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The map label for this gene is yccS [H]

Identifier: 119945208

GI number: 119945208

Start: 1818641

End: 1820842

Strand: Reverse

Name: yccS [H]

Synonym: Ping_1472

Alternate gene names: 119945208

Gene position: 1820842-1818641 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119945211

Following gene: 119945207

Centisome position: 39.93

GC content: 38.96

Gene sequence:

>2202_bases
ATGCAACCGTCAAATTCAATATTCAATTTTAACGGCTTATTACGTAAGCTAATATCAGACTCAAATGTGCATGCCGGGTT
ACGCGTATTAATTGCTATGTCGATGGCATTTATCCCGGTACTTGTGCTAGATTCAATCCCTTTTTTTACACAAAATAGTC
TGCATATTTCAGTTTCCCTGTGTTTAGGGGTAATGGCCAGTGCCATTGTTGAAACCGATGATAATGATCGAAATAGGCGG
AAATTTCTTTTTACCATCGTATTGTGCTTTTTTATTTCCTCTTCCTGCGTGCAATTATTAATGCCCTATCCGGTTGCTTT
TGCCCTGGGTTTATTTACCTCAAGTTTTGCTTTTATGATGCTTGCCATATTAGGCAACCATTACAATAGAGTTGGGTTTG
GTACTATTTTAATCGCCATTTATACCATGATAGGTTATCAGGCCGACATCATCTGGTATGAGCAATCCATTCTCTTAAGC
CTCGGGGCATTATGGTACGGCCTGTTTTCTCTAATCTGGAATTTTTGTAGTCCTTATCGCTCCTTAAGGGATCAACTGGC
ACAACTGTTCTTCGCATTGAGCCGTTATCAGGAGAAAAAATCTGCTCTATTTAACGAAAAAGAGGGCAGCAGCAAAGCCG
GAATATTTGCCGTACGTCAACAATTAGCAATCCGCAACATCGCCATTATGGCTCGCTTTGATCAATGCAAACGTATTATT
CAATCTCGTTTTAAGTTCAACCAGCAACAACCTGAGCTTGATAAACTTAATTATTACTATTTTGTTGCAGAACAAATTCA
TGAACGTATGAGCGCAAGTCAGTATTTATATAGCCAATTGGAAAAAATCTTCCGGGAAAGTCAAATATTAGAAGGTTACC
ATCAGCTTTTCTTACAATTAGGTGAAGAATATTATCAAATGGGGGTAGCTATCTCCGATAAAAAAAACTATCTGCACAGT
CGCCGCTTAAAATGGACCCTTAACGCCCTAGCGGATCAATTATCTCTGCTCAAGCAAAACCAGGCGGTTATTGATAATAA
AAAAGCACTGCAGGGGCTGCAGGGTATTTATGAAAATTTAGATGGCATAAATACATTATTGTTACAAACGCAGCAAACTG
AGCAAAATGAAATAGTCATCGTGCCGATCGAAGCCGAATCTCAGCCAACACAGAAAGCTTACAAGCAACTGCTGGCAGCC
ATGACGGCAAAAAACCCTACTTTTAAACATGCGCTTAGAATCAGTATCGCTTTATTAGTCGCGTTTGTTTTGCAGAACAG
TTTACAACTTAACCACGGTTTCTGGATTTTGCTGACGGTGGTATTTGTTTGCCAACCCAGTTTCAGTGAAACACGCAAGC
GATTGGTATTACGCAGTATAGGCACACTATTTGGCGTCCTATTAGGTTACCCAATCTTAATCTTAGTTGAAGGAACAATA
ATACCGCAAGTTATCTTACTGGTATTAATGGCTTTTTTCTTTTTTACCTATGTGCGTACTAACTATGGTTTATCGATTGT
CTTTATCACCATCTTTGTGATATTTGTCTTCAATTTATTAAACGGCACGGGGATGGAAGTTTTACCCTATCGCATCGGCG
AGACTCTGTTAGGCTGTTTATTAAGCGTACTGGCAACCAGTTTTATCTTTCCTGATTGGCAGTTCCAGCGCTTCCCAATC
TTAGTTAACCAACTTTTAACCTTAAGTGGTCGTTACTTCAAACAGGTAACGGATCAGTACCAACATGGTCGAAGTGAAAA
CTTAAATTACCGGATAACACGTTTTAACACCTTTCAAAGTGATGCGCTATTGGCCAACGCCTGGCAAAGTATGTTGTTTG
AACCTCACTCAAAACAACAGTTAAACCAAGAAGTTTATGCTCTGGTCAATCGTTGTGATGCACTGGTTTCTTATATCGCG
GCACTCGCCTCTCACCGCCATAAGATCAGTGATTTTGAAAAAAACATTAAAATACAAAACTTAATCAACCGTACCAGCAA
ACAACTATTTTTAGCTTGCCACCCTCAACAGATTGATACGAAACAAATTGTTAAAACGATTGAAGAACTGGAAAATTTTG
ATCCCCCTTTTTCTGGCGAAACATTATTAATTATTGAGCAATTGCGTTTAATTGCATTTGCCGCGATAGACATTCAATTG
ATTCTGCAACAGATTAATTTTGACGGTAAAAATCAAGGCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATTTTTTTTATTTCAGATAATATCTTTTCTATTTAGGATCTTATCGGTAAGATCCTTTGTCAGTACCTCTTAGTCGCTT
TATTTACCAGATAGAGATCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATATCTGGATTATGTTTAACCATAGAGGATATACAAGGGCTTTTACAACAGGTAAACTCCATTTTATAGGATATTTTC
GAGAGAAAAAGGATAAAAAT

Product: integral membrane protein, YccS/YhfK family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 733; Mature: 733

Protein sequence:

>733_residues
MQPSNSIFNFNGLLRKLISDSNVHAGLRVLIAMSMAFIPVLVLDSIPFFTQNSLHISVSLCLGVMASAIVETDDNDRNRR
KFLFTIVLCFFISSSCVQLLMPYPVAFALGLFTSSFAFMMLAILGNHYNRVGFGTILIAIYTMIGYQADIIWYEQSILLS
LGALWYGLFSLIWNFCSPYRSLRDQLAQLFFALSRYQEKKSALFNEKEGSSKAGIFAVRQQLAIRNIAIMARFDQCKRII
QSRFKFNQQQPELDKLNYYYFVAEQIHERMSASQYLYSQLEKIFRESQILEGYHQLFLQLGEEYYQMGVAISDKKNYLHS
RRLKWTLNALADQLSLLKQNQAVIDNKKALQGLQGIYENLDGINTLLLQTQQTEQNEIVIVPIEAESQPTQKAYKQLLAA
MTAKNPTFKHALRISIALLVAFVLQNSLQLNHGFWILLTVVFVCQPSFSETRKRLVLRSIGTLFGVLLGYPILILVEGTI
IPQVILLVLMAFFFFTYVRTNYGLSIVFITIFVIFVFNLLNGTGMEVLPYRIGETLLGCLLSVLATSFIFPDWQFQRFPI
LVNQLLTLSGRYFKQVTDQYQHGRSENLNYRITRFNTFQSDALLANAWQSMLFEPHSKQQLNQEVYALVNRCDALVSYIA
ALASHRHKISDFEKNIKIQNLINRTSKQLFLACHPQQIDTKQIVKTIEELENFDPPFSGETLLIIEQLRLIAFAAIDIQL
ILQQINFDGKNQG

Sequences:

>Translated_733_residues
MQPSNSIFNFNGLLRKLISDSNVHAGLRVLIAMSMAFIPVLVLDSIPFFTQNSLHISVSLCLGVMASAIVETDDNDRNRR
KFLFTIVLCFFISSSCVQLLMPYPVAFALGLFTSSFAFMMLAILGNHYNRVGFGTILIAIYTMIGYQADIIWYEQSILLS
LGALWYGLFSLIWNFCSPYRSLRDQLAQLFFALSRYQEKKSALFNEKEGSSKAGIFAVRQQLAIRNIAIMARFDQCKRII
QSRFKFNQQQPELDKLNYYYFVAEQIHERMSASQYLYSQLEKIFRESQILEGYHQLFLQLGEEYYQMGVAISDKKNYLHS
RRLKWTLNALADQLSLLKQNQAVIDNKKALQGLQGIYENLDGINTLLLQTQQTEQNEIVIVPIEAESQPTQKAYKQLLAA
MTAKNPTFKHALRISIALLVAFVLQNSLQLNHGFWILLTVVFVCQPSFSETRKRLVLRSIGTLFGVLLGYPILILVEGTI
IPQVILLVLMAFFFFTYVRTNYGLSIVFITIFVIFVFNLLNGTGMEVLPYRIGETLLGCLLSVLATSFIFPDWQFQRFPI
LVNQLLTLSGRYFKQVTDQYQHGRSENLNYRITRFNTFQSDALLANAWQSMLFEPHSKQQLNQEVYALVNRCDALVSYIA
ALASHRHKISDFEKNIKIQNLINRTSKQLFLACHPQQIDTKQIVKTIEELENFDPPFSGETLLIIEQLRLIAFAAIDIQL
ILQQINFDGKNQG
>Mature_733_residues
MQPSNSIFNFNGLLRKLISDSNVHAGLRVLIAMSMAFIPVLVLDSIPFFTQNSLHISVSLCLGVMASAIVETDDNDRNRR
KFLFTIVLCFFISSSCVQLLMPYPVAFALGLFTSSFAFMMLAILGNHYNRVGFGTILIAIYTMIGYQADIIWYEQSILLS
LGALWYGLFSLIWNFCSPYRSLRDQLAQLFFALSRYQEKKSALFNEKEGSSKAGIFAVRQQLAIRNIAIMARFDQCKRII
QSRFKFNQQQPELDKLNYYYFVAEQIHERMSASQYLYSQLEKIFRESQILEGYHQLFLQLGEEYYQMGVAISDKKNYLHS
RRLKWTLNALADQLSLLKQNQAVIDNKKALQGLQGIYENLDGINTLLLQTQQTEQNEIVIVPIEAESQPTQKAYKQLLAA
MTAKNPTFKHALRISIALLVAFVLQNSLQLNHGFWILLTVVFVCQPSFSETRKRLVLRSIGTLFGVLLGYPILILVEGTI
IPQVILLVLMAFFFFTYVRTNYGLSIVFITIFVIFVFNLLNGTGMEVLPYRIGETLLGCLLSVLATSFIFPDWQFQRFPI
LVNQLLTLSGRYFKQVTDQYQHGRSENLNYRITRFNTFQSDALLANAWQSMLFEPHSKQQLNQEVYALVNRCDALVSYIA
ALASHRHKISDFEKNIKIQNLINRTSKQLFLACHPQQIDTKQIVKTIEELENFDPPFSGETLLIIEQLRLIAFAAIDIQL
ILQQINFDGKNQG

Specific function: Unknown

COG id: COG1289

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the yccS/yhfK family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081808, Length=703, Percent_Identity=31.1522048364154, Blast_Score=347, Evalue=1e-96,
Organism=Escherichia coli, GI87082248, Length=572, Percent_Identity=23.6013986013986, Blast_Score=119, Evalue=1e-27,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR010019
- InterPro:   IPR010020 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 84049; Mature: 84049

Theoretical pI: Translated: 9.00; Mature: 9.00

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905232; 9278503 [H]