Definition Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis L550 chromosome 1, complete sequence.
Accession NC_008508
Length 3,614,446

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The map label for this gene is pknB [H]

Identifier: 116328762

GI number: 116328762

Start: 2502348

End: 2507720

Strand: Reverse

Name: pknB [H]

Synonym: LBL_2136

Alternate gene names: 116328762

Gene position: 2507720-2502348 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116328763

Following gene: 116328761

Centisome position: 69.38

GC content: 40.33

Gene sequence:

>5373_bases
ATGTCAATTCGAACGGATCTGGCCGCCTTTCAAACGAACGAAATTCTACTGCAAGATCACGTCTCGACGGTTTACAGAGG
GATCTTAAAGGGGGAATCCGAAACAAAAATCCTTAGGATTCAGAAAGAAAAAACTAAAGAAGAGGATTCTTTTTACTTTT
TGAACGAATACGAGATCGGAAAATTGATTTCCGACGATCATATCTTAAAGCCCGAACATATATTAAGGATTCAGGATAAA
TACTGCCTCGTCTATGAAAATCTGAAAAGTGTTCTTCTGTCGGATTATATGTCCGAGGTCGGTCCGTTAGCCGTGGAGGA
ATACCTTCAAATTGCGCTTTCGGTTACTGAAAATGTGGTTCACCTACATTCGCAGGGGGTTCTTCACAATCAGATTGGTC
CTAATTCCTTTTTTTACGACGCCGGTACAAAAACCTCCGTTCTTGCTTGGCTCGGCTCCTCTTCTTTACTCATAGGAGAA
AAAGGAAATCCCGCTCCTTTACAGATTTCGTCTACGTTACTCGCTTATTGTTCCCCGGAACGGACTGGAAAGCTCAATCG
CTCCGTGGATTTTCGATCGGACGGTTATTCTATCGGCGCTTTGTTCTATTGGCTTTTAACGGGTAAACCTCCTTTCGAAT
CCGACGACCCGTTGGAAATCATACATTCTCACATAGCCCGCGTTCCCATTCCGGTATCTGAAAAAAGAAAAGAGATTCCG
GTTCCGATTTCGAATCTCGTAATGAAATTACTTTCCAAAATGCCGGAGGAAAGATATTTCTCGTTGGAAACGTTACTCTA
CGATTTGCGGATTCTTTACGATTCCGTTCGGTCTCAAAGAAGCATTTTGGAGTTTATTCCCGGTTTTACCGAAAAAAAGG
ATAAGTTTCGAATCTCCCAAAAGTTATACGGAAGAGACAAGGAAAAGGAAATCATAGAGGAAGCGATTTCTTCCGTTTAT
TCCGGAGTAAAAGCGTCCATTCTGATCAAGGGAAAGTCGGGAACCGGAAAAACCTCCTTGATTCAGGACACGATTCTTTC
CAAAGAATTGAATACATTACGAAGTTTTAAAGGAAAGTTCGAGGAAGATAAAAAGGGGATTCCTTATTTTGCTCTTAGGC
AGGTCTTAGTAGAATTATCCAATTACCTTTTAACCCAATCCGAATATGAAATCCAGTCCTTTCGAAAAAAAATTCAGGAG
AAACTCAGAGGTAATATCCAACTTTTGGCTCAACTCATACCGGAGATCGAAAATCTGACGGGGATCTTTCCCGTTTCGTC
GGAACATCAGAGCCAAAAGGACGATCAATTTTTATTCATCGTAATCCTAAGATTTTTATCCGTCTGTTTCAACAGACGTA
GTCCCGCATTACTCATATTAGACGATATTCAATGGGCCGATCCTGCGTCCCTCGCTCTCATCGAGTTCATATCCAGACTG
ACCGAATGGGAAGGAATGTTGTTCGTATTTATTTCCAGGAACGAGGAAGAATATTCCGATTTCTTAAACTCTTTTCGGGA
