| Definition | Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008817 |
| Length | 1,704,176 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 123966626
Identifier: 123966626
GI number: 123966626
Start: 1230494
End: 1231789
Strand: Reverse
Name: 123966626
Synonym: P9515_13931
Alternate gene names: NA
Gene position: 1231789-1230494 (Counterclockwise)
Preceding gene: 123966632
Following gene: 123966625
Centisome position: 72.28
GC content: 24.92
Gene sequence:
>1296_bases ATGATTATTTATAAAATACATAATTCAATTAAAGAATTATCTTCAATAAGCATAGGGTATTTATTTACTGCTTTAGGCGG ACTTTTAGGAGTAAGAATATTAACTGCATATTTGACACCTAGTCAATATGGTGAACTTTCTTTAGGAATAACAATGGGAG GTTTCATTTATAGTGTTTTTTTTGGTCCTTTAACAAATGGTATAACAAGGTTTTTCCCAGTAGCTAAGGATAAAAAAGAA TTAAGTTTTTATTTATTTAATGTATTAAACATAATTATTAAAGGTTTTAGTTTTATAGGTTTAATTTCACTTTCCATAAT TATTTTTATAGTTTTTTCTGGTAATGTAAATTCGATTTTTATTGTGTTAGCATCAATTTCTTTTGGATTTATATATAGCT TTAATAATATTATTAACGGGTTACAAAATGCTTCTAGGAAGAGAATTCTTGTATCAATGCATCAAGGTTTAATGACTTTT TTAAGGTTTTTTGTAGCTGTAATATTTATAAATATTTTTGGTCCTTCTAGTACAGTGGCAATTTCTGGCCAGTTAATTGG TTTACTTTTTACTTTAATTGTTCAATTATATTTTCTAGCTCCAACTTTGAGAGGTTATCTTATTAATGAAAGATACAAAA TAAGTAAAATAGATTGGCAATCAAAAATTAGTTCTTTTACATTACCTTTGATTTCTATAGGACTATTAAATTGGTTAAGA ATTGCAGTAGAGAAGTGGGGACTTGTATTTTTTACAAATTATGATGAAGCTGTAGGATTTTATTCAATAATTTATCAATT TGGATATATACCAATTTCTTTATTAGTAAATCTATTAGCAACTTATTTAAGACCTATCTACTTTGATAAAGCAGGAGATA ATCAAAAAAGGTTAAAATCAACTTATTTTCTTGGACTGAAAATTTTTGTAATTATATTTTTATTTTTATTATTTTTACTA TTTATTGTGTTTACTTATAGAGAAAAAATATTTCAAATAATTTTAGATGAAAAGTATAAAAGTGTTTCTTATTTAATAGT TCCAATGATGATGTCGGCACTTCTCAATGAAAGTACGAGTTTTGTAACCTTATTAATTCAAACAAAAAAAGAGACAAAAG CTTTGCTTTTGCCTAATTCATATATATATGCATCAGGTATAGTATTTGCTATCTTTGGAGCATACTTTTATGGCCTTTAT GGTGTAGTTATGGCCTCTCTTTTAAATTCTTCAATAAAATTTATCTTATTTTCATATTTATCTATAAACCATTATAAGAA GATAGAGTATAGATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTAAATTAAACTAAATATATAGTAGTATTAAGGAAAATCATCTGAAATTGACAATATTTTCAGATAAATTAGTTTTGAA TTTATAAATATGATTAAGAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTTTTTATTTTAAAAATTATTACTTAAAAATATTTCCTAATGAAGGCTTCTTTAGTTACTTATGATAATGCACTAAAT AATAGGATTTTTGACTCTAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 431; Mature: 431
Protein sequence:
>431_residues MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVFFGPLTNGITRFFPVAKDKKE LSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIFIVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTF LRFFVAVIFINIFGPSSTVAISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKSTYFLGLKIFVIIFLFLLFLL FIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTSFVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLY GVVMASLLNSSIKFILFSYLSINHYKKIEYR
Sequences:
>Translated_431_residues MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVFFGPLTNGITRFFPVAKDKKE LSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIFIVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTF LRFFVAVIFINIFGPSSTVAISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKSTYFLGLKIFVIIFLFLLFLL FIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTSFVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLY GVVMASLLNSSIKFILFSYLSINHYKKIEYR >Mature_431_residues MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVFFGPLTNGITRFFPVAKDKKE LSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIFIVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTF LRFFVAVIFINIFGPSSTVAISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKSTYFLGLKIFVIIFLFLLFLL FIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTSFVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLY GVVMASLLNSSIKFILFSYLSINHYKKIEYR
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 49085; Mature: 49085
Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVF CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHH FGPLTNGITRFFPVAKDKKELSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIF HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEH IVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTFLRFFVAVIFINIFGPSSTVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE ISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKS HHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHH TYFLGLKIFVIIFLFLLFLLFIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC FVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLYGVVMASLLNSSIKFILFSYL EEEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SINHYKKIEYR HHHHCEECCCC >Mature Secondary Structure MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVF CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHH FGPLTNGITRFFPVAKDKKELSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIF HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEH IVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTFLRFFVAVIFINIFGPSSTVA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE ISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKS HHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHH TYFLGLKIFVIIFLFLLFLLFIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC FVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLYGVVMASLLNSSIKFILFSYL EEEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SINHYKKIEYR HHHHCEECCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA