| Definition | Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008639 |
| Length | 3,133,902 |
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The map label for this gene is kefC [C]
Identifier: 119357658
GI number: 119357658
Start: 2157314
End: 2159569
Strand: Reverse
Name: kefC [C]
Synonym: Cpha266_1862
Alternate gene names: 119357658
Gene position: 2159569-2157314 (Counterclockwise)
Preceding gene: 119357664
Following gene: 119357657
Centisome position: 68.91
GC content: 46.63
Gene sequence:
>2256_bases ATGCCCGCAACAGGACATGCCAACTCTCCAAAACCGACAGAACCTCAGATTGCGATGCTGTTAACCGGACTGTTCGATAT AGCCTTGCCGCTCAAGAACCCGGTTCTTCAGTTTTCGCTGCTTCTTTTCATCATTCTTTTTGTTCCGGTTCTCTTCAGCC GGCTTAAGCTTCCCAGTCTCATCAGCCTTATCATCGCCGGAGCTGTGGTTGGCCCGCATGGACTCAACCTCATGCTTCGT GACAGCAGCATCATCCTTTTCGGTACGGTCGGTCTGCTCTATATCATGTTTCTTGCGGGTCTTGAAATTGATGTTGCCGA TTTTAAAAAAAACAGCAGTAAAAGCATTCTGTTTGGTCTCTACACCTTTCTGATTTCCATTATTCTCGGTATTGTCGTTG CCTTGTATGTGCTTCATTTTTCTCTGCTTTCCTCCATTCTTATCGGAAGTATCTTTGCTTCTCATACACTCATCGTCTAT CCTCTTGTCAGTAAACTCGGTATTGCCAAAAACAAGGCGGTCAATATAGCCGTCGGCGGAACCCTGATAACCGATACGCT GGCGCTTCTTGTGCTTGCTGTTATTTCGGGAATGACGACCGGAGAGCTGACCAGTGAATTCTGGATCAGGTTGCTTGTGT CCTTAGCCGTTTTCAGTCTGATCGTTCTTTTCCTTTTTCCGATTATTGCCCGCTGGTTTTTCAAGCGATTCGACGACAGT GTTCTGCAGTACCTTTTTGTGCTTGCTATGGTCTTTTTTAGTGGATTTCTTGCCGAAGCTGCAGGTGTTGAGGCAATTAT CGGGGCATTTCTTGCCGGGCTTGCCCTGAATCGCATGATCCCTCACACCTCAGCGCTCATGAACAGGATCAAGTTTGTCG GCAACGCGATATTCATTCCGTTTTTTTTGATCGGGGTGGGTATGCTTATTGATTTCAGAGCTTTGTTTAAAGATTATGAA ACCCTCAAGGTTGCGCTTGTTATTACCGTGGCGGCAACAATAGCCAAATATCTTTCGGCATGGATAACCCGGAAGCTGTT CGGTTTTTCAATCGACCAGCGCCGGTTGATTTTTGGTCTCATCAGCGCCCATGCGGCAGTGGCTCTGGCAACCGTTCTTG TGGGATATAAAACGATAACAGGGTATACTCTTGCAGGCGATCCTGTACGTCTGCTTGACGAAACTGTTCTGAACGGCACT ATTCTTTTTATACTTGTAACCTGTACGCTCGCAAGTATTGTGGGAGAGAGAGGTGCGCAGAATATCGCCCTTGCCGAAGC GGTTGATGACGTGGCCGAAGCGAGCGCAGAGGCGCAGGAGGAACGAGTGCTCATGCCTGTAAGCGAGAACTCTCCTGTAA ATGAACTGGTAAACCTCAGTATTACCCTGAGGTCGCAAAAAAAACCGAACGGAATTTATGCCCTGCATGTTGCCGACAAT ACTCTTGATGATGCCGCAGTTGAAAAACATGCGCGAAAAATTCTTGAACTCGCTGCTGTAGCCGCATCATCAACAGACAA CAATCTTACACAGCTTCTGCGTTACGACAGTTCTTTGCCAAACGGCATTTCGAGTGTCATCAGGGAACAGAAAATAACCG ATCTTATTCTTGGTCTGCACCACAAAAGCGGTCTGACCGATACATTTCTCGGCAGTTCTTCCGAAACCATTCTCGGAAGG TGTAATGTCACAACGTTTATTTACAGGCCGATGCAGCCATTGGCAACGATAAAACGGACGATTGTGGTGATACCGCTTGG TGCTGAAAACGAGATCGGATTTTCGTTATGGCTCCAAAGGGTAGTAACTATTATAAAAAACACCGGGTCGAAACTTCTCC TCTTTGCCCAGAAGCAAACCCTTGCTTTTTTGAGGGAGCACTGCTCGACAACCATTCCAAGTGCCGAATACAGGCTTCTT CGGGACTGGGAGGATATCCATCTGCTGTCGAGAGAGGTTAAAAGCGACGATAATCTGATTCTTGTCATGAGCAGAAAAAA TCATCCCTCTTACCACAATAAAATGGCGAAGGTACCCGACTATCTGACCCGGTATTTTCAGAAAAACAGCTTTATTCTGA TATTTCCTGTTCAGAGCGGCATTCCTGATGAGACCTGTGACGACATTCCTTTGCTGACGGAGAAGAAAAGTATGTTCAAT TTCAGCTATCTCGGTACGCTTGTTGATAAAATACCAAAGGGTGGCAAACGAGGATTGTTTACCGGAAAGCGAAACTCTTC TGATACGGCCGCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTGTCATAATCCAAAAGATATGCATATTTAGCAACAGATTACAGTATTCAACGCTATGGCCCGGTCCGGGTTCTCATT GAAATGGGTCATGGCAGGGT
Downstream 100 bases:
>100_bases TCTTTCTGTACACGGTGAAGCATCATTGCGTTTTTGTTTTTCATGCAATACCGGCAGAAGGTTCCTGGCAGCCATAAGCA GGTCGATTTGACTCTGACTT
Product: sodium/hydrogen exchanger
Products: Proton [Cytoplasm]; K (I) [Periplasm] [C]
Alternate protein names: MjNapA [H]
Number of amino acids: Translated: 751; Mature: 750
Protein sequence:
>751_residues MPATGHANSPKPTEPQIAMLLTGLFDIALPLKNPVLQFSLLLFIILFVPVLFSRLKLPSLISLIIAGAVVGPHGLNLMLR DSSIILFGTVGLLYIMFLAGLEIDVADFKKNSSKSILFGLYTFLISIILGIVVALYVLHFSLLSSILIGSIFASHTLIVY PLVSKLGIAKNKAVNIAVGGTLITDTLALLVLAVISGMTTGELTSEFWIRLLVSLAVFSLIVLFLFPIIARWFFKRFDDS VLQYLFVLAMVFFSGFLAEAAGVEAIIGAFLAGLALNRMIPHTSALMNRIKFVGNAIFIPFFLIGVGMLIDFRALFKDYE TLKVALVITVAATIAKYLSAWITRKLFGFSIDQRRLIFGLISAHAAVALATVLVGYKTITGYTLAGDPVRLLDETVLNGT ILFILVTCTLASIVGERGAQNIALAEAVDDVAEASAEAQEERVLMPVSENSPVNELVNLSITLRSQKKPNGIYALHVADN TLDDAAVEKHARKILELAAVAASSTDNNLTQLLRYDSSLPNGISSVIREQKITDLILGLHHKSGLTDTFLGSSSETILGR CNVTTFIYRPMQPLATIKRTIVVIPLGAENEIGFSLWLQRVVTIIKNTGSKLLLFAQKQTLAFLREHCSTTIPSAEYRLL RDWEDIHLLSREVKSDDNLILVMSRKNHPSYHNKMAKVPDYLTRYFQKNSFILIFPVQSGIPDETCDDIPLLTEKKSMFN FSYLGTLVDKIPKGGKRGLFTGKRNSSDTAA
Sequences:
>Translated_751_residues MPATGHANSPKPTEPQIAMLLTGLFDIALPLKNPVLQFSLLLFIILFVPVLFSRLKLPSLISLIIAGAVVGPHGLNLMLR DSSIILFGTVGLLYIMFLAGLEIDVADFKKNSSKSILFGLYTFLISIILGIVVALYVLHFSLLSSILIGSIFASHTLIVY PLVSKLGIAKNKAVNIAVGGTLITDTLALLVLAVISGMTTGELTSEFWIRLLVSLAVFSLIVLFLFPIIARWFFKRFDDS VLQYLFVLAMVFFSGFLAEAAGVEAIIGAFLAGLALNRMIPHTSALMNRIKFVGNAIFIPFFLIGVGMLIDFRALFKDYE TLKVALVITVAATIAKYLSAWITRKLFGFSIDQRRLIFGLISAHAAVALATVLVGYKTITGYTLAGDPVRLLDETVLNGT ILFILVTCTLASIVGERGAQNIALAEAVDDVAEASAEAQEERVLMPVSENSPVNELVNLSITLRSQKKPNGIYALHVADN TLDDAAVEKHARKILELAAVAASSTDNNLTQLLRYDSSLPNGISSVIREQKITDLILGLHHKSGLTDTFLGSSSETILGR CNVTTFIYRPMQPLATIKRTIVVIPLGAENEIGFSLWLQRVVTIIKNTGSKLLLFAQKQTLAFLREHCSTTIPSAEYRLL RDWEDIHLLSREVKSDDNLILVMSRKNHPSYHNKMAKVPDYLTRYFQKNSFILIFPVQSGIPDETCDDIPLLTEKKSMFN FSYLGTLVDKIPKGGKRGLFTGKRNSSDTAA >Mature_750_residues PATGHANSPKPTEPQIAMLLTGLFDIALPLKNPVLQFSLLLFIILFVPVLFSRLKLPSLISLIIAGAVVGPHGLNLMLRD