| Definition | Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008816 |
| Length | 1,669,886 |
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The map label for this gene is 123968922
Identifier: 123968922
GI number: 123968922
Start: 1156152
End: 1157402
Strand: Direct
Name: 123968922
Synonym: A9601_13891
Alternate gene names: NA
Gene position: 1156152-1157402 (Clockwise)
Preceding gene: 123968920
Following gene: 123968928
Centisome position: 69.24
GC content: 28.06
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases CAATAATTTGAATTCCCAATTGACCAATAATTAATATCTAAATCCTTTAATTCTTCATAATTAGTAATTGATCTAGTATC AAATAACCAAGCAGGCTTTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 416; Mature: 416
Protein sequence:
>416_residues MKIEKPLFKFFYIGIFLLPSAPSIGSIFLFLCLICSLINNFLELIKDRWNITFFISIFLFPIICLIQSSRFFYKFNNFDK SLTWIGLNNWIPLILCFIAFQKFVNSKSDREIIGKLLIAGSFPLIISGIGQYWFNWYGPFEFLNGFIIWFQRPMQTETGL TSLFSNQNYAGSWFCIVWPFCLSFFIQSFRNNLHRFISLGFLISISTCLILTTSRNAWGGLLLLITLLRGASLFWPIFIG ITITIISVFLLNILIPLDIQTTISNLFPSWINQEFTSTHFQFRESRPEIWWEAIKLIFKNPLLGLGAGAFPIIYQSLKNA YAGHTHNLVFELALSYGIPITLIVFVPIFLICFFSFKEIYIKKTNNIDINERAWFASFFTLLCTQQVDVQYFDLRISIIF WVLLAGLKTRISPQII
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG3307
COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
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Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 48357; Mature: 48357
Theoretical pI: Translated: 9.23; Mature: 9.23
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
2.2 %Cys (Translated Protein) 0.5 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 2.2 %Cys (Mature Protein) 0.5 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKIEKPLFKFFYIGIFLLPSAPSIGSIFLFLCLICSLINNFLELIKDRWNITFFISIFLF CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH PIICLIQSSRFFYKFNNFDKSLTWIGLNNWIPLILCFIAFQKFVNSKSDREIIGKLLIAG HHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHC SFPLIISGIGQYWFNWYGPFEFLNGFIIWFQRPMQTETGLTSLFSNQNYAGSWFCIVWPF CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH CLSFFIQSFRNNLHRFISLGFLISISTCLILTTSRNAWGGLLLLITLLRGASLFWPIFIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH ITITIISVFLLNILIPLDIQTTISNLFPSWINQEFTSTHFQFRESRPEIWWEAIKLIFKN HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHC PLLGLGAGAFPIIYQSLKNAYAGHTHNLVFELALSYGIPITLIVFVPIFLICFFSFKEIY CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE IKKTNNIDINERAWFASFFTLLCTQQVDVQYFDLRISIIFWVLLAGLKTRISPQII EEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKIEKPLFKFFYIGIFLLPSAPSIGSIFLFLCLICSLINNFLELIKDRWNITFFISIFLF CCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH PIICLIQSSRFFYKFNNFDKSLTWIGLNNWIPLILCFIAFQKFVNSKSDREIIGKLLIAG HHHHHHHCCCCEEEECCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHC SFPLIISGIGQYWFNWYGPFEFLNGFIIWFQRPMQTETGLTSLFSNQNYAGSWFCIVWPF CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH CLSFFIQSFRNNLHRFISLGFLISISTCLILTTSRNAWGGLLLLITLLRGASLFWPIFIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH ITITIISVFLLNILIPLDIQTTISNLFPSWINQEFTSTHFQFRESRPEIWWEAIKLIFKN HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHC PLLGLGAGAFPIIYQSLKNAYAGHTHNLVFELALSYGIPITLIVFVPIFLICFFSFKEIY CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE IKKTNNIDINERAWFASFFTLLCTQQVDVQYFDLRISIIFWVLLAGLKTRISPQII EEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA