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The map label for this gene is yvqJ [H]

Identifier: 118478525

GI number: 118478525

Start: 3074093

End: 3075352

Strand: Direct

Name: yvqJ [H]

Synonym: BALH_2900

Alternate gene names: 118478525

Gene position: 3074093-3075352 (Clockwise)

Preceding gene: 118478524

Following gene: 118478529

Centisome position: 58.48

GC content: 38.33

Gene sequence:

>1260_bases
ATGGACATATTGAAAAACCGGAATTTCCTCTTATTATTTTTAGGGAGAATCTTTACAAACATAGGAGATAGCTTGTACTA
TGTAGCCGCGATGTGGCTCGTATATAAGCTAAGTGGTAATCCTTTTTATTCTGGATTGGCTGGTTTCCTTACCTTACTAC
CTTCTGCATTACAATTTCTTACCGGTCCATTCGTTGATAGATGGCCAATAAAAAACACCCTCGTCATCACACAAGTACTG
CAATGCATTCTTATATTAATCATTCCTATTACACACTACTTCGACCTACTAACCGTCCAATTACTACTCATCATTATGCC
AATCGTAGCTTTTATCGAACAATTCGCCTATCCCGCACAATCAAAAGCTTTACCACTTCTACTGCATAAAACACAATTAT
TAAAAGGAAACTCACTCTTTTCATTTGCATATCAAGGCATTGATTTAATTTGCACGACGCTTTCTGGCATATTAGTAGCA
CTATTTGGCGCCATTACTTTATATGTAATCGACTCTTTTACTTTTGCGATTACTGCCCTTTTGTTCTTTTCATTGAAAAT
GCCACAGCAAACTGAAACAGGCACATCACTTTCAACTAAACAATATTTCTCTGATTTAAAAGAAGGCTTTTCAATCGTCT
TTCGTTCATTAATGAGCGTCTTCTTAATCGGTTCAGTTGTTGCCAATTTTTCTATCGGTATGACGATGGCAATACTCCCT
TCTTTCGCTGATTCTTTAGGTGGTGTGAAATCATATGGTTTCTTCTTAGCTGCTATATCAGCAGGTAGTTTAATTGGAGC
ATTATTCAGTTCATGGGTTGGCAAACGTAACGTTGGACGCGCTTCTATTATTAGCTTTGCAACTGGTGCTATCTTTTGGT
TTCTCTCTACGGTTGTACCGTTTCAATGGTTATCTATTTTCTTATTCGGCCTAGCTTGGGTACCGATTGGTGCAACCAAC
ATATTATTTGCGACAATTAGTCAAATTTTAATTCCAAATCGATATATTGGACGCATCAACTCAGTGATGCGAAGTATGGG
CACAATTGCTATGCCATTCGGTTCTTTAATTGGTGGATATGCTGCAAATGTATTTAGTAGCCAACTCATTTTCGCACTCG
CTAGCATCGGGATTTTATTTATTTCTCTCGTATGGCTACTCCATCCGAAATTACGAGCATTGCCGAAAGCTGATGAAATT
ACAGCGGATACTTTTGGGGTGCGGTTTAAGGAAGAGCGTGGGAAAGGTGCAGCTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAATTTGTTAAAGAAGAAGAAAAATCGTAATACGATTTTTTTTACATAAACGGTCAAATTTATTTTACCGAATAAATTT
ATTATAAAGGAGTAGATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGGAGTTAGGGTACGTGAAATTTATATCGGCGATTTTTCAAATATATCAGCGCAACTCGAATTATATCGGCGATTTTCA
CAATATATCGGCGCAATTCG

Product: macrolide-efflux protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 419; Mature: 419

Protein sequence:

>419_residues
MDILKNRNFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPQQTETGTSLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMSVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRASIISFATGAIFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNRYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANVFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVRFKEERGKGAAL

Sequences:

>Translated_419_residues
MDILKNRNFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPQQTETGTSLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMSVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRASIISFATGAIFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNRYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANVFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVRFKEERGKGAAL
>Mature_419_residues
MDILKNRNFLLLFLGRIFTNIGDSLYYVAAMWLVYKLSGNPFYSGLAGFLTLLPSALQFLTGPFVDRWPIKNTLVITQVL
QCILILIIPITHYFDLLTVQLLLIIMPIVAFIEQFAYPAQSKALPLLLHKTQLLKGNSLFSFAYQGIDLICTTLSGILVA
LFGAITLYVIDSFTFAITALLFFSLKMPQQTETGTSLSTKQYFSDLKEGFSIVFRSLMSVFLIGSVVANFSIGMTMAILP
SFADSLGGVKSYGFFLAAISAGSLIGALFSSWVGKRNVGRASIISFATGAIFWFLSTVVPFQWLSIFLFGLAWVPIGATN
ILFATISQILIPNRYIGRINSVMRSMGTIAMPFGSLIGGYAANVFSSQLIFALASIGILFISLVWLLHPKLRALPKADEI
TADTFGVRFKEERGKGAAL

Specific function: Unknown

COG id: COG0477

COG function: function code GEPR; Permeases of the major facilitator superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the major facilitator superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011701
- InterPro:   IPR016196 [H]

Pfam domain/function: PF07690 MFS_1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45968; Mature: 45968

Theoretical pI: Translated: 10.06; Mature: 10.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCCCCCCCCCHHHHCCEEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9639930; 9384377 [H]