACTATTATATGGTCATTACTTTCCC
AGAAAACTTTTCAGAAAATGCGACGACGCTGATGAATAAAGAGCCAAAAACAGTCCAGTTAGATTATCAAACAACACGCG
GTCACAATTATATTTCATCAAAAATGAGTGAAAGTGCGATGAATCAACTGAAATCAGAGGTTTCTAAAAACATTACCCAA
ACTTATACAAAAGAAATATTTGCTAAACTTGGTGACATGAAGTCGGGAATGAAAGAAGCTTCTGACGGCTCAAATAAATT
AGCTGATGGGACTTCGTCAGCGCTGTCAGGTTCCACAGAATTGACTAATAATTTGAACACTTTGTCCTCTTCTAGTGTAA
CTTTTAATAATGGCGCTGATAGTTTAAATTTTGGCCTAAATAAGTTTGTTTCAGGAGTGGATCAAGCTGCAAATGGAGGA
CAACAAGTTTCTTCAGGTGCTGACCAATTTGTCAGTGGAACTCAACAATTAGCTGAGGGAACCCAAACTTTGGCTGATAA
ATCTAAAGATCTGTCAGCAGGAATTTCACAGATTTCTCAAAGTACAGAAGCGGTGAGCCAATTGCAATTGGGTGTGCAAC
AACTATCCGAAGGCTTAAGTCAAATGGCTCAAAAAACAACTTTATCCGAAACTCAACAGCAAAATATTAGTGCTGTGCAA
AATGGTCTTACTGAATTAAATCAAGAGTTACAAAAAAATACGATTGACCCAAATTTGGCTGCTAATGTCCAAAAAAACTT
GGAAGGTCTTGGAGCTACGGTTACAAATTTAGCTAATGATCAAGTGGCAGCCTCTAAGGCAGCAGTTGAAAGTACTGAGA
CTTTTAAAACTTTAACCAAAAGTCAGAAAACAGATATAAGAAATGCATTAGATAATTCTGTTGGTGCCGGAGCGGTTCAA
GCTGATTTAGTTTCATTAAATGAGAATATTACAGGGGTCAAAAACAGTCTTACAAATCTACTACCAATGCTTGGAAAAAT
TGCTGATCTTAAAACATTAGTTCCAGGGGCAAGTCAAACAATTACTGACCTTTCTACAGGTTTAAATAGTGTGAATAGTA
GCTTAAATAGTCAAATTTTACCAGGAATGAATAAACTAGACAGTGGTTTGACAACATTCAATAGTCAACTCACCTCTGGT
GGACAAAAATTGAGTTCTGGCTTTACCCAATATGCTGACGGAGTAGCTAAGGCAAACGCTGGTGCTCAACAATTGGCAAG
TAAATCAAAAGACTTGCAAAGTGGAACCATGCAATTAGTCTCAGGATTGACTCAACTACAAGCGAATGGTCCATCATTAA
CTTCTGGCTCAAACCAATTGGCAAGTGGTGCAAAGCAAATTTCAACGGGTTCACAACAGTTGGCAAATGGTGGCTCAAAC
TTAACTAATGGTTTGGGAACTTTAAATACAGGTGCTACTGATTTATCAACAGCTTTAACTAAGGCTGATGATAGTCTGTC
AGCAACAAATTCTACTGACGAAAATGCTAAAAAAGTAGCAGCTCCACTGAAACTTAAACATACTGACCATGATAATGTGC
CAGTAAATGGTGCTGGGATGACTCCTTATATGATTAATGTTGCACTCTTTATTGGGGCGCTTGCCACTAATGTCGTAATT
GGAGTTGGTTTCTCAGGAGAAAAATGGAAATCAGGACGCGAATTTATGTTTGCTAAGATTGGCACAAATGGTTTAGTTGC
ACTTTTGCAAGGAATCATTGTCTGGGGAGCAGTGGCACTTCTTGGTTTGAGTCCAAATCATTGGTGGGAAATGCTATTAG
TCGTTCTTTTGATAAGTTTTGCATATATGGCTATAAATACTTTCTTCTTAACGGCTTTAGGAAAAGTAGGTGAGTTTGTC
ATGATTGTCGTTCTTGTGTTGCAATTAGCGACAAGCGCTGGAACCTATCCATTACAATTAGCTCCTAAGATCTATCAAGT
CATCAGTCCTTGGTTGCCAATGACCTATGGATTAAAGATGCTACGTGAAACAATTGGCTTGAATGGCGCGATTTTACCTG
AAGCAATTCTCTTTGTGGTTATTATCGCCGTCTTTACATTAATGTTGAGTTTCTTCAAAAAATTCTCACGCTTTGCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCAAAAGCGAATGGATAATAATTGTCAATTTTTCTAAAAAGTTTATAATACATATTGTAACAGTTTTTGGACGTTGTGT
CCATAAAGAAAGGGGAAATG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAAAAATTACTGACAGAAACTTTCTAGACTGAATTTTTACCTGCCAGTAATTTTTTGTCTAGAAATTTTAAAATAAAT
TTGGTAAAATAAAGCTGTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFB [H]

Number of amino acids: Translated: 799; Mature: 799

Protein sequence:

>799_residues
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVITEMKKSKD
LDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKEPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQ
TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG
QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ
NGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLANDQVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQ
ADLVSLNENITGVKNSLTNLLPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG
GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQLASGAKQISTGSQQLANGGSN
LTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI
GVGFSGEKWKSGREFMFAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIAVFTLMLSFFKKFSRFA

Sequences:

>Translated_799_residues
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVITEMKKSKD
LDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKEPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQ
TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG
QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ
NGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLANDQVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQ
ADLVSLNENITGVKNSLTNLLPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG
GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQLASGAKQISTGSQQLANGGSN
LTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI
GVGFSGEKWKSGREFMFAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIAVFTLMLSFFKKFSRFA
>Mature_799_residues
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVITEMKKSKD
LDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKEPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQ
TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG
QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ
NGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLANDQVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQ
ADLVSLNENITGVKNSLTNLLPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG
GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQLASGAKQISTGSQQLANGGSN
LTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI
GVGFSGEKWKSGREFMFAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIAVFTLMLSFFKKFSRFA

Specific function: Unknown

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR022703
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84982; Mature: 84982

Theoretical pI: Translated: 7.83; Mature: 7.83

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSEL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCC
NGKKFKLGDDVITEMKKSKDLDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNK
CCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCC
EPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQTYTKEIFAKLGDMKSGMKEA
CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG
CCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QMAQKTTLSETQQQNISAVQNGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLAND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
QVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQADLVSLNENITGVKNSLTNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
LPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
ASGAKQISTGSQQLANGGSNLTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVA
HHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
APLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVIGVGFSGEKWKSGREFMFAKI
CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEC
GTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVV
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
IIAVFTLMLSFFKKFSRFA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSEL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCC
NGKKFKLGDDVITEMKKSKDLDYHFVSKDKASEGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNK
CCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCC
EPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITQTYTKEIFAKLGDMKSGMKEA
CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SDGSNKLADGTSSALSGSTELTNNLNTLSSSSVTFNNGADSLNFGLNKFVSGVDQAANGG
CCCCCCCCCCCHHHHCCCHHHHHCHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
QQVSSGADQFVSGTQQLAEGTQTLADKSKDLSAGISQISQSTEAVSQLQLGVQQLSEGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QMAQKTTLSETQQQNISAVQNGLTELNQELQKNTIDPNLAANVQKNLEGLGATVTNLAND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
QVAASKAAVESTETFKTLTKSQKTDIRNALDNSVGAGAVQADLVSLNENITGVKNSLTNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
LPMLGKIADLKTLVPGASQTITDLSTGLNSVNSSLNSQILPGMNKLDSGLTTFNSQLTSG
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GQKLSSGFTQYADGVAKANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLTQLQANGPSLTSGSNQL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHH
ASGAKQISTGSQQLANGGSNLTNGLGTLNTGATDLSTALTKADDSLSATNSTDENAKKVA
HHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHH
APLKLKHTDHDNVPVNGAGMTPYMINVALFIGALATNVVIGVGFSGEKWKSGREFMFAKI
CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEC
GTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLSPNHWWEMLLVVLLISFAYMAINTFFLTALGKVGEFV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVV
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
IIAVFTLMLSFFKKFSRFA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]