Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

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The map label for this gene is 123966626

Identifier: 123966626

GI number: 123966626

Start: 1230494

End: 1231789

Strand: Reverse

Name: 123966626

Synonym: P9515_13931

Alternate gene names: NA

Gene position: 1231789-1230494 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123966632

Following gene: 123966625

Centisome position: 72.28

GC content: 24.92

Gene sequence:

>1296_bases
ATGATTATTTATAAAATACATAATTCAATTAAAGAATTATCTTCAATAAGCATAGGGTATTTATTTACTGCTTTAGGCGG
ACTTTTAGGAGTAAGAATATTAACTGCATATTTGACACCTAGTCAATATGGTGAACTTTCTTTAGGAATAACAATGGGAG
GTTTCATTTATAGTGTTTTTTTTGGTCCTTTAACAAATGGTATAACAAGGTTTTTCCCAGTAGCTAAGGATAAAAAAGAA
TTAAGTTTTTATTTATTTAATGTATTAAACATAATTATTAAAGGTTTTAGTTTTATAGGTTTAATTTCACTTTCCATAAT
TATTTTTATAGTTTTTTCTGGTAATGTAAATTCGATTTTTATTGTGTTAGCATCAATTTCTTTTGGATTTATATATAGCT
TTAATAATATTATTAACGGGTTACAAAATGCTTCTAGGAAGAGAATTCTTGTATCAATGCATCAAGGTTTAATGACTTTT
TTAAGGTTTTTTGTAGCTGTAATATTTATAAATATTTTTGGTCCTTCTAGTACAGTGGCAATTTCTGGCCAGTTAATTGG
TTTACTTTTTACTTTAATTGTTCAATTATATTTTCTAGCTCCAACTTTGAGAGGTTATCTTATTAATGAAAGATACAAAA
TAAGTAAAATAGATTGGCAATCAAAAATTAGTTCTTTTACATTACCTTTGATTTCTATAGGACTATTAAATTGGTTAAGA
ATTGCAGTAGAGAAGTGGGGACTTGTATTTTTTACAAATTATGATGAAGCTGTAGGATTTTATTCAATAATTTATCAATT
TGGATATATACCAATTTCTTTATTAGTAAATCTATTAGCAACTTATTTAAGACCTATCTACTTTGATAAAGCAGGAGATA
ATCAAAAAAGGTTAAAATCAACTTATTTTCTTGGACTGAAAATTTTTGTAATTATATTTTTATTTTTATTATTTTTACTA
TTTATTGTGTTTACTTATAGAGAAAAAATATTTCAAATAATTTTAGATGAAAAGTATAAAAGTGTTTCTTATTTAATAGT
TCCAATGATGATGTCGGCACTTCTCAATGAAAGTACGAGTTTTGTAACCTTATTAATTCAAACAAAAAAAGAGACAAAAG
CTTTGCTTTTGCCTAATTCATATATATATGCATCAGGTATAGTATTTGCTATCTTTGGAGCATACTTTTATGGCCTTTAT
GGTGTAGTTATGGCCTCTCTTTTAAATTCTTCAATAAAATTTATCTTATTTTCATATTTATCTATAAACCATTATAAGAA
GATAGAGTATAGATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTTAAATTAAACTAAATATATAGTAGTATTAAGGAAAATCATCTGAAATTGACAATATTTTCAGATAAATTAGTTTTGAA
TTTATAAATATGATTAAGAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTTTTATTTTAAAAATTATTACTTAAAAATATTTCCTAATGAAGGCTTCTTTAGTTACTTATGATAATGCACTAAAT
AATAGGATTTTTGACTCTAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 431; Mature: 431

Protein sequence:

>431_residues
MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVFFGPLTNGITRFFPVAKDKKE
LSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIFIVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTF
LRFFVAVIFINIFGPSSTVAISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR
IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKSTYFLGLKIFVIIFLFLLFLL
FIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTSFVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLY
GVVMASLLNSSIKFILFSYLSINHYKKIEYR

Sequences:

>Translated_431_residues
MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVFFGPLTNGITRFFPVAKDKKE
LSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIFIVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTF
LRFFVAVIFINIFGPSSTVAISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR
IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKSTYFLGLKIFVIIFLFLLFLL
FIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTSFVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLY
GVVMASLLNSSIKFILFSYLSINHYKKIEYR
>Mature_431_residues
MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVFFGPLTNGITRFFPVAKDKKE
LSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIFIVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTF
LRFFVAVIFINIFGPSSTVAISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR
IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKSTYFLGLKIFVIIFLFLLFLL
FIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTSFVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLY
GVVMASLLNSSIKFILFSYLSINHYKKIEYR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49085; Mature: 49085

Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVF
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHH
FGPLTNGITRFFPVAKDKKELSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIF
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEH
IVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTFLRFFVAVIFINIFGPSSTVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
ISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKS
HHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHH
TYFLGLKIFVIIFLFLLFLLFIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
FVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLYGVVMASLLNSSIKFILFSYL
EEEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SINHYKKIEYR
HHHHCEECCCC
>Mature Secondary Structure
MIIYKIHNSIKELSSISIGYLFTALGGLLGVRILTAYLTPSQYGELSLGITMGGFIYSVF
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHH
FGPLTNGITRFFPVAKDKKELSFYLFNVLNIIIKGFSFIGLISLSIIIFIVFSGNVNSIF
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEH
IVLASISFGFIYSFNNIINGLQNASRKRILVSMHQGLMTFLRFFVAVIFINIFGPSSTVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEE
ISGQLIGLLFTLIVQLYFLAPTLRGYLINERYKISKIDWQSKISSFTLPLISIGLLNWLR
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAVEKWGLVFFTNYDEAVGFYSIIYQFGYIPISLLVNLLATYLRPIYFDKAGDNQKRLKS
HHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHH
TYFLGLKIFVIIFLFLLFLLFIVFTYREKIFQIILDEKYKSVSYLIVPMMMSALLNESTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
FVTLLIQTKKETKALLLPNSYIYASGIVFAIFGAYFYGLYGVVMASLLNSSIKFILFSYL
EEEEEEEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SINHYKKIEYR
HHHHCEECCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA