| Definition | Shewanella sp. MR-4 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008321 |
| Length | 4,706,287 |
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The map label for this gene is mprF [H]
Identifier: 113969817
GI number: 113969817
Start: 1727795
End: 1730347
Strand: Direct
Name: mprF [H]
Synonym: Shewmr4_1475
Alternate gene names: 113969817
Gene position: 1727795-1730347 (Clockwise)
Preceding gene: 113969813
Following gene: 113969818
Centisome position: 36.71
GC content: 44.03
Gene sequence:
>2553_bases ATGGGGAGACGCATTCGGGTGATTATTAGCTTACTAATATTCACAGTCTCGTTATTGCTTTTGTATAACCTTGAACAGGA TTATCAATTAAATGATATTTTGGCTGAGGTTAAATTATTTTCATTTTCACAGCTTGCGCTTGCCGTTGCATTGACTGTGA CCAGCTACTTAATCTTGACCTTGTATGATTATCTTGCGATTAAACAACTTGGCTCATCATTAAGTTATCCAAAGGTCGCT CCCGTTTCATTTTTAGCCTTTACCTTTTCCAATACCATAGGGTTTTCATTACTCACAGGCACTTCGATACGCTATAAGTT TTATTCAGAGTTAGGGTTAAGCGGTAATCAGATAACTCAAATAGTGCTCGCCTGCTCGGTGACTTTTTTCCTCGGGTTAT TCTTCATTTGTGGTATCGCGCTGATTAACTTCCCGGCGCAGCAACTGGCTGATTTGCCATTGCCAGCTTGGCTGTTTTCC TTGAGCCGTGTGTTTGGCGTTCTGATGCTGCTCTGTGTCGTAGGCTATTTTCTGTTTAGTCTGTGGCGTAAAAAACCGAT TTATTTTCGTGGGTTTGAGTTTGCGCCTCCCGAACGGTCTCAGTCGTTGAAACAGATTGTGGTCTCGACACTCGATTGGT TAGTGGTGGGAACATTATTCTATTCCCTGCTGCCTGCGGTGGATGGTTTAAGTTACCTTCAAGTGCTCAGTATTTTCTTT GTGGCAAATGCCATCGGGGTGCTTGCCCATGTGCCTGGAGGGATTGGTGTTTTTGAATCTGTGGTTACAGTGACCTTATC CCAGTATTTACCCGTTGAACAAATATTGGGCTCGGTGATTGTGTATCGGGTCATTTATTATATTGTGCCTTTTATGCTGG CCCTGATTTATTTTGTGGCGGGTTTAGTATTAAGTAATAAGGATAAATTATCTAAGATAAATATTGATTTACATATTGTC AGACAGTTATTACCACCACTATTAAGCATTAGTGTGTTTTCCGTCGGTTTAGTTTTATTGCTGTCAGTGGTTAATCCTTC CATTGTGCACAAATATCATTGGCTAGGGGAGATAGTGCCGCTACCGATTGTCGAATTGTCGAGCTTAATATTGAGTGCCA GTGGTATTTTGTTGCTGTTATTATCCCATGGCTTGTTTAAGCGTTATCAAAAAGCCTTCGTACTCACCCAAAAGCTATTA TTAGTAGCCATTGTTTTTATTGTGCTTAAAGGCGCTGAATGGCAGATTTCCCTAGCACTCGGTCTTATCTATTTATTAAT GCTGCCCTGTGAACAGGTGTTTTATCGCCAAGGTTCGATTGTGGGCGTTAAATATTCCTTCGGCTGGTTATTATCCCTCG CCGCGGCGTTATTTTTGATGGTGTGGGTGTTGTTTTTTGCCTACCAAGATGTGGATTATGACCATTCGCTCTGGTTAACC TTCTCGCAGGATAGCCATGTGTCCCGCGCGTTACGGGGTGGTGCGATAGCCCTCGTGATTCTGCTCGGCTTTGCCATTCG TTATGTGCTTGCGGTGCGAAAACCCCATACCAGTCGCCTAGATAGCTCGACCTTGAGCTGCACCATGGAGATTGTTGCCA ATGCGCCGAGTAGCCACGGTTATCTTGCCTTAGTACAAGATAAATCGCTGTTATTTAATGAAGATAAAGATGCCTTCTTA ATGTATGCCCGCGCCGGACATTGCTGGGTGGTGATGGGCGATCCTATCGGTAATCCAGATAAATTTGATGATCTCCTGTG GCAGTTTCGCGAGCTGTGTGACGCCTACGATGGTTGGCCGGTGTTTTATCAAGTGACGCAAAAGTATTTACCCCACTTTT TAGAGCAAGGGTTGAGCCTGTATAAACTCGGCGAAGAGGCCATAGTGTCCTTAGCGGAATTTGAATTGCAGTCGAGTAAG TATCGCAGTTTGCGGCAGAGCCATGCTAAGGCATTAAGGGAAGGCTTGAGCTTTAAGGTTGTCGATGCCAGTGAAGTACA GAGTCTATTGCCAACATTAGAGGCTATTTCAACCAGTTGGCTTAAGGCCAAACAGGGGCGAGAAAAAGGGTTTTCGGTTG GTTATTTCTCCTCAGCTTACCTGTGCACCACGCCTATGGCCTTAGTGTATTTGAATGGCGAGCTGGTGGCCTTTTCCAAT GTGTGGGCCAGTGGCGCCAAAATGGAGTTCTCCGTTGATTTGATGCGTTATCTGCCGAATTTATCGGGCAGCAACATAAT GGACTTTTTGTTTACAGAGCTATTGCTTTGGGGCAAACAGCAAGGATATCAGCAGTTTAATCTTGGCATGGCGCCCATGT CTGGATTAACCGATAGAGCCTTGGTACCGTTTTGGACCAAGCTTGCCAAAACGGTTTATAAGAAGGGGAATAAATTTTAC AACTTTCAGGGGCTTAGAAGGTATAAGGATAAGTTTAATCCAAGATGGGAAGCTAAGTATTTGATTTGTTATGGAGGGCT ATCTTTACCCGTAGTGGTGGGTAGTTTGGTGACCTTAACGAGTCGTGGTGCAACTGGCGTATTTAAAAAGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AACAGTGCTTAATAATAAATTAAAGTTAATTCAGATTTAATGCTTTATCAATAATAGCCATTAACCTTGATTTGCCCCTT AACAATATGTGGAGATGAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGCGAGATGACGAAATCCTTAATCAAGATACTGAGCGTTTTACTTTTATGTTCAACTGCTAACGCCTTTGCCGATGAGT TTGCCGATAATCTGGGGCTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Lysylphosphatidylglycerol synthase; LPG synthase [H]
Number of amino acids: Translated: 850; Mature: 849
Protein sequence:
>850_residues MGRRIRVIISLLIFTVSLLLLYNLEQDYQLNDILAEVKLFSFSQLALAVALTVTSYLILTLYDYLAIKQLGSSLSYPKVA PVSFLAFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNQITQIVLACSVTFFLGLFFICGIALINFPAQQLADLPLPAWLFS LSRVFGVLMLLCVVGYFLFSLWRKKPIYFRGFEFAPPERSQSLKQIVVSTLDWLVVGTLFYSLLPAVDGLSYLQVLSIFF VANAIGVLAHVPGGIGVFESVVTVTLSQYLPVEQILGSVIVYRVIYYIVPFMLALIYFVAGLVLSNKDKLSKINIDLHIV RQLLPPLLSISVFSVGLVLLLSVVNPSIVHKYHWLGEIVPLPIVELSSLILSASGILLLLLSHGLFKRYQKAFVLTQKLL LVAIVFIVLKGAEWQISLALGLIYLLMLPCEQVFYRQGSIVGVKYSFGWLLSLAAALFLMVWVLFFAYQDVDYDHSLWLT FSQDSHVSRALRGGAIALVILLGFAIRYVLAVRKPHTSRLDSSTLSCTMEIVANAPSSHGYLALVQDKSLLFNEDKDAFL MYARAGHCWVVMGDPIGNPDKFDDLLWQFRELCDAYDGWPVFYQVTQKYLPHFLEQGLSLYKLGEEAIVSLAEFELQSSK YRSLRQSHAKALREGLSFKVVDASEVQSLLPTLEAISTSWLKAKQGREKGFSVGYFSSAYLCTTPMALVYLNGELVAFSN VWASGAKMEFSVDLMRYLPNLSGSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQQFNLGMAPMSGLTDRALVPFWTKLAKTVYKKGNKFY NFQGLRRYKDKFNPRWEAKYLICYGGLSLPVVVGSLVTLTSRGATGVFKK
Sequences:
>Translated_850_residues MGRRIRVIISLLIFTVSLLLLYNLEQDYQLNDILAEVKLFSFSQLALAVALTVTSYLILTLYDYLAIKQLGSSLSYPKVA PVSFLAFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNQITQIVLACSVTFFLGLFFICGIALINFPAQQLADLPLPAWLFS LSRVFGVLMLLCVVGYFLFSLWRKKPIYFRGFEFAPPERSQSLKQIVVSTLDWLVVGTLFYSLLPAVDGLSYLQVLSIFF VANAIGVLAHVPGGIGVFESVVTVTLSQYLPVEQILGSVIVYRVIYYIVPFMLALIYFVAGLVLSNKDKLSKINIDLHIV RQLLPPLLSISVFSVGLVLLLSVVNPSIVHKYHWLGEIVPLPIVELSSLILSASGILLLLLSHGLFKRYQKAFVLTQKLL LVAIVFIVLKGAEWQISLALGLIYLLMLPCEQVFYRQGSIVGVKYSFGWLLSLAAALFLMVWVLFFAYQDVDYDHSLWLT FSQDSHVSRALRGGAIALVILLGFAIRYVLAVRKPHTSRLDSSTLSCTMEIVANAPSSHGYLALVQDKSLLFNEDKDAFL MYARAGHCWVVMGDPIGNPDKFDDLLWQFRELCDAYDGWPVFYQVTQKYLPHFLEQGLSLYKLGEEAIVSLAEFELQSSK YRSLRQSHAKALREGLSFKVVDASEVQSLLPTLEAISTSWLKAKQGREKGFSVGYFSSAYLCTTPMALVYLNGELVAFSN VWASGAKMEFSVDLMRYLPNLSGSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQQFNLGMAPMSGLTDRALVPFWTKLAKTVYKKGNKFY NFQGLRRYKDKFNPRWEAKYLICYGGLSLPVVVGSLVTLTSRGATGVFKK >Mature_849_residues GRRIRVIISLLIFTVSLLLLYNLEQDYQLNDILAEVKLFSFSQLALAVALTVTSYLILTLYDYLAIKQLGSSLSYPKVAP VSFLAFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNQITQIVLACSVTFFLGLFFICGIALINFPAQQLADLPLPAWLFSL SRVFGVLMLLCVVGYFLFSLWRKKPIYFRGFEFAPPERSQSLKQIVVSTLDWLVVGTLFYSLLPAVDGLSYLQVLSIFFV ANAIGVLAHVPGGIGVFESVVTVTLSQYLPVEQILGSVIVYRVIYYIVPFMLALIYFVAGLVLSNKDKLSKINIDLHIVR QLLPPLLSISVFSVGLVLLLSVVNPSIVHKYHWLGEIVPLPIVELSSLILSASGILLLLLSHGLFKRYQKAFVLTQKLLL VAIVFIVLKGAEWQISLALGLIYLLMLPCEQVFYRQGSIVGVKYSFGWLLSLAAALFLMVWVLFFAYQDVDYDHSLWLTF SQDSHVSRALRGGAIALVILLGFAIRYVLAVRKPHTSRLDSSTLSCTMEIVANAPSSHGYLALVQDKSLLFNEDKDAFLM YARAGHCWVVMGDPIGNPDKFDDLLWQFRELCDAYDGWPVFYQVTQKYLPHFLEQGLSLYKLGEEAIVSLAEFELQSSKY RSLRQSHAKALREGLSFKVVDASEVQSLLPTLEAISTSWLKAKQGREKGFSVGYFSSAYLCTTPMALVYLNGELVAFSNV WASGAKMEFSVDLMRYLPNLSGSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQQFNLGMAPMSGLTDRALVPFWTKLAKTVYKKGNKFYN FQGLRRYKDKFNPRWEAKYLICYGGLSLPVVVGSLVTLTSRGATGVFKK
Specific function: Catalyzes the transfer of a lysyl group from L-lysyl- tRNA(Lys) to membrane-bound phosphatidylglycerol (PG), which produces lysylphosphatidylglycerol (LPG), one of the components of the bacterial membrane with a positive net charge. LPG synthesis contribu
COG id: COG2898
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the LPG synthase family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787006, Length=294, Percent_Identity=28.5714285714286, Blast_Score=120, Evalue=5e-28,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR016181 - InterPro: IPR022791 [H]
Pfam domain/function: PF03706 UPF0104 [H]
EC number: =2.3.2.3 [H]
Molecular weight: Translated: 95223; Mature: 95092
Theoretical pI: Translated: 9.27; Mature: 9.27
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.1 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.1 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGRRIRVIISLLIFTVSLLLLYNLEQDYQLNDILAEVKLFSFSQLALAVALTVTSYLILT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYDYLAIKQLGSSLSYPKVAPVSFLAFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNQITQ HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCEEEEHHHHHCCCCHHHHH IVLACSVTFFLGLFFICGIALINFPAQQLADLPLPAWLFSLSRVFGVLMLLCVVGYFLFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWRKKPIYFRGFEFAPPERSQSLKQIVVSTLDWLVVGTLFYSLLPAVDGLSYLQVLSIFF HHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH VANAIGVLAHVPGGIGVFESVVTVTLSQYLPVEQILGSVIVYRVIYYIVPFMLALIYFVA HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLVLSNKDKLSKINIDLHIVRQLLPPLLSISVFSVGLVLLLSVVNPSIVHKYHWLGEIVP HHHHCCCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCC LPIVELSSLILSASGILLLLLSHGLFKRYQKAFVLTQKLLLVAIVFIVLKGAEWQISLAL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHH GLIYLLMLPCEQVFYRQGSIVGVKYSFGWLLSLAAALFLMVWVLFFAYQDVDYDHSLWLT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE FSQDSHVSRALRGGAIALVILLGFAIRYVLAVRKPHTSRLDSSTLSCTMEIVANAPSSHG ECCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC YLALVQDKSLLFNEDKDAFLMYARAGHCWVVMGDPIGNPDKFDDLLWQFRELCDAYDGWP EEEEEECCCHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH VFYQVTQKYLPHFLEQGLSLYKLGEEAIVSLAEFELQSSKYRSLRQSHAKALREGLSFKV HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE VDASEVQSLLPTLEAISTSWLKAKQGREKGFSVGYFSSAYLCTTPMALVYLNGELVAFSN ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCEEECCCCCHHHHCCEEEEEECCCEEEEEH VWASGAKMEFSVDLMRYLPNLSGSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQQFNLGMAPMSGLTDRA HHCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC LVPFWTKLAKTVYKKGNKFYNFQGLRRYKDKFNPRWEAKYLICYGGLSLPVVVGSLVTLT HHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH SRGATGVFKK CCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure GRRIRVIISLLIFTVSLLLLYNLEQDYQLNDILAEVKLFSFSQLALAVALTVTSYLILT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LYDYLAIKQLGSSLSYPKVAPVSFLAFTFSNTIGFSLLTGTSIRYKFYSELGLSGNQITQ HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCEEEEHHHHHCCCCHHHHH IVLACSVTFFLGLFFICGIALINFPAQQLADLPLPAWLFSLSRVFGVLMLLCVVGYFLFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LWRKKPIYFRGFEFAPPERSQSLKQIVVSTLDWLVVGTLFYSLLPAVDGLSYLQVLSIFF HHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH VANAIGVLAHVPGGIGVFESVVTVTLSQYLPVEQILGSVIVYRVIYYIVPFMLALIYFVA HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLVLSNKDKLSKINIDLHIVRQLLPPLLSISVFSVGLVLLLSVVNPSIVHKYHWLGEIVP HHHHCCCCHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCC LPIVELSSLILSASGILLLLLSHGLFKRYQKAFVLTQKLLLVAIVFIVLKGAEWQISLAL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHH GLIYLLMLPCEQVFYRQGSIVGVKYSFGWLLSLAAALFLMVWVLFFAYQDVDYDHSLWLT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE FSQDSHVSRALRGGAIALVILLGFAIRYVLAVRKPHTSRLDSSTLSCTMEIVANAPSSHG ECCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCC YLALVQDKSLLFNEDKDAFLMYARAGHCWVVMGDPIGNPDKFDDLLWQFRELCDAYDGWP EEEEEECCCHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH VFYQVTQKYLPHFLEQGLSLYKLGEEAIVSLAEFELQSSKYRSLRQSHAKALREGLSFKV HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE VDASEVQSLLPTLEAISTSWLKAKQGREKGFSVGYFSSAYLCTTPMALVYLNGELVAFSN ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCEEECCCCCHHHHCCEEEEEECCCEEEEEH VWASGAKMEFSVDLMRYLPNLSGSNIMDFLFTELLLWGKQQGYQQFNLGMAPMSGLTDRA HHCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCCCCCCCC LVPFWTKLAKTVYKKGNKFYNFQGLRRYKDKFNPRWEAKYLICYGGLSLPVVVGSLVTLT HHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH SRGATGVFKK CCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8946165; 9384377 [H]