| Definition | Psychromonas ingrahamii 37, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008709 |
| Length | 4,559,598 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is sbcC [H]
Identifier: 119945049
GI number: 119945049
Start: 1614435
End: 1618139
Strand: Direct
Name: sbcC [H]
Synonym: Ping_1303
Alternate gene names: 119945049
Gene position: 1614435-1618139 (Clockwise)
Preceding gene: 119945048
Following gene: 119945050
Centisome position: 35.41
GC content: 43.62
Gene sequence:
>3705_bases ATGAAAATATTATCTATTCGTTTTAAAAATCTAAATTCATTAAAAGGCCATTGGAAAATTGATTTTCAGGATGCTGATTT TTTAGAAAACGGTCTGTTTGTTATTACCGGACAAACAGGTGCAGGCAAAAGCACTATTCTGGATGCTATCTGTTTAGCCT TATATCAGCAGACCCCACGTTTAGACAGGATCACTCAAAGTAAAAATGAATTAATGACTCGCGGAACGTGGGAGTGTTCA GCGGAAGTGGAATTTAGTGTTAAGGGAAAGGGCTACCGTGTTTTTTGGGAACAAAAAAGAGCCAGAAAAAGTGCTGCCGG GAAACTGCAGGCGCCTATCTGTGAATTAAGCTTGATTGAAGGCGATGTACTTTGCACTAAAAGCAGTGAAGTATTAAAGC AGGTTATTGAGCTTACCGGACTCGATTTTTCCCGTTTTACAAAATCTATGCTGCTGGCGCAGGGCGGTTTTGCCGCGTTT TTAAACGCCAGCCCGAGAGATCGTGCCGAATTATTAGAAGAGTTAACTGGGACTGAGATTTATTGTGAAATCGCTAAACA CGTGTTTGAACGTAATAAACAGGCTCAGGCGGAATTAGATTTATTAATCAAACAAGCGGATGTATTAGAAGTACTGTCAG AAGAGCAGGTTGATGAGTTAAATAAGCAAGTTCAGCTCCTTGCCGCCGATAAACAGACAGTACAAACAGACTTAAAGGAT CTTGAAGGCGCTTTATTGTGGCTGAAAAACGCACAAGTATTAAAAGAACAGGTAGAAGCGCAGTTGAGACTGTTAACAAA CGCGCAGCAGTCTGCCGCTGAGTTTAAGAATAAACAGCAGCAGATTGAACTTGCACAGCAGGCTAAACGGCTGGAACAGC CGTATCAGAATCAGTTGTTAAACGCAGAGAAGATCCAGTCTGGCGAGACGTTGCTAGTTGAAAATGAACAAAAAAACAAA ATATTACAAGCGCAGCTAATAGAGTGCAAAAACGGGGCTGAAAGCCTCACTGCAGCGCAGAAATCTCTACAAGAAAGCCA TGCTGTCCGGCATAATAAAATCAATGAACATCTTATGCCTTTAGATTTGGCAATAGGTCAGTTAACAGGCCTATGCGGTG AACAACAATTGGCCGTCGACAAACAGATAAATACAGCCGTTGAAACGCAGCAGACGCTGAATATTCGCTTAGCCCAACAA AAGACTGATAATCTTGCCTTAAAAACGTTAAATGAGGGTTTACAGAAGCAGCAGGCTGCGCATCATCTTCAGGAAAGTTT GCCGCTTATTGAGCAGCAGTTTTCTTTCTATATTAAGCAGCAGTCGCAATTAAAAGACTCTTTGTCTGGCAGTTCTGAGT TGCAGAAAAAACAAAGCGTGTTGCACAATGACCTGCTGGATGTGCATAAGCAGGTCAAGCTCAGCGCACAAGCGCTGCAT GAAAAGCAGCTGCTACTGCAACAAGTTCAGCAGCACCGAGAGTCATTATTGGACAGTGGTCAATTTAGCAGTGCCGGGCA AATGAATATAATACTGACCGAGGTCTTTGATCAACAGTCTCAAAACCAACAGGCTTTATCTTTAACAAGGCAGCTAGATG ATAGTTATGCAAGGTTAGCCGCTGTACACAAAGGCAGTGCTGAATTAGAGCAAAGCATTAAAGGCAATCAGCAGGCATTA ATGGTGAGTGAGCAGCAAGGACTAGAGTGCAAAAATTCGCTGCTTGCACTGCAAAAGCTGTTAAAACAAGAGCAGGTGAT TGCCCAATTGAGTGATTTAAAAAAACATTTACAGAAAGATAACCCTTGCCCGTTATGCGGATCGATTGAACACCCGTCGG TGAGTAATTATCAGCCCGTCGATATACCTGAAACGCAAATAGCGCTATCGCTGCAAGAGCAGCGGCTCGAGAGTATCCGA GAGCAGTATTCAGATGCTAAAAACCGAATAAAAACAGATACCAGACAGCTCGCTGAATATCGTCTTCAGGCGGCTAATCT TAGTCAGCTGTTGGAAAAACAGCTGACTGAATGGCAAGATAGTCCTTATTTATCTGCCTTTACCTATCAGCAGAGCAGTT TTGCGGATTTATCTTTATTAACACAAAGCTTACGCGAAAAACGTTTTAATATTGAGAATCTGCAAAAACAAATTCAGCAA ATAGATGCCCAGCTTCCTGATTTACGAGAGGTTATGCAGGCGCTAACGCAAAAAGCCAATGACCATGACAGGTTATTACA GCAGCTTAATAACCAGCATGCCGTTGCAGATAATGAAGATCAGCGATTAGCTAAAGAACAGCAGATGCTTTTAGCACAAC TTGAAGAAAATCAGCAGGGCATCTGCCAGCAGCTGCCTGCCGAGTTATTAAAAAAGCAGGTTGAAGTCGAACAATTATTC AATAGTCCAGCAGCGTGGATTGAAAATCAGAAGAGTTTAATTCTCTTATACCAGTCACAACAGGCGCAAAGCATAACGCT GCAAAGCCTGGTCGATAAGCAAGCCCATCAAATAGCCCTGCAGGAGCAGCAATATGCACAGCAGCAAAGTGTATTACAGC AGCTGCAGACATTATGGCAATCTAATCAGTCGCAGTTGACCGAGCAGCAGCGACAAAGGGCAGATGAATTTGGCAGTCAA AGCCAGGCGCAGATTCGCCAGCTGCTTGAATCTGAAAAAAATGAACTATCAGGTCAGCTGGAGCTTGCGATGGCCTCCCT GCTAAATGTGCAGGGGCAATCTGCACGTTTAGCAGGGCAACTTGCCGAGCAGAAAAATACTCAGGCAGAACTGCAAGGTA ACCAGCAGACGTTACTGACTGTTTTTAAAAAACAGTTAATCACTAGTCCTTTTATTGATCAGACTGACTTTATTAATGCG CGTTTAGCAGAAGAGCCATTACAGGTACTGCTCGCGCTGCAAAAGCAGCTGCATGAGCAGTTACTCACAGAGAAAACCCG TTTAAGTTCGGCACAGCAGAGTCTTGAAAAACATCTCAAATTAAGTGTTACTGAAGAAGATCCATTAGTCTTAGAAAATG CGCAGGCTGCGAATCAGGAAAAATCTGAGGTCATCGGTGAACAGCTGGTGGAGAAAAAAGGCAAACTGCAGGCTGATATT CGTTTAAAAGCGCAGCAACAGGCACTGCTGGATCAACAGGTGCAACAAAAAGACAGTGCAGAGCAGTGGGCGATGCTCAA TAAACTGATCGGCTCAGCTGACGGCAGTAAATTCAGAACCTTTGCGCAGGGCTTAACCTTAGACAATCTGGTTTATCTGG CGAATAAAGAGATGGCAGATCTGCATCAGCGTTATCAGCTGCAGAGAAATCTTGATGAACCCTTAGCACTGCAGGTCATT GATTTATGGCAGGCGAATGCCGTACGGGATGTAAAAACCCTGTCGGGCGGGGAAAGCTTTTTAGTAAGCTTAGGACTGGC CTTAGCGCTTTCTAATCTGGTCAGTCATAAGACGCAGATAGAATCGTTATTTTTAGATGAAGGATTTGGCACCTTAGATG CGGATACCTTAGAAATCGCCTTAGATGCGCTAGAGCGGTTAAATGCAACCGGCAAGCTGATTGGGGTTATTTCCCACGTT GATGCGCTTAAGGAGCGGATTAATAAGCAGATTCATGTCAGTAAAGGCAGCGGGGCAGGGTACAGTCAGCTGGATAAGCA ATATGTTTTTGTGGAAAAGAGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCAGCATCGTTTACAGATTGAAGACAGCTACAGTGACCAGCAGAGAGAGCAGTTAACTAAACTGTTTGCCGAAGTCTGC TCTGAAGTGGAGCATAAATC
Downstream 100 bases:
>100_bases CCATTCTCTTAACTCGGGGAGTCGTAGGCTTTTGCTTTTGAGCGTCAGTTTTGCCTTTAAAGAAAGAGGTCATAAACTTA ATACTCTTGGTATTCTGTTA
Product: SMC domain-containing protein
Products: 5'-phosphomonoesters [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1234; Mature: 1234
Protein sequence:
