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The map label for this gene is nha [H]

Identifier: 125623267

GI number: 125623267

Start: 392501

End: 394543

Strand: Reverse

Name: nha [H]

Synonym: llmg_0399

Alternate gene names: 125623267

Gene position: 394543-392501 (Counterclockwise)

Preceding gene: 125623268

Following gene: 125623262

Centisome position: 15.6

GC content: 36.66

Gene sequence:

>2043_bases
ATGCTCCATACTATTTTTTATGTCATTATTTTCCTTTTGGTATTAGCTTTTTCAAATGTCCTTAATAAAGTTTTCCCAAA
ACTTGCCCTTCCGCTGATTCAAGTGGTTTTAGGACTTATTTTGGGCTTTTTTGGTGCTGACGAAGTTTTACATGTCGCTC
CAGAATTTTTTCTAGGCTTTATTATTGCCCCACTTCTTTTTAGAGAAAGTGAAGAAGCTGACGTCAAACATATTTTAAAA
CATAGTAAAATTATTTTAGTACTTATTTTCCCCCTTGTTTTTATCACAACTCTTGGATTAGGTTTAATTTCTAATTGGAT
ATATGTCGGACTTCCTTTGGCTGCTTGTTTTGCTTTAGGAGCCAGTCTTGCTCCTACCGATGCCGTAGCCGTGGGGGCTT
TATCCAAAAACTTCTCCTTTCCACGTAGGGTCATGAGTGTTTTACAGGGTGAAGGGCTTCTCAATGATGCTTCTGGAATT
ATTTCCTTTCAAATTGCATTAGTCGCACTGGTTACAGGTTATTTTTCTTTTCCAGATGCAACAATGAAATTGGTGATCTC
TGCCATTGGTGGGGCTGCTATTGGATTTAGTTTAATTTATATCAAAGGGCTAGTTTTGAGACTTTTAGAAGATGTCGATG
CCCGAGATGTCTCAGGATATCTTCTCTTAGAACTTGTGGTTCCTCTTGCCGCCTTTCTCATTTCTGAAGAACTTCATGTT
TCTGGAATTATCGCTGCTGTCGTCGCTGGAGTGATGTCAGCCAATGGTCTCAAAAGAACAACTTTATTTGATGCTCAAGT
AGAAAAACTTAAAAGTACAATTTGGGACACTTTGACCTTCATTTTAAATTCCTTTGTCTTCTTGTTTTTAGGAATTGAAC
TTTATCAACTTGTTGTTCCACTTTTAGTTGACCCTGTTTATTCTTCAGCTCATCTAATTCTCCTTACTCTTGCTCTAACT
GCTGGCTTATTTGCCCTTCGCTTCGTCGTCATTGCCTTTTATTACTGGCTTCGTTCGCTTAAACAAAAACAGCCTTTCTC
TGCTTATTGGAATGATATTCTTCTTCTTACTTTTGCTGGCTCTAAAGGAACTGTAAGTATCGCAACGATTCTTTTGGTTC
CTCGAAGCGTTGATATCCAACCAGTCCTAGTCTTTCTAGCAGCTGCCGTAACTGGCTTAAGCTTTTTGGTCGGAATGTTC
ATTCTCCCTTTCTTTGCAGTCAAAAAAGTCTCTAAAGTTAACAATATCTCTAAAATCGCTATTTTATCCGAGGTTGTTGA
TGAATTACGCCAGGATATGACAACAGCTAAAAATCCTCAGGGATACGATATTGCAATTGATGCTTATCAAGAAAGGATTC
AACAGTTAATTATTGAGCAAGAATCCACCGATATGGCGATTGACTATAATGATTTGCAACTTTTGATTATCCGAATCGAA
TCTGAAGGTCTTGAAGCTTACTTACGTGAAAATAAAATTTCTATGTATACTTATCGAACTTATCAAAGGTATATTCGCTC
ATTGGAAACAAGTATTGTCCATTCCCTTGTTTCAAGTATTCAATTTGTTTATGTTATTACTTTGCGTGCCTTTCATTTGC
TGGTTTCTCGCTTCTTGCATGTGGATTTTTATTTCAAAAAAACAAAGGCAGCAATGGAAACAACGCGTGATGAAATTACT
GAACTATATTTCAATAACACCGAACTTATCTTACAAGCCTTGGACAATTTAAATGGGGTTTTTGATGAACAACTTTTGAA
TTTCTTACAATCAGAACGTTTGCGAACTTCTGAAATTGTGGCTTCTGGTGGTCATATTTCTCGGATGGTAAATAAAGCTC
AGCCTAATAACATTACTGAAATGATGCGTGCCTACTATTTAGAACGTAAAGTTATCTTTGAGCATGAGCTTTCTGGAGCA
ATTACCGCAAGAGAAGCCAAAGATATGCGACTTAATGTCAATATTCTTGAAGATTATTCATTAGCAAGTAATCATCATAC
GCTACTTTTCGACTTTTTGGAACGTCGAAAAAATAAAAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGAAATAAATAAGTAGAATATGCACTAGTAGAGCTACCTTTGATAGCTCTACTTTGCACTTTTTAAGCGCTCATCAAT
TTTTTTAAAGAAAGGACTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGATTAAATTAGCATAAAATCAAAAAAGTTACTGACATCTTTGTCAGTAACTTTTTATTCTTCAATCTTAATGATCGTTT
CTAATTTTATATTTCCTTGA

Product: Na+/H+ antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 680; Mature: 680

Protein sequence:

>680_residues
MLHTIFYVIIFLLVLAFSNVLNKVFPKLALPLIQVVLGLILGFFGADEVLHVAPEFFLGFIIAPLLFRESEEADVKHILK
HSKIILVLIFPLVFITTLGLGLISNWIYVGLPLAACFALGASLAPTDAVAVGALSKNFSFPRRVMSVLQGEGLLNDASGI
ISFQIALVALVTGYFSFPDATMKLVISAIGGAAIGFSLIYIKGLVLRLLEDVDARDVSGYLLLELVVPLAAFLISEELHV
SGIIAAVVAGVMSANGLKRTTLFDAQVEKLKSTIWDTLTFILNSFVFLFLGIELYQLVVPLLVDPVYSSAHLILLTLALT
AGLFALRFVVIAFYYWLRSLKQKQPFSAYWNDILLLTFAGSKGTVSIATILLVPRSVDIQPVLVFLAAAVTGLSFLVGMF
ILPFFAVKKVSKVNNISKIAILSEVVDELRQDMTTAKNPQGYDIAIDAYQERIQQLIIEQESTDMAIDYNDLQLLIIRIE
SEGLEAYLRENKISMYTYRTYQRYIRSLETSIVHSLVSSIQFVYVITLRAFHLLVSRFLHVDFYFKKTKAAMETTRDEIT
ELYFNNTELILQALDNLNGVFDEQLLNFLQSERLRTSEIVASGGHISRMVNKAQPNNITEMMRAYYLERKVIFEHELSGA
ITAREAKDMRLNVNILEDYSLASNHHTLLFDFLERRKNKN

Sequences:

>Translated_680_residues
MLHTIFYVIIFLLVLAFSNVLNKVFPKLALPLIQVVLGLILGFFGADEVLHVAPEFFLGFIIAPLLFRESEEADVKHILK
HSKIILVLIFPLVFITTLGLGLISNWIYVGLPLAACFALGASLAPTDAVAVGALSKNFSFPRRVMSVLQGEGLLNDASGI
ISFQIALVALVTGYFSFPDATMKLVISAIGGAAIGFSLIYIKGLVLRLLEDVDARDVSGYLLLELVVPLAAFLISEELHV
SGIIAAVVAGVMSANGLKRTTLFDAQVEKLKSTIWDTLTFILNSFVFLFLGIELYQLVVPLLVDPVYSSAHLILLTLALT
AGLFALRFVVIAFYYWLRSLKQKQPFSAYWNDILLLTFAGSKGTVSIATILLVPRSVDIQPVLVFLAAAVTGLSFLVGMF
ILPFFAVKKVSKVNNISKIAILSEVVDELRQDMTTAKNPQGYDIAIDAYQERIQQLIIEQESTDMAIDYNDLQLLIIRIE
SEGLEAYLRENKISMYTYRTYQRYIRSLETSIVHSLVSSIQFVYVITLRAFHLLVSRFLHVDFYFKKTKAAMETTRDEIT
ELYFNNTELILQALDNLNGVFDEQLLNFLQSERLRTSEIVASGGHISRMVNKAQPNNITEMMRAYYLERKVIFEHELSGA
ITAREAKDMRLNVNILEDYSLASNHHTLLFDFLERRKNKN
>Mature_680_residues
MLHTIFYVIIFLLVLAFSNVLNKVFPKLALPLIQVVLGLILGFFGADEVLHVAPEFFLGFIIAPLLFRESEEADVKHILK
HSKIILVLIFPLVFITTLGLGLISNWIYVGLPLAACFALGASLAPTDAVAVGALSKNFSFPRRVMSVLQGEGLLNDASGI
ISFQIALVALVTGYFSFPDATMKLVISAIGGAAIGFSLIYIKGLVLRLLEDVDARDVSGYLLLELVVPLAAFLISEELHV
SGIIAAVVAGVMSANGLKRTTLFDAQVEKLKSTIWDTLTFILNSFVFLFLGIELYQLVVPLLVDPVYSSAHLILLTLALT
AGLFALRFVVIAFYYWLRSLKQKQPFSAYWNDILLLTFAGSKGTVSIATILLVPRSVDIQPVLVFLAAAVTGLSFLVGMF
ILPFFAVKKVSKVNNISKIAILSEVVDELRQDMTTAKNPQGYDIAIDAYQERIQQLIIEQESTDMAIDYNDLQLLIIRIE
SEGLEAYLRENKISMYTYRTYQRYIRSLETSIVHSLVSSIQFVYVITLRAFHLLVSRFLHVDFYFKKTKAAMETTRDEIT
ELYFNNTELILQALDNLNGVFDEQLLNFLQSERLRTSEIVASGGHISRMVNKAQPNNITEMMRAYYLERKVIFEHELSGA
ITAREAKDMRLNVNILEDYSLASNHHTLLFDFLERRKNKN

Specific function: Transporter involved in the efflux of sodium, potassium, lithium and rubidium [H]

COG id: COG0025

COG function: function code P; NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family. Nhak (TC 2.A.36.3.2) subfamily [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790501, Length=562, Percent_Identity=30.6049822064057, Blast_Score=197, Evalue=2e-51,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71992107, Length=330, Percent_Identity=20, Blast_Score=65, Evalue=8e-11,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71992101, Length=330, Percent_Identity=20, Blast_Score=65, Evalue=1e-10,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320663, Length=367, Percent_Identity=22.6158038147139, Blast_Score=64, Evalue=7e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR006153
- InterPro:   IPR018422
- InterPro:   IPR018417
- InterPro:   IPR004705 [H]

Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76146; Mature: 76146

Theoretical pI: Translated: 6.46; Mature: 6.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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CCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure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CCCCCHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]