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The map label for this gene is epsK [H]

Identifier: 124485716

GI number: 124485716

Start: 882949

End: 884517

Strand: Reverse

Name: epsK [H]

Synonym: Mlab_0894

Alternate gene names: 124485716

Gene position: 884517-882949 (Counterclockwise)

Preceding gene: 124485717

Following gene: 124485715

Centisome position: 49.0

GC content: 39.01

Gene sequence:

>1569_bases
ATGTCCGAGAAAACACTTGATATCCAATTTCAAAAGCAATTACCAAAAAATCTGCTTTCAAATTTAGCATATTTGACCAT
CAATCTGGTCATAGGTCTTGCCTTAGTTCCATTTTTTCTTGAGACTCTTGGTGAATCAGCCTATGGATTGATTCCTCTTG
CCACATCTTTTACCAGTTTTATCACTCTATTTATAGATGTAGTTAATGAAGCAATATCACGCTATCTCACCATTGACCTC
CAGCGCGGAGATCGAAAAAAAGCAGTAATTACTTTTAACACCTCCCTCATTGGAACACTGGTGATTCTTCTCATAGTAAC
CCCCATTGGACTAATCTTTGCACTTTTATCTCCAACAATATTTAATATTGGAGATACAGTTGCAACTGATGTAATCTGGT
TATTCGCTCTTGTGATAATATCTGTCCTTATCAGGGCTTGGAGCAGCAATTTCAGTGTGATATTATTCGCATATAATCGT
ATCGACCTCAAAAACCATGTGAACAATACCAACCTTATCGCACAAATTATATCTGTGGTTCTCCTATTCACCTTACTCGA
ACCAACACTTCCCTTTGTTGGATTATCATATCTAATAGCTGCATGCATGGCATTATTTCTCTCCATTGTATTTTCCAGAA
AAATATGTCCTTTCCTTAATATCTCTATCACAGCATTTTCTCTATTCCATCTGAAAGAAATACTAAGCACTGCATTTTGG
TTAGCAATATTACGAATGGGTGTTGTCCTGAGAAATCAAGCGGCATTAATAATTACTAACATAGTACTTGGATCCATCGT
CGCTACTGAATTTTCTCTGGTTCTCACATGGAATACACTCATAGTTGGTCTTCTTGGTTTGATAACTACCTGCTTTTCGC
CGATGATATTCTCATACCGTGCTAAAGATAACAAAGAGAGTATGGTAACATTTACAGCCTTCTCTGTAAAAATAGTAACC
CTGTTAACCGCACTTCTTGTAGGGCTTGTCTGTGTATTTTCGTCCCAGTTAATGACAATATGGGTTGGTCAAAACTACGC
AGACCTCTCCTTGCTTGTATGGATTACTGTAATTGCCTCTATATTTATGGTCCAGTTTTCATGTTGTGGGTCAATTACAG
CTGCCTACATTCGTGTTCGCACTCCAGGCCTCATATATCTTGTGGCAGGTGGGTTTAATGTCATACTAGCTCTTACTTTA
TCGCTTGTATTTAATATGGGGATTTACGGTATAGCTCTTGCCACTACTATAACAACTCTCATAACAGACGGATTATTTGG
TCCTATATACGCAGCTCACATTCTCAAAGCCCCTCTCATCACATTTGTCAAGCCCGCATTCCCCGGTTACGTTGCACTCC
TCATCCTGTTGGTGCTTGGATTCTTATTCATGCAGGTTGTTTCCATTAGCGGAATTGTACCAACGTTCCTCGCCGGAGGC
TCGATTGCTACAGTTTACTGCGTCATTTTATGGTGTGCGGTATTAAATAAAGGAGAGCGAAAAAATATACTCAGGATATT
TCCTCCCAGCCTGGATAGAAAATTGCTGTGGAATAATAAGAGAGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTGTGTGTTCAAGTGGAGTAATTGATTATTTGGTCCCATCATAGGTTGTGTTTTGCCCACCTAATTCATTGAAATATT
GAAAATATGAAACGTTTAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAGTAAAAAATGGAAGTTATTCAAATGAAACTACTCCTATTTGAATACTGTACCCTGAGTCATAATATGGATTTGTGT
TTTAGATTTGTTTTATGTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 522; Mature: 521

Protein sequence:

>522_residues
MSEKTLDIQFQKQLPKNLLSNLAYLTINLVIGLALVPFFLETLGESAYGLIPLATSFTSFITLFIDVVNEAISRYLTIDL
QRGDRKKAVITFNTSLIGTLVILLIVTPIGLIFALLSPTIFNIGDTVATDVIWLFALVIISVLIRAWSSNFSVILFAYNR
IDLKNHVNNTNLIAQIISVVLLFTLLEPTLPFVGLSYLIAACMALFLSIVFSRKICPFLNISITAFSLFHLKEILSTAFW
LAILRMGVVLRNQAALIITNIVLGSIVATEFSLVLTWNTLIVGLLGLITTCFSPMIFSYRAKDNKESMVTFTAFSVKIVT
LLTALLVGLVCVFSSQLMTIWVGQNYADLSLLVWITVIASIFMVQFSCCGSITAAYIRVRTPGLIYLVAGGFNVILALTL
SLVFNMGIYGIALATTITTLITDGLFGPIYAAHILKAPLITFVKPAFPGYVALLILLVLGFLFMQVVSISGIVPTFLAGG
SIATVYCVILWCAVLNKGERKNILRIFPPSLDRKLLWNNKRE

Sequences:

>Translated_522_residues
MSEKTLDIQFQKQLPKNLLSNLAYLTINLVIGLALVPFFLETLGESAYGLIPLATSFTSFITLFIDVVNEAISRYLTIDL
QRGDRKKAVITFNTSLIGTLVILLIVTPIGLIFALLSPTIFNIGDTVATDVIWLFALVIISVLIRAWSSNFSVILFAYNR
IDLKNHVNNTNLIAQIISVVLLFTLLEPTLPFVGLSYLIAACMALFLSIVFSRKICPFLNISITAFSLFHLKEILSTAFW
LAILRMGVVLRNQAALIITNIVLGSIVATEFSLVLTWNTLIVGLLGLITTCFSPMIFSYRAKDNKESMVTFTAFSVKIVT
LLTALLVGLVCVFSSQLMTIWVGQNYADLSLLVWITVIASIFMVQFSCCGSITAAYIRVRTPGLIYLVAGGFNVILALTL
SLVFNMGIYGIALATTITTLITDGLFGPIYAAHILKAPLITFVKPAFPGYVALLILLVLGFLFMQVVSISGIVPTFLAGG
SIATVYCVILWCAVLNKGERKNILRIFPPSLDRKLLWNNKRE
>Mature_521_residues
SEKTLDIQFQKQLPKNLLSNLAYLTINLVIGLALVPFFLETLGESAYGLIPLATSFTSFITLFIDVVNEAISRYLTIDLQ
RGDRKKAVITFNTSLIGTLVILLIVTPIGLIFALLSPTIFNIGDTVATDVIWLFALVIISVLIRAWSSNFSVILFAYNRI
DLKNHVNNTNLIAQIISVVLLFTLLEPTLPFVGLSYLIAACMALFLSIVFSRKICPFLNISITAFSLFHLKEILSTAFWL
AILRMGVVLRNQAALIITNIVLGSIVATEFSLVLTWNTLIVGLLGLITTCFSPMIFSYRAKDNKESMVTFTAFSVKIVTL
LTALLVGLVCVFSSQLMTIWVGQNYADLSLLVWITVIASIFMVQFSCCGSITAAYIRVRTPGLIYLVAGGFNVILALTLS
LVFNMGIYGIALATTITTLITDGLFGPIYAAHILKAPLITFVKPAFPGYVALLILLVLGFLFMQVVSISGIVPTFLAGGS
IATVYCVILWCAVLNKGERKNILRIFPPSLDRKLLWNNKRE

Specific function: May be involved in the production of the exopolysaccharide (EPS) component of the extracellular matrix during biofilm formation. EPS is responsible for the adhesion of chains of cells into bundles [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57372; Mature: 57241

Theoretical pI: Translated: 9.43; Mature: 9.43

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSEKTLDIQFQKQLPKNLLSNLAYLTINLVIGLALVPFFLETLGESAYGLIPLATSFTSF
CCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
ITLFIDVVNEAISRYLTIDLQRGDRKKAVITFNTSLIGTLVILLIVTPIGLIFALLSPTI
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
FNIGDTVATDVIWLFALVIISVLIRAWSSNFSVILFAYNRIDLKNHVNNTNLIAQIISVV
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEEHHHCCCCHHHHHHHHHHH
LLFTLLEPTLPFVGLSYLIAACMALFLSIVFSRKICPFLNISITAFSLFHLKEILSTAFW
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAILRMGVVLRNQAALIITNIVLGSIVATEFSLVLTWNTLIVGLLGLITTCFSPMIFSYR
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKDNKESMVTFTAFSVKIVTLLTALLVGLVCVFSSQLMTIWVGQNYADLSLLVWITVIAS
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
IFMVQFSCCGSITAAYIRVRTPGLIYLVAGGFNVILALTLSLVFNMGIYGIALATTITTL
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITDGLFGPIYAAHILKAPLITFVKPAFPGYVALLILLVLGFLFMQVVSISGIVPTFLAGG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
SIATVYCVILWCAVLNKGERKNILRIFPPSLDRKLLWNNKRE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SEKTLDIQFQKQLPKNLLSNLAYLTINLVIGLALVPFFLETLGESAYGLIPLATSFTSF
CCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
ITLFIDVVNEAISRYLTIDLQRGDRKKAVITFNTSLIGTLVILLIVTPIGLIFALLSPTI
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
FNIGDTVATDVIWLFALVIISVLIRAWSSNFSVILFAYNRIDLKNHVNNTNLIAQIISVV
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCEEHHHCCCCHHHHHHHHHHH
LLFTLLEPTLPFVGLSYLIAACMALFLSIVFSRKICPFLNISITAFSLFHLKEILSTAFW
HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAILRMGVVLRNQAALIITNIVLGSIVATEFSLVLTWNTLIVGLLGLITTCFSPMIFSYR
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKDNKESMVTFTAFSVKIVTLLTALLVGLVCVFSSQLMTIWVGQNYADLSLLVWITVIAS
CCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
IFMVQFSCCGSITAAYIRVRTPGLIYLVAGGFNVILALTLSLVFNMGIYGIALATTITTL
HHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ITDGLFGPIYAAHILKAPLITFVKPAFPGYVALLILLVLGFLFMQVVSISGIVPTFLAGG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCC
SIATVYCVILWCAVLNKGERKNILRIFPPSLDRKLLWNNKRE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969506; 9384377 [H]