| Definition | Prochlorococcus marinus str. AS9601, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008816 |
| Length | 1,669,886 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 123968219
Identifier: 123968219
GI number: 123968219
Start: 607725
End: 609113
Strand: Direct
Name: 123968219
Synonym: A9601_06841
Alternate gene names: NA
Gene position: 607725-609113 (Clockwise)
Preceding gene: 123968218
Following gene: 123968220
Centisome position: 36.39
GC content: 30.17
Gene sequence:
>1389_bases ATGTTTTTGAAATCATTGAATATTTTTTCGATACAGAATAAAGATATTTTTTCAAATTCTCTATTGATAAGTTTTTTTGG ATTGTTAATTATATTTTTTTTGTTGATTTTTGGAAGGAAATTTAAACTAGCTGTTCAACTCGAGAGATTTGGATTGCCGA TAGCCGTCATATCAGGAATTTTAGGTATATCTATAGGCCCATTTGGTGCGATACACTTTTTACCAAAAGAAACAATAAAT GTTTGGAGTAATTTTCCTACTCCTCTTTTATCATTAGTCTTCGCAACTTTAATGATGGGAAGACCTATACCGAATATAAA TGGTTTAGTTAAACCGATTTTTAATCAATTTCTATTAGCTCTTTCACTAGGTTTCGGACAATTTTTTGTCGGCGGCCTTG TTGTTAAATATTTTCTGCCTCCATCTATGGACGCAAATCCTCTAATGGGTTGTTTAATAGAGGTAGGTTTTGAGGGCGGT CATGGAGCCGCATCAATAATCGGTGAAAGTTTTAATAAACTAGGTTTCCCAAATGGTTTAGATCTTGGTTTGGCTATGGC AACAATGGGTCTTTTATCCTCTTCAATATTAGGTAGCATATTTATCTTTATTGGAAGAACTTTAGGCCTTTCAGATACTG AGGAAATTCTTGAACAAAAAGATATTTTAAATGGAAAAAATAAGATTAGAATTTTTGCAGATTTTAGAATTTTTATAATA AATCTTGGATTCTCTGGTTTGGCAATTTCTTTTGGTGTTTTGCTTCTTAAATTTTTAAGGTATATTTCAAGTTCTTTTGG TGATTTTTCGAAGGAAATTATTTTTTCACTACCAGTATTTCCTTTTATCCTTATAGGTTCGCTCCTTATTAGATATATTT TAGAAAAAACCAAAAATACAGAATTTATTTCAAATATTCTGCAAAGGGAGATTGGTATTTTATCAACAGACTTATTGATT TTTACAGCTATGGCGAGTTTAGATATTGCAGTTGTTTTTGATAATTGGATACTTATTTTAGTATTTACTATTTTCGGTTT ATTTTGGAATTTAATCTGCATTGCTTATTTCGCATACTTTATTTTTGATGATTATTGGTTTGAAAAAAGTTTGATAGAGT TTGGTAATTCTACTGGTGTAGTAGCTTCTGGGTTACTTCTTTTAAGGCTTGCAGATCCTAAAAATATTTCTAAGACTTTA CCAATTTTTACGTCAAAACAGCTATTTGCTCAATTAATTCTTTCTGGGGGACTATTCACAGTTCTTGCACCATTAATGAT TTCTAAAATTGGGTTAGATTATTGGACAGAAATTTGTGCCTTAATTACATTCGCAATTCTTTCTATCGCATTGATTTTTA ACAAAGTAGAGATGAAAAAGTTTCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGATTAATTTTCAAATTTTCTTACCAATATCAAAAGGCTCCTCTTATCGGAGCCTTTTTTATTTGAAAAATTTTGTTTAT TAATTTAAATTTAGAATTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GAACTCTAGAATGGTAAAAAGCATAAATTTTTTATTTTAATGTCATTTACACCCTACGATATTCCACCTCAAGAAAATAA AGGTAAGTGGTTTAGGAGTC
Product: sodium/solute symporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein
Number of amino acids: Translated: 462; Mature: 462
Protein sequence:
>462_residues MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISIGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNKLGFPNGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFIGRTLGLSDTEEILEQKDILNGKNKIRIFADFRIFII NLGFSGLAISFGVLLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILSIALIFNKVEMKKFQ
Sequences:
>Translated_462_residues MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISIGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNKLGFPNGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFIGRTLGLSDTEEILEQKDILNGKNKIRIFADFRIFII NLGFSGLAISFGVLLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILSIALIFNKVEMKKFQ >Mature_462_residues MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGILGISIGPFGAIHFLPKETIN VWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLALSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGG HGAASIIGESFNKLGFPNGLDLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFIGRTLGLSDTEEILEQKDILNGKNKIRIFADFRIFII NLGFSGLAISFGVLLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNTEFISNILQREIGILSTDLLI FTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTL PIFTSKQLFAQLILSGGLFTVLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILSIALIFNKVEMKKFQ
Specific function: Unknown
COG id: COG0786
COG function: function code E; Na+/glutamate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51278; Mature: 51278
Theoretical pI: Translated: 8.75; Mature: 8.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGI CCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCHHHHHHH LGISIGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLA HHCCCCCCHHHEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNKLGFPNGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFIGRTLGLSDTEEILEQKDILNGKNKIRIFADFRIFII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEE NLGFSGLAISFGVLLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNT ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH VLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILSIALIFNKVEMKKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MFLKSLNIFSIQNKDIFSNSLLISFFGLLIIFFLLIFGRKFKLAVQLERFGLPIAVISGI CCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHCCCHHHHHHH LGISIGPFGAIHFLPKETINVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLVKPIFNQFLLA HHCCCCCCHHHEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH LSLGFGQFFVGGLVVKYFLPPSMDANPLMGCLIEVGFEGGHGAASIIGESFNKLGFPNGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLGLAMATMGLLSSSILGSIFIFIGRTLGLSDTEEILEQKDILNGKNKIRIFADFRIFII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEE NLGFSGLAISFGVLLLKFLRYISSSFGDFSKEIIFSLPVFPFILIGSLLIRYILEKTKNT ECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH EFISNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIAVVFDNWILILVFTIFGLFWNLICIAYFAYF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGLFT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHH VLAPLMISKIGLDYWTEICALITFAILSIALIFNKVEMKKFQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA