Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

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The map label for this gene is 123965929

Identifier: 123965929

GI number: 123965929

Start: 628922

End: 630301

Strand: Direct

Name: 123965929

Synonym: P9515_06941

Alternate gene names: NA

Gene position: 628922-630301 (Clockwise)

Preceding gene: 123965928

Following gene: 123965930

Centisome position: 36.9

GC content: 30.29

Gene sequence:

>1380_bases
TTGAATATTTCTTTCCTACAAAATAAAGATGTTTTTTCAAATTCCCTTTTAATAAGCTTTTCCGGATTTTTAATAATATC
TTTTTTCTTGATATTTGGGAGAAGATTAAAACTAGCTGTTCAATTAGAAAGATTTGGATTACCCATCGCAGTTATTTCAG
GTGTCGCTGGTATCTCAATAGGACCTTATGGTTTAATCCATTTTTTATCTAAAGAGACTACAAGTGTTTGGAGTAATTTC
CCAACTCCTCTATTGTCATTAGTTTTTGCAACTTTGATGATGGGAAGACCAATACCTAACATTAATGGTTTAATTAAGCC
TATTGTCAACCAGTTTTTACTTGCTCTTTCCTTAGGGTTTGGCCAGTTTTTTATTGGTGGATTAGTTGTTAAATACCTTT
TAGCTCCTCATATGGATATAAATCCTTTAATGGGATGTTTGATAGAGGTTGGTTTTGAGGGGGGGCATGGAGCTGCCACT
ATTATTGGAGAAAGTTTTGATAGACTTGGATTCTCAGATGGACTTGATCTCGGACTAGCGATGGCAACAATGGGACTTTT
GACGTCTTCATTATTAGGCAGTATATTCATTTTTATTGGAAGAACTTTAAGGCTTTCAGATACAGAGGAAATTATAGATA
AAAAAGAAAATTTAAATACAAATATAAATCTTAAAACCGAATTTTTAGTAGATTTGAGAGTATTGCTAATAAATCTTGGT
TTTGCAGGTTTAGCAATCATTTTTGGTGTATTGCTTCTTCAGTTTTTAAGATATATTTCAAATTACTTTGGTGAATTTTC
AAGAGAAATTATCTTTTCACTTCCTGTCTTTCCTCTTATTCTTATAGGCTCTCTTTTGATAAGATATATTTTAGAAAAAA
CAAAAAATACAGATTTTATCTCTAATATTCTTCAAAGAGAAATAGGCATACTATCAACAGATTTATTGATTTTTACAGCA
ATGGCAAGTTTAGATATCGCAACTGTTTTTGAAAATTGGGTTCTTATATTATTGCTTACTATTTTTGGTTTGTTCTGGAA
TTTGATTTGTATTGCTTATTTTGCATACTTTATATTTGATGATTACTGGTTTGAGAAAAGTTTAATAGAGTTTGGTAATT
CTACAGGTGTAGTTGCTTCGGGTTTATTATTGTTGAGGCTTGCAGATCCTAAAAACATTTCTAAAACTCTTCCTATTTTT
ACATCTAAACAACTTTTCGCCCAATTAATACTATCAGGAGGCTTTTTTACTGTAGTAGCACCTCTAGTTATATCTAAAAT
CGGACTAGATTATTGGACAGAGATTTGCGCATTAATAACTTTTTTAATTATTATTATCGCTTTTTTATTTAATAAAAAAT
TTTCTGCAAGTTACCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCATTAATAATATTTAAAGGCCTCATTATTTGAGGCCTTTTTTATTTGGTAAGATTAATTTATTAAATTAAATTTATAGA
GTTATTAAATCTCGAACTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAGTTCAGTTAGTATTAAAATATATTTCTATTGATTCATGTCGCATACCCCATACGATATTCCTCCTCAAGAAAACAAG
GAAAAATGGTTTAGGAGTCA

Product: sodium/solute symporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein; Integral Membrane Protein

Number of amino acids: Translated: 459; Mature: 459

Protein sequence:

>459_residues
MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISIGPYGLIHFLSKETTSVWSNF
PTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGFGQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAAT
IIGESFDRLGFSDGLDLGLAMATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG
FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFISNILQREIGILSTDLLIFTA
MASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIF
TSKQLFAQLILSGGFFTVVAPLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ

Sequences:

>Translated_459_residues
MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISIGPYGLIHFLSKETTSVWSNF
PTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGFGQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAAT
IIGESFDRLGFSDGLDLGLAMATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG
FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFISNILQREIGILSTDLLIFTA
MASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIF
TSKQLFAQLILSGGFFTVVAPLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ
>Mature_459_residues
MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISIGPYGLIHFLSKETTSVWSNF
PTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGFGQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAAT
IIGESFDRLGFSDGLDLGLAMATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG
FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFISNILQREIGILSTDLLIFTA
MASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFDDYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIF
TSKQLFAQLILSGGFFTVVAPLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ

Specific function: Unknown

COG id: COG0786

COG function: function code E; Na+/glutamate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50993; Mature: 50993

Theoretical pI: Translated: 6.29; Mature: 6.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISI
CCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCC
GPYGLIHFLSKETTSVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAATIIGESFDRLGFSDGLDLGLA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
MATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCC
FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
SNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGFFTVVA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH
PLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNISFLQNKDVFSNSLLISFSGFLIISFFLIFGRRLKLAVQLERFGLPIAVISGVAGISI
CCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCC
GPYGLIHFLSKETTSVWSNFPTPLLSLVFATLMMGRPIPNINGLIKPIVNQFLLALSLGF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GQFFIGGLVVKYLLAPHMDINPLMGCLIEVGFEGGHGAATIIGESFDRLGFSDGLDLGLA
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH
MATMGLLTSSLLGSIFIFIGRTLRLSDTEEIIDKKENLNTNINLKTEFLVDLRVLLINLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHCC
FAGLAIIFGVLLLQFLRYISNYFGEFSREIIFSLPVFPLILIGSLLIRYILEKTKNTDFI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
SNILQREIGILSTDLLIFTAMASLDIATVFENWVLILLLTIFGLFWNLICIAYFAYFIFD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DYWFEKSLIEFGNSTGVVASGLLLLRLADPKNISKTLPIFTSKQLFAQLILSGGFFTVVA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH
PLVISKIGLDYWTEICALITFLIIIIAFLFNKKFSASYQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA