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The map label for this gene is yraM [H]

Identifier: 119944932

GI number: 119944932

Start: 1466382

End: 1468415

Strand: Reverse

Name: yraM [H]

Synonym: Ping_1177

Alternate gene names: 119944932

Gene position: 1468415-1466382 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119944935

Following gene: 119944931

Centisome position: 32.2

GC content: 38.94

Gene sequence:

>2034_bases
ATGCGGCAATATTACACTATAGCCATCTTGATACCTACATCGAATACTTGCGAGCTAAAAAGGGATGATATTTTGAATGT
TTTAACCTCAGCACAACGCTTTTCATACTTGTTAATGATCTCATTAACAATGACATTTTTAACGGCGTGCAGTACGAGTC
CTTCATCCCCCAAGGAGATACCACCAGAACTCTTTTCTGAATTAGCAAACAGTTCGGCATACTACCTGCAAAAGGATCAA
TTATATCCAGATTCAAATAATGTTGATTGGCAGCTTTTAACCGTTCAAGCCCTTATTGAAGAGGGTCGAGTTGTCCTTGC
TGATTCCATTATTAGCCATATGCAAAGCAAGACTCTTTCAGGTAAAGATAAAACATCACTGGGTTTATTAATCGCGCAGA
ATTTATTTGCAAAAAATCAATTCGACGAATCACAAAAAGCGTTAAGTGCGATTGATCCTGAACAGTTGTCACAACTTGCC
TCTATTGCCTCTTTATCGCTACAGGCGGATCTTTATATAAAGCGCGAGAATCATTTAGCGGCATCAAATCTTTTATTAAT
TCTTACCCCTCTATTACAAAGTGATAAAAGTAAACAAAAATACAATGATATTTTATTAACCCAGCTCTCCTTCTTGCCAG
CTAAGACCCTTAATCAATATGAAACAGTAGACGCTGCTAAAAGTCCCATTGAACAGAATTTTGAAAAAGATTTATTTAAA
AAAGGCTGGTATGCGCTTGCAAGTATTTTTAAGCGTTACCAATTACGCATTAACCTTTTAAAACAAGGCGTCAGTGATTG
GAAAAAAAGCTATCCACAGCACCCGGTACTGTTATTTATGCCGACACAGCTGACTAATATTCATGAAATTCAACCTTTTC
AGCCTGAAAATATCGCTGTTTTACTGCCCCTGTCGGGACGTTTCCAAGAACAGGGTAAGTCAATTAAGTTAGGGATATTA
GATGCATTTTATCGTCAGCAGCAGTTGAATAAATCGACAAGCACAGATGCTCTTGCAATGAATGCAATTAACTCACCCAC
ACTTCATTTTTATGATAGCCATGCGCAGACGATGAAAGAAATCACCACCCAGTTTGCACAAAATAAGATCGACTTCGTTA
TTGGTCCATTATTAAAAAATGAGATTGAAACGTTTCTACCTTTAGTTGAAAAAATGCCGGTTTTAGCGCTAAACGGTTTT
CCAGAAAACAGTCTGAACAGCACTATTAATAAGCCTGAAACAGTCACGTCTGTAAAGCCTTGGCATTATTCATTTTCACT
TTCCCCCGAACACGAAGCCGAACAAGCGGTTCAATTTATCAGTGAAAATAAACACCAAAATCCGCTTATTATTGCGCCTG
ATTCTGACTACGGTAAACGTGTTGCAGAGGCATTTAAAAATGAATGGCAAACACGGTATAACAGGGAAATTGAACAACAT
TTTTTCACTTCTAAGTCGAAATTAGATTCTTTTATTGAGCGCGTTTTATACACGGACCAAAGTCAAACCCGTATTAATCA
AATGAAAAGCCTGACGCGTCTTTCGCTTGAAACAGCGGTCCGCAGCCGTACCGATATTGATGCGATTTATCTGGTCAGTA
AGCGTGATGAACTGATCTTACTTAAACCCTTTATCGATGTCACTGTCAGCCCTTTTGCTGACCGGATACCACTCTATGCC
AGTTCTCGTTCTCATCAATTTGACCGCGGTGGTCTGCAAAATAAGGAGTTATCAAATTTCACATTTTCAGATATGCCCTT
TCTTATCCATCAACAGGATGAAATAATAACCACGCTGAATGAGGTGTTACCAAGGCAGTCCTATGCTGCGTTACGCTTGT
TCGCCTTAGGTTTTGATAGTTACCAATTGATTGGGCAACTAATGCAGTTACAAACCAATAAAGATTATTACTACCCCGGT
TTAGGCGGTCAATTAAGCCTGGATTTAAATAATACGGTTCAACCAGCATTGAGTTGGGCAACATACTATCAGGGAGAATT
AGTTGAAGTTGCCTCGCCTACTACAAGCGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGGTAGCCACTATATAGAGTTTGGCAGGTAGTTGAGATGAAATTTGGCTCTTTTCAGACATATAATCGCCTTGATAAAG
TGAATAAGATTGTTTAACTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTCAAAAGGGGTACTTGCAGAGAAACAAGCCTTATCTTATTTACAAGAACAAGGCTTAAGGTTAATTTGCCAAAATTATT
ACTGCCGTTTTGGTGAAATA

