Definition Prochlorococcus marinus str. NATL1A, complete genome.
Accession NC_008819
Length 1,864,731

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 124025575

Identifier: 124025575

GI number: 124025575

Start: 803010

End: 804476

Strand: Reverse

Name: 124025575

Synonym: NATL1_08681

Alternate gene names: NA

Gene position: 804476-803010 (Counterclockwise)

Preceding gene: 124025576

Following gene: 124025573

Centisome position: 43.14

GC content: 24.2

Gene sequence:

>1467_bases
ATGAAACCAAAATATAGTATAAGCAACATAATCAAATATTCATCTGGCGAAATAATAAGCAGAATACCTTTGACTCTTTT
AGAAATGTCATTAGTCGCTATACTTTCTCCTTCCTTATATGGGGCTTGGAGTTTAATACAATCACTAGTAAGTTATGGAA
ATTTTTCTCACTTTGGTATTGCATCATCTCTTACAAGAAAAGAGCCAGGATTAATTTCAAAAAATTTATTTGCTCAGATA
AAAAAGTACAGATCAAATGCTTATGCTTCACAAATAATAATTATTATATTTATTTCATTAATACTAATATTATGGAATAA
GATATTTAAAAATTCATTTGAATTAATAGGAGGGTACCCATCTATAATATTTTTATTGATTACTATTTATCTTCAACAAC
TTTTAATCGTTGGTTATTCATCATCAATTAATGAATTAAAAATAAAATTAGTATCATTTTTAAGAATATTTTACTCATTA
ATATTTCTATTCTTAGGACTATTAGCAGCAATTTATCATAAAAGCATTTATTCATTACTTATATCATGGTCAATTTCACT
TCTAGTTACGTTTATTATCTTAATAAGAAACGTTCCTTCACTTCGTATAAAACCAGAATTTGATAGACACATTACAAAGC
TTTTATTATTTGATGGTTTTCCAATTTTATTTCAAGGATTGCAAAGATTTGCTATCGTAAATATAGATAGATTATTTCTA
ATAAAAGTAAGCACACTAGAGAACTTAGGATATTACTCAATTGGACTTTTGGCATCAAACTTAGTTTCTCTTCCAGGTAC
AATCATCACAAAAGTTACACTTCCAATAATACTTAGACGAATATCATCATTAGGTTTTTATACCGATGAAAATAAAAAAG
TAGTAAAAGTAAGTATAATGTTAATTCATAAATCATGTATTTTCTTAGGTCTTATTCTTACAGTATTTCTACCAATTATT
ATTAGAAATTTATTCCCTGCCTATTTACCATCTTTAGATTTATGCACAATTTTAATTATTGTTGGAGTTGAAATTGGAAT
TGCACAAAGTTGTATAGATTTTACGCTTGCTGTTGGAAAAAAAAAGAAGATATTAATAATTACAAGCTTATTTATACCAA
TAATTTTAATATCCCACTCATTATTTTGGATAAATTATAAATCAATAACTTTTCTTGCAATATCGTTATTTATTTGCATA
ACAGTCTACACATCCATAATAATTAATATATGCTTAAATTATTTTAAGATAAATAGAGCAGAATCTAAAAGAATTAATCT
TATAATTATTAGTGATATCCTAAAATATCTTATACTTGGCTTATCGTATAATTTTGCACTTAATACATCATTAGATAATA
AATATTATATAATTTTAATAATAATACTCATATCGACTAGTCTAATTATTACTGAAATAAATTCTATAATTAAAGTATCA
AAAGAGTATCAAAAATTGAATAATTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAAGAAAAATCGGAATAGATATATAAATAAACAGTTTAAAGGTAATAATAGTATCGATAAAACAATGAATCTTTTAGAA
AATATATAATTCAGATAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTACAATTAATTTTAAAAATTTTTATTTAATCAGATATATAAATTATAAAAATATCTATTTCTTAACTAATTTTTCAGCA
ACTGTAATTCAATTGTCTTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGIASSLTRKEPGLISKNLFAQI
KKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYPSIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSL
IFLFLGLLAAIYHKSIYSLLISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL
IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIMLIHKSCIFLGLILTVFLPII
IRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGKKKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICI
TVYTSIIINICLNYFKINRAESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS
KEYQKLNN

Sequences:

>Translated_488_residues
MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGIASSLTRKEPGLISKNLFAQI
KKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYPSIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSL
IFLFLGLLAAIYHKSIYSLLISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL
IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIMLIHKSCIFLGLILTVFLPII
IRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGKKKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICI
TVYTSIIINICLNYFKINRAESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS
KEYQKLNN
>Mature_488_residues
MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGIASSLTRKEPGLISKNLFAQI
KKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYPSIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSL
IFLFLGLLAAIYHKSIYSLLISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL
IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIMLIHKSCIFLGLILTVFLPII
IRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGKKKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICI
TVYTSIIINICLNYFKINRAESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS
KEYQKLNN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55329; Mature: 55329

Theoretical pI: Translated: 10.21; Mature: 10.21

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
0.6 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
0.6 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGI
CCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
ASSLTRKEPGLISKNLFAQIKKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYP
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCH
SIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSLIFLFLGLLAAIYHKSIYSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIM
EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEEEEHH
LIHKSCIFLGLILTVFLPIIIRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICITVYTSIIINICLNYFKINRA
CCEEEEHHHHHHHHHHHHCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS
CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEYQKLNN
HHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKPKYSISNIIKYSSGEIISRIPLTLLEMSLVAILSPSLYGAWSLIQSLVSYGNFSHFGI
CCCCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
ASSLTRKEPGLISKNLFAQIKKYRSNAYASQIIIIIFISLILILWNKIFKNSFELIGGYP
HHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCH
SIIFLLITIYLQQLLIVGYSSSINELKIKLVSFLRIFYSLIFLFLGLLAAIYHKSIYSLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISWSISLLVTFIILIRNVPSLRIKPEFDRHITKLLLFDGFPILFQGLQRFAIVNIDRLFL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
IKVSTLENLGYYSIGLLASNLVSLPGTIITKVTLPIILRRISSLGFYTDENKKVVKVSIM
EEEHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCEEEEEEHH
LIHKSCIFLGLILTVFLPIIIRNLFPAYLPSLDLCTILIIVGVEIGIAQSCIDFTLAVGK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KKKILIITSLFIPIILISHSLFWINYKSITFLAISLFICITVYTSIIINICLNYFKINRA
CCEEEEHHHHHHHHHHHHCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ESKRINLIIISDILKYLILGLSYNFALNTSLDNKYYIILIIILISTSLIITEINSIIKVS
CCCEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEYQKLNN
HHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA