Definition Prochlorococcus marinus str. NATL1A, complete genome.
Accession NC_008819
Length 1,864,731

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The map label for this gene is yfbI [C]

Identifier: 124026357

GI number: 124026357

Start: 1343984

End: 1345822

Strand: Reverse

Name: yfbI [C]

Synonym: NATL1_16511

Alternate gene names: 124026357

Gene position: 1345822-1343984 (Counterclockwise)

Preceding gene: 124026358

Following gene: 124026354

Centisome position: 72.17

GC content: 33.22

Gene sequence:

>1839_bases
TTGAAAAGCTTCACTAAACCTTTTTATCCAACTTCAATACAAAGAAGACGTGGTCTTCTTTGTATTTTATTTATTGGATT
AATAATTTTTGTTTGGCAATTAGGGACAACAGGTTTAGTTGATGAAACACCACCTTTGTTTGCTGCAGCCAGTCGAGCAA
TGGCTGAAACGGGTAATTGGTTTACTCCTCAAGTAAATGGATTACCTCGATTTGACAAGCCTCCTTTGGTTTATTGGTTG
ATGGGACTGGGATTTTCAATCCCAGGGAATATTTCTTGGGACCCTTTAGGGACATGGGCTGCAAGGCTTCCTTCTGCATT
ATCAACAATTTTTTTAATGCTCGTTTTAGGGGACACAATGATGAAATATCCCCAAGAAGAAAATAATTTCAATAGAAGAA
CCGCAGTTATTACTGCGCTGGTATTTGCGTTGTCGCCTTTGGTAATAATTTGGGGAAGAATTGCTGTAAGTGATGCACTC
CTTTGCAGCACTTTAGGAATTTGCTTACTTCTTAAATGGAGAAGATTCGCTAATCCAGAGGGAGAAGCTTGGTGGTTGTC
TTGGATTTTTTTGTCATTTGCAGTTTTAACTAAAGGTCCTGTCGCTTTGGTTTTATCAGCATTAACAATTTTATTTTTTT
CCTTATTTCAAAATAATTTGCTCGGAATTTTAAAAATATTGAAAGTAATTCCAGGACTTTTTCTTGTTTTTATTATTAGT
TTTCCTTGGTATTTAATTGAATTATTAATAGAGGGAAAACCCTTCTTAGATAGTTTTTTTGGGTATCATAATCTTCAAAG
ATTCACCTCAGTAGTAAATTCTCATGGGGAGCCTTGGTGGTTTTTTTTAATAGTATTATGTATTGCTTCTTTACCACTTA
CTCCATTTTTATTAATAAGTATTTGGAAGAATTTTTACAATGTATCTAAATGGTCTAGAAGAGTTATTAAAAAACCAGAA
AAGTCATTATTTGAGTTTTCATTTTTTTGGTTAATAGCTGTATTTGTTTTCTTTACTATTTCAGCTACCAAGCTACCGAG
CTATTGGCTTCCTGCTACACCTGCAGCATCAGTTTTAATATCACTTTCCTTAACCAATAATGTTAAAGAGGAATTCTTAA
AATCTTTGGCTTGGAAATTTACAATATTTTTATCAATACTCTTTTCCATATTTCTCTTCTCTTCAAAGCTATGGATTCAG
CTTCTTAACGATCCTGAGATTCCAAACTTCTCAGAAGAATTAACCAATAGCTTTTTAATTGAAAAGTCTGGTTTTATTTT
TCTTTTACTTGCTGTTCTAGGAATAATATTTTCCTCTAGAAAAATATATGGAAAACTATTGATTTTGCAAATCCCTATAG
CTTTATCTCATTTCCTGATTGTGTTACCAACTTTTGATTTGGCAGATAGATTAAGACAACTCCCCTTAAGAGAAGCCTCA
GAATTACTTTTAAATTCCCAAAATAGAAACGAGCCTTTAGTAATGGTAGGAGCTATGAAACCCTCAATTCATTTTTATAC
TAATCAAGTCATTGTTTTTGAAGGTAGATCTAAAAATGCTTTTGTAAATGTTTCAGATCGACTTAAAAACGAGAAGAGAA
GAGGCTGGAAAGGAAGGCCAATATATGGATCCAATGGCTCAGAAACTACACTTTTACTTATTGATAAAAGATCAGTGGAA
AAATCTTATTGGCAAGGACTTAATCCAGAAGTCTTAGGTAATTTTGGTGTTTATAGCGTTTGGAGACTTGATAGAGAAAT
TATTGAAAGACGAGCTAAATTGTTGAAAATAGATGGTGTCACTTCTACTTGGAAAAATCCTAGACCAGAGAGATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTTGAAAAAAAAGCCACTAGCAAAGTCTTTGCAGAAAGAGTGGAGAATTGGCTTTATAAAGGCTTAAATAAGAAAATCT
CAGCAGACTTTAAAGATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAACGTCAAATACCTATTGAATCGAATTTATTAAATCTTGTTTGCTACATCTTTCAGGGATAATAACAATGCCTAGAT
CATCCTGAAGACTCTCTAAA

Product: glycosyltransferase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 612; Mature: 612

Protein sequence:

>612_residues
MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNWFTPQVNGLPRFDKPPLVYWL
MGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTMMKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDAL
LCSTLGICLLLKWRRFANPEGEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS
FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLISIWKNFYNVSKWSRRVIKKPE
KSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLISLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQ
LLNDPEIPNFSEELTNSFLIEKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS
ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRPIYGSNGSETTLLLIDKRSVE
KSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGVTSTWKNPRPERF

Sequences:

>Translated_612_residues
MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNWFTPQVNGLPRFDKPPLVYWL
MGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTMMKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDAL
LCSTLGICLLLKWRRFANPEGEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS
FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLISIWKNFYNVSKWSRRVIKKPE
KSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLISLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQ
LLNDPEIPNFSEELTNSFLIEKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS
ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRPIYGSNGSETTLLLIDKRSVE
KSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGVTSTWKNPRPERF
>Mature_612_residues
MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNWFTPQVNGLPRFDKPPLVYWL
MGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTMMKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDAL
LCSTLGICLLLKWRRFANPEGEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS
FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLISIWKNFYNVSKWSRRVIKKPE
KSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLISLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQ
LLNDPEIPNFSEELTNSFLIEKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS
ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRPIYGSNGSETTLLLIDKRSVE
KSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGVTSTWKNPRPERF

Specific function: Unknown

COG id: COG1807

COG function: function code M; 4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase and related glycosyltransferases of PMT family

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the glycosyltransferase 83 family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788591, Length=343, Percent_Identity=27.1137026239067, Blast_Score=67, Evalue=3e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003342 [H]

Pfam domain/function: PF02366 PMT [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 70089; Mature: 70089

Theoretical pI: Translated: 10.39; Mature: 10.39

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNW
CCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
FTPQVNGLPRFDKPPLVYWLMGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTM
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDALLCSTLGICLLLKWRRFANPE
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLIS
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IWKNFYNVSKWSRRVIKKPEKSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHEE
SLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQLLNDPEIPNFSEELTNSFLI
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
EKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHH
ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRP
HHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCC
IYGSNGSETTLLLIDKRSVEKSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGV
CCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
TSTWKNPRPERF
CCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKSFTKPFYPTSIQRRRGLLCILFIGLIIFVWQLGTTGLVDETPPLFAAASRAMAETGNW
CCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCC
FTPQVNGLPRFDKPPLVYWLMGLGFSIPGNISWDPLGTWAARLPSALSTIFLMLVLGDTM
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MKYPQEENNFNRRTAVITALVFALSPLVIIWGRIAVSDALLCSTLGICLLLKWRRFANPE
HHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
GEAWWLSWIFLSFAVLTKGPVALVLSALTILFFSLFQNNLLGILKILKVIPGLFLVFIIS
CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FPWYLIELLIEGKPFLDSFFGYHNLQRFTSVVNSHGEPWWFFLIVLCIASLPLTPFLLIS
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IWKNFYNVSKWSRRVIKKPEKSLFEFSFFWLIAVFVFFTISATKLPSYWLPATPAASVLI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHEE
SLSLTNNVKEEFLKSLAWKFTIFLSILFSIFLFSSKLWIQLLNDPEIPNFSEELTNSFLI
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHC
EKSGFIFLLLAVLGIIFSSRKIYGKLLILQIPIALSHFLIVLPTFDLADRLRQLPLREAS
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHH
ELLLNSQNRNEPLVMVGAMKPSIHFYTNQVIVFEGRSKNAFVNVSDRLKNEKRRGWKGRP
HHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCEEEEECEEEEEECCCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCC
IYGSNGSETTLLLIDKRSVEKSYWQGLNPEVLGNFGVYSVWRLDREIIERRAKLLKIDGV
CCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCC
TSTWKNPRPERF
CCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9537320 [H]