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The map label for this gene is ltaS1 [H]

Identifier: 116492398

GI number: 116492398

Start: 658712

End: 660886

Strand: Direct

Name: ltaS1 [H]

Synonym: PEPE_0604

Alternate gene names: 116492398

Gene position: 658712-660886 (Clockwise)

Preceding gene: 116492397

Following gene: 116492399

Centisome position: 35.95

GC content: 39.26

Gene sequence:

>2175_bases
ATGAATCGTTTATGGGGTAAATTTCGACAGGGGCTAAATACTAAATTTGGCTTCTTCATGCTAATTACAGGTTTATTTTG
GATTAAATCGTACATAGCATATCAAACAAAATTCACGTTGGGTGTTCAGGGTGGCATGCAAGAATTGATTCTCGCCATCA
GCCCGCTGGGTTTTGCCATACTTTTGTTCGGGATTGGATTGTATATCCGTGGTAAGTGGGCCTACTGGTACATGATTATT
ATGGATACCATCTTATCGACTTGGCTATTTGCCAACATCCTTTATTATCGCGAGTTTTCAGATTTCATTACCTTTAATTT
AATTAAGGGTTCTGGGTCAGCCTCCGATAATTTAGGAAAGAGTCTGATGGGAATTCTACGAACTACTGATTTCCTAGTTT
TTATTGATGTAATTTTCGTTATTGCTATTTTAGCGTTTGGATTCGTTAAGATAGACCAAAGCAAGTTCAAGTTAATGAAC
TCCTTTGCGGTGACGGTCCTATCGATTGGGGTTTTAGCAGCTAACTTGGCTTTAGCTTATTCCAACCGTTCAGGATTATT
GACGCGGACCTTTGATAATAACTACATTGTTAAGTACCTAGGACTACAAAGTTTCACTTTGTATGATGGGGTTAAGTCAT
TTGAAAACAGCAATAAGAAAAAGGAAGCTAAGGGTTCACAATTAGATCCGATTAAGAAGTTCATCAAAGAAAATAATGTT
CCTGCTAATGTTGAATACAAAGGGGTGGCTAAGGGCAAAAATGTCATTATCATCCATTTGGAAAGTCTTCAACAATTTGT
AATTAACAAAAAATGGAAAGGCGAAGAAATTACGCCGAACATTAATAAGTTCTACAAGGATAAAAATACTTTAGCCTACG
ACAACTTCTTCAATCAAGTTGGTCAAGGTAAGACGGCGGATGCCGAAATGATGCTGGAAAATTCCTTATTTGGTTTGGCA
GAAGGTTCGGCGATGGTAACTGACGGGACCACCAATACTTTCCAATCGATGCCCGCTTTAATGCAACAAAATGGGTATTC
GACGGCCGCTTTCCATGGGGATGTAGCTAGTTTCTGGAACCGAGACAACGCTTATAAGTCATTTGGTTACCAGTACTTCT
TCAGTAAGCAATATTACACATTGAAGAAGGGCTACGTTAGTGGATACGGGATGAAGGATAAGCTCTTCTTACAACAATCG
GCTAAGTACTTGGAACAATTACCACAACCGTTCTATGCTAAATTGATTACGGTCTCGAACCACTATCCATACGGAATCGA
AAAGAAGAACGTTTCTATCGACAAATGGGATACCGGTGATTCAACCGTTGATCCGTATGTGCAAACTGCGCATTACTTAG
ATCAATCAATTGGGGAATTACTAAATTACTTGAAGAAAACTGGTTTGTACAATAAGAGCACCATCATGATGTATGGTGAC
CATTATGGGATTTCTAACAACCATAAGCCGGCCATTGCCAAGATCTTAGGTTTGAAGGGTGTAACCAACTATGATCTTGC
CATGTTCCAAAAGGTTCCTTTCATGATTCATTCACCTGGTCTAAAGGGTGGTGTTAACCACAACTACAGTGGTGAAATTG
ATGTGATGCCAACCTTATTGAATTTACTCGGCATCAAGACGCCAGGCGCTTACCAATTTGGACATGATATTAATTCAAAA
CAATACAACCAGATTGTGGCGTTCCGAAATGGGGACTTTGTTTCGAAGAAGTATACCAAGTACGGGGGCGACCTCTACTT
GACGGCCACTGGTGAACAAGTCACAGACGAAACACCTGCTCAAAAACAAGAAGTGAAAAAGATCCAAGATTACGTTAATA
AAGAACTCGAATATTCAGATAAGATTATTAATGGTGATCTCTTGCGCTTTGCCAAGTTGGATTGGTTTAAGAAGGTTAAT
AAGTCAGACTACAGTTACAATATGAAGTCGGCGCTCGAACAACTAAATAAAGCTCAAAGTTCTAAGACGAGTTTGATTGA
ACAAAACCACGGCAAATCAACGTTGGATGATTATGAAACGGATGCTCCTGAACTAGAAAGCAATGCTGATAAATCATCTA
GTTCAAGCAGTAGTTCTTCAGATAGCTCAGCTTCGAAGTCTTCAAGCAGTGATTCAAGTAGTAGCTCTAGTTCATCATCT
GAAAGTAGTAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATCTTTCTAAATTAACACCTCAAATGGGGTTAATTTTTTAGTTTTTAATATATAATGGTTAAGTTGTATCAAGAAATA
TCACGTGGAGGAACGATAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTAAAGACTGAGAAGAGACCTTTAGGGGTGCTTCTCAGTTTTTTTATTAAGAGAGGAAGCGATTTTATGGCAAGTCATT
TGATAATTCTACTATTAGTG

Product: phosphoglycerol transferase/alkaline phosphatase superfamily protein

Products: NA

Alternate protein names: LTA synthase 1; Polyglycerol phosphate synthase 1 [H]

Number of amino acids: Translated: 724; Mature: 724

Protein sequence:

>724_residues
MNRLWGKFRQGLNTKFGFFMLITGLFWIKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAILLFGIGLYIRGKWAYWYMII
MDTILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGSASDNLGKSLMGILRTTDFLVFIDVIFVIAILAFGFVKIDQSKFKLMN
SFAVTVLSIGVLAANLALAYSNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKSFENSNKKKEAKGSQLDPIKKFIKENNV
PANVEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINKKWKGEEITPNINKFYKDKNTLAYDNFFNQVGQGKTADAEMMLENSLFGLA
EGSAMVTDGTTNTFQSMPALMQQNGYSTAAFHGDVASFWNRDNAYKSFGYQYFFSKQYYTLKKGYVSGYGMKDKLFLQQS
AKYLEQLPQPFYAKLITVSNHYPYGIEKKNVSIDKWDTGDSTVDPYVQTAHYLDQSIGELLNYLKKTGLYNKSTIMMYGD
HYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHSPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLLNLLGIKTPGAYQFGHDINSK
QYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYLTATGEQVTDETPAQKQEVKKIQDYVNKELEYSDKIINGDLLRFAKLDWFKKVN
KSDYSYNMKSALEQLNKAQSSKTSLIEQNHGKSTLDDYETDAPELESNADKSSSSSSSSSDSSASKSSSSDSSSSSSSSS
ESSK

Sequences:

>Translated_724_residues
MNRLWGKFRQGLNTKFGFFMLITGLFWIKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAILLFGIGLYIRGKWAYWYMII
MDTILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGSASDNLGKSLMGILRTTDFLVFIDVIFVIAILAFGFVKIDQSKFKLMN
SFAVTVLSIGVLAANLALAYSNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKSFENSNKKKEAKGSQLDPIKKFIKENNV
PANVEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINKKWKGEEITPNINKFYKDKNTLAYDNFFNQVGQGKTADAEMMLENSLFGLA
EGSAMVTDGTTNTFQSMPALMQQNGYSTAAFHGDVASFWNRDNAYKSFGYQYFFSKQYYTLKKGYVSGYGMKDKLFLQQS
AKYLEQLPQPFYAKLITVSNHYPYGIEKKNVSIDKWDTGDSTVDPYVQTAHYLDQSIGELLNYLKKTGLYNKSTIMMYGD
HYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHSPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLLNLLGIKTPGAYQFGHDINSK
QYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYLTATGEQVTDETPAQKQEVKKIQDYVNKELEYSDKIINGDLLRFAKLDWFKKVN
KSDYSYNMKSALEQLNKAQSSKTSLIEQNHGKSTLDDYETDAPELESNADKSSSSSSSSSDSSASKSSSSDSSSSSSSSS
ESSK
>Mature_724_residues
MNRLWGKFRQGLNTKFGFFMLITGLFWIKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAILLFGIGLYIRGKWAYWYMII
MDTILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGSASDNLGKSLMGILRTTDFLVFIDVIFVIAILAFGFVKIDQSKFKLMN
SFAVTVLSIGVLAANLALAYSNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKSFENSNKKKEAKGSQLDPIKKFIKENNV
PANVEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINKKWKGEEITPNINKFYKDKNTLAYDNFFNQVGQGKTADAEMMLENSLFGLA
EGSAMVTDGTTNTFQSMPALMQQNGYSTAAFHGDVASFWNRDNAYKSFGYQYFFSKQYYTLKKGYVSGYGMKDKLFLQQS
AKYLEQLPQPFYAKLITVSNHYPYGIEKKNVSIDKWDTGDSTVDPYVQTAHYLDQSIGELLNYLKKTGLYNKSTIMMYGD
HYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHSPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLLNLLGIKTPGAYQFGHDINSK
QYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYLTATGEQVTDETPAQKQEVKKIQDYVNKELEYSDKIINGDLLRFAKLDWFKKVN
KSDYSYNMKSALEQLNKAQSSKTSLIEQNHGKSTLDDYETDAPELESNADKSSSSSSSSSDSSASKSSSSDSSSSSSSSS
ESSK

Specific function: Catalyzes the polymerization of lipoteichoic acid (LTA) polyglycerol phosphate, a reaction that presumably uses phosphatidylglycerol (PG) as substrate [H]

COG id: COG1368

COG function: function code M; Phosphoglycerol transferase and related proteins, alkaline phosphatase superfamily

Gene ontology:

Cell location: Processed glycerol phosphate lipoteichoic acid synthase 1:Secreted. Note=The secretion into the extracellular medium is dependent on secA and ffh [H]

Metaboloic importance: Non Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the LTA synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR017849
- InterPro:   IPR017850
- InterPro:   IPR012160
- InterPro:   IPR000917 [H]

Pfam domain/function: PF00884 Sulfatase [H]

EC number: 3.1.6.- [C]

Molecular weight: Translated: 81357; Mature: 81357

Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNRLWGKFRQGLNTKFGFFMLITGLFWIKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAI
CCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLFGIGLYIRGKWAYWYMIIMDTILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGSASDNLGK
HHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHH
SLMGILRTTDFLVFIDVIFVIAILAFGFVKIDQSKFKLMNSFAVTVLSIGVLAANLALAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
SNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKSFENSNKKKEAKGSQLDPIKKFIKENNV
CCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCC
PANVEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINKKWKGEEITPNINKFYKDKNTLAYDNFFNQV
CCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEHHHHHHHH
GQGKTADAEMMLENSLFGLAEGSAMVTDGTTNTFQSMPALMQQNGYSTAAFHGDVASFWN
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHC
RDNAYKSFGYQYFFSKQYYTLKKGYVSGYGMKDKLFLQQSAKYLEQLPQPFYAKLITVSN
CCCHHHHCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEECC
HYPYGIEKKNVSIDKWDTGDSTVDPYVQTAHYLDQSIGELLNYLKKTGLYNKSTIMMYGD
CCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEC
HYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHSPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLL
CCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHH
NLLGIKTPGAYQFGHDINSKQYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYLTATGEQVTDETPA
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCH
QKQEVKKIQDYVNKELEYSDKIINGDLLRFAKLDWFKKVNKSDYSYNMKSALEQLNKAQS
HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
SKTSLIEQNHGKSTLDDYETDAPELESNADKSSSSSSSSSDSSASKSSSSDSSSSSSSSS
HHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
ESSK
CCCC
>Mature Secondary Structure
MNRLWGKFRQGLNTKFGFFMLITGLFWIKSYIAYQTKFTLGVQGGMQELILAISPLGFAI
CCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLFGIGLYIRGKWAYWYMIIMDTILSTWLFANILYYREFSDFITFNLIKGSGSASDNLGK
HHHHCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHH
SLMGILRTTDFLVFIDVIFVIAILAFGFVKIDQSKFKLMNSFAVTVLSIGVLAANLALAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE
SNRSGLLTRTFDNNYIVKYLGLQSFTLYDGVKSFENSNKKKEAKGSQLDPIKKFIKENNV
CCCCCCEEEECCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCC
PANVEYKGVAKGKNVIIIHLESLQQFVINKKWKGEEITPNINKFYKDKNTLAYDNFFNQV
CCCEEEEEECCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCEEHHHHHHHH
GQGKTADAEMMLENSLFGLAEGSAMVTDGTTNTFQSMPALMQQNGYSTAAFHGDVASFWN
CCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCHHHHHC
RDNAYKSFGYQYFFSKQYYTLKKGYVSGYGMKDKLFLQQSAKYLEQLPQPFYAKLITVSN
CCCHHHHCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEEEEECC
HYPYGIEKKNVSIDKWDTGDSTVDPYVQTAHYLDQSIGELLNYLKKTGLYNKSTIMMYGD
CCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEC
HYGISNNHKPAIAKILGLKGVTNYDLAMFQKVPFMIHSPGLKGGVNHNYSGEIDVMPTLL
CCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHH
NLLGIKTPGAYQFGHDINSKQYNQIVAFRNGDFVSKKYTKYGGDLYLTATGEQVTDETPA
HHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCEEEEEECCCCCHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCH
QKQEVKKIQDYVNKELEYSDKIINGDLLRFAKLDWFKKVNKSDYSYNMKSALEQLNKAQS
HHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
SKTSLIEQNHGKSTLDDYETDAPELESNADKSSSSSSSSSDSSASKSSSSDSSSSSSSSS
HHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
ESSK
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9141694; 9384377; 10658653 [H]