SSIILFGTVGLLYIMFLAGLEIDVADFKKNSSKSILFGLYTFLISIILGIVVALYVLHFSLLSSILIGSIFASHTLIVYP LVSKLGIAKNKAVNIAVGGTLITDTLALLVLAVISGMTTGELTSEFWIRLLVSLAVFSLIVLFLFPIIARWFFKRFDDSV LQYLFVLAMVFFSGFLAEAAGVEAIIGAFLAGLALNRMIPHTSALMNRIKFVGNAIFIPFFLIGVGMLIDFRALFKDYET LKVALVITVAATIAKYLSAWITRKLFGFSIDQRRLIFGLISAHAAVALATVLVGYKTITGYTLAGDPVRLLDETVLNGTI LFILVTCTLASIVGERGAQNIALAEAVDDVAEASAEAQEERVLMPVSENSPVNELVNLSITLRSQKKPNGIYALHVADNT LDDAAVEKHARKILELAAVAASSTDNNLTQLLRYDSSLPNGISSVIREQKITDLILGLHHKSGLTDTFLGSSSETILGRC NVTTFIYRPMQPLATIKRTIVVIPLGAENEIGFSLWLQRVVTIIKNTGSKLLLFAQKQTLAFLREHCSTTIPSAEYRLLR DWEDIHLLSREVKSDDNLILVMSRKNHPSYHNKMAKVPDYLTRYFQKNSFILIFPVQSGIPDETCDDIPLLTEKKSMFNF SYLGTLVDKIPKGGKRGLFTGKRNSSDTAA
Specific function: This is probably a Na(+)/H(+) antiporter [H]
COG id: COG0475
COG function: function code P; Kef-type K+ transport systems, membrane components
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the monovalent cation:proton antiporter 1 (CPA1) transporter (TC 2.A.36) family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1786232, Length=319, Percent_Identity=28.8401253918495, Blast_Score=73, Evalue=6e-14, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6322367, Length=382, Percent_Identity=25.6544502617801, Blast_Score=101, Evalue=3e-22,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR006153 [H]
Pfam domain/function: PF00999 Na_H_Exchanger [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 82298; Mature: 82167
Theoretical pI: Translated: 9.33; Mature: 9.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 2.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPATGHANSPKPTEPQIAMLLTGLFDIALPLKNPVLQFSLLLFIILFVPVLFSRLKLPSL CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH ISLIIAGAVVGPHGLNLMLRDSSIILFGTVGLLYIMFLAGLEIDVADFKKNSSKSILFGL HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHCCCCCCCHHHHHH YTFLISIILGIVVALYVLHFSLLSSILIGSIFASHTLIVYPLVSKLGIAKNKAVNIAVGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECC TLITDTLALLVLAVISGMTTGELTSEFWIRLLVSLAVFSLIVLFLFPIIARWFFKRFDDS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLQYLFVLAMVFFSGFLAEAAGVEAIIGAFLAGLALNRMIPHTSALMNRIKFVGNAIFIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFLIGVGMLIDFRALFKDYETLKVALVITVAATIAKYLSAWITRKLFGFSIDQRRLIFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH ISAHAAVALATVLVGYKTITGYTLAGDPVRLLDETVLNGTILFILVTCTLASIVGERGAQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NIALAEAVDDVAEASAEAQEERVLMPVSENSPVNELVNLSITLRSQKKPNGIYALHVADN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCHHHHHEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCC TLDDAAVEKHARKILELAAVAASSTDNNLTQLLRYDSSLPNGISSVIREQKITDLILGLH CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HKSGLTDTFLGSSSETILGRCNVTTFIYRPMQPLATIKRTIVVIPLGAENEIGFSLWLQR CCCCCCHHHCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHH VVTIIKNTGSKLLLFAQKQTLAFLREHCSTTIPSAEYRLLRDWEDIHLLSREVKSDDNLI HHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE LVMSRKNHPSYHNKMAKVPDYLTRYFQKNSFILIFPVQSGIPDETCDDIPLLTEKKSMFN EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH FSYLGTLVDKIPKGGKRGLFTGKRNSSDTAA HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure PATGHANSPKPTEPQIAMLLTGLFDIALPLKNPVLQFSLLLFIILFVPVLFSRLKLPSL CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH ISLIIAGAVVGPHGLNLMLRDSSIILFGTVGLLYIMFLAGLEIDVADFKKNSSKSILFGL HHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHCCCCCCCHHHHHH YTFLISIILGIVVALYVLHFSLLSSILIGSIFASHTLIVYPLVSKLGIAKNKAVNIAVGG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECC TLITDTLALLVLAVISGMTTGELTSEFWIRLLVSLAVFSLIVLFLFPIIARWFFKRFDDS HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VLQYLFVLAMVFFSGFLAEAAGVEAIIGAFLAGLALNRMIPHTSALMNRIKFVGNAIFIP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFLIGVGMLIDFRALFKDYETLKVALVITVAATIAKYLSAWITRKLFGFSIDQRRLIFGL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH ISAHAAVALATVLVGYKTITGYTLAGDPVRLLDETVLNGTILFILVTCTLASIVGERGAQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NIALAEAVDDVAEASAEAQEERVLMPVSENSPVNELVNLSITLRSQKKPNGIYALHVADN CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCHHHHHEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCC TLDDAAVEKHARKILELAAVAASSTDNNLTQLLRYDSSLPNGISSVIREQKITDLILGLH CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HKSGLTDTFLGSSSETILGRCNVTTFIYRPMQPLATIKRTIVVIPLGAENEIGFSLWLQR CCCCCCHHHCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCHHHHHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHH VVTIIKNTGSKLLLFAQKQTLAFLREHCSTTIPSAEYRLLRDWEDIHLLSREVKSDDNLI HHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEE LVMSRKNHPSYHNKMAKVPDYLTRYFQKNSFILIFPVQSGIPDETCDDIPLLTEKKSMFN EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH FSYLGTLVDKIPKGGKRGLFTGKRNSSDTAA HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Proton [Periplasm]; K (I) [Cytoplasm] [C]
Specific reaction: Proton [Periplasm] + K (I) [Cytoplasm] = Proton [Cytoplasm] + K (I) [Periplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]