Definition Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome, complete genome.
Accession NC_008639
Length 3,133,902

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The map label for this gene is 119358390

Identifier: 119358390

GI number: 119358390

Start: 3008857

End: 3010092

Strand: Reverse

Name: 119358390

Synonym: Cpha266_2623

Alternate gene names: NA

Gene position: 3010092-3008857 (Counterclockwise)

Preceding gene: 119358391

Following gene: 119358389

Centisome position: 96.05

GC content: 26.62

Gene sequence:

>1236_bases
ATGTATATATTGTTCACAAATATTATAATTACTTCTATTGTTTTGCTTATGCGTAAGCAAAATATATCAGGTGTTATGTC
TTTTTTTAGTCTTTTTGTAATGTATTATGTTTCGGTGTCCTTGTTATTATTTGATTTTGGTAAAGATATGCCATTTGGGT
TTAATAGATACATATATGATGACATTTTAATATATGGAACACTTGTGGTTTTATTGTCTTGCATATTTTATGATATTGGG
TTTAATTTAGGTAAAAATAAATTTATAATAAAAGCTTTAGATGAAAAGAATGATGGTTTATTAAAAGATATTTTATTTAG
TATCATTTCGATTGTTCCTGTATTGTTTTTGATTGAAGCATTTGATTTTGCTTATTTGTTAAGAAGAGGTTTTTATAGTA
GCCTTTCAAGTAATGTTGTTTATGTGAAATATGCTGATATATTTGCATATATAAGTATGCTTTTGACGCCTCAAATATAT
AGTAAATATTTAAGGCGAGTGGTGTTTGTAATGGTTTTTATGATTTTTGCAGCAATTGGCTCTAGGATGGCAATATTATA
TGCTATGGCATATTTATTTATAAGAATGGGTGTCAATTTTAATCGTGATAGTAGTATTAGATTTAAGTATTACGTTTATT
TATTCTTTTTTCTCTTGTTGGGTGTAAATATATATATTATGAGGTCTGGTTCAGTGTTCGGATTTGTCGGATTTATTGAA
TCAATATGGTATTTTGGTTTTTCATTATTTTATGAAATGTTTAAGTTTTTAAATTTCTCAATTAATTGTTCTGTTATTAC
AATAGGTAGATATGTTGTTGACCCGGATATTAATTATTATCTGTTTTTGCAATCATTAAACCCTTTGCCAGGCTTTTTAT
TGCCTATAAGTCAAGGCGATATTGATGCATGGGCGAGATTTAGAAAAAATATTCCTTATTCTGGTCTTTCGCAAGTATAT
GTACATTTAGGCCCAATTTTCTCATCGATTGTATTTTTCCTTATTGGAAGAATAAATAAGTATTTTGTTTTGATGTTTAG
TGTTTATAGTAACGGAAAATATTATGTCAATAAATTATTATACCATATAGTTGCAATTATGGGTGGGATACCATTACTCG
TAGGGTTTCAATTTAATATTCGAACTGTAACTAGAGTTTATTATGCAGTATGGTTTATCGCTTTACTCGTTATTTTTTTG
AAAAAATTTAAAATCTTTATTATAAAAACTGTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAGGGAGAGTATGAATGCGAATGTGAGAGTAATGTATCAGAGCTTAAATCTCAAGATAAGATATTAAGTAGTTATATT
GATTTTCTAAAAGCATTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAAGAAAACAGTATAGTTATTTTATTATAGTTTTAACAGAGTATTGAAACTATAATAAAATATTATGTTATTCGATT
TTCTTTTTGTGGTATAACAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 411; Mature: 411

Protein sequence:

>411_residues
MYILFTNIIITSIVLLMRKQNISGVMSFFSLFVMYYVSVSLLLFDFGKDMPFGFNRYIYDDILIYGTLVVLLSCIFYDIG
FNLGKNKFIIKALDEKNDGLLKDILFSIISIVPVLFLIEAFDFAYLLRRGFYSSLSSNVVYVKYADIFAYISMLLTPQIY
SKYLRRVVFVMVFMIFAAIGSRMAILYAMAYLFIRMGVNFNRDSSIRFKYYVYLFFFLLLGVNIYIMRSGSVFGFVGFIE
SIWYFGFSLFYEMFKFLNFSINCSVITIGRYVVDPDINYYLFLQSLNPLPGFLLPISQGDIDAWARFRKNIPYSGLSQVY
VHLGPIFSSIVFFLIGRINKYFVLMFSVYSNGKYYVNKLLYHIVAIMGGIPLLVGFQFNIRTVTRVYYAVWFIALLVIFL
KKFKIFIIKTV

Sequences:

>Translated_411_residues
MYILFTNIIITSIVLLMRKQNISGVMSFFSLFVMYYVSVSLLLFDFGKDMPFGFNRYIYDDILIYGTLVVLLSCIFYDIG
FNLGKNKFIIKALDEKNDGLLKDILFSIISIVPVLFLIEAFDFAYLLRRGFYSSLSSNVVYVKYADIFAYISMLLTPQIY
SKYLRRVVFVMVFMIFAAIGSRMAILYAMAYLFIRMGVNFNRDSSIRFKYYVYLFFFLLLGVNIYIMRSGSVFGFVGFIE
SIWYFGFSLFYEMFKFLNFSINCSVITIGRYVVDPDINYYLFLQSLNPLPGFLLPISQGDIDAWARFRKNIPYSGLSQVY
VHLGPIFSSIVFFLIGRINKYFVLMFSVYSNGKYYVNKLLYHIVAIMGGIPLLVGFQFNIRTVTRVYYAVWFIALLVIFL
KKFKIFIIKTV
>Mature_411_residues
MYILFTNIIITSIVLLMRKQNISGVMSFFSLFVMYYVSVSLLLFDFGKDMPFGFNRYIYDDILIYGTLVVLLSCIFYDIG
FNLGKNKFIIKALDEKNDGLLKDILFSIISIVPVLFLIEAFDFAYLLRRGFYSSLSSNVVYVKYADIFAYISMLLTPQIY
SKYLRRVVFVMVFMIFAAIGSRMAILYAMAYLFIRMGVNFNRDSSIRFKYYVYLFFFLLLGVNIYIMRSGSVFGFVGFIE
SIWYFGFSLFYEMFKFLNFSINCSVITIGRYVVDPDINYYLFLQSLNPLPGFLLPISQGDIDAWARFRKNIPYSGLSQVY
VHLGPIFSSIVFFLIGRINKYFVLMFSVYSNGKYYVNKLLYHIVAIMGGIPLLVGFQFNIRTVTRVYYAVWFIALLVIFL
KKFKIFIIKTV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 47985; Mature: 47985

Theoretical pI: Translated: 9.85; Mature: 9.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MYILFTNIIITSIVLLMRKQNISGVMSFFSLFVMYYVSVSLLLFDFGKDMPFGFNRYIYD
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
DILIYGTLVVLLSCIFYDIGFNLGKNKFIIKALDEKNDGLLKDILFSIISIVPVLFLIEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDFAYLLRRGFYSSLSSNVVYVKYADIFAYISMLLTPQIYSKYLRRVVFVMVFMIFAAIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRMAILYAMAYLFIRMGVNFNRDSSIRFKYYVYLFFFLLLGVNIYIMRSGSVFGFVGFIE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHH
SIWYFGFSLFYEMFKFLNFSINCSVITIGRYVVDPDINYYLFLQSLNPLPGFLLPISQGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECCCCC
IDAWARFRKNIPYSGLSQVYVHLGPIFSSIVFFLIGRINKYFVLMFSVYSNGKYYVNKLL
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCHHHHHHHH
YHIVAIMGGIPLLVGFQFNIRTVTRVYYAVWFIALLVIFLKKFKIFIIKTV
HHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MYILFTNIIITSIVLLMRKQNISGVMSFFSLFVMYYVSVSLLLFDFGKDMPFGFNRYIYD
CEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
DILIYGTLVVLLSCIFYDIGFNLGKNKFIIKALDEKNDGLLKDILFSIISIVPVLFLIEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDFAYLLRRGFYSSLSSNVVYVKYADIFAYISMLLTPQIYSKYLRRVVFVMVFMIFAAIG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SRMAILYAMAYLFIRMGVNFNRDSSIRFKYYVYLFFFLLLGVNIYIMRSGSVFGFVGFIE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHH
SIWYFGFSLFYEMFKFLNFSINCSVITIGRYVVDPDINYYLFLQSLNPLPGFLLPISQGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCEEEECCCCC
IDAWARFRKNIPYSGLSQVYVHLGPIFSSIVFFLIGRINKYFVLMFSVYSNGKYYVNKLL
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHCCCHHHHHHHH
YHIVAIMGGIPLLVGFQFNIRTVTRVYYAVWFIALLVIFLKKFKIFIIKTV
HHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA