Definition Shewanella sp. W3-18-1 chromosome, complete genome.
Accession NC_008750
Length 4,708,380

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The map label for this gene is 120598317

Identifier: 120598317

GI number: 120598317

Start: 1692832

End: 1694400

Strand: Direct

Name: 120598317

Synonym: Sputw3181_1499

Alternate gene names: NA

Gene position: 1692832-1694400 (Clockwise)

Preceding gene: 120598316

Following gene: 120598320

Centisome position: 35.95

GC content: 43.59

Gene sequence:

>1569_bases
ATGACTGTTATGAGTTATGCCGATTCGGCACTTTCTTTGCTGCCGCCTGCGGTAGCGATTGTATTGGCGATTTTTACTCG
CCGAGTTCTACTTTCCCTTGGATTAGGAATTGTCATTGGAGCGTTATTGCTTAACCAATACTCGCCTGTTGCCAGTGGAG
CCTTTTTGTTCAGTAGTGTAAAAGGTCTTTTTTGGGCTGATGACGCTGCTAATACGTGGAATTTATATATTCTTGGTTTT
TTAATCGTTTTAGGAATGATCACCGCATTAATTACTGTTAGTGGTAGTGCCCGCGCATTCGCCGATTGGGCTCGTTTGCA
TATTCGTAATAAGCGTGATGCAAAACTACTCACCATGTTTTTAGGTTGTGTTGTTTTTATTGACGATTATTTCAATAGCT
TAGTTGTGGGTTCTGTCGCAAAACCCGTCACAGATCGCTATTATATTTCTCGCGCTAAGTTAGCGTATTTATTGGATTCA
ACGGCGGCGCCCGTTTGTGTTATTTCACCAGTATCTAGCTGGGGAGCTTATATTATTGCCTTAATTGGCGGTATTTTAAC
GGCTCATGGTTTTGCAGACTCTGGACATTTGAGCGTATTTGTCCAAATGATACCAATGAACTTCTACGCTATCTTCTCTT
TGTTATTATTACTTTGTGTTGCGTTTATGGGGCTCGATATTGGGCCAATGCGTGAACATGAGTTAAATGCCCAACGGGGG
AATTTATACGATGAAACAAAAGGATTACCCCCCGGAGCGAACGCGGATTTACCCGAGGCTGAAACGGGTAAAATTTTAGG
CTTATTCCTGCCGATCACTGTGCTGGTAATTGCAACCTTATATTTTATGATTAGCAGCGGTGCTCAAGTGCTCGCCGCTG
AAGGCATTGAGTTTAGTCTTATTTCAGCTTTTGAAAAAACCGATGTGAGCTCATCATTATTTTTGGGTTCCCTGTTCGGG
TTAGCCGTGGCTTTAGTGGTTAACGTGGTACAAGGAGTCGAAAAGTCGATGATTGTAAAAGGTGTAGTGCAGGGCGCACG
TTCTATGCTACCCGCGATTTATATTTTGTTATTTGCATGGACAATTGCAGGGATTATTGGCCAACTCGAAACCGGTAAGT
TTATGGCGAGTTTAGCGACGGGTAATATTCCTTTTGCTTTCTTACCTGCGCTTATGTTTATTCTGGCGGGATTAACTGCG
TTTTCTACGGGCACGAGTTGGGGAACTTTTGGTATTATGTTGCCGATTGCAGCCGATATGGCGATGGGCAGCCATACTGG
GATGATGTTACCTATGTTGGCCTCTGTTTTAGCGGGTGCGGTATTTGGCGATCATTGTTCACCTATCTCAGATACCACAA
TTTTGTCGTCAACTGGCGCGAGTTGTCACCATATAGACCATGTAGTCACTCAGTTACCCTATGCCTTGATAGTAGCGTTT
ATCAGCTTGGTGGGTTATTTGGTACTCGGGTTTACAGAGTCGGTCAGTGCAGGTTTAGTGACCTGTAGTGTGTTGTTGGT
GATGAGTGTTATTTGGCTGAGAATAAAGTCAACAGGTGCAGTGAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATGGAGCGCTACTGATAGGACAGGTGATCTTGGGTATCTATTGCCTTTTCCCACCAGTTCAGTCGCCCTCCATTCGTAT
TTTTGACGAAGAAATAATCA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GACTAAGTGTGTTTGGATATAAAAATCAGCCAGCAATTGCTGGCTGATTTTTTATGGATCTGACGTTCGTTTTATTTATT
GGCGCTATTTAAACCACGCC

Product: Na+/H+ antiporter NhaC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 522; Mature: 521

Protein sequence:

>522_residues
MTVMSYADSALSLLPPAVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGALLLNQYSPVASGAFLFSSVKGLFWADDAANTWNLYILGF
LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVAKPVTDRYYISRAKLAYLLDS
TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADSGHLSVFVQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVIATLYFMISSGAQVLAAEGIEFSLISAFEKTDVSSSLFLGSLFG
LAVALVVNVVQGVEKSMIVKGVVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGIIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFILAGLTA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIVAF
ISLVGYLVLGFTESVSAGLVTCSVLLVMSVIWLRIKSTGAVK

Sequences:

>Translated_522_residues
MTVMSYADSALSLLPPAVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGALLLNQYSPVASGAFLFSSVKGLFWADDAANTWNLYILGF
LIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVAKPVTDRYYISRAKLAYLLDS
TAAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADSGHLSVFVQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVIATLYFMISSGAQVLAAEGIEFSLISAFEKTDVSSSLFLGSLFG
LAVALVVNVVQGVEKSMIVKGVVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGIIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFILAGLTA
FSTGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIVAF
ISLVGYLVLGFTESVSAGLVTCSVLLVMSVIWLRIKSTGAVK
>Mature_521_residues
TVMSYADSALSLLPPAVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGALLLNQYSPVASGAFLFSSVKGLFWADDAANTWNLYILGFL
IVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMFLGCVVFIDDYFNSLVVGSVAKPVTDRYYISRAKLAYLLDST
AAPVCVISPVSSWGAYIIALIGGILTAHGFADSGHLSVFVQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRGN
LYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVIATLYFMISSGAQVLAAEGIEFSLISAFEKTDVSSSLFLGSLFGL
AVALVVNVVQGVEKSMIVKGVVQGARSMLPAIYILLFAWTIAGIIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFILAGLTAF
STGTSWGTFGIMLPIAADMAMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIVAFI
SLVGYLVLGFTESVSAGLVTCSVLLVMSVIWLRIKSTGAVK

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55269; Mature: 55138

Theoretical pI: Translated: 6.59; Mature: 6.59

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTVMSYADSALSLLPPAVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGALLLNQYSPVASGAFLFSSV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
KGLFWADDAANTWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF
CCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVAKPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFADSGHLSVFVQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC
NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVIATLYFMISSGAQVLAAEGIEFSL
CCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHCCCCHHH
ISAFEKTDVSSSLFLGSLFGLAVALVVNVVQGVEKSMIVKGVVQGARSMLPAIYILLFAW
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGIIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFILAGLTAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIVAF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLVGYLVLGFTESVSAGLVTCSVLLVMSVIWLRIKSTGAVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TVMSYADSALSLLPPAVAIVLAIFTRRVLLSLGLGIVIGALLLNQYSPVASGAFLFSSV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
KGLFWADDAANTWNLYILGFLIVLGMITALITVSGSARAFADWARLHIRNKRDAKLLTMF
CCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
LGCVVFIDDYFNSLVVGSVAKPVTDRYYISRAKLAYLLDSTAAPVCVISPVSSWGAYIIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHHHHH
LIGGILTAHGFADSGHLSVFVQMIPMNFYAIFSLLLLLCVAFMGLDIGPMREHELNAQRG
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCC
NLYDETKGLPPGANADLPEAETGKILGLFLPITVLVIATLYFMISSGAQVLAAEGIEFSL
CCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHCCCCHHH
ISAFEKTDVSSSLFLGSLFGLAVALVVNVVQGVEKSMIVKGVVQGARSMLPAIYILLFAW
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TIAGIIGQLETGKFMASLATGNIPFAFLPALMFILAGLTAFSTGTSWGTFGIMLPIAADM
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AMGSHTGMMLPMLASVLAGAVFGDHCSPISDTTILSSTGASCHHIDHVVTQLPYALIVAF
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISLVGYLVLGFTESVSAGLVTCSVLLVMSVIWLRIKSTGAVK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]