Definition Pediococcus pentosaceus ATCC 25745, complete genome.
Accession NC_008525
Length 1,832,387

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The map label for this gene is yhaN [H]

Identifier: 116492443

GI number: 116492443

Start: 714877

End: 717453

Strand: Direct

Name: yhaN [H]

Synonym: PEPE_0675

Alternate gene names: 116492443

Gene position: 714877-717453 (Clockwise)

Preceding gene: 116492442

Following gene: 116492444

Centisome position: 39.01

GC content: 35.55

Gene sequence:

>2577_bases
ATGAAAATTAATAAGATTGAGATTTATGGATTTGGAAAATGGAATAACGTTATTTTCGATTTGAAACAAGATTTGCAAGT
TTTTTATGGTTTGAATGAAGCTGGTAAATCAACGCTAAGACAATTTATTTATAGTATTCTATTTGGTTTTGCTGGTGGAC
GTGGTAATCATAAGTATTTACAATATGTACCTAAAAAAGCACAAGGTGCAGCAGGGTACGGTGGCAATTTGGTAGTAGAA
TATCAAGGAAAAACTTACCAAATCGAGCGAATTAAAGGTAAAAATGGTGGGAAAGTAAATGTTAAAAATATGGATGATGG
ACTCGAAATGAATCCAGAATTTTTAACAGAGATGCTTGGCCCCATTGACCAAAATGCTTACGAACGGTTGCTGGGATTTA
ACCAGAGTGATTTGGACGACTTCAATGATTTAGGCAACCGGGATGATTTACGAAGACATATTCTGCGAATGGGCGCAGTC
GGAAGTGATGAGTGGATTAAGCTCGAAAACGACTTAAAAAAGGAAGCGGATAAGCTTCATACTGCCAGTTCTCGAAAACG
AGACCTAGATCTTAAAATCAAGCAATATAAAGAAGCTGTTGATCAGCTTCAAGCTGATAAGGCCAAACTACCAGATTATC
AGGTAACGAAAGACTTAGAAGAAGCCAGTCAACAAAAGTTGCAGCAAGTTCGATCGGAGATTGCAAAATTAAATACTAAA
ATTACTGAAACCAATAATCTGATTAATACGTGGCCTACATATTCAGAAACATTAGATTTAAAGCAAAAGCTGCAAGATAT
CCCCGAAGCATACTTGAATTTAGATTTGAATCAGTTGGAAGTTTTAGCCAACCAGATACGTGAAAATCAGAATGAACTTC
GTAATTTACAAAGTCAGCTAGAGGATTTACCAAATGAGAAAAACAATGTAATTGATATAACTAAATTAGACGAACTACAA
AGTAAGCTACCAGAAGTAAAATTGAATTATGGTCAGTTAGAGGACTTGAAACATAGATTCAATCGATTGAACCAACAACT
TGAAGAAATTCAAGCGCAGTATCAAGTTGACCTTGGTAATCTTAAACCCATGCCAGAAGGTCAATTTGTTGAATTAAAGG
ACTTATTGTTAAAGCAGAAACGTAAGAATGCGGATATTAATCAACTTAAAACACAAATGTTAGAAACTACGGGAAGTCGT
TCAACACATACGAATTCTAATTCCAATGTAGTAATTGGCGCAGCCGCGGTACTGGTCGTAATTGATTTTTTAATCCCATT
AAACTGGTTATTTAAGTTGATCTTGCTAGCAATAATTATTGGTGGTGGATATGGTTTAACCCATGCTAAATCAGCAGACA
ACGTTACACCTAATGAAGAGAATTTAGAAGATGTTTTGAAGCGGGATGAAACCGAAGCTGAGCAAATTAAAACTGCAATC
AAGCAAATTGGTGATAAAACAAGCTTTAACGCATTTCCAGTGGAAGATTGGGTAGCATTACAATCTAACTTGTTGAACTA
CCAGCATTTGGTTAATGAAATGAGCGAATTAAAGGGACACTTAACCCAAATCGAAGAACAGCTTGGCACTTTTTGGGAAT
TCAGCGATGGAATTCTCCCAGTGGATGAACATCGAAAAGAAGCTCTACAAACTTTGATCGATCAGGTAAATGGAATGGTT
GAGCAAGATCGAAAGCAACAAAGTATCAGCCAACAGCGTCAATTACTTAATAAAAATGTGGCGGAACGGCGTACCGAGTT
AGATAAATTGCGAATTCAATTTAAACAGCTTAATGGACCTGAAATTAATGCTGATTTTGATGATTGGCTTAAGCAAGTTA
GAACAGCCCAACATTTAAACTTAAGATTAAATACTTTATTGGAATCTAACCAAGTTAAGTTTTTTGACCAACTACAACAA
TATGCAGATTTAACAAAATTGCAGCAACTTCAAAACGAACAGGAACAAAAGCTGGCCGAGTTTAAACAAGCTGAGCAAGA
TATTTTAGACCAACGTGCTAATCAACTAGGTGAACTTACGGGTCTTAAGAGTAGTGTAGACATCCTAGCTGAACAACAGT
TACTATCAGAACAAGAAACCGAAATTAAAGATCTGGTTTCAGAATGGTTAACTTTGCAGCTAGGTGCTGAATGGGTCGAT
CAAACACTAGGGGTGGCAACTAAGGGACGTTTACCGGTAATCCTTGATAAGGCAAATGAGTACTTTAGACAGATAACTAA
TCAGCGTTACCAAAAAATTGAATTTGATAAAGATGATATGATTAATGTAACGGATGAAACTGGAAATGTATTTGAAATTG
GTGAGCTGTCAAAAGGTACGATGGAACAGCTTTATATTTCAATTCGATTTGCCTTTATGCAAGCTTTTGCGGATACGGTA
AGATTACCAATTATCATTGACGATGCTTTTGTAGCGTTCGATGATGTTCGTTTACGACAAGCCTTTAGTTTATTAAACAA
AATTGCAGAACAAACTCAAGTTATTTATTTTTCTGCCAAGAAAGAAGTTTACGACTTAATTGATGACCAAAAAATTATTA
ATTTAAATGAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTATAGCAGAAACCTATGGAAATGATTTAGAACTTAACCCGTTGAAAGACCAAGTTGAACTAATGTTGAAACAACGGAA
TGCTCTTGGAGACGAACGCG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGGGGGAGATATTTTGACGAAAAAAATAACCGAATTTCAAAATGATGAAGAAATGGAATTATTTGTCTTAATCAAATCT
GCGGAAAAGCGGGTGACCAA

Product: DNA repair ATPase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 858; Mature: 858

Protein sequence:

>858_residues
MKINKIEIYGFGKWNNVIFDLKQDLQVFYGLNEAGKSTLRQFIYSILFGFAGGRGNHKYLQYVPKKAQGAAGYGGNLVVE
YQGKTYQIERIKGKNGGKVNVKNMDDGLEMNPEFLTEMLGPIDQNAYERLLGFNQSDLDDFNDLGNRDDLRRHILRMGAV
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RLPIIIDDAFVAFDDVRLRQAFSLLNKIAEQTQVIYFSAKKEVYDLIDDQKIINLNEK

Sequences:

>Translated_858_residues
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YQGKTYQIERIKGKNGGKVNVKNMDDGLEMNPEFLTEMLGPIDQNAYERLLGFNQSDLDDFNDLGNRDDLRRHILRMGAV
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>Mature_858_residues
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YQGKTYQIERIKGKNGGKVNVKNMDDGLEMNPEFLTEMLGPIDQNAYERLLGFNQSDLDDFNDLGNRDDLRRHILRMGAV
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SKLPEVKLNYGQLEDLKHRFNRLNQQLEEIQAQYQVDLGNLKPMPEGQFVELKDLLLKQKRKNADINQLKTQMLETTGSR
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RLPIIIDDAFVAFDDVRLRQAFSLLNKIAEQTQVIYFSAKKEVYDLIDDQKIINLNEK

Specific function: Unknown

COG id: COG4717

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 98733; Mature: 98733

Theoretical pI: Translated: 4.74; Mature: 4.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
1.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKINKIEIYGFGKWNNVIFDLKQDLQVFYGLNEAGKSTLRQFIYSILFGFAGGRGNHKYL
CCCEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHH
QYVPKKAQGAAGYGGNLVVEYQGKTYQIERIKGKNGGKVNVKNMDDGLEMNPEFLTEMLG
HHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEEEECCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHC
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CCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECHHHHHHHHHHHH
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HHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCH
ITETNNLINTWPTYSETLDLKQKLQDIPEAYLNLDLNQLEVLANQIRENQNELRNLQSQL
HHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EDLPNEKNNVIDITKLDELQSKLPEVKLNYGQLEDLKHRFNRLNQQLEEIQAQYQVDLGN
HHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
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KEVYDLIDDQKIINLNEK
HHHHHHHCCCEEECCCCC
>Mature Secondary Structure
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QYVPKKAQGAAGYGGNLVVEYQGKTYQIERIKGKNGGKVNVKNMDDGLEMNPEFLTEMLG
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KEVYDLIDDQKIINLNEK
HHHHHHHCCCEEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377 [H]