Definition Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome, complete genome.
Accession NC_008639
Length 3,133,902

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The map label for this gene is 119356717

Identifier: 119356717

GI number: 119356717

Start: 1012543

End: 1014303

Strand: Direct

Name: 119356717

Synonym: Cpha266_0889

Alternate gene names: NA

Gene position: 1012543-1014303 (Clockwise)

Preceding gene: 119356713

Following gene: 119356718

Centisome position: 32.31

GC content: 41.17

Gene sequence:

>1761_bases
ATGAAGAATCAGAGCAATGCACATAAGAAACTTGCCGGAAATGCGTTATCCGGTATGGTTGCTATTGTCATTTATATGGT
AAGCCGTATTCTTTTGACTCCCTATATCCTGCACTATCTCTCGCTGACTGAATTCGGATTGTGGTCTCTCTCTTTTATTA
TTCTTTCTTATGCAGGGATGGGCGGATTCGGGGTTAACAGTACCTATATCCGTTATTCTGCACGGTATCTCGCTGATGGC
AAGCAGAGTGAAATAAGTAATCTTCTTTCGACCGGCATAGCTTATATGTTATCCTTTAGTTTGCTTTTTTGCTCGGTACT
TTATTTTTTGATGCCTTTTATTCTCCGGCAATTTCATATAGAACCTTCACAACAGGAACTTGCTTCCACCATATTTCTTG
GAACAGCACTTGTATTCAGTCTTGAACTGACGTTAGGCGGGCTTGCATTTATCATCAATGGAATGCATGAGTTTGCAAAG
GAAAAAATAATCTCAACAATTGCCGGGCTTTTTGAAATTGTATTTATTCTTCTCTTTCTTGCTCTTGGAGCAGGGGTCAA
GGGATTACTTTATGCTTTTGCCTTAAGGATTGTCATGTCAACGATCCTCTGCTGGAAAGTTGCCCGCAGCCTGTTGCCAT
CGTTAACGATATCATGGAAACTGGTAACTCGTGAACACTTTCGCCACTTTACAGGGTTTGGCGGGAAAGTCCAGGTGCTT
GGTATTATTGGCATCTTTCTTACAGCGATGGACAGAATGTTTATTACCGCTATTTTGGGACTTGCGTCCGGAGGTATGTT
TGAACTTGGCCGAAAGCTGCCCTCTACTGCCGGAGGTATTGCCAATTCGGCATTTGCCCCGTTTTTATCTACAGCAGCAC
ATCTTGAAGGCTCATGGGCGGGTGAAATGAACAATACGGTGGGAGACAGAATTAAAACCTATCTCATCATTTCGATAATG
GCCATTCTTTTTGCCATTATTCCCGTTGTTTTTTTGCCGGGTTTTCAGAAATATCTTCCGATATCACCGGTTTTCATAGC
TTCAGCAGTTGCCATGGTGTTTTTCTATCTGTTTTTTCAGCTTCAACACGAACAGAAAAAAAATAATTTCCTTGACAATC
AGGAATTAAAAGAACTGTATCTCAATGGCATCCGGTTTACAAATATCATAAGTTCAATACTTTTTGTTTTTCTGGTTGTT
ATGGCTTACCCCCTTATCGATGCATGGGTTGGTTCAAAATATTCAGAGGCTGCAACGATCATGATTTTTCTTTCTGCAGG
ATACGCAGTCCAGCAGTGTACCGGACCAATAAACATGATATTCAGGGGAATAAACAAGACAGGAAAAGAACTGGAATATA
TGCTTGTTCAGGTTTTATTGATGCTGATCTGGATTCCGGCAGCAACAATAACCTACAGTTTATCAGGTGCTGCTGCCGCA
ATAGCATTAAGTTCAATAACCAGCACCCTGTTTCTTTTTTTGCGAAGCAGTTATATCTTTCAAGTCAGAATCTGGGAAAT
TATTGTTCGATCTATCCTTCCTTCGCTGGTGTCGTTTTTTCCCGCTTGCCTGATCTACATCATTACGGTACTGTTTCCTG
TTACAGGGAGGATTGCTGTCATTGCGCAAATCCTTGTCTGTGGAGTTCTCTATCTCATCATGACCATAGCGCTGCTTTGG
GGCATTGTTTTGAACGAAGATGAAAAAAAACAGGCAATTGCATTATTGCCATTTAAAAAGAAGATGGACTCATCACAGTG
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGTATTATTCATGAACACGGGGCAACAAGAAAAATCTGCCGCATAATAATAGTTGCCAGGCAATGCGCACCATCCTCAT
TCTCTACCCGTCGGAGTATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATGCGAAAACCATTTCAGAACGGTTTACGTGTGCATTCGCCATTTTTTGTGAATTATGAAAGCTTCAATACTTTATGCAG
GACTTGCAGCACCTTATGCC

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 586; Mature: 586

Protein sequence:

>586_residues
MKNQSNAHKKLAGNALSGMVAIVIYMVSRILLTPYILHYLSLTEFGLWSLSFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLADG
KQSEISNLLSTGIAYMLSFSLLFCSVLYFLMPFILRQFHIEPSQQELASTIFLGTALVFSLELTLGGLAFIINGMHEFAK
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MAYPLIDAWVGSKYSEAATIMIFLSAGYAVQQCTGPINMIFRGINKTGKELEYMLVQVLLMLIWIPAATITYSLSGAAAA
IALSSITSTLFLFLRSSYIFQVRIWEIIVRSILPSLVSFFPACLIYIITVLFPVTGRIAVIAQILVCGVLYLIMTIALLW
GIVLNEDEKKQAIALLPFKKKMDSSQ

Sequences:

>Translated_586_residues
MKNQSNAHKKLAGNALSGMVAIVIYMVSRILLTPYILHYLSLTEFGLWSLSFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLADG
KQSEISNLLSTGIAYMLSFSLLFCSVLYFLMPFILRQFHIEPSQQELASTIFLGTALVFSLELTLGGLAFIINGMHEFAK
EKIISTIAGLFEIVFILLFLALGAGVKGLLYAFALRIVMSTILCWKVARSLLPSLTISWKLVTREHFRHFTGFGGKVQVL
GIIGIFLTAMDRMFITAILGLASGGMFELGRKLPSTAGGIANSAFAPFLSTAAHLEGSWAGEMNNTVGDRIKTYLIISIM
AILFAIIPVVFLPGFQKYLPISPVFIASAVAMVFFYLFFQLQHEQKKNNFLDNQELKELYLNGIRFTNIISSILFVFLVV
MAYPLIDAWVGSKYSEAATIMIFLSAGYAVQQCTGPINMIFRGINKTGKELEYMLVQVLLMLIWIPAATITYSLSGAAAA
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GIVLNEDEKKQAIALLPFKKKMDSSQ
>Mature_586_residues
MKNQSNAHKKLAGNALSGMVAIVIYMVSRILLTPYILHYLSLTEFGLWSLSFIILSYAGMGGFGVNSTYIRYSARYLADG
KQSEISNLLSTGIAYMLSFSLLFCSVLYFLMPFILRQFHIEPSQQELASTIFLGTALVFSLELTLGGLAFIINGMHEFAK
EKIISTIAGLFEIVFILLFLALGAGVKGLLYAFALRIVMSTILCWKVARSLLPSLTISWKLVTREHFRHFTGFGGKVQVL
GIIGIFLTAMDRMFITAILGLASGGMFELGRKLPSTAGGIANSAFAPFLSTAAHLEGSWAGEMNNTVGDRIKTYLIISIM
AILFAIIPVVFLPGFQKYLPISPVFIASAVAMVFFYLFFQLQHEQKKNNFLDNQELKELYLNGIRFTNIISSILFVFLVV
MAYPLIDAWVGSKYSEAATIMIFLSAGYAVQQCTGPINMIFRGINKTGKELEYMLVQVLLMLIWIPAATITYSLSGAAAA
IALSSITSTLFLFLRSSYIFQVRIWEIIVRSILPSLVSFFPACLIYIITVLFPVTGRIAVIAQILVCGVLYLIMTIALLW
GIVLNEDEKKQAIALLPFKKKMDSSQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 64883; Mature: 64883

Theoretical pI: Translated: 9.65; Mature: 9.65

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
4.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
4.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNQSNAHKKLAGNALSGMVAIVIYMVSRILLTPYILHYLSLTEFGLWSLSFIILSYAGM
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GGFGVNSTYIRYSARYLADGKQSEISNLLSTGIAYMLSFSLLFCSVLYFLMPFILRQFHI
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EPSQQELASTIFLGTALVFSLELTLGGLAFIINGMHEFAKEKIISTIAGLFEIVFILLFL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGAGVKGLLYAFALRIVMSTILCWKVARSLLPSLTISWKLVTREHFRHFTGFGGKVQVL
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
GIIGIFLTAMDRMFITAILGLASGGMFELGRKLPSTAGGIANSAFAPFLSTAAHLEGSWA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GEMNNTVGDRIKTYLIISIMAILFAIIPVVFLPGFQKYLPISPVFIASAVAMVFFYLFFQ
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQHEQKKNNFLDNQELKELYLNGIRFTNIISSILFVFLVVMAYPLIDAWVGSKYSEAATI
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEE
MIFLSAGYAVQQCTGPINMIFRGINKTGKELEYMLVQVLLMLIWIPAATITYSLSGAAAA
EEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHH
IALSSITSTLFLFLRSSYIFQVRIWEIIVRSILPSLVSFFPACLIYIITVLFPVTGRIAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
IAQILVCGVLYLIMTIALLWGIVLNEDEKKQAIALLPFKKKMDSSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEECCCHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKNQSNAHKKLAGNALSGMVAIVIYMVSRILLTPYILHYLSLTEFGLWSLSFIILSYAGM
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
GGFGVNSTYIRYSARYLADGKQSEISNLLSTGIAYMLSFSLLFCSVLYFLMPFILRQFHI
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
EPSQQELASTIFLGTALVFSLELTLGGLAFIINGMHEFAKEKIISTIAGLFEIVFILLFL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ALGAGVKGLLYAFALRIVMSTILCWKVARSLLPSLTISWKLVTREHFRHFTGFGGKVQVL
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
GIIGIFLTAMDRMFITAILGLASGGMFELGRKLPSTAGGIANSAFAPFLSTAAHLEGSWA
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CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQHEQKKNNFLDNQELKELYLNGIRFTNIISSILFVFLVVMAYPLIDAWVGSKYSEAATI
HHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEE
MIFLSAGYAVQQCTGPINMIFRGINKTGKELEYMLVQVLLMLIWIPAATITYSLSGAAAA
EEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHH
IALSSITSTLFLFLRSSYIFQVRIWEIIVRSILPSLVSFFPACLIYIITVLFPVTGRIAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
IAQILVCGVLYLIMTIALLWGIVLNEDEKKQAIALLPFKKKMDSSQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHEEECCCHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA