| Definition | Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008600 |
| Length | 5,257,091 |
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The map label for this gene is yhgE [H]
Identifier: 118476682
GI number: 118476682
Start: 1104400
End: 1107135
Strand: Direct
Name: yhgE [H]
Synonym: BALH_0960
Alternate gene names: 118476682
Gene position: 1104400-1107135 (Clockwise)
Preceding gene: 118476681
Following gene: 118476688
Centisome position: 21.01
GC content: 38.08
Gene sequence:
>2736_bases ATGAAATGGAATCAGTTACTTCGTAAAGAGTTTACTGAAATTATAAAAAGCAAAAAAATATTAATTCCAATTATCGCGGT TTTATTCGTACCGATTTTATATGCAGGTATGTTTTTATGGGCCTTTTGGGATCCGTATAAACAGTTAGATGATTTACCAG TGGCGGTAGTCAATTTAGATAAAGGTGCAGTATTTGATGGGAAACCAATTGAGGTCGGAAAAGGGCTTGTTGATAATTTA AAAGATAATACAAGTTTTAAATGGGAATTTGTAAGTGAAAAAGAAGCGAAAAAAGGAATGGAAGATAGAAAGTATTACAT GTTAGTACGCATTCCAGATGACTTCTCAAGTAACGCTACAACGTTATTAAAAGATGAACCAAAACCATTAAACTTAGAAT ACATTCCGAACGAAAGCTTAAACTTCTTATCTTCACAAATTGGCGGAACAGCCATTGAAAAAATTAAAGGTGAAGTATCA AGTACATTAACGAAAACATATGCAGAGAAAATGTTTGATTCCATTCAAGACGTCTCAAAAGGATTAGCAGATGGGGCGGA AGGAGCAAATAAACTACACGACGGATCAAGTGAGTTGCATGATGGTTCAAGTAAAGTGACGGATGGCCTTCATACACTTC AAGGGAAGTCTGGGGAGATGAAGGATGGAGTAGGGAAACTATTTGATGGATCTGGGAAAGTAACAGCAGGTTTAAATACG TTAAACGGCAAAACAGGTGAGATGCAAATAGGTATCGGGAAATTAGTAGATGGCTCCGGAAAAGTAACAGATGGTTTACA TGTACTAAATAGCAATGCGGGTATCGGGAAATTAGTAGATGGCTCCGGAAAGGTAACAGATGGTTTAAATACGTTAAATA GTAAAACGGGTGAAATGCAAAAAGGAATTGGCGAATTGCGTGATGGATCTGAGAAAGTGACTGGTGGCTTGAACAAACTA GTAAGTAAATCCGGTGAATTACAAACTGGAACAACGGACCTATCAAATGGTATGGAAGCACTTGTTGAAGGGCAAAGTCA ATTAGAAAAAGGGTCTCAAGAAATTCAAAAGGGATTGCAAGAGTTAAATAGTAACGTACAAAAATCTGTTGCAGGATTAG GGGAAATGCAGTTGAAAGTTCCTGCTATATTGAATACAGTAAATGAGAAAATAGATGGGGCTGGGGCGAATGTAAATGAG TTAAATGAACTTACGCAATCTACAGCAGGAGATGCAAAAACTGCAGCACAAGATGTAGCGAATTTACAAAAGCAAATTGA AAGTTTACCAAAAGAATATCAAGAGCAGTTACAGCCATTCATAACAAATGCGGTAAAAAGTACGGCGACAGTTCAGCAAA AATCTGCCGGAGTAGCAGGCGGAACAAATAAATTAAATGAAGAAGTAAAACAATTAAAAGGTGAAATAGATCAAAAAACA AGTGATGCACAAAACGAACTGCCGAATACAGCGAAATTGCAATCTTTAACAGATGGTATTGAGAAATTAGCGAGTGCACA AAAAGGATTTGTTGGAAATTTCCAAGGGTTTGGTACGAAGTTAAATGCCGCTAAAGAAGGGGCAAATAAATTTAAAAACG AATCCGGTCAATTAATTGATGCGATAAATCAATTAGCAGATGGTTCGGGTAAAGTAACAGGTGGCTTAGACACATTTTCT GCAGTAGCAAACCAAATGGCAGGTGGCGTAAATCAATTAGCAGATGGTTCAAGCAAAGTAACAGGCGGTTTAGGTCAATT ATCTGTAGGCGTAACGAAATTAGCGGATGGCTCAAACCAAGTAACAGGTGGCTTAGGTACGTTATCTGCAGGAGCGGGCC AAATGTCAGGTGGAATAATGCAATTAGCAAATGGCTCTGGCCAAGTAACAACAGGATTAAGTACATTATCAATTGGCTCA ATCCAGCTAATCGACGGCGTAAATAAACTAGCAGACGGATCTGGTAAAGTAACAGATGGCCTCGTAAAAGTAAACAATGG TTCAGGTGAACTTGCTGAGAAACTTGGCGAAGGGGCAGAGAAAACTGGTGAAGTGAAAGGAACCGATAAAACGTATGATA TGTTTGCAAGTCCTGTAAAAGTGAAGACGGAGAAAATGGCGGAAGTTCCAAACTACGGAACTGGATTTACACCATATTTC TTATCACTCGGTTTATTTGTTGGGGCATTACTCTTATCAATCGTATATCCATTACGTGATACAGTTGGTGTTCCGAAATC AGGATTTAGTTGGTTTATTAGTAAGTTCGGCGTATTACTCTCAGTCGGTATTATTCAAGCGGTAGTAGCGGATGTTATAT TACTATTTGGATTAGGTGTAGAAGTACAAAGTATTCCGTATTTCATACTCTTTAGCATCGTTACAAGCTTAGCGTTTATC GCATTAATTCAATGTTTAGTAACAGCATTCGGTGATGCGGGGCGTTTCATCGCCATCATCACATTAATTATTCAGCTTAC AACAAGTGCCGGAACATTCCCGCTAGAATTGATTCCGAAGTTTTTACAACCATTCAATGCTTGGTTACCGATGACATACT CTGTATCCGGATTGAAAGCAGTCGTATCAAGTGGAGACTTTAACTTCATGTGGCAAAACATAGGAATACTCATGATTTTC ATCGTTGTATTATCACTTGGAACAATTGCATCCTTAACTTGGATGCACAAACGACAATTTAGAAATATTGCGGAAAATCA ATCGATTGAAGCATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTCGGGGATAAGGCATATGTATGAATAAATATAGCCTTTTTATTTGGGTAAGAATGACCGAATGAACATTTTGGTCAT TTGAAAGAGGGGGAGTAAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAAGCACCTTTTCGGTGCTTTTTTTATCCCGCATTAACGGGCAGTAAGATCCCCACCTCAAATTTCAGCGGAAGCAA AGAAGTTAGGTGGGGGGTCG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFB [H]
Number of amino acids: Translated: 911; Mature: 911
Protein sequence:
>911_residues MKWNQLLRKEFTEIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLDKGAVFDGKPIEVGKGLVDNL KDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEDRKYYMLVRIPDDFSSNATTLLKDEPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVS STLTKTYAEKMFDSIQDVSKGLADGAEGANKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVGKLFDGSGKVTAGLNT LNGKTGEMQIGIGKLVDGSGKVTDGLHVLNSNAGIGKLVDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGIGELRDGSEKVTGGLNKL VSKSGELQTGTTDLSNGMEALVEGQSQLEKGSQEIQKGLQELNSNVQKSVAGLGEMQLKVPAILNTVNEKIDGAGANVNE LNELTQSTAGDAKTAAQDVANLQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKSAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEIDQKT SDAQNELPNTAKLQSLTDGIEKLASAQKGFVGNFQGFGTKLNAAKEGANKFKNESGQLIDAINQLADGSGKVTGGLDTFS AVANQMAGGVNQLADGSSKVTGGLGQLSVGVTKLADGSNQVTGGLGTLSAGAGQMSGGIMQLANGSGQVTTGLSTLSIGS IQLIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNNGSGELAEKLGEGAEKTGEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYF LSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGVPKSGFSWFISKFGVLLSVGIIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFI ALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPKFLQPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIF IVVLSLGTIASLTWMHKRQFRNIAENQSIEA
Sequences:
>Translated_911_residues MKWNQLLRKEFTEIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLDKGAVFDGKPIEVGKGLVDNL KDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEDRKYYMLVRIPDDFSSNATTLLKDEPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVS STLTKTYAEKMFDSIQDVSKGLADGAEGANKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVGKLFDGSGKVTAGLNT LNGKTGEMQIGIGKLVDGSGKVTDGLHVLNSNAGIGKLVDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGIGELRDGSEKVTGGLNKL VSKSGELQTGTTDLSNGMEALVEGQSQLEKGSQEIQKGLQELNSNVQKSVAGLGEMQLKVPAILNTVNEKIDGAGANVNE LNELTQSTAGDAKTAAQDVANLQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKSAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEIDQKT SDAQNELPNTAKLQSLTDGIEKLASAQKGFVGNFQGFGTKLNAAKEGANKFKNESGQLIDAINQLADGSGKVTGGLDTFS AVANQMAGGVNQLADGSSKVTGGLGQLSVGVTKLADGSNQVTGGLGTLSAGAGQMSGGIMQLANGSGQVTTGLSTLSIGS IQLIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNNGSGELAEKLGEGAEKTGEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYF LSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGVPKSGFSWFISKFGVLLSVGIIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFI ALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPKFLQPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIF IVVLSLGTIASLTWMHKRQFRNIAENQSIEA >Mature_911_residues MKWNQLLRKEFTEIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLDKGAVFDGKPIEVGKGLVDNL KDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEDRKYYMLVRIPDDFSSNATTLLKDEPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVS STLTKTYAEKMFDSIQDVSKGLADGAEGANKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVGKLFDGSGKVTAGLNT LNGKTGEMQIGIGKLVDGSGKVTDGLHVLNSNAGIGKLVDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQKGIGELRDGSEKVTGGLNKL VSKSGELQTGTTDLSNGMEALVEGQSQLEKGSQEIQKGLQELNSNVQKSVAGLGEMQLKVPAILNTVNEKIDGAGANVNE LNELTQSTAGDAKTAAQDVANLQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKSAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEIDQKT SDAQNELPNTAKLQSLTDGIEKLASAQKGFVGNFQGFGTKLNAAKEGANKFKNESGQLIDAINQLADGSGKVTGGLDTFS AVANQMAGGVNQLADGSSKVTGGLGQLSVGVTKLADGSNQVTGGLGTLSAGAGQMSGGIMQLANGSGQVTTGLSTLSIGS IQLIDGVNKLADGSGKVTDGLVKVNNGSGELAEKLGEGAEKTGEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYF LSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGVPKSGFSWFISKFGVLLSVGIIQAVVADVILLFGLGVEVQSIPYFILFSIVTSLAFI ALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPKFLQPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIF IVVLSLGTIASLTWMHKRQFRNIAENQSIEA
Specific function: Unknown
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR022703 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 96381; Mature: 96381
Theoretical pI: Translated: 5.18; Mature: 5.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKWNQLLRKEFTEIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLD CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEEEECC KGAVFDGKPIEVGKGLVDNLKDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEDRKYYMLVRIPDDFSSNAT CCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCE TLLKDEPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVSSTLTKTYAEKMFDSIQDVSK EEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLADGAEGANKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVGKLFDGSGKVTAGLNT HHHCCHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCHHHHCCCCCCEEECCCC LNGKTGEMQIGIGKLVDGSGKVTDGLHVLNSNAGIGKLVDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQ CCCCCCEEEEEHHHEECCCCCCCCCHHEECCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHCCCHHHH KGIGELRDGSEKVTGGLNKLVSKSGELQTGTTDLSNGMEALVEGQSQLEKGSQEIQKGLQ HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELNSNVQKSVAGLGEMQLKVPAILNTVNEKIDGAGANVNELNELTQSTAGDAKTAAQDVA HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH NLQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKSAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEIDQKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SDAQNELPNTAKLQSLTDGIEKLASAQKGFVGNFQGFGTKLNAAKEGANKFKNESGQLID CHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH AINQLADGSGKVTGGLDTFSAVANQMAGGVNQLADGSSKVTGGLGQLSVGVTKLADGSNQ HHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC VTGGLGTLSAGAGQMSGGIMQLANGSGQVTTGLSTLSIGSIQLIDGVNKLADGSGKVTDG CCCCCHHCCCCCCHHCCCCEEECCCCCCEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC LVKVNNGSGELAEKLGEGAEKTGEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYF EEEEECCCHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH LSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGVPKSGFSWFISKFGVLLSVGIIQAVVADVILLFGLGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EVQSIPYFILFSIVTSLAFIALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH FLQPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIFIVVLSLGTIASLTWMHKRQF HHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNIAENQSIEA HHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKWNQLLRKEFTEIIKSKKILIPIIAVLFVPILYAGMFLWAFWDPYKQLDDLPVAVVNLD CCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCCCCEEEEECC KGAVFDGKPIEVGKGLVDNLKDNTSFKWEFVSEKEAKKGMEDRKYYMLVRIPDDFSSNAT CCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCCCCEEEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCE TLLKDEPKPLNLEYIPNESLNFLSSQIGGTAIEKIKGEVSSTLTKTYAEKMFDSIQDVSK EEECCCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLADGAEGANKLHDGSSELHDGSSKVTDGLHTLQGKSGEMKDGVGKLFDGSGKVTAGLNT HHHCCHHHHHHHCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCHHHHCCCCCCEEECCCC LNGKTGEMQIGIGKLVDGSGKVTDGLHVLNSNAGIGKLVDGSGKVTDGLNTLNSKTGEMQ CCCCCCEEEEEHHHEECCCCCCCCCHHEECCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHCCCHHHH KGIGELRDGSEKVTGGLNKLVSKSGELQTGTTDLSNGMEALVEGQSQLEKGSQEIQKGLQ HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELNSNVQKSVAGLGEMQLKVPAILNTVNEKIDGAGANVNELNELTQSTAGDAKTAAQDVA HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH NLQKQIESLPKEYQEQLQPFITNAVKSTATVQQKSAGVAGGTNKLNEEVKQLKGEIDQKT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC SDAQNELPNTAKLQSLTDGIEKLASAQKGFVGNFQGFGTKLNAAKEGANKFKNESGQLID CHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH AINQLADGSGKVTGGLDTFSAVANQMAGGVNQLADGSSKVTGGLGQLSVGVTKLADGSNQ HHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC VTGGLGTLSAGAGQMSGGIMQLANGSGQVTTGLSTLSIGSIQLIDGVNKLADGSGKVTDG CCCCCHHCCCCCCHHCCCCEEECCCCCCEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCC LVKVNNGSGELAEKLGEGAEKTGEVKGTDKTYDMFASPVKVKTEKMAEVPNYGTGFTPYF EEEEECCCHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH LSLGLFVGALLLSIVYPLRDTVGVPKSGFSWFISKFGVLLSVGIIQAVVADVILLFGLGV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC EVQSIPYFILFSIVTSLAFIALIQCLVTAFGDAGRFIAIITLIIQLTTSAGTFPLELIPK CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH FLQPFNAWLPMTYSVSGLKAVVSSGDFNFMWQNIGILMIFIVVLSLGTIASLTWMHKRQF HHHHHHHHCCCEECHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNIAENQSIEA HHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]