Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9303, complete genome.
Accession NC_008820
Length 2,682,675

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The map label for this gene is 124023165

Identifier: 124023165

GI number: 124023165

Start: 1255510

End: 1258362

Strand: Direct

Name: 124023165

Synonym: P9303_14611

Alternate gene names: NA

Gene position: 1255510-1258362 (Clockwise)

Preceding gene: 124023163

Following gene: 124023167

Centisome position: 46.8

GC content: 46.34

Gene sequence:

>2853_bases
ATGGGCTTGGCTGGTTTCGCCCGACCCTTGCAATGGTTCAAGAGCCAGTGGCTTTGGCTCTTGCTCTCTATCGCAGCTTT
CTGGTTGTTGATGCGGGTTCAAGTCGAATGGTTGTGGTTCGGTCAATTTGATTGGCAAGGGATGCTTCTCCGCCGTTGGC
TCTGGCAACTGGGAGGACTTCTACTCGCCCTTCTGGTTGTAGCGACTTGTCAGCTTTGGCAGCGCAACTGGATCAAACTC
GAAGGTGCAAGCAACTTGGCAGAGCCAGCGCTTCCCCTGCATGGATGGCGTTATGGATTGGGGCTACTTGGCTGCTTCGT
GGTGGTGGTCGGTGATCTTGTATTACTCACTCGATTGGCGTGGTTAGCTTGTTTTAAGCCATTTGCCCTTGGGCATTGGT
GGAGTGAACCTTTTGAAGACATTTGGGCGTTGGTGATTCCGCTGTCCTGTGTATTCATCTCAATTTGCGTGATGCTTGGC
AATGCCCGAGGGGGAAGGATTGCTCATTTGATGGGTTGTTTTTGCTTCAGTATCTCCATCGCTAGAGGCTGGGGATTATG
GTCACTCGCCCTTGCTATCCCTCCTACAGGTATTAAAGAACCACTACTGGGCGCTGATGTGAGTTTTGGGCTCGGTCAAT
TTCCAGCACTTGCCTTTGCCTTGGTTGTTCTATTGGCCCAACTCGTCTTAACAACGAGTACGACAATATGGATGAAGTTA
GCCCAGCCTGAATCTCTTTCAGATTGGGTTTTCAAAGGTTTATCGCCTAGACAGTGTGATGTTATGAGGCCATTAATTGG
CATCATACTTTTAACACTTTCAGCACTTTTATGGTTGTCACGTCATGAACTTCTGTGGACGCAGAACGGTACGGTAGCCG
GAGCTGGTTGGTTGGATGCTCACCTGATACTTCCTCTACGAAGTTTGGCGAGCTTGGCCATTTTGGTTCTCGCATTTCTG
GTGATTCCATTTCCATGGATACAACAAAGGCGTTTATGGAGATTAATCGCTTCAATTATTGGCGTAGGCGCAATTCTTCT
CGAAGTGCTTTTGGCTCCTTTTGTCCAGTGGATGGTCGTAAAACCTAGAGAACTGAAACTAGAAACCCCTTACATCATTC
GAGCAATTAAAGCCACAAGGAAAGCATTTCAGCTTGACTCGATTACGACTACACTTATTAATCCTCAACCTCAGTTAACT
CAACTTGATCTTGAACAAGGTGCAAGCACCCTAAGGAATATTCGTCTATGGGACAGCCAGCCTCTCTTGGCAACCAATCG
TCAATTACAGCAATTGAGGGTTTACTATCGCTTTTCAAATGCGGCGGTAGATCGTTATCGCTTTGTGCCTGACAAGGCGA
ACCGGCAACAGGTGATGATCACAGCACGCGAACTTGATCAGGCTGCACTTCCAAAACGTTCACGTACTTGGTTGAATCGT
CATTTTGTTTTCACGCATGGATATGGCTTTACTCTCAGTCCAGTCAATACAAGAGCACCCGATGGCCTCCCTGACTATTT
TATCAGTGATCTAGGAACCTCAACACGTCTTGAAGGTAGTTCTGAGCTCGGCATTACTCGTGAAGATGTCAAAGAGGCAG
TGCCTATTGGGCGAGCAGCTCTCTATTTTGGAATGCTTCCCTCTCCTTATGCTCTTGCTCCGAGCAAACTAAAAGAACTA
GATTATCCAGTAGGCGATAAGAATATCTACAACCACTATTTAGGATCAGGAGGTGTGCCGGTGGGTCATCCCTGGCAACA
ATTAGCAGCAGCTATGTACCTTTTTGAACCCCGCCTTCTTAATACAGGGTCGCTAACGATTAATTCCAAACTTCTTATTA
GGCGAGAAGTGAGACAAAGAGTGAGTGCAATAGCGCCATTCCTTGAAGTTATTGGTGATCCATATTTGGTCTCTACATCT
GTTAATTCTAGAGATCATGATTATCAAGCTAAGCAAAACCAATATTGGATTGTTGAAGCTTATACAAGCTCACGCACATA
TCCCTACGCAGCAAACCTGCCAGATGGTCGCCCTGTGCGATATTTACGTAACTCAGTCAAAGCTATTGTTGATGCATACA
GTGGTCGTGTTCACTTGTATGTGAGCGAACCGCGGGATCCGATAATATTGGGTTGGCAGCGATTGTTTCCAGATCTTTTC
AAACCTCTTGAGGAGATGCCTTCAAGCTTACGAGAGCATCTTAAGGTTCCTACAGATTTGTTTAATGTACAGGTACAGCA
ATTGCTTAGATACCACGTTACTGATCCTCGTATATTTTATAGCGGTGATGATGTTTGGCAGGTTCCAAAGGAACTCTATG
GTAAGCGGCAGGTTCCTGTTGATCCCTATCACATCACTGCACAATTAGGTAGTCAAGAAAGTTCAGAATTTCTCTTATTA
CAACCACTAACACCACTAGCTCGCCCCAATCTTTCTGCGTGGCTCGCTGCTCGAAGTGATGGTGATCATTATGGAAAATT
AGTGTTGCTACGTTTCCCAAGTCAAACGCCAATCTTTGGCCCTGAACAGATTCAGGCCCTTATCAATCAGGACCCGCAGA
TCAGCCAACAGTTTGGTCTTTGGGATCGTGCTGGGTCTGAAGTTGTGCAAGGGAACCTTCTTGTTGTACCCCTAGGCAAG
GCCCTTCTTTATGTAGAACCTGTTTACCTAAGGGCACGTCAAGGTGGTCTACCAACCCTTACCAGGGTAGTTGTTAGTGA
TGGCAAAAGGATTGCCATGGCTGAGGATCTCGGAGAAGGCCTAAGGGCCTTGGTTGACGGATCAAGCAAAAAAGCAGTGT
ATTTAAATAGAAATGATCTGCCACCGATTAAGGCAGCAGATCAATCAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCATACTGATCGGTTTCTGCAATTGGCTGGATTGACTGTTGATCAGTCACAGCCAGTGGGCGTGTAACTAGAACGACTT
AGCCTGTGTTGATTGAGTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGATGTATTGATAGATTAATGATTAATTTATTGAGGCGAAGAACTCCTTACTTCCAACTGGGTCTGGTTTCATTGTTTTC
TCTCCTGGTGTCCAATTAGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 950; Mature: 949