>1234_residues MKILSIRFKNLNSLKGHWKIDFQDADFLENGLFVITGQTGAGKSTILDAICLALYQQTPRLDRITQSKNELMTRGTWECS AEVEFSVKGKGYRVFWEQKRARKSAAGKLQAPICELSLIEGDVLCTKSSEVLKQVIELTGLDFSRFTKSMLLAQGGFAAF LNASPRDRAELLEELTGTEIYCEIAKHVFERNKQAQAELDLLIKQADVLEVLSEEQVDELNKQVQLLAADKQTVQTDLKD LEGALLWLKNAQVLKEQVEAQLRLLTNAQQSAAEFKNKQQQIELAQQAKRLEQPYQNQLLNAEKIQSGETLLVENEQKNK ILQAQLIECKNGAESLTAAQKSLQESHAVRHNKINEHLMPLDLAIGQLTGLCGEQQLAVDKQINTAVETQQTLNIRLAQQ KTDNLALKTLNEGLQKQQAAHHLQESLPLIEQQFSFYIKQQSQLKDSLSGSSELQKKQSVLHNDLLDVHKQVKLSAQALH EKQLLLQQVQQHRESLLDSGQFSSAGQMNIILTEVFDQQSQNQQALSLTRQLDDSYARLAAVHKGSAELEQSIKGNQQAL MVSEQQGLECKNSLLALQKLLKQEQVIAQLSDLKKHLQKDNPCPLCGSIEHPSVSNYQPVDIPETQIALSLQEQRLESIR EQYSDAKNRIKTDTRQLAEYRLQAANLSQLLEKQLTEWQDSPYLSAFTYQQSSFADLSLLTQSLREKRFNIENLQKQIQQ IDAQLPDLREVMQALTQKANDHDRLLQQLNNQHAVADNEDQRLAKEQQMLLAQLEENQQGICQQLPAELLKKQVEVEQLF NSPAAWIENQKSLILLYQSQQAQSITLQSLVDKQAHQIALQEQQYAQQQSVLQQLQTLWQSNQSQLTEQQRQRADEFGSQ SQAQIRQLLESEKNELSGQLELAMASLLNVQGQSARLAGQLAEQKNTQAELQGNQQTLLTVFKKQLITSPFIDQTDFINA RLAEEPLQVLLALQKQLHEQLLTEKTRLSSAQQSLEKHLKLSVTEEDPLVLENAQAANQEKSEVIGEQLVEKKGKLQADI RLKAQQQALLDQQVQQKDSAEQWAMLNKLIGSADGSKFRTFAQGLTLDNLVYLANKEMADLHQRYQLQRNLDEPLALQVI DLWQANAVRDVKTLSGGESFLVSLGLALALSNLVSHKTQIESLFLDEGFGTLDADTLEIALDALERLNATGKLIGVISHV DALKERINKQIHVSKGSGAGYSQLDKQYVFVEKS
Sequences:
>Translated_1234_residues MKILSIRFKNLNSLKGHWKIDFQDADFLENGLFVITGQTGAGKSTILDAICLALYQQTPRLDRITQSKNELMTRGTWECS AEVEFSVKGKGYRVFWEQKRARKSAAGKLQAPICELSLIEGDVLCTKSSEVLKQVIELTGLDFSRFTKSMLLAQGGFAAF LNASPRDRAELLEELTGTEIYCEIAKHVFERNKQAQAELDLLIKQADVLEVLSEEQVDELNKQVQLLAADKQTVQTDLKD LEGALLWLKNAQVLKEQVEAQLRLLTNAQQSAAEFKNKQQQIELAQQAKRLEQPYQNQLLNAEKIQSGETLLVENEQKNK ILQAQLIECKNGAESLTAAQKSLQESHAVRHNKINEHLMPLDLAIGQLTGLCGEQQLAVDKQINTAVETQQTLNIRLAQQ KTDNLALKTLNEGLQKQQAAHHLQESLPLIEQQFSFYIKQQSQLKDSLSGSSELQKKQSVLHNDLLDVHKQVKLSAQALH EKQLLLQQVQQHRESLLDSGQFSSAGQMNIILTEVFDQQSQNQQALSLTRQLDDSYARLAAVHKGSAELEQSIKGNQQAL MVSEQQGLECKNSLLALQKLLKQEQVIAQLSDLKKHLQKDNPCPLCGSIEHPSVSNYQPVDIPETQIALSLQEQRLESIR EQYSDAKNRIKTDTRQLAEYRLQAANLSQLLEKQLTEWQDSPYLSAFTYQQSSFADLSLLTQSLREKRFNIENLQKQIQQ IDAQLPDLREVMQALTQKANDHDRLLQQLNNQHAVADNEDQRLAKEQQMLLAQLEENQQGICQQLPAELLKKQVEVEQLF NSPAAWIENQKSLILLYQSQQAQSITLQSLVDKQAHQIALQEQQYAQQQSVLQQLQTLWQSNQSQLTEQQRQRADEFGSQ SQAQIRQLLESEKNELSGQLELAMASLLNVQGQSARLAGQLAEQKNTQAELQGNQQTLLTVFKKQLITSPFIDQTDFINA RLAEEPLQVLLALQKQLHEQLLTEKTRLSSAQQSLEKHLKLSVTEEDPLVLENAQAANQEKSEVIGEQLVEKKGKLQADI RLKAQQQALLDQQVQQKDSAEQWAMLNKLIGSADGSKFRTFAQGLTLDNLVYLANKEMADLHQRYQLQRNLDEPLALQVI DLWQANAVRDVKTLSGGESFLVSLGLALALSNLVSHKTQIESLFLDEGFGTLDADTLEIALDALERLNATGKLIGVISHV DALKERINKQIHVSKGSGAGYSQLDKQYVFVEKS >Mature_1234_residues MKILSIRFKNLNSLKGHWKIDFQDADFLENGLFVITGQTGAGKSTILDAICLALYQQTPRLDRITQSKNELMTRGTWECS AEVEFSVKGKGYRVFWEQKRARKSAAGKLQAPICELSLIEGDVLCTKSSEVLKQVIELTGLDFSRFTKSMLLAQGGFAAF LNASPRDRAELLEELTGTEIYCEIAKHVFERNKQAQAELDLLIKQADVLEVLSEEQVDELNKQVQLLAADKQTVQTDLKD LEGALLWLKNAQVLKEQVEAQLRLLTNAQQSAAEFKNKQQQIELAQQAKRLEQPYQNQLLNAEKIQSGETLLVENEQKNK ILQAQLIECKNGAESLTAAQKSLQESHAVRHNKINEHLMPLDLAIGQLTGLCGEQQLAVDKQINTAVETQQTLNIRLAQQ KTDNLALKTLNEGLQKQQAAHHLQESLPLIEQQFSFYIKQQSQLKDSLSGSSELQKKQSVLHNDLLDVHKQVKLSAQALH EKQLLLQQVQQHRESLLDSGQFSSAGQMNIILTEVFDQQSQNQQALSLTRQLDDSYARLAAVHKGSAELEQSIKGNQQAL MVSEQQGLECKNSLLALQKLLKQEQVIAQLSDLKKHLQKDNPCPLCGSIEHPSVSNYQPVDIPETQIALSLQEQRLESIR EQYSDAKNRIKTDTRQLAEYRLQAANLSQLLEKQLTEWQDSPYLSAFTYQQSSFADLSLLTQSLREKRFNIENLQKQIQQ IDAQLPDLREVMQALTQKANDHDRLLQQLNNQHAVADNEDQRLAKEQQMLLAQLEENQQGICQQLPAELLKKQVEVEQLF NSPAAWIENQKSLILLYQSQQAQSITLQSLVDKQAHQIALQEQQYAQQQSVLQQLQTLWQSNQSQLTEQQRQRADEFGSQ SQAQIRQLLESEKNELSGQLELAMASLLNVQGQSARLAGQLAEQKNTQAELQGNQQTLLTVFKKQLITSPFIDQTDFINA RLAEEPLQVLLALQKQLHEQLLTEKTRLSSAQQSLEKHLKLSVTEEDPLVLENAQAANQEKSEVIGEQLVEKKGKLQADI RLKAQQQALLDQQVQQKDSAEQWAMLNKLIGSADGSKFRTFAQGLTLDNLVYLANKEMADLHQRYQLQRNLDEPLALQVI DLWQANAVRDVKTLSGGESFLVSLGLALALSNLVSHKTQIESLFLDEGFGTLDADTLEIALDALERLNATGKLIGVISHV DALKERINKQIHVSKGSGAGYSQLDKQYVFVEKS
Specific function: SbcCD cleaves DNA hairpin structures. These structures can inhibit DNA replication and are intermediates in certain DNA recombination reactions. The complex acts as a 3'->5' double strand exonuclease that can open hairpins. It also has a 5' single-strand
COG id: COG0419
COG function: function code L; ATPase involved in DNA repair
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasm [C]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the SMC family. SbcC subfamily [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786597, Length=306, Percent_Identity=50.6535947712418, Blast_Score=285, Evalue=9e-78,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004592 [H]
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 139076; Mature: 139076
Theoretical pI: Translated: 5.34; Mature: 5.34
Prosite motif: PS00675 SIGMA54_INTERACT_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKILSIRFKNLNSLKGHWKIDFQDADFLENGLFVITGQTGAGKSTILDAICLALYQQTPR CCEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC LDRITQSKNELMTRGTWECSAEVEFSVKGKGYRVFWEQKRARKSAAGKLQAPICELSLIE HHHHHHHHHHHHHCCCCEECCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEC GDVLCTKSSEVLKQVIELTGLDFSRFTKSMLLAQGGFAAFLNASPRDRAELLEELTGTEI CCEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCHH YCEIAKHVFERNKQAQAELDLLIKQADVLEVLSEEQVDELNKQVQLLAADKQTVQTDLKD HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEGALLWLKNAQVLKEQVEAQLRLLTNAQQSAAEFKNKQQQIELAQQAKRLEQPYQNQLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCC NAEKIQSGETLLVENEQKNKILQAQLIECKNGAESLTAAQKSLQESHAVRHNKINEHLMP CHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDLAIGQLTGLCGEQQLAVDKQINTAVETQQTLNIRLAQQKTDNLALKTLNEGLQKQQAA HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH HHLQESLPLIEQQFSFYIKQQSQLKDSLSGSSELQKKQSVLHNDLLDVHKQVKLSAQALH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKQLLLQQVQQHRESLLDSGQFSSAGQMNIILTEVFDQQSQNQQALSLTRQLDDSYARLA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVHKGSAELEQSIKGNQQALMVSEQQGLECKNSLLALQKLLKQEQVIAQLSDLKKHLQKD HHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NPCPLCGSIEHPSVSNYQPVDIPETQIALSLQEQRLESIREQYSDAKNRIKTDTRQLAEY CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLQAANLSQLLEKQLTEWQDSPYLSAFTYQQSSFADLSLLTQSLREKRFNIENLQKQIQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH IDAQLPDLREVMQALTQKANDHDRLLQQLNNQHAVADNEDQRLAKEQQMLLAQLEENQQG HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH ICQQLPAELLKKQVEVEQLFNSPAAWIENQKSLILLYQSQQAQSITLQSLVDKQAHQIAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QEQQYAQQQSVLQQLQTLWQSNQSQLTEQQRQRADEFGSQSQAQIRQLLESEKNELSGQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELAMASLLNVQGQSARLAGQLAEQKNTQAELQGNQQTLLTVFKKQLITSPFIDQTDFINA HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH RLAEEPLQVLLALQKQLHEQLLTEKTRLSSAQQSLEKHLKLSVTEEDPLVLENAQAANQE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEECCCHHCCHH KSEVIGEQLVEKKGKLQADIRLKAQQQALLDQQVQQKDSAEQWAMLNKLIGSADGSKFRT HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH FAQGLTLDNLVYLANKEMADLHQRYQLQRNLDEPLALQVIDLWQANAVRDVKTLSGGESF HHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHH LVSLGLALALSNLVSHKTQIESLFLDEGFGTLDADTLEIALDALERLNATGKLIGVISHV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH DALKERINKQIHVSKGSGAGYSQLDKQYVFVEKS HHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHCCCEEEEECC >Mature Secondary Structure MKILSIRFKNLNSLKGHWKIDFQDADFLENGLFVITGQTGAGKSTILDAICLALYQQTPR CCEEEEECCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC LDRITQSKNELMTRGTWECSAEVEFSVKGKGYRVFWEQKRARKSAAGKLQAPICELSLIE HHHHHHHHHHHHHCCCCEECCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEEC GDVLCTKSSEVLKQVIELTGLDFSRFTKSMLLAQGGFAAFLNASPRDRAELLEELTGTEI CCEEECCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHCCCHH YCEIAKHVFERNKQAQAELDLLIKQADVLEVLSEEQVDELNKQVQLLAADKQTVQTDLKD HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LEGALLWLKNAQVLKEQVEAQLRLLTNAQQSAAEFKNKQQQIELAQQAKRLEQPYQNQLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCC NAEKIQSGETLLVENEQKNKILQAQLIECKNGAESLTAAQKSLQESHAVRHNKINEHLMP CHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LDLAIGQLTGLCGEQQLAVDKQINTAVETQQTLNIRLAQQKTDNLALKTLNEGLQKQQAA HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH HHLQESLPLIEQQFSFYIKQQSQLKDSLSGSSELQKKQSVLHNDLLDVHKQVKLSAQALH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKQLLLQQVQQHRESLLDSGQFSSAGQMNIILTEVFDQQSQNQQALSLTRQLDDSYARLA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVHKGSAELEQSIKGNQQALMVSEQQGLECKNSLLALQKLLKQEQVIAQLSDLKKHLQKD HHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NPCPLCGSIEHPSVSNYQPVDIPETQIALSLQEQRLESIREQYSDAKNRIKTDTRQLAEY CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLQAANLSQLLEKQLTEWQDSPYLSAFTYQQSSFADLSLLTQSLREKRFNIENLQKQIQQ HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH IDAQLPDLREVMQALTQKANDHDRLLQQLNNQHAVADNEDQRLAKEQQMLLAQLEENQQG HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH ICQQLPAELLKKQVEVEQLFNSPAAWIENQKSLILLYQSQQAQSITLQSLVDKQAHQIAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QEQQYAQQQSVLQQLQTLWQSNQSQLTEQQRQRADEFGSQSQAQIRQLLESEKNELSGQL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELAMASLLNVQGQSARLAGQLAEQKNTQAELQGNQQTLLTVFKKQLITSPFIDQTDFINA HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH RLAEEPLQVLLALQKQLHEQLLTEKTRLSSAQQSLEKHLKLSVTEEDPLVLENAQAANQE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEECCCHHCCHH KSEVIGEQLVEKKGKLQADIRLKAQQQALLDQQVQQKDSAEQWAMLNKLIGSADGSKFRT HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH FAQGLTLDNLVYLANKEMADLHQRYQLQRNLDEPLALQVIDLWQANAVRDVKTLSGGESF HHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCHHH LVSLGLALALSNLVSHKTQIESLFLDEGFGTLDADTLEIALDALERLNATGKLIGVISHV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH DALKERINKQIHVSKGSGAGYSQLDKQYVFVEKS HHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHCCCEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ribo- or deoxyribonucleic acids [C]
Specific reaction: ribo- or deoxyribonucleic acids = 5'-phosphomonoesters [C]
General reaction: Hydrolase; Acting on ester bonds [C]
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 2530497; 9278503; 1744033; 1490631; 10886369; 9653124; 9927737 [H]