AAGAATTCTGAATTCGGAAATTCTTCTTCAAGAGATCTCCTTGAATCCCCTTGATCAAACTATGATCCGAAGTTATGTTA
CGGACAGTTTGGATTTGAAAGAGGAAGATTCGGAAAAACTCACCGAAATTCTTTATCAAAAAACGAACGGGAATCCGTTT
TTTCTCAATCAGTTTTTCAATACGCTTTATACGGAATCCTTTATACGATACCAGAAGAGTTCGGGGATTTGGAGTCTGGA
TTGGGATCAAATTATCAAAAAAACCGTGACCGAAAACGTTTTGGATCTTCTCACGGAAGAGATTACGAGGCTTCCGGAGG
ATACGCAAGAATTCCTTAAGGTGGCTGCGTGTGTCGGAAATCTTTTCGATTTGGGAATTTTGTATCGGTATTTTCAGGAT
ATTCCGGAGATCGTCGAAACCGGAATTAGGGAATGTATCAAACAAGGAATCATCATATATCAGGAATCGCAGGTAAGCCT
TTATCCGATTTTGCAAATATTAAAAAAAAAGAATGTTGAAGAGCTGGATAAGAATAGGGTTTTCGAAGGAATCACATTCC
GTTTTTCGCATGATAAGATCAATCAGGTGATCGGGGAATCGATTGCTCTTGACCAAAGGGCTGAAATTCATAAAAACCTC
GCTTGGTTTCTGATCGAATCGGATCGACTTACCTCCAAACAAGAACGGATCCCGGAGATTGCAAATCACCTGATCAAATC
CCAAAAAATTCTGAGTTCGAAAGAAGAAGTCGAGATCTTCAACCATTACATCATTCTCGCCGGAAATTCGGCCAAACTTG
CAGCGGCGTTTAACACCGCTTATAACCTTTTCACTCTTCTGAAAAAAAAGATCACAGAGGAATCTTGGAAGGATAGAAAA
GAGCAATGTGTTCAAATTTATAAGTCTTTTGCAGAGTCCGCATATTTCCTTTCTAAAACCCTCGAAGCGGAGGATGCGGT
TCAAGTTCTGCTTTCTCGACTGCAGGATCGGATCGAAATCGTCGACGTTTATCTCATGCAATTGGAAGTGATGAACGCAA
AGAACGATCTCGAAGGAGCCTACAAAGTCGGTTTAAAAGCGCTTCAATCTTTGGACGTAGGATTTCCGGAAAAACCCGGA
ATCACGGTTCTTATCTTCGAATTTTTAAAGATGATTTATTATCAAAGAGGCAGGAGTCCTGAACGATTACGGGAAGCAAA
AAAGAATCAAGATCCTTATAAAATAGAAACTATAAACATACTTACAAATATGTTGAATTACGGAAAACATTCCGACGGTA
AGTTGTTCGTATTCCTGTTTTTAAAATTGATGAACATCACTCTCAAGGAGGGAAATTCTCCGGTAAGTTTTTTCGGTTAT
GCCGGATTCGGTTCCCTTCTCTTTGTGGTGACTGGAAATTTTAAAACGACGCTTCGATACTGGGATCTCGGCGAATATAT
CATTCGGATTTTCAATGCGGATCGAATTCGTGGTAGATATCTGTTTGGAAAGAATATGCTCCTCGATTTCTATAGGCAAC
CTTTTTCCAAATTGGTCTTACTCGCCGACGAGGCGTACGAAAAGTGCATTCAATATGGAGATTATCTTTGGGCTGCGTTT
TCTTTGATCTCACATTCCATTTATCATTTGTATTCTTCGGACACTTCCGAGTCGTATTATGAAGTCCTAATTAAGGATGC
GAAACGAGGGGAACAACTAGGTTATGAGACCGTTTATATAGTTGTTGCAAGTTCCGATTTCTTGATTCGCAGTATAGGAA
ATACCTCCAAACAAAACGTGATTTATAGGGATCGGGAGATGTCCGCGGAGATTTTCGAACGGGAAGTTTTAGTGCCGAAC
GCGAACGGAACCGCAAACGCTTGGTATGCGGTTCTGAGAGGAAAGGAAACTTATCTTAGCGGGGAATGGAAAGAAGGATT
GAGGGTTTTCGATAAATTTGCAAACGACCTGGAAAGATCCAGAACGATTTTCATCTATTCCGAATACAGATTCTATAAAT
CTCTTCACTTGATCCGCTCTAACGAATCGAAAAGAAGGCTAAGTTGGTCGAATTTATTTTTTATTAAAAGATCAATCTCC
TTGTTCAAGGTTTGGTCGAAAACTTTTCCGGATAATTTTCAATCTTATTTCTATATTCTAAAAGCGGAATATAATAGATA
TAAAAAGGATTTTGCGAAAACGGACATGTTTTACGAATCTGCGCTCTCTTCTCTTCGGGAAAACGAAGGTAATCTTAGAA
AAACGATTGTTCACGAACACGCGGGCGTATGGGAATTTGAAAGGGGGAGAAAACATTATGCAAATTATCTCTTAAAGGTT
TCGGAAAGACAATACCGAACCTGGGGCGCTACCGCAAAGGCGAATCAAATTCAGGCGATGAGGCAACACGAGGAAGATGT
GGGAATACTTCTTCGTATGAGAGAAGAAGCTCTTTGGGATACGATCCTGAAGTCCGCCGAAAAACTGGATTTTAGAAGCG
TTTTAAAGTCTTCTCAGTCCATTTCTGAAATTATAGAACAAGACGAACTTCTAAGGAAATTAATGCGAACAATCATGGAA
AACGCAGGAGCGACTCGAGGATTTTTGATACTTCCAAGAAAAGACGGTTTGTATGTGGAAACGGGACAGGATATCGAAAG
AGAGGACATTCTGACTCGATCTCTGATTTTGGACTACGCTACGGAGTTGCTACCGATTGAAATCGTTTATTATTGTTATC
GTTCGGGACAAAGAATACTTCTGAATAATACGTCCTCTAAAGATTCTCCGCATTCTTTGAATTCTTATATCGGAGCAAAA
CGACCGAAGTCTCTTCTTTGTCTGCCTATCACAAAACAAGGAAGAATTTTGAGCGTTCTTTATCTGGAAAACGGACTCAC
TTATGACGTATTCGACGAACATAAGTTGGAAATTCTCGAAATCCTATCTTCACAGGCCGCAATTTCATTAGAAAATGCTA
AACTATATGAGGATATCACAAGTTTAAACGCCGAGTTGGAAAAGAAGGTGGAACTTCGTACACAGGAATTGATGCAATCT
TTGGAAATTATACGGAAGGATCTTTTGTATTCCAAAAAGATCCAACGTAGTATCTTACCGGAGCATCCGGTTCTTCCGGG
AATTGTTTATTCGGTTTCGTATCAACCTATGGACGAGGTCGGAGGGGATTTTTACGATCTTTTCGAAATTCGTCCCGGAG
TTTACAGATTTTTCGTGGCGGATGCGACGGGGCATGGAGTTCAGGCCGCTTTGATTACTATGGCAATCAAAAGCGAATAT
GAACATCTGAAAAAGATCCAGAAAAATCCTTCTTCTTTATTAGGAGAATTGAATGCCGTTATCCTTGAAAAATTTAAAAC
CTTGTATCTCACCTGCGTCGTTGCGGACATAAACGTGAAAAATCATACTTTGGAGTATTCGTCCGCGGGTCATCCGCCTC
AGATTCTTTTGAGAGAAGGAAAGACGGATCTCTTTCATAAAACCGGGGCGATTCTCGGACTTAAGAAAGACTTCGTATAT
TATACCGAAAAAGTAAAATTAAAATCGGGCGACCGAATTTATCTTTTTACGGACGGGATTTACGAACAATTTAATGCGAC
TAAAACCGAATTCGGCGAAGCGAGGTTTTCAAATTCGATCGTTTTATCCTCTTCTTTGAGTCCCGAAGACCAAATTTCCA
CGGTTCAAAAAGATTTGAATTTATTCCTGCAGGGAGAGCCGATACAGGACGATTTGACTCTTATAATTATCGAAGTTGTG
TTCAGTCGATCTCAAAAAAAGCTCATATATAAATCTTGGTTTTTAAGATCGGAAGTTAGAAAAATCTTCGTTCCGCAAAA
ATTTAGAGCGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTATTTCCCGAAGGAATATTTCGTTTTATGTTTGGGTGTATTGGTTTTTATAGCGGATGCATATTACGTCTATTTATTT
GCAAAGACTAGAAAATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTACAAGCTTGAATTTGAAAAATTTTGAGATGGTGGCAAGTTTTTTTGGAGATTTGTCGTATAATACAAACCTTTTGCG
GATGAGATCGAACTTCTGAA

Product: ATPase/protein kinase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1790; Mature: 1789

Protein sequence:

>1790_residues
MSIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIGKLISDDHILKPEHILRIQDK
YCLVYENLKSVLLSDYMSEVGPLAVEEYLQIALSVTENVVHLHSQGVLHNQIGPNSFFYDAGTKTSVLAWLGSSSLLIGE
KGNPAPLQISSTLLAYCSPERTGKLNRSVDFRSDGYSIGALFYWLLTGKPPFESDDPLEIIHSHIARVPIPVSEKRKEIP
VPISNLVMKLLSKMPEERYFSLETLLYDLRILYDSVRSQRSILEFIPGFTEKKDKFRISQKLYGRDKEKEIIEEAISSVY
SGVKASILIKGKSGTGKTSLIQDTILSKELNTLRSFKGKFEEDKKGIPYFALRQVLVELSNYLLTQSEYEIQSFRKKIQE
KLRGNIQLLAQLIPEIENLTGIFPVSSEHQSQKDDQFLFIVILRFLSVCFNRRSPALLILDDIQWADPASLALIEFISRL
TEWEGMLFVFISRNEEEYSDFLNSFRERILNSEILLQEISLNPLDQTMIRSYVTDSLDLKEEDSEKLTEILYQKTNGNPF
FLNQFFNTLYTESFIRYQKSSGIWSLDWDQIIKKTVTENVLDLLTEEITRLPEDTQEFLKVAACVGNLFDLGILYRYFQD
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YTEKVKLKSGDRIYLFTDGIYEQFNATKTEFGEARFSNSIVLSSSLSPEDQISTVQKDLNLFLQGEPIQDDLTLIIIEVV
FSRSQKKLIYKSWFLRSEVRKIFVPQKFRA

Sequences:

>Translated_1790_residues
MSIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIGKLISDDHILKPEHILRIQDK
YCLVYENLKSVLLSDYMSEVGPLAVEEYLQIALSVTENVVHLHSQGVLHNQIGPNSFFYDAGTKTSVLAWLGSSSLLIGE
KGNPAPLQISSTLLAYCSPERTGKLNRSVDFRSDGYSIGALFYWLLTGKPPFESDDPLEIIHSHIARVPIPVSEKRKEIP
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FLNQFFNTLYTESFIRYQKSSGIWSLDWDQIIKKTVTENVLDLLTEEITRLPEDTQEFLKVAACVGNLFDLGILYRYFQD
IPEIVETGIRECIKQGIIIYQESQVSLYPILQILKKKNVEELDKNRVFEGITFRFSHDKINQVIGESIALDQRAEIHKNL
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SLISHSIYHLYSSDTSESYYEVLIKDAKRGEQLGYETVYIVVASSDFLIRSIGNTSKQNVIYRDREMSAEIFEREVLVPN
ANGTANAWYAVLRGKETYLSGEWKEGLRVFDKFANDLERSRTIFIYSEYRFYKSLHLIRSNESKRRLSWSNLFFIKRSIS
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LEIIRKDLLYSKKIQRSILPEHPVLPGIVYSVSYQPMDEVGGDFYDLFEIRPGVYRFFVADATGHGVQAALITMAIKSEY
EHLKKIQKNPSSLLGELNAVILEKFKTLYLTCVVADINVKNHTLEYSSAGHPPQILLREGKTDLFHKTGAILGLKKDFVY
YTEKVKLKSGDRIYLFTDGIYEQFNATKTEFGEARFSNSIVLSSSLSPEDQISTVQKDLNLFLQGEPIQDDLTLIIIEVV
FSRSQKKLIYKSWFLRSEVRKIFVPQKFRA
>Mature_1789_residues
SIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIGKLISDDHILKPEHILRIQDKY
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GVKASILIKGKSGTGKTSLIQDTILSKELNTLRSFKGKFEEDKKGIPYFALRQVLVELSNYLLTQSEYEIQSFRKKIQEK
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FKVWSKTFPDNFQSYFYILKAEYNRYKKDFAKTDMFYESALSSLRENEGNLRKTIVHEHAGVWEFERGRKHYANYLLKVS
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AGATRGFLILPRKDGLYVETGQDIEREDILTRSLILDYATELLPIEIVYYCYRSGQRILLNNTSSKDSPHSLNSYIGAKR
PKSLLCLPITKQGRILSVLYLENGLTYDVFDEHKLEILEILSSQAAISLENAKLYEDITSLNAELEKKVELRTQELMQSL
EIIRKDLLYSKKIQRSILPEHPVLPGIVYSVSYQPMDEVGGDFYDLFEIRPGVYRFFVADATGHGVQAALITMAIKSEYE
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TEKVKLKSGDRIYLFTDGIYEQFNATKTEFGEARFSNSIVLSSSLSPEDQISTVQKDLNLFLQGEPIQDDLTLIIIEVVF
SRSQKKLIYKSWFLRSEVRKIFVPQKFRA

Specific function: Unknown

COG id: COG3899

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 protein kinase domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011009
- InterPro:   IPR005543
- InterPro:   IPR000719
- InterPro:   IPR017441
- InterPro:   IPR017442
- InterPro:   IPR008271
- InterPro:   IPR002290 [H]

Pfam domain/function: PF03793 PASTA; PF00069 Pkinase [H]

EC number: =2.7.11.1 [H]

Molecular weight: Translated: 207146; Mature: 207015

Theoretical pI: Translated: 6.73; Mature: 6.73

Prosite motif: PS50011 PROTEIN_KINASE_DOM

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIG
CCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCEEEECCCCCC
KLISDDHILKPEHILRIQDKYCLVYENLKSVLLSDYMSEVGPLAVEEYLQIALSVTENVV
CCCCCCCCCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HLHSQGVLHNQIGPNSFFYDAGTKTSVLAWLGSSSLLIGEKGNPAPLQISSTLLAYCSPE
HHHCCCCEECCCCCCCEEECCCCCHHHHEEECCCCEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHCCCC
RTGKLNRSVDFRSDGYSIGALFYWLLTGKPPFESDDPLEIIHSHIARVPIPVSEKRKEIP
CCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
VPISNLVMKLLSKMPEERYFSLETLLYDLRILYDSVRSQRSILEFIPGFTEKKDKFRISQ
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
KLYGRDKEKEIIEEAISSVYSGVKASILIKGKSGTGKTSLIQDTILSKELNTLRSFKGKF
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
EEDKKGIPYFALRQVLVELSNYLLTQSEYEIQSFRKKIQEKLRGNIQLLAQLIPEIENLT
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCC
GIFPVSSEHQSQKDDQFLFIVILRFLSVCFNRRSPALLILDDIQWADPASLALIEFISRL
EECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHH
TEWEGMLFVFISRNEEEYSDFLNSFRERILNSEILLQEISLNPLDQTMIRSYVTDSLDLK
HHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCC
EEDSEKLTEILYQKTNGNPFFLNQFFNTLYTESFIRYQKSSGIWSLDWDQIIKKTVTENV
CCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHH
LDLLTEEITRLPEDTQEFLKVAACVGNLFDLGILYRYFQDIPEIVETGIRECIKQGIIIY
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEE
QESQVSLYPILQILKKKNVEELDKNRVFEGITFRFSHDKINQVIGESIALDQRAEIHKNL
ECCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCE
AWFLIESDRLTSKQERIPEIANHLIKSQKILSSKEEVEIFNHYIILAGNSAKLAAAFNTA
EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEEEEEEECCCCEEHHHHHHH
YNLFTLLKKKITEESWKDRKEQCVQIYKSFAESAYFLSKTLEAEDAVQVLLSRLQDRIEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VDVYLMQLEVMNAKNDLEGAYKVGLKALQSLDVGFPEKPGITVLIFEFLKMIYYQRGRSP
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCH
ERLREAKKNQDPYKIETINILTNMLNYGKHSDGKLFVFLFLKLMNITLKEGNSPVSFFGY
HHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEC
AGFGSLLFVVTGNFKTTLRYWDLGEYIIRIFNADRIRGRYLFGKNMLLDFYRQPFSKLVL
CCCCEEEEEEECCCEEEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCHHHHHH
LADEAYEKCIQYGDYLWAAFSLISHSIYHLYSSDTSESYYEVLIKDAKRGEQLGYETVYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEE
VVASSDFLIRSIGNTSKQNVIYRDREMSAEIFEREVLVPNANGTANAWYAVLRGKETYLS
EEECCCHHHHHCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHCEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHCC
GEWKEGLRVFDKFANDLERSRTIFIYSEYRFYKSLHLIRSNESKRRLSWSNLFFIKRSIS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHH
LFKVWSKTFPDNFQSYFYILKAEYNRYKKDFAKTDMFYESALSSLRENEGNLRKTIVHEH
HHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHC
AGVWEFERGRKHYANYLLKVSERQYRTWGATAKANQIQAMRQHEEDVGILLRMREEALWD
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
TILKSAEKLDFRSVLKSSQSISEIIEQDELLRKLMRTIMENAGATRGFLILPRKDGLYVE
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEE
TGQDIEREDILTRSLILDYATELLPIEIVYYCYRSGQRILLNNTSSKDSPHSLNSYIGAK
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHCCC
RPKSLLCLPITKQGRILSVLYLENGLTYDVFDEHKLEILEILSSQAAISLENAKLYEDIT
CCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHH
SLNAELEKKVELRTQELMQSLEIIRKDLLYSKKIQRSILPEHPVLPGIVYSVSYQPMDEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHH
GGDFYDLFEIRPGVYRFFVADATGHGVQAALITMAIKSEYEHLKKIQKNPSSLLGELNAV
CCCHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
ILEKFKTLYLTCVVADINVKNHTLEYSSAGHPPQILLREGKTDLFHKTGAILGLKKDFVY
HHHHHHHHEEEEEEEECCCCCCEEECCCCCCCHHHHEECCCHHHHHHCCCCEEECHHHHE
YTEKVKLKSGDRIYLFTDGIYEQFNATKTEFGEARFSNSIVLSSSLSPEDQISTVQKDLN
EEEEEEECCCCEEEEEECCHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH
LFLQGEPIQDDLTLIIIEVVFSRSQKKLIYKSWFLRSEVRKIFVPQKFRA
EEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SIRTDLAAFQTNEILLQDHVSTVYRGILKGESETKILRIQKEKTKEEDSFYFLNEYEIG
CCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHCCCCCCEEEECCCCCC
KLISDDHILKPEHILRIQDKYCLVYENLKSVLLSDYMSEVGPLAVEEYLQIALSVTENVV
CCCCCCCCCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
HLHSQGVLHNQIGPNSFFYDAGTKTSVLAWLGSSSLLIGEKGNPAPLQISSTLLAYCSPE
HHHCCCCEECCCCCCCEEECCCCCHHHHEEECCCCEEEECCCCCCCEEEHHHHHHHCCCC
RTGKLNRSVDFRSDGYSIGALFYWLLTGKPPFESDDPLEIIHSHIARVPIPVSEKRKEIP
CCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
VPISNLVMKLLSKMPEERYFSLETLLYDLRILYDSVRSQRSILEFIPGFTEKKDKFRISQ
CCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHH
KLYGRDKEKEIIEEAISSVYSGVKASILIKGKSGTGKTSLIQDTILSKELNTLRSFKGKF
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
EEDKKGIPYFALRQVLVELSNYLLTQSEYEIQSFRKKIQEKLRGNIQLLAQLIPEIENLT
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