Protein sequence:

>950_residues
MGLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGLLLALLVVATCQLWQRNWIKL
EGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLAWLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLG
NARGGRIAHLMGCFCFSISIARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL
AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDAHLILPLRSLASLAILVLAFL
VIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVVKPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLT
QLDLEQGASTLRNIRLWDSQPLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNR
HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAALYFGMLPSPYALAPSKLKEL
DYPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLLNTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTS
VNSRDHDYQAKQNQYWIVEAYTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF
KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPVDPYHITAQLGSQESSEFLLL
QPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFGPEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGK
ALLYVEPVYLRARQGGLPTLTRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN

Sequences:

>Translated_950_residues
MGLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGLLLALLVVATCQLWQRNWIKL
EGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLAWLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLG
NARGGRIAHLMGCFCFSISIARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL
AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDAHLILPLRSLASLAILVLAFL
VIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVVKPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLT
QLDLEQGASTLRNIRLWDSQPLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNR
HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAALYFGMLPSPYALAPSKLKEL
DYPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLLNTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTS
VNSRDHDYQAKQNQYWIVEAYTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF
KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPVDPYHITAQLGSQESSEFLLL
QPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFGPEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGK
ALLYVEPVYLRARQGGLPTLTRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN
>Mature_949_residues
GLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGLLLALLVVATCQLWQRNWIKLE
GASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLAWLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLGN
ARGGRIAHLMGCFCFSISIARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKLA
QPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDAHLILPLRSLASLAILVLAFLV
IPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVVKPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLTQ
LDLEQGASTLRNIRLWDSQPLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNRH
FVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAALYFGMLPSPYALAPSKLKELD
YPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLLNTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTSV
NSRDHDYQAKQNQYWIVEAYTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLFK
PLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPVDPYHITAQLGSQESSEFLLLQ
PLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFGPEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGKA
LLYVEPVYLRARQGGLPTLTRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN

Specific function: Unknown

COG id: COG1615

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0182 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005372 [H]

Pfam domain/function: PF03699 UPF0182 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 107055; Mature: 106924

Theoretical pI: Translated: 9.64; Mature: 9.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLALLVVATCQLWQRNWIKLEGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLA
HHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLGNARGGRIAHLMGCFCFSISI
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
ARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL
HCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE
AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDA
CCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEECCHHHH
HLILPLRSLASLAILVLAFLVIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLTQLDLEQGASTLRNIRLWDSQ
CCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCC
PLLATNRQLQQLRVYYRFSNAAVDRYRFVPDKANRQQVMITARELDQAALPKRSRTWLNR
CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHC
HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAA
EEEEEECCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHH
LYFGMLPSPYALAPSKLKELDYPVGDKNIYNHYLGSGGVPVGHPWQQLAAAMYLFEPRLL
HHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEE
NTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTSVNSRDHDYQAKQNQYWIVEA
CCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE
YTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF
ECCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEECHHHHHHHHH
KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPV
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
DPYHITAQLGSQESSEFLLLQPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFG
CCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC
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HHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHCCCHHHCCCEEEEECCCEEEEECHHHEEECCCCCHHH
TRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN
HHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GLAGFARPLQWFKSQWLWLLLSIAAFWLLMRVQVEWLWFGQFDWQGMLLRRWLWQLGGL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLALLVVATCQLWQRNWIKLEGASNLAEPALPLHGWRYGLGLLGCFVVVVGDLVLLTRLA
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WLACFKPFALGHWWSEPFEDIWALVIPLSCVFISICVMLGNARGGRIAHLMGCFCFSISI
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ARGWGLWSLALAIPPTGIKEPLLGADVSFGLGQFPALAFALVVLLAQLVLTTSTTIWMKL
HCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE
AQPESLSDWVFKGLSPRQCDVMRPLIGIILLTLSALLWLSRHELLWTQNGTVAGAGWLDA
CCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEECCHHHH
HLILPLRSLASLAILVLAFLVIPFPWIQQRRLWRLIASIIGVGAILLEVLLAPFVQWMVV
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KPRELKLETPYIIRAIKATRKAFQLDSITTTLINPQPQLTQLDLEQGASTLRNIRLWDSQ
CCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCEEECCCC
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CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHC
HFVFTHGYGFTLSPVNTRAPDGLPDYFISDLGTSTRLEGSSELGITREDVKEAVPIGRAA
EEEEEECCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHH
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HHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEE
NTGSLTINSKLLIRREVRQRVSAIAPFLEVIGDPYLVSTSVNSRDHDYQAKQNQYWIVEA
CCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEE
YTSSRTYPYAANLPDGRPVRYLRNSVKAIVDAYSGRVHLYVSEPRDPIILGWQRLFPDLF
ECCCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEECHHHHHHHHH
KPLEEMPSSLREHLKVPTDLFNVQVQQLLRYHVTDPRIFYSGDDVWQVPKELYGKRQVPV
HHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
DPYHITAQLGSQESSEFLLLQPLTPLARPNLSAWLAARSDGDHYGKLVLLRFPSQTPIFG
CCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCC
PEQIQALINQDPQISQQFGLWDRAGSEVVQGNLLVVPLGKALLYVEPVYLRARQGGLPTL
HHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHCCCHHHCCCEEEEECCCEEEEECHHHEEECCCCCHHH
TRVVVSDGKRIAMAEDLGEGLRALVDGSSKKAVYLNRNDLPPIKAADQSN
HHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12917642 [H]