Product: LppC family lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 677; Mature: 677

Protein sequence:

>677_residues
MRQYYTIAILIPTSNTCELKRDDILNVLTSAQRFSYLLMISLTMTFLTACSTSPSSPKEIPPELFSELANSSAYYLQKDQ
LYPDSNNVDWQLLTVQALIEEGRVVLADSIISHMQSKTLSGKDKTSLGLLIAQNLFAKNQFDESQKALSAIDPEQLSQLA
SIASLSLQADLYIKRENHLAASNLLLILTPLLQSDKSKQKYNDILLTQLSFLPAKTLNQYETVDAAKSPIEQNFEKDLFK
KGWYALASIFKRYQLRINLLKQGVSDWKKSYPQHPVLLFMPTQLTNIHEIQPFQPENIAVLLPLSGRFQEQGKSIKLGIL
DAFYRQQQLNKSTSTDALAMNAINSPTLHFYDSHAQTMKEITTQFAQNKIDFVIGPLLKNEIETFLPLVEKMPVLALNGF
PENSLNSTINKPETVTSVKPWHYSFSLSPEHEAEQAVQFISENKHQNPLIIAPDSDYGKRVAEAFKNEWQTRYNREIEQH
FFTSKSKLDSFIERVLYTDQSQTRINQMKSLTRLSLETAVRSRTDIDAIYLVSKRDELILLKPFIDVTVSPFADRIPLYA
SSRSHQFDRGGLQNKELSNFTFSDMPFLIHQQDEIITTLNEVLPRQSYAALRLFALGFDSYQLIGQLMQLQTNKDYYYPG
LGGQLSLDLNNTVQPALSWATYYQGELVEVASPTTSE

Sequences:

>Translated_677_residues
MRQYYTIAILIPTSNTCELKRDDILNVLTSAQRFSYLLMISLTMTFLTACSTSPSSPKEIPPELFSELANSSAYYLQKDQ
LYPDSNNVDWQLLTVQALIEEGRVVLADSIISHMQSKTLSGKDKTSLGLLIAQNLFAKNQFDESQKALSAIDPEQLSQLA
SIASLSLQADLYIKRENHLAASNLLLILTPLLQSDKSKQKYNDILLTQLSFLPAKTLNQYETVDAAKSPIEQNFEKDLFK
KGWYALASIFKRYQLRINLLKQGVSDWKKSYPQHPVLLFMPTQLTNIHEIQPFQPENIAVLLPLSGRFQEQGKSIKLGIL
DAFYRQQQLNKSTSTDALAMNAINSPTLHFYDSHAQTMKEITTQFAQNKIDFVIGPLLKNEIETFLPLVEKMPVLALNGF
PENSLNSTINKPETVTSVKPWHYSFSLSPEHEAEQAVQFISENKHQNPLIIAPDSDYGKRVAEAFKNEWQTRYNREIEQH
FFTSKSKLDSFIERVLYTDQSQTRINQMKSLTRLSLETAVRSRTDIDAIYLVSKRDELILLKPFIDVTVSPFADRIPLYA
SSRSHQFDRGGLQNKELSNFTFSDMPFLIHQQDEIITTLNEVLPRQSYAALRLFALGFDSYQLIGQLMQLQTNKDYYYPG
LGGQLSLDLNNTVQPALSWATYYQGELVEVASPTTSE
>Mature_677_residues
MRQYYTIAILIPTSNTCELKRDDILNVLTSAQRFSYLLMISLTMTFLTACSTSPSSPKEIPPELFSELANSSAYYLQKDQ
LYPDSNNVDWQLLTVQALIEEGRVVLADSIISHMQSKTLSGKDKTSLGLLIAQNLFAKNQFDESQKALSAIDPEQLSQLA
SIASLSLQADLYIKRENHLAASNLLLILTPLLQSDKSKQKYNDILLTQLSFLPAKTLNQYETVDAAKSPIEQNFEKDLFK
KGWYALASIFKRYQLRINLLKQGVSDWKKSYPQHPVLLFMPTQLTNIHEIQPFQPENIAVLLPLSGRFQEQGKSIKLGIL
DAFYRQQQLNKSTSTDALAMNAINSPTLHFYDSHAQTMKEITTQFAQNKIDFVIGPLLKNEIETFLPLVEKMPVLALNGF
PENSLNSTINKPETVTSVKPWHYSFSLSPEHEAEQAVQFISENKHQNPLIIAPDSDYGKRVAEAFKNEWQTRYNREIEQH
FFTSKSKLDSFIERVLYTDQSQTRINQMKSLTRLSLETAVRSRTDIDAIYLVSKRDELILLKPFIDVTVSPFADRIPLYA
SSRSHQFDRGGLQNKELSNFTFSDMPFLIHQQDEIITTLNEVLPRQSYAALRLFALGFDSYQLIGQLMQLQTNKDYYYPG
LGGQLSLDLNNTVQPALSWATYYQGELVEVASPTTSE

Specific function: Unknown

COG id: COG3107

COG function: function code R; Putative lipoprotein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To H.influenzae HI_1655 [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789537, Length=704, Percent_Identity=25.2840909090909, Blast_Score=198, Evalue=1e-51,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007443 [H]

Pfam domain/function: PF04348 LppC [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77018; Mature: 77018

Theoretical pI: Translated: 6.12; Mature: 6.12

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRQYYTIAILIPTSNTCELKRDDILNVLTSAQRFSYLLMISLTMTFLTACSTSPSSPKEI
CCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PPELFSELANSSAYYLQKDQLYPDSNNVDWQLLTVQALIEEGRVVLADSIISHMQSKTLS
CHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCCC
GKDKTSLGLLIAQNLFAKNQFDESQKALSAIDPEQLSQLASIASLSLQADLYIKRENHLA
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCC
ASNLLLILTPLLQSDKSKQKYNDILLTQLSFLPAKTLNQYETVDAAKSPIEQNFEKDLFK
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
KGWYALASIFKRYQLRINLLKQGVSDWKKSYPQHPVLLFMPTQLTNIHEIQPFQPENIAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
LLPLSGRFQEQGKSIKLGILDAFYRQQQLNKSTSTDALAMNAINSPTLHFYDSHAQTMKE
EEECCCCHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHH
ITTQFAQNKIDFVIGPLLKNEIETFLPLVEKMPVLALNGFPENSLNSTINKPETVTSVKP
HHHHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCC
WHYSFSLSPEHEAEQAVQFISENKHQNPLIIAPDSDYGKRVAEAFKNEWQTRYNREIEQH
CEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFTSKSKLDSFIERVLYTDQSQTRINQMKSLTRLSLETAVRSRTDIDAIYLVSKRDELIL
HHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEE
LKPFIDVTVSPFADRIPLYASSRSHQFDRGGLQNKELSNFTFSDMPFLIHQQDEIITTLN
EECCCCCEECCHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHH
EVLPRQSYAALRLFALGFDSYQLIGQLMQLQTNKDYYYPGLGGQLSLDLNNTVQPALSWA
HHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH
TYYQGELVEVASPTTSE
HHCCCCEEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRQYYTIAILIPTSNTCELKRDDILNVLTSAQRFSYLLMISLTMTFLTACSTSPSSPKEI
CCCEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PPELFSELANSSAYYLQKDQLYPDSNNVDWQLLTVQALIEEGRVVLADSIISHMQSKTLS
CHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCCC
GKDKTSLGLLIAQNLFAKNQFDESQKALSAIDPEQLSQLASIASLSLQADLYIKRENHLA
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEECCCCC
ASNLLLILTPLLQSDKSKQKYNDILLTQLSFLPAKTLNQYETVDAAKSPIEQNFEKDLFK
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHH
KGWYALASIFKRYQLRINLLKQGVSDWKKSYPQHPVLLFMPTQLTNIHEIQPFQPENIAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCEEE
LLPLSGRFQEQGKSIKLGILDAFYRQQQLNKSTSTDALAMNAINSPTLHFYDSHAQTMKE
EEECCCCHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEECHHHHHHHH
ITTQFAQNKIDFVIGPLLKNEIETFLPLVEKMPVLALNGFPENSLNSTINKPETVTSVKP
HHHHHHHCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCC
WHYSFSLSPEHEAEQAVQFISENKHQNPLIIAPDSDYGKRVAEAFKNEWQTRYNREIEQH
CEEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFTSKSKLDSFIERVLYTDQSQTRINQMKSLTRLSLETAVRSRTDIDAIYLVSKRDELIL
HHCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEE
LKPFIDVTVSPFADRIPLYASSRSHQFDRGGLQNKELSNFTFSDMPFLIHQQDEIITTLN
EECCCCCEECCHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHHHHHHH
EVLPRQSYAALRLFALGFDSYQLIGQLMQLQTNKDYYYPGLGGQLSLDLNNTVQPALSWA
HHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH
TYYQGELVEVASPTTSE
HHCCCCEEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9278503 [H]